单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32 篇文献，本页显示第 21 - 32 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
Dissociable Structural and Functional Hippocampal Outputs via Distinct Subiculum Cell Classes
2018-05-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.03.031
PMID:29681453
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research paper | 本文通过群体和单细胞RNA测序，揭示了海马体背侧下托中存在两种空间相邻的亚区域，这些区域在锥体细胞基因表达、长程输入、局部连接、投射目标和电生理特性上存在显著差异，并利用基因表达差异进行神经元沉默，展示了这些区域在空间工作记忆中的不同贡献。 | 首次详细描述了海马体背侧下托中两种不同亚区域的结构和功能特性，并通过基因表达差异进行神经元沉默实验，证明了这些区域在行为层面的不同作用。 | NA | 识别、描绘和操纵海马体背侧下托中假定的并行架构，以理解其功能多样性。 | 海马体背侧下托的结构和功能特性。 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22 | 2024-08-09 |
Myoepithelial Cells of Submucosal Glands Can Function as Reserve Stem Cells to Regenerate Airways after Injury
2018-05-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.03.018
PMID:29656943
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了黏膜下腺的肌上皮细胞在损伤后能够增殖和迁移，以再生气道表面上皮 | 首次发现黏膜下腺的肌上皮细胞具有多能性，并能在严重损伤后在大型动物肺部的气道表面再生 | NA | 探索细胞在损伤后的可塑性及其细胞机制 | 黏膜下腺的肌上皮细胞及其在气道再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个损伤模型的细胞样本 |
| 23 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the mouse kidney reveals potential cellular targets of kidney disease
2018-05-18, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar2131
PMID:29622724
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康小鼠肾脏的57,979个细胞，揭示了肾脏疾病潜在的细胞靶点 | 发现了通过Notch信号通路介导的过渡细胞在肾脏疾病中的作用 | NA | 旨在通过单细胞转录组学揭示肾脏疾病的细胞机制 | 小鼠肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 57,979个细胞 |
| 24 | 2024-08-09 |
FateID infers cell fate bias in multipotent progenitors from single-cell RNA-seq data
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4662
PMID:29630061
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研究论文 | 本文开发了FateID算法，用于从单细胞RNA测序数据中推断多能祖细胞的细胞命运倾向 | 开发了FateID，一种迭代监督学习算法，用于概率量化祖细胞群体中的细胞命运倾向 | NA | 理解沿着多条谱系的干细胞分化 | 小鼠造血祖细胞，特别是淋巴系祖细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | CEL-Seq2 | RaceID3 | RNA-seq数据 | 约2,000个 |
| 25 | 2024-08-09 |
Single-Cell Digital Lysates Generated by Phase-Switch Microfluidic Device Reveal Transcriptome Perturbation of Cell Cycle
2018-05-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.8b01272
PMID:29589910
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研究论文 | 本文介绍了一种利用相变微流控装置生成单细胞数字裂解液的方法，并应用于构建细胞周期中转录组扰动的分子图谱 | 提出了“数字裂解液”概念，通过相变微流控平台和下一代测序技术，实现了单细胞转录组的随机采样和多单细胞转录组的排列与平均化 | 需要确定在每个单细胞研究中需要多少细胞才能得出有意义的结论 | 研究细胞异质性，并构建细胞周期中转录组扰动的分子图谱 | 单细胞转录组和细胞周期调控基因 | 生物技术 | NA | 下一代测序 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞 |
| 26 | 2024-08-09 |
scmap: projection of single-cell RNA-seq data across data sets
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4644
PMID:29608555
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scmap的方法，用于将单细胞RNA测序数据集中的细胞投影到其他实验的细胞类型或单个细胞上 | scmap方法的创新之处在于能够跨越不同实验的数据集进行单细胞RNA测序数据的投影 | NA | 开发一种方法，用于比较不同实验间的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27 | 2024-08-09 |
Identification of spatial expression trends in single-cell gene expression data
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4634
PMID:29553578
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研究论文 | 本文介绍了一种名为trendsceek的计算分析方法，用于识别单细胞基因表达数据中的空间表达趋势 | trendsceek方法基于标记点过程，能够识别具有统计学意义的空间表达趋势基因 | NA | 开发一种计算分析策略，以处理单细胞分辨率的空间基因表达数据 | 单细胞基因表达数据中的空间表达趋势 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学和顺序荧光原位杂交技术 | 标记点过程 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 28 | 2024-08-09 |
Bone marrow PDGFRα+Sca-1+-enriched mesenchymal stem cells support survival of and antibody production by plasma cells in vitro through IL-6
2018-05-24, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxy018
PMID:29529192
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研究论文 | 研究骨髓中的PDGFRα+Sca-1+富集间充质干细胞如何通过IL-6支持浆细胞的体外存活和抗体产生 | 首次展示了骨髓中的PDGFRα+Sca-1+富集间充质干细胞通过IL-6支持浆细胞的体外存活和抗体产生 | 尚未完全阐明支持浆细胞存活和抗体产生的完整分子机制 | 探究骨髓中的间充质干细胞如何支持浆细胞的存活和抗体产生 | 骨髓中的PDGFRα+Sca-1+富集间充质干细胞和浆细胞 | 免疫学 | NA | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个具有不同基因表达谱的细胞群 |
| 29 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal Endothelial Cell Heterogeneity in Tumors and Changes following Antiangiogenic Treatment
2018-05-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-17-2728
PMID:29449267
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，研究了肿瘤中内皮细胞的异质性及其在抗血管生成治疗后的变化 | 首次通过单细胞转录组学技术详细描述了肿瘤内皮细胞的异质性，并揭示了VEGF和Dll4-Notch信号通路在调控内皮细胞表型中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨肿瘤内皮细胞的异质性及其对抗血管生成治疗的响应 | 肿瘤内皮细胞及其他基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括小鼠异种移植肿瘤及成年正常心脏中的内皮细胞和其他基质细胞 |
| 30 | 2024-08-09 |
Circulating plasmablasts are elevated and produce pathogenic anti-endothelial cell autoantibodies in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2018-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.201747460
PMID:29369345
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研究论文 | 本文研究了特发性肺动脉高压（IPAH）中循环浆母细胞的水平及其在疾病发病机制中的作用 | 首次详细描述了IPAH中浆母细胞产生的IgA自身抗体及其对内皮细胞的影响 | NA | 评估IPAH中激活B细胞（浆母细胞）的水平，并表征这些浆母细胞衍生的重组抗体 | 特发性肺动脉高压（IPAH）中的浆母细胞及其产生的抗体 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA |
| 31 | 2024-08-09 |
Systems biology of embryonic development: Prospects for a complete understanding of the Caenorhabditis elegans embryo
2018-05, Wiley interdisciplinary reviews. Developmental biology
DOI:10.1002/wdev.314
PMID:29369536
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研究论文 | 本文探讨了系统生物学框架如何帮助全面理解秀丽隐杆线虫胚胎中的胚胎调控关系 | 结合现代基因组学工具和发育生物学，特别是利用秀丽隐杆线虫胚胎的小尺寸和强大的遗传及基因组工具，以细胞分辨率理解mRNA表达和调控 | 目前的建模和扰动实验主要集中在单个细胞类型或基因上，需要改进方法以扩展到整个基因组和生物体 | 旨在通过系统生物学框架全面理解秀丽隐杆线虫胚胎的发育调控关系 | 秀丽隐杆线虫胚胎的基因表达和调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 32 | 2024-08-09 |
Lessons from single-cell transcriptome analysis of oxygen-sensing cells
2018-05, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-017-2682-0
PMID:28887696
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在氧感应细胞转录组分析中的应用 | 单细胞RNA测序技术为小而异质性的组织如氧感应细胞提供了革命性的无偏见方法，用于识别关键分子 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增进对氧感应细胞的理解 | 氧感应细胞及其在颈动脉体和嗅觉系统中的机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |