单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 36 篇文献，本页显示第 21 - 36 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
Comprehensive Identification and Spatial Mapping of Habenular Neuronal Types Using Single-Cell RNA-Seq
2018-04-02, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2018.02.040
PMID:29576475
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合脑部解剖注册，全面识别并绘制了斑马鱼缰核的神经元类型图谱 | 首次通过高覆盖率的单细胞转录组数据，识别出斑马鱼缰核的18种神经元类型，并将其标记基因注册到参考图谱上，为解剖和功能研究提供了资源 | NA | 旨在全面发现并识别脑部细胞类型，以解析神经发育和功能 | 斑马鱼缰核的神经元类型及其标记基因 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 约13,000个缰核细胞，覆盖率为4倍 |
| 22 | 2024-08-09 |
A Fibroblast Is Not a Fibroblast Is Not a Fibroblast
2018-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2017.10.012
PMID:29579454
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究人类皮肤成纤维细胞的异质性及其在纤维化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示人类皮肤成纤维细胞的主要群体，为理解成纤维细胞异质性和纤维化提供了新的视角 | NA | 深入理解成纤维细胞的异质性及其在纤维化中的作用 | 人类皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 23 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Tumor Heterogeneity
2018-04, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2018.02.003
PMID:29606308
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术分析肿瘤内部的异质性 | 利用高吞吐量的单细胞RNA测序技术，提供了分析肿瘤多样性细胞群体的统计能力 | NA | 探讨肿瘤内部异质性对精准癌症治疗的影响 | 肿瘤内部的细胞异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 24 | 2024-08-09 |
The use of single-cell RNA-Seq to understand virus-host interactions
2018-04, Current opinion in virology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.coviro.2018.03.001
PMID:29558678
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术探讨病毒与宿主细胞的相互作用 | 通过单细胞转录组分析揭示病毒感染下的细胞异质性 | NA | 理解病毒与宿主细胞的相互作用 | 病毒感染下的细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25 | 2024-08-09 |
Alignment of single-cell trajectories to compare cellular expression dynamics
2018-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4628
PMID:29529018
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cellAlign的定量框架，用于比较单细胞轨迹内的表达动力学 | cellAlign框架能够系统地描绘出在单细胞发育轨迹中基因表达程序的时间调控差异 | NA | 开发一种方法来比较单细胞轨迹中的表达动力学 | 单细胞RNA测序和高维细胞仪生成的动态生物过程轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎发育轨迹的样本 |
| 26 | 2024-08-09 |
Exponential scaling of single-cell RNA-seq in the past decade
2018-04, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2017.149
PMID:29494575
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研究论文 | 本文回顾了过去十年中单细胞RNA测序技术在细胞数量上的指数级增长 | 强调了技术进步和协议改进对单细胞RNA测序数据增长的推动作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术的发展及其在细胞类型多样性研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞类型多样性研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量细胞 |
| 27 | 2024-08-09 |
Bias, robustness and scalability in single-cell differential expression analysis
2018-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4612
PMID:29481549
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研究论文 | 评估了36种方法在单细胞RNA测序数据中差异基因表达分析的表现，并介绍了conquer数据库，该数据库提供了一致处理的、分析就绪的公共单细胞RNA测序数据集。 | 发现批量RNA测序分析方法在单细胞RNA测序数据分析中并不一定表现更差，并介绍了conquer数据库，简化了方法评估和已发表结果的重分析。 | NA | 评估不同方法在单细胞差异基因表达分析中的性能。 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了实验和合成数据集 |
| 28 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals metallothionein heterogeneity during hESC differentiation to definitive endoderm
2018-04, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2018.01.015
PMID:29427839
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人胚胎干细胞向确定性内胚层分化过程中金属硫蛋白的异质性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和X射线荧光显微镜及多同位素质谱分析，揭示了金属硫蛋白基因在未能分化为确定性内胚层的细胞中的高表达与细胞内高锌水平的相关性 | NA | 提高体外定向分化过程中确定性内胚层分化的效率 | 人胚胎干细胞向确定性内胚层的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在4天的确定性内胚层分化过程中，收集了四个时间点的单细胞样本 |
| 29 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptome Analyses Reveal Molecular Signals to Intrinsic and Acquired Paclitaxel Resistance in Esophageal Squamous Cancer Cells
2018-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2018.01.059
PMID:29410067
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research paper | 本研究通过低剂量长期处理紫杉醇诱导食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞产生紫杉醇耐药性，并利用群体RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析基因表达谱，揭示了内在和获得性紫杉醇耐药的分子信号。 | 本研究首次发现卡非佐米（CFZ）通过激活HIF-1信号通路，能够减弱紫杉醇耐药性，为食管鳞状细胞癌等癌症的治疗提供了一种新的联合疗法。 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌中紫杉醇耐药的分子机制，并探索新的联合疗法。 | 食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞及其紫杉醇耐药细胞。 | digital pathology | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 37个KYSE-30细胞和73个紫杉醇耐药KYSE-30细胞（Taxol-R） |
| 30 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell fate potential assay of murine hematopoietic progenitors in vitro
2018-04, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2018.01.005
PMID:29410050
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research paper | 本文详细介绍了开发一种体外高通量单细胞培养 assay，用于测量单个小鼠骨髓前体细胞向五个髓系分化的能力 | 本文开发了一种新的体外高通量单细胞培养 assay，用于评估小鼠造血前体细胞的命运潜力 | NA | 测试基于单细胞转录组学提出的高分辨率造血系统模型的预测 | 小鼠骨髓造血前体细胞的单细胞命运潜力 | digital pathology | NA | flow cytometry | NA | single-cell transcriptomics | 单个小鼠骨髓前体细胞 |
| 31 | 2024-08-09 |
dropClust: efficient clustering of ultra-large scRNA-seq data
2018-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky007
PMID:29361178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dropClust的新型聚类算法，该算法利用局部敏感哈希技术对超大规模的单细胞RNA测序数据进行高效聚类 | dropClust在执行时间、聚类准确性和检测次要细胞亚型方面优于现有的最佳实践方法 | NA | 开发一种适用于高维单细胞数据的聚类方法，以提高处理大规模数据时的效率和准确性 | 超大规模的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | 局部敏感哈希 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 数万个单细胞 |
| 32 | 2024-08-09 |
Review: Somatic mutations in neurodegeneration
2018-04, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12465
PMID:29369391
|
综述 | 本文综述了体细胞突变在神经退行性疾病中的作用，特别是晚发性散发性神经退行性疾病 | 探讨了体细胞突变在神经退行性疾病中的潜在作用，尤其是通过单细胞测序技术的进步 | 单细胞测序技术仍存在误差，且需要进一步改进 | 探讨体细胞突变在神经退行性疾病中的作用及其与疾病发展的关系 | 主要关注散发性晚发性神经退行性疾病，如帕金森病、阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-09 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
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研究论文 | 本研究探讨了利用锡中卟啉（SnMP）作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效，特别是在化疗诱导的抗肿瘤免疫反应背景下针对血红素氧化酶-1（HO-1）的作用。 | 首次评估SnMP作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的应用，并展示了其与PD-1阻断相当的疗效。 | 研究主要基于小鼠模型和临床数据分析，尚未进行人体临床试验。 | 研究SnMP作为新型免疫检查点疗法在癌症治疗中的潜在应用。 | 评估SnMP在乳腺癌模型中的疗效及其对化疗诱导的CD8 T细胞免疫抑制的影响。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用乳腺癌患者的数据和乳腺癌小鼠模型进行研究 |
| 34 | 2024-08-09 |
SFRP2/DPP4 and FMO1/LSP1 Define Major Fibroblast Populations in Human Skin
2018-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2017.09.045
PMID:29080679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常人皮肤中的不同成纤维细胞群体 | 发现了两个主要的成纤维细胞群体，分别由SFRP2和FMO1基因定义，并进一步定义了每个群体内的亚群 | NA | 探索人皮肤中不同成纤维细胞群体的特征 | 人皮肤中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个皮肤活检样本 |
| 35 | 2024-08-09 |
Immune cell type 'fingerprints' at the basis of outcome diversity of human infection
2018-04, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2017.09.012
PMID:29049916
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研究论文 | 本文提出利用单细胞分析技术研究人类感染结果多样性的新视角 | 利用单细胞RNA测序技术识别与宿主清除病原体能力相关的免疫细胞类型指纹 | NA | 探索感染结果多样性的原因，为治疗传染病提供新工具 | 人类感染结果的多样性及免疫细胞类型的作用 | NA | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 36 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals gene signatures and alterations associated with aging in distinct neural stem/progenitor cell subpopulations
2018-04, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-017-0450-2
PMID:28748452
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研究论文 | 本研究利用群体和单细胞转录组分析，揭示了衰老大脑中神经干细胞/祖细胞（NSC/NPCs）亚群的基因特征和改变 | 首次使用群体和单细胞转录组分析方法，揭示了不同NSC/NPCs与其微环境在衰老大脑中的分子相互作用 | 研究仅限于小鼠前脑的室管膜和室下区域，可能不适用于其他物种或其他脑区 | 探索衰老过程中神经干细胞/祖细胞亚群的分子机制 | 神经干细胞/祖细胞（NSC/NPCs）及其在衰老大脑中的分子变化 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的前脑室管膜和室下区域样本 |