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当前共找到 36 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Sensitivity to sequencing depth in single-cell cancer genomics
2018-04-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0537-2
PMID:29661213
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞癌症基因组数据，评估测序深度对变异检测敏感性的影响 | 首次系统评估单细胞癌症基因组测序中测序深度对变异检测、克隆推断和系统发育重建的影响 | 研究基于已发表的五个数据集，可能受原始数据质量和特定癌症类型的限制 | 探索单细胞癌症基因组测序中成本效益最优的测序策略 | 单细胞癌症基因组数据集 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | 基因组测序数据 | 5个单细胞癌症数据集，共生成6280个单细胞BAM文件 | NA | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Early emergence of cortical interneuron diversity in the mouse embryo
2018-04-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar6821
PMID:29472441
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了小鼠胚胎中皮质中间神经元多样性的早期起源机制 | 首次在胚胎期神经节隆起中识别出具有时空限制性转录模式的祖细胞和新生神经元类型 | 研究仅限于小鼠模型，未验证其他物种的普适性 | 探究哺乳动物大脑皮质中间神经元多样性的发育起源 | 小鼠胚胎期神经节隆起的祖细胞和新生神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
The use of single-cell RNA-Seq to understand virus-host interactions
2018-04, Current opinion in virology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.coviro.2018.03.001
PMID:29558678
|
综述 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序技术揭示病毒-宿主相互作用的研究进展 | 通过单细胞转录组分析揭示病毒感染过程中的细胞异质性和特定细胞亚群表型 | NA | 理解病毒与宿主之间的相互作用机制 | 病毒感染过程中的细胞异质性 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
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研究论文 | 本研究评估了锡中卟啉作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效 | 首次将锡中卟啉重新用作免疫检查点抑制剂，靶向血红素加氧酶-1以增强化疗引发的抗肿瘤免疫反应 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 评估锡中卟啉作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的疗效 | 乳腺癌小鼠模型和人类乳腺癌患者数据 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，肿瘤微阵列分析 | NA | 基因表达数据，临床生存数据 | 乳腺癌患者临床数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，微阵列分析 | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding
2018-04-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam8999
PMID:29545511
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研究论文 | 本文开发了一种名为SPLiT-seq的单细胞RNA测序方法，用于对发育中的小鼠大脑和脊髓进行单细胞转录组分析 | SPLiT-seq方法通过组合条形码标记细胞来源，适用于固定细胞或细胞核，无需定制设备，并允许高效样本复用 | NA | 研究小鼠大脑和脊髓在早期发育阶段的单细胞转录组特征 | 小鼠大脑和脊髓的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156,049个单核转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-05 |
Developmental and oncogenic programs in H3K27M gliomas dissected by single-cell RNA-seq
2018-04-20, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4750
PMID:29674595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了H3K27M胶质瘤中的致癌和发育程序。 | 首次使用单细胞分辨率解析H3K27M胶质瘤的细胞架构和发育程序，提供了潜在的治疗靶点。 | 研究仅在六个原发H3K27M胶质瘤模型中进行，样本数量相对较少，可能限制结果的普适性。 | 探索H3K27M胶质瘤的细胞组成及其发展机制。 | 本研究的对象为六个原发H3K27M胶质瘤和相匹配的模型中的细胞。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 3321个细胞来自六个原发H3K27M胶质瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-05 |
Depletion of Maternal Cyclin B3 Contributes to Zygotic Genome Activation in the Ciona Embryo
2018-04-02, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2018.02.046
PMID:29576477
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研究论文 | 本文探讨了母体Cyclin B3在Ciona胚胎中对合子基因组激活的影响 | 揭示母体Cyclin B3在合子转录激活过程中的重要作用 | 研究主要基于Ciona intestinalis，可能不适用于所有动物 | 探索Ciona胚胎中合子基因组激活的机制 | Ciona intestinalis的胚胎 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 8细胞和16细胞阶段的胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing
2018-04-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1426-0
PMID:29622030
|
研究论文 | 使用高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究人类多能干细胞的早期分化路径 | 首次提供了人类多能干细胞在单细胞层面的全面分化路线图 | NA | 研究人类多能干细胞的细胞分化过程 | 人类多能干细胞及其早期分化路径 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个细胞系，包括神经、肌肉、内皮、基质、肝脏和上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies celltype-specific cis-eQTLs and co-expression QTLs
2018-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0089-9
PMID:29610479
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了约25,000个外周血单个核细胞的表达谱，以识别细胞类型特异性的顺式表达数量性状位点（cis-eQTLs）和共表达QTLs | 本研究首次通过单细胞eQTL分析，识别了新的细胞类型特异性cis-eQTLs，并生成了个性化的共表达网络，发现了显著改变共表达关系的遗传变异（称为共表达QTLs） | NA | 旨在通过无偏倚的方法识别细胞类型特异性的eQTLs和共表达QTLs | 外周血单个核细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 约25,000个外周血单个核细胞来自45名供体 | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
On the design of CRISPR-based single-cell molecular screens
2018-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4604
PMID:29457792
|
研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR的单细胞分子筛选设计，特别是优化了CROP-seq方法，提高了引导RNA分配给细胞的效率 | 提出了CROP-seq方法的优化，使得引导RNA分配给细胞的效率提高到94% | NA | 优化基于CRISPR的单细胞分子筛选设计 | CRISPR引导RNA与单细胞RNA测序的结合 | NA | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-09 |
The Use of the Fluidigm C1 for RNA Expression Analyses of Single Cells
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.55
PMID:29851244
|
研究论文 | 本文描述了使用Fluidigm C1系统进行单细胞RNA表达分析的流程 | 开发了基于微流控技术的自动化平台，用于同时分离数十个单细胞并进行RNA测序分析 | NA | 理解单细胞水平上的转录异质性，以揭示发育和疾病中的基因调控机制 | 单细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数十个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-09 |
Introduction to Single-Cell RNA Sequencing
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.57
PMID:29851283
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在生物学研究中的应用 | scRNA-seq通过分离单个细胞并生成测序文库，允许以空前的分辨率评估细胞群体和生物系统的基本生物学特性 | NA | 介绍和讨论当前使用的最常见的scRNA-seq协议及其数据分析基础，以及在规划和设计scRNA-seq项目时需要考虑的因素 | 单细胞RNA测序技术及其数据分析方法 | 生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-09 |
Advances in Transcriptomics: Investigating Cardiovascular Disease at Unprecedented Resolution
2018-04-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.117.310910
PMID:29700068
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研究论文 | 本文综述了RNA测序（RNAseq）技术在转录组学中的最新进展，特别是在单细胞转录组学方面的应用 | 介绍了RNAseq技术在单细胞转录组学中的应用，以及其在质量控制、读取映射、特征计数等方面的最新发展 | NA | 探讨RNAseq技术在心血管疾病研究中的应用及其在现代生物学中的重要性 | RNAseq技术及其在单细胞转录组学中的应用 | 基因组学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-09 |
Characterization of germ cell differentiation in the male mouse through single-cell RNA sequencing
2018-04-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-24725-0
PMID:29695820
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，首次全面、无偏地展示了小鼠精子发生过程中的细胞分化过程 | 利用单细胞RNA测序技术，提高了阶段标记检测和验证的准确性，捕捉到了分化的连续性，并揭示了在批量测序数据中被掩盖的稀有细胞群体 | NA | 研究小鼠精子发生过程中的细胞分化 | 小鼠的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过2,500个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptional Heterogeneity in Latent and Reactivated HIV-Infected Cells
2018-04-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.03.102
PMID:29694901
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了HIV潜伏感染细胞在潜伏和重新激活状态下的转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了HIV潜伏感染细胞在潜伏和重新激活状态下的转录异质性 | NA | 研究HIV潜伏感染细胞的转录异质性，以期为HIV根除提供策略 | HIV潜伏感染细胞的转录异质性 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-09 |
Hippo Signaling Plays an Essential Role in Cell State Transitions during Cardiac Fibroblast Development
2018-04-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.03.019
PMID:29689192
|
研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路中的Lats1和Lats2激酶在心脏成纤维细胞发育中的作用 | 首次揭示了Lats1/2缺失导致心脏成纤维细胞分化受阻，细胞停留在中间状态 | 研究仅限于胚胎阶段，未涉及成体心脏的发育情况 | 探究Hippo信号通路在心脏成纤维细胞发育中的作用 | 心脏成纤维细胞的发育过程 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胚胎心脏组织中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-09 |
Cellular diversity in the Drosophila midbrain revealed by single-cell transcriptomics
2018-04-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.34550
PMID:29671739
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术分析了果蝇中脑的细胞多样性 | 利用单细胞转录组学技术揭示了果蝇中脑的细胞多样性，并将其与神经递质和神经调质联系起来 | NA | 理解大脑的分子细节与神经连接图的关系 | 果蝇中脑的单个细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-09 |
Pseudotime Dynamics in Melanoma Single-Cell Transcriptomes Reveals Different Mechanisms of Tumor Progression
2018-Apr-03, Biology
DOI:10.3390/biology7020023
PMID:29614062
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研究论文 | 本研究通过分析三种不同遗传背景的黑色素瘤短期培养细胞的伪时间（PT）动力学，探讨了影响黑色素瘤进展的特定和一致的PT动力学特性。 | 首次在黑色素瘤细胞中观察到伪时间动力学主要由细胞周期基因驱动，并发现微眼相关转录因子（MITF）和AXL受体酪氨酸激酶（AXL）的双极表达。 | 研究仅限于短期培养的黑色素瘤细胞，可能无法完全代表所有黑色素瘤细胞的动态变化。 | 研究黑色素瘤细胞的伪时间动力学，以揭示肿瘤进展的不同机制。 | 三种不同遗传背景的黑色素瘤短期培养细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 三种黑色素瘤短期培养细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-09 |
Detecting hidden batch factors through data-adaptive adjustment for biological effects
2018-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx635
PMID:29617963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数据自适应收缩和半非负矩阵分解的新算法，用于检测未知的批次效应 | 该算法在识别隐藏批次效应方面优于现有算法，并能在先前研究中未发现的批次因素中识别出差异表达基因 | NA | 检测隐藏的批次因素，以准确捕捉基因表达与其他建模变量之间的关系 | 批次效应的检测 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 半非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 三个不同数据集：(i) 测序质量控制，(ii) 拓扑替康RNA-Seq，(iii) 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-09 |
A multitask clustering approach for single-cell RNA-seq analysis in Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa
2018-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006053
PMID:29630593
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研究论文 | 本文介绍了一种基于方差的单细胞RNA测序数据多任务聚类方法（scVDMC），用于在遗传性大疱性表皮松解症中分析单细胞RNA测序数据 | scVDMC方法通过控制细胞簇内的方差和跨数据集的方差，能够更准确地检测细胞亚群，并揭示新的细胞类型和标记 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据分析方法，以更好地整合和分析多个单细胞群体的数据 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 遗传性大疱性表皮松解症 | 单细胞RNA测序 | 多任务聚类 | RNA测序数据 | 两个真实单细胞RNA测序数据集，包含多个重复样本和一个大规模液滴法数据集，涉及三个患者样本 | NA | NA | NA | NA |