单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32 篇文献，本页显示第 21 - 32 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis unveils a prevalent epithelial/mesenchymal hybrid state during mouse organogenesis
2018-03-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1416-2
PMID:29540203
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了在小鼠器官发生过程中普遍存在的上皮/间充质混合状态。 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同器官之间的相似性和共同特征，并发现了器官发生过程中上皮细胞具有普遍的间充质特征。 | NA | 探讨哺乳动物胚胎发育过程中器官形成的相似性和细胞异质性。 | 小鼠胚胎的八个器官和组织（前脑、后脑、皮肤、心脏、体节、肺、肝和肠）的1916个单个细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 1916个单个细胞 |
| 22 | 2024-08-09 |
Defining the Transcriptional Landscape during Cytomegalovirus Latency with Single-Cell RNA Sequencing
2018-03-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.00013-18
PMID:29535194
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人巨细胞病毒（HCMV）潜伏感染期间的转录组景观 | 揭示了潜伏相关基因表达主要反映了晚期裂解病毒程序，而不是高度受限的潜伏相关病毒基因表达程序 | 对HCMV潜伏状态的分子理解仍然有限 | 深入理解HCMV持久性和潜伏机制 | 人巨细胞病毒潜伏感染期间的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多种组织 |
| 23 | 2024-08-09 |
Erratum for Research Article: "Single-cell RNA-seq and computational analysis using temporal mixture modeling resolves TH1/TFH fate bifurcation in malaria" by T. Lönnberg, V. Svensson, K. R. James, D. Fernandez-Ruiz, I. Sebina, R. Montandon, M. S. F. Soon, L. G. Fogg, A. S. Nair, U. N. Liligeto, M. J. T. Stubbington, L.-H. Ly, F. Otzen Bagger, M. Zwiessele, N. D. Lawrence, F. Souza-Fonseca-Guimaraes, P. T. Bunn, C. R. Engwerda, W. R. Heath, O. Billker, O. Stegle, A. Haque, S. A. Teichmann
2018-03-09, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aat1469
PMID:29523583
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-09 |
An accurate and robust imputation method scImpute for single-cell RNA-seq data
2018-03-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03405-7
PMID:29520097
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research paper | 本文介绍了一种名为scImpute的统计方法，用于准确且稳健地填补单细胞RNA测序数据中的零计数（即dropouts） | scImpute能够自动识别可能的dropouts，并仅对这些值进行填补，不会对其他数据引入新的偏差。此外，scImpute还能检测并排除异常细胞 | NA | 开发一种有效的方法来恢复被dropouts掩盖的转录组动态 | 单细胞RNA测序数据中的dropouts | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 涉及人类和小鼠的单细胞RNA测序数据 |
| 25 | 2024-08-09 |
Transcriptional Dysregulation in Postnatal Glutamatergic Progenitors Contributes to Closure of the Cortical Neurogenic Period
2018-03-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.02.030
PMID:29514086
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研究论文 | 本研究通过命运图谱方法揭示了在皮质神经发生期关闭后，大量谷氨酸能神经元前体细胞（Glu前体细胞）在出生后前脑中持续存在，并发现这些细胞在出生后表现出转录程序的失调，与mA甲基化的变化相关。 | 本研究首次详细描述了出生后Glu前体细胞的特性，并识别了促进脑修复的潜在治疗靶点。 | NA | 研究出生后谷氨酸能神经元前体细胞的特性和转录调控，以及其与脑修复的关系。 | 出生后皮质谷氨酸能神经元前体细胞及其转录调控。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity of blastomeres during major genome activation in bovine embryos
2018-03-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-22248-2
PMID:29511234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了牛胚胎在主要基因组激活期间卵裂球的发育异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了牛胚胎在主要基因组激活阶段的转录组异质性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨牛胚胎在主要基因组激活阶段的细胞发育异质性 | 牛胚胎的卵裂球 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 161个卵裂球来自14个体外生产的牛胚胎 |
| 27 | 2024-08-09 |
Reconstruction of complex single-cell trajectories using CellRouter
2018-03-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03214-y
PMID:29497036
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellRouter的多功能单细胞分析平台，用于通过流网络探索多维单细胞组学数据中的亚群结构，从而识别复杂的细胞状态转换轨迹 | CellRouter能够同时识别新的细胞状态及其转换，揭示控制细胞类型分化的基因表达动态 | NA | 旨在更好地理解正常发育和疾病中复杂细胞生态系统中的细胞命运转换，以促进细胞工程和改进疗法 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞状态转换轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 流网络 | 单细胞组学数据 | 涉及造血干细胞和祖细胞（HSPC）向红细胞、髓系和淋巴系分化的数据集，以及单核细胞和B细胞重编程为HSPC的数据集 |
| 28 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq of Mouse Dopaminergic Neurons Informs Candidate Gene Selection for Sporadic Parkinson Disease
2018-03-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2018.02.001
PMID:29499164
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠脑中多巴胺能神经元在胚胎期和早期新生期的转录组特征，以识别与散发性帕金森病相关的候选基因。 | 通过单细胞RNA测序技术，首次系统性地分析了小鼠多巴胺能神经元的亚群及其特异性转录组特征，为散发性帕金森病的基因研究提供了新的候选基因和可测试的假设。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别与散发性帕金森病风险相关的候选基因。 | 小鼠脑中的多巴胺能神经元及其在胚胎期和早期新生期的转录组特征。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠脑中多巴胺能神经元的多个亚群 |
| 29 | 2024-08-09 |
Pulmonary alveolar type I cell population consists of two distinct subtypes that differ in cell fate
2018-03-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1719474115
PMID:29463737
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肺泡I型细胞（AT1细胞）在成年期的发育和异质性 | 首次发现成年AT1细胞群体包含两种不同亚型，具有不同的细胞命运 | NA | 探究AT1细胞在肺发育和再生中的细胞命运机制 | 肺泡I型细胞（AT1细胞）及其亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用-CreER小鼠模型进行研究 |
| 30 | 2024-08-09 |
Single-cell gene expression reveals a landscape of regulatory T cell phenotypes shaped by the TCR
2018-03, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-018-0051-0
PMID:29434354
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、激活报告和T细胞受体（TCR）分析，研究了小鼠淋巴器官和人类血液中CD4调节性T细胞（T）和常规CD4FoxP3 T细胞（T）的表型异质性 | 揭示了TCR信号强度对激活T细胞程序的影响，并展示了小鼠和人类血液中T细胞异质性的显著保守性 | NA | 理解CD4调节性T细胞的表型异质性 | CD4调节性T细胞和常规CD4FoxP3 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个T细胞和常规CD4FoxP3 T细胞 |
| 31 | 2024-08-09 |
Cell-cell signaling in blood vessel development and function
2018-03, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201708610
PMID:29363489
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综述 | 本文综述了血管发育过程中细胞间信号传导的作用及其对血管功能的影响 | 单细胞RNA测序技术为解析器官内血管多样性和动静脉层次结构中的转录多样性提供了新方法 | 器官内血管多样性和动静脉层次结构复杂，增加了血管细胞分子特征化的难度 | 探讨血管发育及其在健康和疾病中的功能 | 血液血管及其在器官发育和功能中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 32 | 2024-08-09 |
Medical bioinformatics in melanoma
2018-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000428
PMID:29227308
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综述 | 本文综述了下一代测序技术在黑色素瘤生物学、治疗抵抗和新治疗途径方面的应用 | 通过全基因组测序、全外显子测序和RNA测序重新定义了黑色素瘤的分子分类，揭示了定义临床亚型的独特遗传畸变，并揭示了个体肿瘤中存在的多样性异质性 | NA | 总结近期全基因组研究，探讨单细胞RNA测序研究以及个性化疫苗方法在黑色素瘤治疗中的应用 | 黑色素瘤的分子分类、遗传畸变、肿瘤异质性及治疗抵抗 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 下一代测序(NGS), 全基因组测序, 全外显子测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, RNA数据 | 多个黑色素瘤亚型, 单细胞水平 |