单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-08-09	Conserved properties of dentate gyrus neurogenesis across postnatal development revealed by single-cell RNA sequencing 2018-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-017-0056-2 PMID:29335606	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了出生后、幼年和成年小鼠齿状回细胞类型的分子动力学和多样性	发现了不同静止和增殖的前体细胞类型，并通过短暂的中介状态与神经母细胞阶段和完全成熟的颗粒细胞相联系	NA	探讨发育期和成年期齿状回神经发生的关系	齿状回的细胞类型及其分子动态变化	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	出生后、幼年和成年小鼠
22	2024-08-09	Early B cell changes predict autoimmunity following combination immune checkpoint blockade 2018-02-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI96798 PMID:29309048	研究论文	本文分析了黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后B细胞的变化，发现联合免疫检查点阻断（CCB）治疗导致循环B细胞数量下降及CD21lo B细胞和浆细胞样细胞增加，这些早期B细胞变化与免疫相关不良事件（IRAEs）的发生频率和时间相关。	首次揭示了CCB治疗后B细胞的早期变化与IRAEs风险增加之间的关系，并提出通过靶向B细胞的预防策略可能减少这些患者的毒性反应。	NA	研究CCB治疗后B细胞的变化及其与免疫相关不良事件的关系。	黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后的B细胞变化。	免疫学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞	具体样本数量未在摘要中提及
23	2024-08-09	Human-specific subcellular compartmentalization of P-element induced wimpy testis-like (PIWIL) granules during germ cell development and spermatogenesis 2018-02-01, Human reproduction (Oxford, England) DOI:10.1093/humrep/dex365 PMID:29237021	研究论文	研究了人类胚胎发育和精子发生过程中P-element induced wimpy testis-like (PIWIL)蛋白在生殖细胞中的表达动态及其亚细胞定位	发现了PIWIL蛋白在人类生殖细胞中的表达模式与小鼠不同，特别是在女性卵母细胞中PIWIL1的免疫染色显示出单一的密集核周体	研究受限于样本数量有限，因此分析的阶段也有限	探讨PIWIL蛋白在人类胚胎发育和精子发生过程中的表达动态及其在生殖细胞中的亚细胞定位	PIWIL1, PIWIL2, PIWIL3和PIWIL4蛋白在人类生殖细胞中的表达和定位	NA	NA	免疫荧光	NA	组织样本	8个男性胚胎样本，6个女性胚胎样本，5个成年男性睾丸样本，242个单细胞转录组数据
24	2024-08-09	Clinical Applications of and Challenges in Single-Cell Analysis of Circulating Tumor Cells 2018-Feb, DNA and cell biology IF:2.6Q2 DOI:10.1089/dna.2017.3981 PMID:29265876	review	本文综述了单细胞分析循环肿瘤细胞（CTCs）的技术原理及其在基础研究和临床应用中的进展与挑战	利用单细胞测序技术发现了癌症细胞群体的异质性、化疗耐药的新驱动突变及肿瘤转移机制等新发现	目前面临的挑战包括技术限制和临床应用中的问题	探讨单细胞分析CTCs在癌症管理中的应用及面临的挑战	循环肿瘤细胞（CTCs）及其分子层面的检测与分析	digital pathology	NA	下一代测序（NGS）	NA	基因组、转录组和表观遗传数据	NA
25	2024-08-09	Single-Cell RNA-seq Reveals a Subpopulation of Prostate Cancer Cells with Enhanced Cell-Cycle-Related Transcription and Attenuated Androgen Response 2018-02-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-17-1924 PMID:29233929	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了144个经过或未经过雄激素处理的同步化LNCaP前列腺癌细胞的转录组，识别出八个潜在的LNCaP细胞亚群，揭示了前列腺癌细胞对雄激素刺激的先前未被重视的细胞异质性	本研究首次揭示了一个具有干细胞样特征的亚群，该亚群表现出较慢的细胞倍增率、增强的球体形成能力和对有丝分裂抑制剂诱导的G-M阻滞的抵抗性，以及对雄激素受体信号依赖性的降低	NA	研究前列腺癌中存在的少数细胞亚群，这些亚群在雄激素剥夺治疗后可能成为优势克隆	LNCaP前列腺癌细胞的亚群及其对雄激素处理的响应	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	144个单细胞
26	2024-08-09	Single-cell transcriptome sequencing reveals that cell division cycle 5-like protein is essential for porcine oocyte maturation 2018-02-02, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1074/jbc.M117.809608 PMID:29222335	研究论文	本文通过单细胞转录组测序研究了细胞分裂周期5-样蛋白（CDC5L）在猪卵母细胞成熟中的作用	首次揭示了CDC5L蛋白在猪卵母细胞减数分裂和早期胚胎发育中的潜在新作用	NA	探索BCB测试背后的分子机制，并研究CDC5L蛋白在猪卵母细胞成熟中的作用	猪卵母细胞	分子生物学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	BCB阴性和BCB阳性猪卵母细胞
27	2024-08-09	Cross-platform single cell analysis of kidney development shows stromal cells express Gdnf 2018-02-01, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2017.11.006 PMID:29183737	研究论文	本研究使用三种独立平台（Drop-Seq、Chromium 10x Genomics和Fluidigm C1）进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，研究E14.5小鼠肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制	通过一种新的整合监督计算策略，成功地协调和比较了所有三种技术平台的细胞谱，并意外发现间质细胞表达GDNF，这推翻了之前认为的只有肾小管祖细胞是GDNF唯一来源的观点	使用无监督方法ICGS未能识别和确认16种不同细胞群体的存在	研究肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制	E14.5小鼠肾脏的单细胞RNA测序分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	E14.5小鼠肾脏样本
28	2024-08-09	CRISPR/Cas9 library screening for drug target discovery 2018-Feb, Journal of human genetics IF:2.6Q2 DOI:10.1038/s10038-017-0376-9 PMID:29158600	综述	本文综述了基于CRISPR/Cas9的工具在药物靶点发现中的应用	介绍了CRISPRa和CRISPRi在功能获得和功能丧失筛选中的优势，以及负选择在合成致死相互作用中的应用	NA	探讨CRISPR/Cas9技术在药物靶点发现中的应用和未来发展方向	CRISPR/Cas9库在药物靶点发现中的应用	基因编辑	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
29	2024-08-09	Tumour heterogeneity and resistance to cancer therapies 2018-02, Nature reviews. Clinical oncology DOI:10.1038/nrclinonc.2017.166 PMID:29115304	综述	本文综述了肿瘤异质性及其对癌症治疗抵抗性的影响	探讨了多区域测序、单细胞测序、尸检样本分析和液体活检样本的纵向分析等新兴技术在解析癌症复杂克隆结构中的潜力	NA	探讨肿瘤异质性的驱动因素及其对开发有效个性化治疗的影响	肿瘤异质性及其对癌症治疗的影响	NA	癌症	多区域测序, 单细胞测序, 尸检样本分析, 液体活检样本的纵向分析	NA	NA	NA
30	2024-08-09	TH2 cell development and function 2018-02, Nature reviews. Immunology DOI:10.1038/nri.2017.118 PMID:29082915	综述	本文综述了T辅助2细胞（T2细胞）在调节保护性2型免疫反应中的作用及其在慢性炎症疾病中的影响	介绍了单细胞转录组学和单细胞蛋白质组学等新技术在研究T细胞多样性和疾病相关异质性中的应用	NA	探讨T2细胞的分化机制及其在哮喘和过敏治疗中的潜在应用	T2细胞及其在免疫反应中的作用	免疫学	哮喘	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
31	2024-08-09	Constructing cell lineages from single-cell transcriptomes 2018-02, Molecular aspects of medicine IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.mam.2017.10.004 PMID:29107741	研究论文	本文比较和对比了现有的计算方法，并展示了如何应用这些方法从大规模并行RNA单细胞测序数据中构建小鼠髓系祖细胞谱系	本文开发了计算算法来推断细胞类型之间的谱系关系，并构建沿着细胞重新排序的发展轨迹，以最大化连续细胞对之间的相似性	NA	揭示细胞分化过程中存在的细胞异质性水平，并构建细胞谱系	小鼠髓系祖细胞的谱系关系	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	计算算法	转录组数据	大规模并行RNA单细胞测序数据
32	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications 2018-02, Molecular aspects of medicine IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.mam.2017.07.003 PMID:28754496	综述	本文综述了自2009年以来发展的单细胞RNA测序技术及其在不同生物学背景下的应用	单细胞RNA测序技术为从头发现细胞异质性和细胞类型/状态提供了巨大潜力	NA	总结和比较单细胞RNA测序技术，并讨论其在不同生物学背景下的应用	单细胞RNA测序技术及其应用	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
33	2024-08-09	Can single-cell RNA sequencing crack the mystery of cells? 2018-02, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-017-9404-y PMID:28733864	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
34	2024-08-09	Somatosensory Neuron Typing with High-Coverage Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis 2018-Feb, Neuroscience bulletin IF:5.9Q1 DOI:10.1007/s12264-017-0147-9 PMID:28612318	综述	本文综述了基于单细胞RNA测序和功能分析的背根神经节（DRG）神经元分类方法及其在体感神经元研究中的应用	介绍了基于单细胞RNA测序和功能分析的DRG神经元分类方法	NA	探讨体感神经元的基因表达谱及其在体感信号生成、传递和调控中的作用	背根神经节（DRG）神经元的基因表达和功能	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA