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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-07 |
Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing
2018-04-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1426-0
PMID:29622030
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研究论文 | 使用高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究人类多能干细胞的早期分化路径 | 首次提供了人类多能干细胞在单细胞层面的全面分化路线图 | NA | 研究人类多能干细胞的细胞分化过程 | 人类多能干细胞及其早期分化路径 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个细胞系，包括神经、肌肉、内皮、基质、肝脏和上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies celltype-specific cis-eQTLs and co-expression QTLs
2018-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0089-9
PMID:29610479
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了约25,000个外周血单个核细胞的表达谱，以识别细胞类型特异性的顺式表达数量性状位点（cis-eQTLs）和共表达QTLs | 本研究首次通过单细胞eQTL分析，识别了新的细胞类型特异性cis-eQTLs，并生成了个性化的共表达网络，发现了显著改变共表达关系的遗传变异（称为共表达QTLs） | NA | 旨在通过无偏倚的方法识别细胞类型特异性的eQTLs和共表达QTLs | 外周血单个核细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 约25,000个外周血单个核细胞来自45名供体 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-07 |
Molecular transitions in early progenitors during human cord blood hematopoiesis
2018-03-15, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20178041
PMID:29545397
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研究论文 | 本研究利用Drop-seq技术对人类脐带血中的20,000个前体细胞进行单细胞RNA测序，揭示了脐带血中前体细胞状态的转录组图谱及其命运承诺的转录动力学 | 首次在人类脐带血中使用Drop-seq技术进行大规模单细胞RNA测序，揭示了前体细胞的转录组图谱和命运承诺的动态过程 | NA | 深入理解人类脐带血造血过程中早期前体细胞的分子转变 | 人类脐带血中的前体细胞 | NA | NA | Drop-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-07 |
TALK-1 reduces delta-cell endoplasmic reticulum and cytoplasmic calcium levels limiting somatostatin secretion
2018-03, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2018.01.016
PMID:29402588
|
研究论文 | 本文研究了TALK-1通道在δ细胞中的作用，特别是其对内质网和细胞质钙水平的影响，以及对生长抑素分泌的限制作用。 | 首次揭示了TALK-1通道在δ细胞中的生理功能，即通过调节内质网钙泄漏来影响钙处理和生长抑素分泌。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证TALK-1通道的作用。 | 探讨TALK-1通道在δ细胞中的功能及其对生长抑素分泌和内质网钙水平的调节作用。 | TALK-1通道在δ细胞中的表达和功能。 | NA | 糖尿病 | 免疫荧光、膜片钳电生理学、钙成像和激素分泌测定 | NA | 细胞内钙水平数据 | 控制组和TALK-1通道缺陷（TALK-1 KO）小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-07 |
Population snapshots predict early haematopoietic and erythroid hierarchies
2018-03-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25741
PMID:29466336
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组学、命运分析和一种从群体快照预测细胞命运的理论，展示了小鼠造血祖细胞通过连续的层次结构分化为七个血系的早期造血和红细胞层次结构 | 揭示了红细胞和嗜碱/肥大细胞命运之间的耦合，以及对红细胞应激的全球造血反应，并发现了调节红细胞生成的新型生长因子受体 | NA | 重建干细胞生物学中红细胞分化的步骤 | 小鼠造血祖细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 预测性命运模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-07 |
Characterizing the replicability of cell types defined by single cell RNA-sequencing data using MetaNeighbor
2018-02-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03282-0
PMID:29491377
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MetaNeighbor的复制框架，用于量化单细胞RNA测序数据中细胞类型的跨数据集复制程度，并快速识别高度相似的集群 | 提出了MetaNeighbor框架，用于评估和提高单细胞RNA测序数据的复制性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中细胞类型的复制性，并定义最佳实践 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型复制性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8个技术性和生物多样性不同的数据集，45个中间神经元亚型中的24个 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-07 |
An Efficient Single-Cell RNA-Seq Approach to Identify Neoantigen-Specific T Cell Receptors
2018-02-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2017.10.018
PMID:29174843
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研究论文 | 本文提出了一种新的治疗策略，通过遗传修饰自体T细胞与新抗原特异性T细胞受体（TCRs）并将其转移回癌症患者，以提高针对肿瘤特异性突变的T细胞疗法的疗效 | 开发了一种新的方法，通过TILs与TMG转染或肽脉冲的自体抗原呈递细胞（APCs）共培养，并进行单细胞RNA测序分析T细胞，以识别与高表达IFN-γ和IL-2细胞相关的配对TCR序列 | 目前的分离新抗原特异性TCRs的技术耗时且技术挑战大，不适合临床应用 | 提高针对肿瘤特异性突变的T细胞疗法的疗效 | 新抗原特异性T细胞受体（TCRs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 多个TCRs被识别、合成、克隆并转导到供体T细胞中 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-07 |
A stochastic and dynamical view of pluripotency in mouse embryonic stem cells
2018-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006000
PMID:29451874
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研究论文 | 本文开发了一个框架，将布尔级别的网络拓扑结构扩展为更高分辨率的网络模型，明确考虑了启动子结构和基因状态切换动力学 | 提出了一个系统的方法，将布尔级别的网络拓扑结构扩展为更高分辨率的网络模型，明确考虑了启动子结构和基因状态切换动力学 | 文章未明确提及现有方法的局限性 | 研究胚胎干细胞多能性状态的动态和分子随机性 | 胚胎干细胞的多能性状态及其调控网络 | 生物医学科学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习方法 | 基因网络拓扑结构 | 未明确提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-07 |
Genome organization and DNA accessibility control antigenic variation in trypanosomes
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0619-8
PMID:30333624
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研究论文 | 本文研究了布氏锥虫中基因组组织和DNA可及性控制抗原变异的现象 | 首次在布氏锥虫中识别了连接全局基因组结构、局部染色质构象和抗原变异的分子机制，即组蛋白变异体 | 研究受限于抗原基因阵列的高度重复性和杂合性，这阻碍了许多病原体的完整基因组组装 | 探讨基因组结构在抗原变异中的作用 | 布氏锥虫的抗原基因阵列及其基因组结构 | 基因组学 | 寄生虫病 | 长读长测序技术、染色体构象捕获(Hi-C) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-07 |
Dimensionality reduction for visualizing single-cell data using UMAP
2018-Dec-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4314
PMID:30531897
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研究论文 | 本文应用UMAP（一种非线性降维技术）于生物数据分析，通过三个已验证的质谱流式细胞术和单细胞RNA测序数据集，比较UMAP与其他五种工具的性能 | UMAP提供了最快的运行时间、最高的可重复性和最有意义的细胞簇组织 | NA | 改进单细胞数据的可视化和解释 | 单细胞数据分析 | 计算机视觉 | NA | UMAP | NA | 数据 | 三个已验证的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-07 |
Identification of spatially associated subpopulations by combining scRNAseq and sequential fluorescence in situ hybridization data
2018-Oct-29, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4260
PMID:30371680
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研究论文 | 本文开发了一种方法，通过整合基于测序和成像的单细胞转录组数据，结合跨平台细胞类型映射和隐马尔可夫随机场模型，来区分内在和外在因素对全局基因表达的影响 | 本文首次通过结合scRNAseq和荧光原位杂交数据，识别了与空间相关且细胞类型独立的特征，并发现了先前未知的与空间相关的亚群 | NA | 研究内在基因调控网络如何与细胞的空间环境相互作用以定义其身份 | 小鼠视觉皮层区域的细胞类型和空间域相关异质性 | 数字病理学 | NA | scRNAseq, 荧光原位杂交 | 隐马尔可夫随机场模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠视觉皮层区域的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-07 |
Structure-Aware Principal Component Analysis for Single-Cell RNA-seq Data
2018-Aug-22, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2018.0027
PMID:30133312
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研究论文 | 本文提出了一种结构感知的主成分分析（LSPCA）方法，用于处理单细胞RNA测序数据中的少数细胞类型识别问题 | LSPCA通过结构感知的数据采样，减少了传统PCA在主成分方向上的偏差，提高了对少数细胞类型的检测准确性 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据中少数细胞类型的识别 | 单细胞RNA测序数据中的少数细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 表达数据 | 涉及十个公开可用的单细胞表达数据集，包括一个非常大的注释数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of lineage diversity in high-grade glioma
2018-07-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0567-9
PMID:30041684
|
研究论文 | 本研究通过高密度微孔系统对分离的人体手术样本进行大规模单细胞RNA测序，分析高级别胶质瘤（HGG）中的细胞系多样性 | 首次揭示了高级别胶质瘤中细胞身份与增殖之间的关系，并发现恶性转化细胞中神经与非神经系相似性的不同群体结构 | NA | 深入理解高级别胶质瘤中的细胞系身份、分化和增殖 | 高级别胶质瘤（HGG）细胞及其微环境细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 图论方法 | 转录组 | 多个分离的人体手术样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-07 |
Gli3 is a negative regulator of Tas1r3-expressing taste cells
2018-02, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007058
PMID:29415007
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研究论文 | 研究探讨了Gli3在味觉细胞再生中的作用，特别是在Tas1r3表达的味觉受体细胞中的表达和功能 | 首次揭示了Gli3作为抑制因子在成年后舌味觉细胞再生中的作用，特别是在Tas1r3+细胞中的作用 | 研究主要集中在后舌的味觉细胞，前舌的情况未详细探讨 | 探究Gli3在成年后舌味觉细胞再生中的作用及其对味觉功能的影响 | 小鼠的味觉细胞和味觉干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、PCR和免疫组织化学 | NA | RNA | Gli3CKO和Gli3WT小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-07 |
The European Bioinformatics Institute in 2017: data coordination and integration
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx1154
PMID:29186510
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research paper | 本文介绍了欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）在2017年如何通过提供开放数据、开源软件和分析工具以及技术基础设施来支持全球生命科学研究，并整合日益多样化的数据类型 | EMBL-EBI通过整合高质量的生物成像、生物银行和其他类型的分子数据，以及参与Open Targets、植物表型标准（MIAPPE）和人类细胞图谱数据协调平台等项目，展示了其在数据整合和服务开发方面的深入参与 | NA | 支持全球生命科学研究，整合多样化数据类型，以便各学科的生物学家能够更详细地探索生命 | EMBL-EBI提供的开放数据、开源软件、分析工具和技术基础设施 | 生物信息学 | NA | 细胞成像和单细胞测序技术 | NA | 高维数据 | 数据存储量在不到两年内翻倍至120PB | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the mechanism for a breast cancer prognostic gene panel
2018-Sep-07, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.26044
PMID:30279960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 首次详细描述了MammaPrint签名基因在细胞周期中的精细扰动，并发现这些基因的细胞周期活动与临床预后相关 | NA | 探讨乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 乳腺癌细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 70个MammaPrint签名基因中的38个 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-07 |
Induced pluripotent stem cell-based mapping of β-globin expression throughout human erythropoietic development
2018-08-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2018020560
PMID:30108108
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研究论文 | 本文报道了一种基于诱导多能干细胞（iPSCs）的β-珠蛋白报告细胞系，该细胞系能够在单细胞分辨率下实时映射人类红细胞生成过程中β-珠蛋白的表达 | 通过结合单细胞RNA测序（scRNAseq），本文能够区分β-珠蛋白表达细胞的特征，并解析iPSC衍生红细胞系细胞的发育和成熟状态 | NA | 提高β-珠蛋白表达的量化，并解析其在人类红细胞生成中的作用 | 诱导多能干细胞衍生的红细胞系细胞中的β-珠蛋白表达 | 再生医学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 单细胞分辨率 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-07 |
Patch-Seq Protocol to Analyze the Electrophysiology, Morphology and Transcriptome of Whole Single Neurons Derived From Human Pluripotent Stem Cells
2018, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2018.00261
PMID:30147644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Patch-seq的新方法，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、膜片钳电生理记录和形态学分析，用于全面分析从人多能干细胞衍生的单个神经元的电生理、形态和转录组特征。 | Patch-seq方法的创新之处在于它能够同时进行多模态的神经元分析，揭示功能特性、形态和基因表达之间的联系。 | NA | 研究目的是通过Patch-seq方法深入剖析神经元的类型和状态，揭示人类神经多样性的分子基础，并探索脑部疾病的细胞机制。 | 研究对象是从人胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的单个神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 研究中使用了从健康受试者衍生的胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的神经元。 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-07 |
A cloning and expression system to probe T-cell receptor specificity and assess functional avidity to neoantigens
2018-11-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-04-843763
PMID:30150207
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研究论文 | 本文开发了一种简化的方法，通过按需克隆和表达T细胞受体（TCR）并针对候选抗原进行筛选，来匹配TCR序列与相应抗原，以评估发现的TCR的特异性 | 本文提出的系统能够快速评估重建TCR的抗原特异性和功能亲和力，可用于监测抗原特异性T细胞反应，并可能指导基于T细胞的免疫疗法的设计 | NA | 提高对抗原-T细胞受体（TCR）相互作用的理解，以生成强效的抗肿瘤免疫反应 | T细胞受体的特异性和功能亲和力 | 免疫学 | 黑色素瘤，慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 来自接受个性化新抗原疫苗治疗的黑色素瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-07 |
Large-scale reconstruction of cell lineages using single-cell readout of transcriptomes and CRISPR-Cas9 barcodes by scGESTALT
2018-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-018-0058-x
PMID:30353175
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGESTALT的方法，该方法结合CRISPR-Cas9的累积编辑和基于液滴的单细胞RNA测序，用于大规模重建细胞系谱关系。 | scGESTALT技术通过在多个时间点使用Cas9和单导向RNA（sgRNAs）进行编辑，生成条形码阵列的编辑，从而与类似的Cas9系谱追踪方法区分开来。 | 生成转基因线需要6个月，进行条形码编辑和生成单细胞文库需要7天的手动操作时间。 | 提供一个可扩展的平台，用于在任何允许发育、再生或疾病期间进行基因组编辑的系统中映射细胞类型之间的系谱关系。 | 重建发育过程中产生的大量异质细胞类型的系谱关系。 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 数千个细胞转录组和记录的系谱 | NA | NA | NA | NA |