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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Sensory Neuron Diversity in the Inner Ear Is Shaped by Activity
2018-08-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.07.007
PMID:30078709
|
研究论文 | 这篇文章探讨了内耳感觉神经元的多样性及其被活动影响的机制 | 通过单细胞RNA测序,提出了一种小鼠I型螺旋神经节神经元的分子分类,并揭示了其在听觉处理中意想不到的活跃角色 | 研究主要集中在小鼠模型,可能不完全适用于其他物种 | 研究I型螺旋神经节神经元的特征与多样性的起源 | 小鼠的类型I螺旋神经节神经元 | 数字病理学 | 先天性耳聋 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | 小鼠模型的多种类型I螺旋神经节神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of early progenitor cells that build coronary arteries
2018-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0288-7
PMID:29973725
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和小鼠遗传学展示了发育心脏中的静脉细胞如何经过早期细胞命运转换,形成构建冠状动脉的前动脉细胞群。 | 揭示了静脉细胞如何在发育过程中转变为前动脉细胞,并阐明了COUP-TF2对这一过程的抑制作用 | 未提及特定的限制性因素 | 研究冠状动脉的发育机制与静脉细胞的转变 | 静脉细胞和前动脉细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-05 |
High-Throughput Screening Enhances Kidney Organoid Differentiation from Human Pluripotent Stem Cells and Enables Automated Multidimensional Phenotyping
2018-Jun-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.04.022
PMID:29779890
|
研究论文 | 本文提出了一种全自动化的高通量筛选平台,用于增强人类肾脏类器官的分化和表型分析 | 开发了一个完全自动化且兼容高通量筛选的系统,能够在21天内实现从培养到分析的全流程自动化 | 未提及任何特定的限制 | 研究人类肾脏类器官的分化和多维表型筛选 | 人类诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾囊性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-05 |
Successful Anti-PD-1 Cancer Immunotherapy Requires T Cell-Dendritic Cell Crosstalk Involving the Cytokines IFN-γ and IL-12
2018-12-18, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.09.024
PMID:30552023
|
研究论文 | 本研究揭示了抗PD-1免疫疗法中T细胞与树突细胞之间的相互作用及其依赖的细胞因子IFN-γ和IL-12 | 揭示了树突细胞产生IL-12的机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 本研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 研究抗PD-1免疫疗法在肿瘤内的作用机制 | 重点研究肿瘤浸润性树突细胞的功能和T细胞的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和活体实时成像 | 小鼠模型 | 细胞和分子水平的数据 | 特定小鼠模型的树突细胞样本,具体数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
Renal compartment-specific genetic variation analyses identify new pathways in chronic kidney disease
2018-11, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-018-0194-4
PMID:30275566
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研究论文 | 本文探讨了肾脏慢性疾病的基因变异及相关通路 | 通过建立肾脏不同部分的表达数量性状位点(eQTL)图谱,识别了与慢性肾病相关的新基因 | GWAS结果的生物学基础仍然不够清晰 | 识别与慢性肾病发展相关的新基因和细胞通路 | 人类肾脏的肾小球和肾小管部分 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、表达数量性状位点图谱 | NA | 基因组数据、RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-05 |
LC3-Associated Phagocytosis in Myeloid Cells Promotes Tumor Immune Tolerance
2018-10-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.08.061
PMID:30245008
|
研究论文 | 本文展示了髓系细胞中的LC3相关吞噬作用在肿瘤免疫耐受中的作用 | 研究指出LAP在髓系细胞中影响肿瘤生长,而不仅仅是经典自噬 | 本文未探讨不同类型肿瘤对LAP的影响 | 探讨自噬在肿瘤微环境中的不同功能及其对免疫反应的影响 | 研究重点为肿瘤相关巨噬细胞及其对肿瘤细胞的吞噬作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
Regulated Capture of Vκ Gene Topologically Associating Domains by Transcription Factories
2018-08-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.07.091
PMID:30157436
|
研究论文 | 本文探讨了淋巴细胞抗原受体多样性表达的机制,重点研究了Vκ基因的转录和重组过程 | 该研究首次揭示了Vκ基因如何通过转录工厂在核矩阵上被选择性捕获,从而实现单拷贝基因的转录 | 本文未提供单细胞转录组数据的详细样本量和具体实验条件 | 研究Vκ基因在淋巴细胞中的单拷贝转录与重组的机制 | 研究对象为预B细胞中Vκ基因的转录和重组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing
2018-05-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.03.041
PMID:29681456
|
研究论文 | 该文章探讨了三阴性乳腺癌中的化疗耐药性演变 | 该研究使用单细胞测序揭示了耐药基因型的存在与适应选择 | 样本数量较小,仅涉及20名患者,可能限制了结论的普遍性 | 研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗中的耐药性机制 | 20名接受新辅助化疗的三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA和RNA测序,整体外显子组测序 | NA | 细胞数据 | 20名三阴性乳腺癌患者,分析900个单细胞和6862个单细胞RNA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-05 |
Developmental and oncogenic programs in H3K27M gliomas dissected by single-cell RNA-seq
2018-04-20, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4750
PMID:29674595
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了H3K27M胶质瘤中的致癌和发育程序。 | 首次使用单细胞分辨率解析H3K27M胶质瘤的细胞架构和发育程序,提供了潜在的治疗靶点。 | 研究仅在六个原发H3K27M胶质瘤模型中进行,样本数量相对较少,可能限制结果的普适性。 | 探索H3K27M胶质瘤的细胞组成及其发展机制。 | 本研究的对象为六个原发H3K27M胶质瘤和相匹配的模型中的细胞。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 3321个细胞来自六个原发H3K27M胶质瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-05 |
Depletion of Maternal Cyclin B3 Contributes to Zygotic Genome Activation in the Ciona Embryo
2018-04-02, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2018.02.046
PMID:29576477
|
研究论文 | 本文探讨了母体Cyclin B3在Ciona胚胎中对合子基因组激活的影响 | 揭示母体Cyclin B3在合子转录激活过程中的重要作用 | 研究主要基于Ciona intestinalis,可能不适用于所有动物 | 探索Ciona胚胎中合子基因组激活的机制 | Ciona intestinalis的胚胎 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 8细胞和16细胞阶段的胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-05 |
Developmental diversification of cortical inhibitory interneurons
2018-03-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25999
PMID:29513653
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研究论文 | 本文探讨了皮层抑制性中间神经元的发育多样性及其生成机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了小鼠细胞的转录组异质性及其在发育过程中的动态变化 | NA | 研究皮层内神经元如何在发育过程中产生多样性 | 小鼠的皮层抑制性中间神经元及其前体细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠细胞沿发展时间过程的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-05 |
A Novel Approach to Single Cell RNA-Sequence Analysis Facilitates In Silico Gene Reporting of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retinal Cell Types
2018-03, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2755
PMID:29230913
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研究论文 | 本研究提出了一种新的单细胞RNA测序分析方法,以促进对人类多能干细胞衍生视网膜细胞类型的基因报告。 | 创新点在于开发了一种简单、通用的方法,通过排名单个细胞的基因表达水平来生成与报告基因线相似的表达数据。 | 传统单细胞RNA测序分析方法基于无偏算法的应用未能揭示结果,可能限制了细胞鉴定的明确性。 | 研究旨在分析人类多能干细胞衍生的多种视网膜细胞类型的基因表达谱。 | 研究对象为人类多能干细胞衍生的视网膜细胞类型及其基因表达特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自光感受器样结构的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of experience-dependent transcriptomic states in the mouse visual cortex
2018-01, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-017-0029-5
PMID:29230054
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研究论文 | 本文探讨了小鼠视觉皮层中经历依赖的转录组状态的单细胞分析 | 识别了30种细胞类型中显著且不同的刺激响应,揭示了611个刺激响应基因 | 尚缺乏对所有皮层细胞类型转录响应多样性的全面理解 | 研究小鼠视觉皮层在光照刺激后的转录变化 | 小鼠视觉皮层中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 发育性脑障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Uncovers a Robust Transcriptional Response to Morphine by Glia
2018-09-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.08.080
PMID:30257220
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研究论文 | 本研究揭示了胶质细胞对吗啡的转录反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了少突胶质细胞和星形胶质细胞对吗啡的特异性转录响应 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能无法直接推广到其他物种 | 调查特定细胞类型对吗啡的转录反应 | 小鼠的核壳,特别关注少突胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 药物成瘾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠的核壳样本,数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
Power in Numbers: Single-Cell RNA-Seq Strategies to Dissect Complex Tissues
2018-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序在解析复杂组织中的应用 | 单细胞RNA测序提供了以新的方式测量表型的机会,有助于基因功能的细化和多效性剖析 | NA | 研究单细胞RNA测序在机体解剖和发育动态分析中的潜力 | 复杂组织中的稀有细胞状态和发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-05 |
Linking single-cell measurements of mass, growth rate, and gene expression
2018-11-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1576-0
PMID:30482222
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研究论文 | 本文介绍了一种微流体平台,可直接测量单细胞质量和生长速率。 | 创新之处在于将单细胞质量和生长速率的测量与高倍单细胞分析技术结合起来 | 未提及特定的局限性 | 研究单细胞生理特征与转录特征之间的关系 | 研究L1210和FL5.12细胞系及激活的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 微流体平台 | NA | NA | 涉及的细胞系包括L1210、FL5.12和患者来源的胶质母细胞瘤细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-07 |
An integrative approach for building personalized gene regulatory networks for precision medicine
2018-12-19, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0608-4
PMID:30567569
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研究论文 | 本文提出了一种综合方法,利用单细胞数据和批量数据的敏感性,重建个性化、细胞类型和上下文特定的基因调控网络 | 利用RNA速度、同时研究数十万细胞的能力和单细胞测序成本的下降,构建基因调控网络 | NA | 开发一种综合方法,以实现精准医疗 | 个性化基因调控网络 | 精准医疗 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 数十万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
Understanding tumor ecosystems by single-cell sequencing: promises and limitations
2018-12-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1593-z
PMID:30509292
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在理解肿瘤生态系统中的应用及其局限性 | 单细胞测序技术揭示了肿瘤内和肿瘤间的细胞异质性,为癌症进化、转移、耐药性和肿瘤微环境研究带来了新发现 | 单细胞测序技术仍存在局限性,包括技术挑战和潜在应用的限制 | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的最新进展和局限性及其潜在应用 | 肿瘤生态系统和癌症研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、表观基因组、转录组和多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
Missing data and technical variability in single-cell RNA-sequencing experiments
2018-10-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxx053
PMID:29121214
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研究论文 | 本文通过评估实验分析了已发表研究中的单细胞RNA测序数据,揭示了系统误差对细胞间表达变异性的影响 | 本文首次详细探讨了单细胞RNA测序中技术变异导致的零表达问题,并展示了这种技术变异如何与新的生物学结果混淆 | 本文主要关注技术变异对单细胞RNA测序数据的影响,未深入探讨生物学变异的作用 | 研究单细胞RNA测序实验中的数据缺失和技术变异性问题 | 单细胞RNA测序数据中的零表达和技术变异性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个已发表研究的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
Using single nucleotide variations in single-cell RNA-seq to identify subpopulations and genotype-phenotype linkage
2018-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-07170-5
PMID:30459309
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研究论文 | 本文提出使用单细胞RNA测序中的有效且表达的核苷酸变异(eeSNVs)作为肿瘤亚群识别的替代特征,并开发了SSrGE线性建模框架来关联eeSNVs与基因表达。 | 首次使用eeSNVs作为单细胞RNA测序数据中的特征进行肿瘤亚群识别,并开发了SSrGE框架来整合多组学单细胞技术。 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中亚群识别的准确性,并探索基因型-表型关联。 | 单细胞RNA测序数据中的eeSNVs及其在肿瘤亚群识别和基因型-表型关联中的应用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |