单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Defining the earliest step of cardiovascular lineage segregation by single-cell RNA-seq
2018-03-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4174
PMID:29371425
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠心血管祖细胞在早期发育阶段的谱系分离机制 | 首次在单细胞水平上定义了心血管祖细胞从多能状态退出的最早步骤，并识别了与不同心脏区域和细胞谱系承诺相关的分子特征 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 阐明心血管祖细胞早期区域和谱系分离的分子调控机制 | 野生型和Mesp1缺失型小鼠的心血管祖细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心血管祖细胞单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Observation weights unlock bulk RNA-seq tools for zero inflation and single-cell applications
2018-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1406-4
PMID:29478411
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研究论文 | 本文提出一种基于零膨胀负二项模型的加权策略，使传统bulk RNA-seq差异表达分析方法适用于单细胞RNA测序数据 | 开发了基因和细胞特异性权重策略，首次实现将传统bulk RNA-seq工具应用于零膨胀的单细胞RNA测序数据 | NA | 解决单细胞RNA测序中零膨胀导致的差异表达分析能力下降问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
scNMT-seq enables joint profiling of chromatin accessibility DNA methylation and transcription in single cells
2018-02-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03149-4
PMID:29472610
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研究论文 | 开发了一种可同时分析单细胞染色质可及性、DNA甲基化和转录组的测序方法 | 首次实现了在单细胞水平上同时分析三种分子层面（染色质可及性、DNA甲基化和转录组）的方法 | NA | 研究表观基因组与转录组之间的调控关系 | 小鼠胚胎干细胞分化过程 | 表观基因组学 | NA | scNMT-seq, GpC甲基转移酶标记, 亚硫酸氢盐测序, RNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | scNMT-seq（单细胞核小体、甲基化和转录测序） |
| 64 | 2025-10-06 |
A molecular atlas of cell types and zonation in the brain vasculature
2018-02-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25739
PMID:29443965
|
研究论文 | 通过血管单细胞转录组学绘制小鼠大脑血管系统的细胞类型和分区图谱 | 首次在分子水平定义大脑血管主要细胞类型，揭示沿动静脉轴的连续表型变化模式，发现内皮细胞与壁细胞的连续模式差异 | 研究仅限于成年小鼠模型，人类血管系统可能存在差异 | 解析大脑血管系统的细胞组成和组织结构 | 成年小鼠大脑血管系统 | 单细胞生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠大脑血管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Graded Arrays of Spinal and Supraspinal V2a Interneuron Subtypes Underlie Forelimb and Hindlimb Motor Control
2018-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.01.023
PMID:29398364
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓V2a中间神经元的分级阵列结构及其在前肢和后肢运动控制中的作用机制 | 首次发现V2a中间神经元存在I型和II型两种主要类型，并呈反向梯度分布，揭示了脊髓不同节段运动输出的特异性处理机制 | 研究主要基于发育过程中的观察，对成年后该系统的功能维持和可塑性需要进一步验证 | 探究脊髓中控制肢体运动的神经回路组织结构 | 小鼠脊髓V2a中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Defining murine organogenesis at single-cell resolution reveals a role for the leukotriene pathway in regulating blood progenitor formation
2018-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-017-0013-z
PMID:29311656
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制小鼠原肠胚形成后器官发生的细胞图谱，揭示白三烯途径在血液祖细胞形成中的调控作用 | 首次在原肠胚形成后阶段(E8.25)对小鼠发育进行大规模单细胞转录组分析，识别出20种主要细胞类型及其亚结构，并发现白三烯途径在造血祖细胞生成中的新功能 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎发育的特定时间点(E8.25)，未涵盖整个器官发生过程 | 解析小鼠器官发生阶段的细胞类型组成和分子调控机制 | 小鼠胚胎发育E8.25阶段的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本研究揭示了成年小鼠脑室下区神经干细胞通过感知生态位占用情况来调节自身数量的新机制 | 发现Wnt靶基因Troy可同时标记活跃和静息态神经干细胞，并证实干细胞数量在共享生态位中随时间波动的随机命运决定模型 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究神经干细胞的分子特征、自我更新潜能和命运决定机制 | 成年小鼠脑室下区神经干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因谱系追踪,命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
|
研究论文 | 提出一种通用灵活的单细胞RNA测序数据信号提取方法ZINB-WaVE | 开发了零膨胀负二项模型，能同时处理数据中的零膨胀、过度离散和计数特性 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的低维表示方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ZINB-WaVE（零膨胀负二项模型） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
|
研究论文 | 开发了一种转基因斑马鱼模型，用于在原生组织环境中分析内耳和侧线毛细胞的翻译组 | 创建了首个用于斑马鱼毛细胞特异性翻译组分析的RiboTag转基因模型，避免了组织解离导致的基因表达变化 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果向哺乳动物系统的直接转化需要进一步验证 | 开发一种能够在原生组织环境中特异性分析斑马鱼毛细胞基因表达的方法 | 斑马鱼内耳器官和侧线神经丘中的毛细胞 | 功能基因组学 | 听力障碍 | RiboTag技术，RNA-Seq，免疫沉淀 | 转基因动物模型 | 转录组数据 | 斑马鱼幼虫 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
States and Origins of Mammalian Embryonic Pluripotency In Vivo and in a Dish
2018, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2017.11.002
PMID:29477162
|
综述 | 探讨哺乳动物早期胚胎多能性状态及其在体内外的起源与维持机制 | 通过单细胞转录组学揭示不同物种胚胎发育中细胞互作与命运决定的新机制 | 主要基于比较研究，尚未建立统一的跨物种多能性理论框架 | 解析哺乳动物早期胚胎多能性的发育原理与物种差异 | 小鼠和人类等哺乳动物的早期胚胎及多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多物种胚胎样本（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Experimental design for single-cell RNA sequencing
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx035
PMID:29126257
|
综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序的实验设计原则，比较了两种主流方法的优缺点 | 系统比较了平板式Smart-Seq2和微滴式10x Chromium两种主流scRNA-seq技术的实验设计考量 | NA | 探讨单细胞RNA测序实验设计的关键因素 | 单细胞RNA测序技术 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 微滴式单细胞RNA测序平台 |
| 72 | 2025-10-06 |
TH2 cell development and function
2018-02, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/nri.2017.118
PMID:29082915
|
综述 | 本文综述了T辅助2细胞（TH2）的发育与功能机制及其在疾病中的作用 | 整合了树突状细胞、先天淋巴样细胞和上皮细胞等多种细胞来源的分子信号对TH2细胞分化的调控机制，并探讨了单细胞技术带来的新研究机遇 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 阐明TH2细胞分化机制及其在哮喘和过敏等疾病中的治疗靶点 | T辅助2细胞（TH2）及其分化调控机制 | 免疫学 | 哮喘和过敏 | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、体内细胞命运示踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-07 |
New insight into GABAergic neurons in the hypothalamic feeding regulation
2018-Nov, The journal of physiological sciences : JPS
DOI:10.1007/s12576-018-0622-8
PMID:30003408
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综述 | 综述下丘脑GABA能神经元在摄食调节中的研究进展 | 整合光遗传学、在体钙成像和单细胞RNA-seq三大前沿技术揭示GABA能神经元的多样性与摄食调控功能 | NA | 探讨下丘脑不同区域GABA能神经元在摄食调节中的作用机制 | 下丘脑弓状核(ARC)、背内侧下丘脑(DMH)和外侧下丘脑(LH)的GABA能神经元 | 神经科学 | 代谢疾病 | 光遗传学, 化学遗传学, 在体钙成像, 单细胞RNA测序 | NA | 神经活动数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2024-12-12 |
Single-cell RNA sequencing reveals microglia-like cells in cerebrospinal fluid during virologically suppressed HIV
2018-09-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.121718
PMID:30232286
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HIV感染者脑脊液和血液中的细胞，发现了与神经退行性疾病相关的微胶质样细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术在脑脊液中识别出与神经退行性疾病相关的微胶质样细胞亚群，揭示了其在HIV感染中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅限于HIV感染者，未来需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨HIV感染期间中枢神经系统免疫激活与神经元损伤的细胞机制 | HIV感染者和非感染者的脑脊液和血液中的细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成人的脑脊液和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-11-22 |
A structural equation model for imaging genetics using spatial transcriptomics
2018-Nov-02, Brain informatics
DOI:10.1186/s40708-018-0091-0
PMID:30390165
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研究论文 | 本文提出了一种结合遗传标记和影像特征的结构方程模型，利用空间转录组学数据来解释疾病背景下脑体积变化及其与遗传变异的关系 | 本文的创新点在于将空间转录组学数据引入结构方程模型，以减少噪声并提高模型的解释性 | NA | 研究遗传变异与影像变量之间的关系，特别是在疾病背景下的脑体积变化 | 脑体积变化及其与遗传变异的关系 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 结构方程模型 | 结构方程模型 | 影像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-11-15 |
Single-cell RNA sequencing of the mammalian pineal gland identifies two pinealocyte subtypes and cell type-specific daily patterns of gene expression
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0205883
PMID:30347410
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了大鼠松果体转录组，识别出两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出大鼠松果体中的两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 研究仅限于大鼠松果体，结果可能不适用于其他物种 | 通过单细胞RNA测序技术分析大鼠松果体细胞的组成及其基因表达的每日变化模式 | 大鼠松果体细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约17,000个松果体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-11-14 |
Background fluorescence and spreading error are major contributors of variability in high-dimensional flow cytometry data visualization by t-distributed stochastic neighboring embedding
2018-08, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.23566
PMID:30107099
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研究论文 | 本文探讨了在高维流式细胞术数据可视化中，背景荧光和扩散误差对t-分布随机邻域嵌入（tSNE）算法的影响 | 本文首次识别了背景值分布差异和扩散误差是高维流式细胞术数据可视化中tSNE算法的主要变异来源，并提出了通过双指数变换和限制扩散误差来改善数据可视化的方法 | 本文主要关注了背景荧光和扩散误差的影响，未全面探讨其他可能影响tSNE算法性能的因素 | 研究tSNE算法在高维流式细胞术数据可视化中的应用及其变异来源 | 高维流式细胞术数据及其在tSNE算法中的可视化效果 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术 | tSNE | 流式细胞术数据 | 多个独立实验或临床试验中的大量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-11-13 |
Rainbow-Seq: Combining Cell Lineage Tracing with Single-Cell RNA Sequencing in Preimplantation Embryos
2018-Sep-28, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2018.08.009
PMID:30267678
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研究论文 | 开发了Rainbow-seq技术，结合细胞谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示胚胎植入前胚胎的细胞分裂历史和单细胞转录组 | Rainbow-seq技术能够在单细胞RNA测序实验中同时解码谱系标记基因和读取单细胞转录组，填补了细胞分裂历史与单细胞RNA测序之间的关键空白 | 谱系差异在单个基因水平上并不明确，但在整体转录组分析中变得清晰 | 开发新技术以追踪细胞分裂历史并揭示单细胞转录组 | 胚胎植入前胚胎的细胞分裂历史和单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 每个实验涉及多个单细胞样本，包括4-细胞和8-细胞阶段的胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-11-11 |
Mapping gene regulatory networks from single-cell omics data
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx046
PMID:29342231
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综述 | 本文综述了从单细胞组学数据中构建基因调控网络（GRN）的最新方法 | 讨论了单细胞转录组数据中噪声水平和数据稀疏性增加的挑战，并介绍了单细胞表观基因组学技术（如单细胞ATAC-seq和单细胞DNA甲基化分析）在解析基因调控程序中的应用 | NA | 探讨如何从单细胞数据中解析基因调控网络，以理解细胞异质性 | 单细胞转录组数据和单细胞表观基因组数据 | 基因组学 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA甲基化分析 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding
2018-04-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam8999
PMID:29545511
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研究论文 | 本文开发了一种名为SPLiT-seq的单细胞RNA测序方法，用于对发育中的小鼠大脑和脊髓进行单细胞转录组分析 | SPLiT-seq方法通过组合条形码标记细胞来源，适用于固定细胞或细胞核，无需定制设备，并允许高效样本复用 | NA | 研究小鼠大脑和脊髓在早期发育阶段的单细胞转录组特征 | 小鼠大脑和脊髓的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156,049个单核转录组 | NA | NA | NA | NA |