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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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581 | 2024-08-09 |
VDJdb: a curated database of T-cell receptor sequences with known antigen specificity
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx760
PMID:28977646
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研究论文 | 本文介绍了VDJdb数据库,该数据库收集并整合了已知抗原特异性的T细胞受体序列,为T细胞受体谱数据注释提供了一个通用平台 | VDJdb数据库整合了已发表的T细胞特异性检测结果,将抗原特异性与T细胞受体序列相结合,为T细胞受体谱数据注释提供了一个多功能工具 | NA | 旨在解码T细胞受体基因序列中包含的抗原特异性,以加深对适应性免疫系统的理解,并推动转化医学领域的发展 | T细胞受体序列及其抗原特异性 | 生物信息学 | NA | 免疫谱系测序技术(RepSeq),单细胞RNA测序技术 | NA | 序列数据 | 大量从供体样本中获得的T细胞受体序列 |
582 | 2024-08-09 |
Functional genomics of stromal cells in chronic inflammatory diseases
2018-Jan, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000455
PMID:28984647
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综述 | 本文综述了利用功能基因组学和单细胞技术研究慢性炎症疾病中基质细胞的最新进展 | 采用高维策略如mRNA测序、质谱流式细胞术和荧光激活细胞分选,提供了对类风湿关节炎、炎症性肠病和癌症中病变组织的详细视图 | NA | 探讨基质细胞在慢性炎症疾病中的功能和病理作用 | 基质细胞,包括成纤维细胞、内皮细胞、周细胞和间充质前体细胞 | 功能基因组学 | 炎症性疾病 | mRNA测序、质谱流式细胞术、荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞RNA-seq | 大量患者组织样本 |
583 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing to quantify genomic integrity in cancer
2018-01, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.09.016
PMID:28951245
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综述 | 本文综述了单细胞DNA测序(sc-seq)技术在癌症诊断、预后和治疗中的最新进展及其对改善癌症患者护理的潜在贡献 | sc-seq技术使得能够研究来自原发肿瘤、转移瘤和循环肿瘤细胞的单个癌细胞基因组,揭示了其他方法无法检测到的肿瘤间和肿瘤内异质性 | NA | 探讨sc-seq技术在癌症诊断和治疗中的应用及未来展望 | 单细胞DNA测序技术及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞DNA测序(sc-seq) | NA | 基因组数据 | NA |
584 | 2024-08-09 |
Lessons from single-cell transcriptome analysis of oxygen-sensing cells
2018-05, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-017-2682-0
PMID:28887696
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在氧感应细胞转录组分析中的应用 | 单细胞RNA测序技术为小而异质性的组织如氧感应细胞提供了革命性的无偏见方法,用于识别关键分子 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增进对氧感应细胞的理解 | 氧感应细胞及其在颈动脉体和嗅觉系统中的机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
585 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing to explore immune cell heterogeneity
2018-01, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/nri.2017.76
PMID:28787399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在探索免疫细胞异质性方面的应用 | 讨论了如何利用scRNA-seq技术解析免疫系统的异质性,包括识别健康和疾病中的新型免疫细胞亚群,描述细胞群体内的随机异质性,以及构建免疫细胞的发育‘轨迹’ | NA | 探讨scRNA-seq技术在解析免疫系统异质性方面的应用及未来发展方向 | 免疫细胞的异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
586 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals gene signatures and alterations associated with aging in distinct neural stem/progenitor cell subpopulations
2018-04, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-017-0450-2
PMID:28748452
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研究论文 | 本研究利用群体和单细胞转录组分析,揭示了衰老大脑中神经干细胞/祖细胞(NSC/NPCs)亚群的基因特征和改变 | 首次使用群体和单细胞转录组分析方法,揭示了不同NSC/NPCs与其微环境在衰老大脑中的分子相互作用 | 研究仅限于小鼠前脑的室管膜和室下区域,可能不适用于其他物种或其他脑区 | 探索衰老过程中神经干细胞/祖细胞亚群的分子机制 | 神经干细胞/祖细胞(NSC/NPCs)及其在衰老大脑中的分子变化 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的前脑室管膜和室下区域样本 |
587 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications
2018-02, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2017.07.003
PMID:28754496
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综述 | 本文综述了自2009年以来发展的单细胞RNA测序技术及其在不同生物学背景下的应用 | 单细胞RNA测序技术为从头发现细胞异质性和细胞类型/状态提供了巨大潜力 | NA | 总结和比较单细胞RNA测序技术,并讨论其在不同生物学背景下的应用 | 单细胞RNA测序技术及其应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
588 | 2024-08-09 |
Can single-cell RNA sequencing crack the mystery of cells?
2018-02, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-017-9404-y
PMID:28733864
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
589 | 2024-08-09 |
Vibrissa sensory neurons: Linking distinct morphology to specific physiology and function
2018-Jan-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本文探讨了啮齿动物的触须感觉神经元,通过形态学和电生理特征的结合,研究其生理特性和功能 | 文章提出使用单细胞转录组测序和光遗传学辅助的在体电生理技术,填补了触须感觉系统中形态学定义的神经元类型与其生理特性和功能之间的知识空白 | NA | 旨在揭示触须感觉神经元的形态学特征与其生理功能之间的联系 | 啮齿动物的触须感觉神经元及其在物体定位和辨别中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序,光遗传学 | NA | 电生理记录 | 多个不同类型的三叉神经(TG)感觉神经元 |
590 | 2024-08-09 |
Somatosensory Neuron Typing with High-Coverage Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis
2018-Feb, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-017-0147-9
PMID:28612318
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序和功能分析的背根神经节(DRG)神经元分类方法及其在体感神经元研究中的应用 | 介绍了基于单细胞RNA测序和功能分析的DRG神经元分类方法 | NA | 探讨体感神经元的基因表达谱及其在体感信号生成、传递和调控中的作用 | 背根神经节(DRG)神经元的基因表达和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
591 | 2024-08-09 |
DNA copy number profiling using single-cell sequencing
2018-09-28, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbx004
PMID:28159966
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研究论文 | 本文介绍了一种新的工具包SCNV,用于从单细胞DNA测序数据中检测拷贝数变异并构建全基因组拷贝数图谱 | SCNV采用了一种高效的无需分箱的分割方法,提供了最高分辨率的断点检测和随后的拷贝数调用 | NA | 开发用于单细胞DNA测序数据中拷贝数变异检测和全基因组拷贝数图谱构建的软件工具 | 单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 一组来自同一批次的正常细胞 |