单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Cellular Diversity and Intercommunication in the Mouse Heart
2018-01-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.072
PMID:29346760
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏非心肌细胞的转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络 | 本研究首次详细分析了小鼠心脏非心肌细胞的单细胞转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络，并发现了心脏基因表达中的性别二态性 | NA | 理解心脏发育和正常器官功能，并为制定精确的治疗策略以对抗心脏病提供基础 | 小鼠心脏的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 542 | 2024-08-09 |
Early B cell changes predict autoimmunity following combination immune checkpoint blockade
2018-02-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI96798
PMID:29309048
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研究论文 | 本文分析了黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后B细胞的变化，发现联合免疫检查点阻断（CCB）治疗导致循环B细胞数量下降及CD21lo B细胞和浆细胞样细胞增加，这些早期B细胞变化与免疫相关不良事件（IRAEs）的发生频率和时间相关。 | 首次揭示了CCB治疗后B细胞的早期变化与IRAEs风险增加之间的关系，并提出通过靶向B细胞的预防策略可能减少这些患者的毒性反应。 | NA | 研究CCB治疗后B细胞的变化及其与免疫相关不良事件的关系。 | 黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后的B细胞变化。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 543 | 2024-08-09 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本文提出了一种模型，其中活跃的神经干细胞（NSCs）的命运与共享微环境中邻近NSCs的总数相关联 | 使用敲入报告基因和单细胞RNA测序技术，发现Wnt靶标Troy可以识别活跃和静止的NSCs，并揭示了NSCs在稳态或损伤响应中的快速扩增和部分返回静止状态的行为 | NSCs的分子特征、自我更新能力和命运行为仍未完全明确 | 研究神经干细胞在成年小鼠侧脑室下区的微环境中的行为和调控机制 | 神经干细胞（NSCs）及其在微环境中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 成年小鼠的神经干细胞 |
| 544 | 2024-08-09 |
Reply to Edemir: Physiological regulation and single-cell RNA sequencing
2018-01-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1720333115
PMID:29311339
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-08-09 |
The epigenetic control of stemness in CD8+ T cell fate commitment
2018-Jan-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah6499
PMID:29326266
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白甲基转移酶Suv39h1在感染后激活的小鼠CD8 T细胞中通过H3K9三甲基化调控干细胞相关记忆基因表达的作用 | 首次揭示了Suv39h1在CD8 T细胞效应分化过程中通过标记染色质沉默干细胞/记忆基因的关键作用 | NA | 探究染色质动态变化如何影响基因表达程序，进而控制CD8+ T细胞的命运承诺 | CD8+ T细胞的命运承诺及其与干细胞特性的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠CD8 T细胞 |
| 546 | 2024-08-09 |
Clonal analysis of lineage fate in native haematopoiesis
2018-01-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25168
PMID:29323290
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研究论文 | 本研究使用转座子标记技术在未受干扰的造血过程中对前体细胞和干细胞的命运进行克隆追踪 | 研究揭示了在未受干扰的造血过程中，巨核细胞谱系主要独立于其他造血命运，并表明传统的长期造血干细胞是巨核细胞限制性前体细胞的重要来源 | NA | 探讨在未受干扰的造血过程中，造血干细胞和多能前体细胞的谱系命运 | 造血干细胞和多能前体细胞 | NA | NA | 转座子标记技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 547 | 2024-08-09 |
Exploration of the Germline Genome of the Ciliate Chilodonella uncinata through Single-Cell Omics (Transcriptomics and Genomics)
2018-01-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01836-17
PMID:29317511
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术探索纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组结构 | 首次使用单细胞转录组学和基因组学技术，克服了获取纯化生殖系DNA的困难，揭示了奇洛登尼亚生殖系基因组的结构特征 | 研究仅限于奇洛登尼亚这一种纤毛虫，且依赖于其高度碎片化的体细胞基因组 | 探索纤毛虫生殖系与体细胞基因组之间的基因组重排进化 | 纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 有限数量的奇洛登尼亚样本 |
| 548 | 2024-08-09 |
Variation in Activity State, Axonal Projection, and Position Define the Transcriptional Identity of Individual Neocortical Projection Neurons
2018-01-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.046
PMID:29320739
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研究论文 | 本文通过比较单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达谱，揭示了转录子类型主要反映了轴突投射模式、皮质层位置和神经元活动状态 | 本文首次展示了轴突投射模式、皮质层位置和活动状态如何定义个体神经元的转录身份及其在每个神经元亚型中的转录异质性 | NA | 探讨细胞过程如何贡献于神经元亚型指定和转录异质性 | 单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,023个细胞响应 |
| 549 | 2024-08-09 |
Single-Cell Expression Profiling and Proteomics of Primordial Germ Cells, Spermatogonial Stem Cells, Adult Germ Stem Cells, and Oocytes
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/5584_2017_117
PMID:29299873
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综述 | 本文综述了利用现代分子技术对不同类型的人类生殖细胞进行单细胞表达谱和蛋白质组学分析的研究进展 | 介绍了针对单细胞分析优化的现代分子技术，如单细胞荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）等 | NA | 探讨和理解生殖细胞和干细胞的分子基础、细胞命运可塑性和决定机制 | 原始生殖细胞（PGCs）、精原干细胞（SSCs）、成人生殖干细胞（haGSCs）和卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）、液相色谱-串联质谱（LC-MSMS） | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA |
| 550 | 2024-08-09 |
visnormsc: A Graphical User Interface to Normalize Single-cell RNA Sequencing Data
2018-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-017-0277-9
PMID:29280088
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研究论文 | 本文介绍了一个名为 visnormsc 的图形用户界面，用于标准化单细胞 RNA 测序数据 | 提供了一个用户友好的替代方案，使得不具备 R 编程能力的生物学家也能轻松使用 | NA | 简化单细胞 RNA 测序数据的标准化过程 | 单细胞 RNA 测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 551 | 2024-08-09 |
Clustering single cells: a review of approaches on high-and low-depth single-cell RNA-seq data
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx044
PMID:29236955
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综述 | 本文综述了在高深度和低深度单细胞RNA测序数据上进行细胞类型聚类的不同方法 | 研究发现，基于PCA的算法最适合低读取深度数据集，而基于基因聚类和双聚类算法在高通量数据集上表现更好 | 目前尚不清楚不同的计算细胞类型识别方法是否更适合于一种或另一种实验范式 | 探讨不同深度单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类方法的适用性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, 基因聚类, 双聚类 | RNA测序数据 | 大量单细胞 |
| 552 | 2024-08-09 |
Human-specific subcellular compartmentalization of P-element induced wimpy testis-like (PIWIL) granules during germ cell development and spermatogenesis
2018-02-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dex365
PMID:29237021
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研究论文 | 研究了人类胚胎发育和精子发生过程中P-element induced wimpy testis-like (PIWIL)蛋白在生殖细胞中的表达动态及其亚细胞定位 | 发现了PIWIL蛋白在人类生殖细胞中的表达模式与小鼠不同，特别是在女性卵母细胞中PIWIL1的免疫染色显示出单一的密集核周体 | 研究受限于样本数量有限，因此分析的阶段也有限 | 探讨PIWIL蛋白在人类胚胎发育和精子发生过程中的表达动态及其在生殖细胞中的亚细胞定位 | PIWIL1, PIWIL2, PIWIL3和PIWIL4蛋白在人类生殖细胞中的表达和定位 | NA | NA | 免疫荧光 | NA | 组织样本 | 8个男性胚胎样本，6个女性胚胎样本，5个成年男性睾丸样本，242个单细胞转录组数据 |
| 553 | 2024-08-09 |
Clinical Applications of and Challenges in Single-Cell Analysis of Circulating Tumor Cells
2018-Feb, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2017.3981
PMID:29265876
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review | 本文综述了单细胞分析循环肿瘤细胞（CTCs）的技术原理及其在基础研究和临床应用中的进展与挑战 | 利用单细胞测序技术发现了癌症细胞群体的异质性、化疗耐药的新驱动突变及肿瘤转移机制等新发现 | 目前面临的挑战包括技术限制和临床应用中的问题 | 探讨单细胞分析CTCs在癌症管理中的应用及面临的挑战 | 循环肿瘤细胞（CTCs）及其分子层面的检测与分析 | digital pathology | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | NA |
| 554 | 2024-08-09 |
Medical bioinformatics in melanoma
2018-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000428
PMID:29227308
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综述 | 本文综述了下一代测序技术在黑色素瘤生物学、治疗抵抗和新治疗途径方面的应用 | 通过全基因组测序、全外显子测序和RNA测序重新定义了黑色素瘤的分子分类，揭示了定义临床亚型的独特遗传畸变，并揭示了个体肿瘤中存在的多样性异质性 | NA | 总结近期全基因组研究，探讨单细胞RNA测序研究以及个性化疫苗方法在黑色素瘤治疗中的应用 | 黑色素瘤的分子分类、遗传畸变、肿瘤异质性及治疗抵抗 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 下一代测序(NGS), 全基因组测序, 全外显子测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, RNA数据 | 多个黑色素瘤亚型, 单细胞水平 |
| 555 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Reveals a Subpopulation of Prostate Cancer Cells with Enhanced Cell-Cycle-Related Transcription and Attenuated Androgen Response
2018-02-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-17-1924
PMID:29233929
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了144个经过或未经过雄激素处理的同步化LNCaP前列腺癌细胞的转录组，识别出八个潜在的LNCaP细胞亚群，揭示了前列腺癌细胞对雄激素刺激的先前未被重视的细胞异质性 | 本研究首次揭示了一个具有干细胞样特征的亚群，该亚群表现出较慢的细胞倍增率、增强的球体形成能力和对有丝分裂抑制剂诱导的G-M阻滞的抵抗性，以及对雄激素受体信号依赖性的降低 | NA | 研究前列腺癌中存在的少数细胞亚群，这些亚群在雄激素剥夺治疗后可能成为优势克隆 | LNCaP前列腺癌细胞的亚群及其对雄激素处理的响应 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 144个单细胞 |
| 556 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals that cell division cycle 5-like protein is essential for porcine oocyte maturation
2018-02-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.M117.809608
PMID:29222335
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了细胞分裂周期5-样蛋白（CDC5L）在猪卵母细胞成熟中的作用 | 首次揭示了CDC5L蛋白在猪卵母细胞减数分裂和早期胚胎发育中的潜在新作用 | NA | 探索BCB测试背后的分子机制，并研究CDC5L蛋白在猪卵母细胞成熟中的作用 | 猪卵母细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | BCB阴性和BCB阳性猪卵母细胞 |
| 557 | 2024-08-09 |
SIDR: simultaneous isolation and parallel sequencing of genomic DNA and total RNA from single cells
2018-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223263.117
PMID:29208629
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研究论文 | 本文报道了一种名为SIDR的新方法，用于从单个细胞中同时分离基因组DNA和总RNA，该方法通过低渗裂解保留核膜完整性，并使用抗体偶联的磁性微珠捕获细胞裂解物，实现了高回收率和低交叉污染。 | SIDR方法能够同时高效地从单个细胞中分离基因组DNA和总RNA，适用于单细胞水平的基因组和转录组测序分析。 | 尽管SIDR-seq在捕获拷贝数和单核苷酸变异方面比传统的单细胞RNA测序更准确，但拷贝数变异与相应基因表达水平之间存在正相关关系。 | 开发一种新技术，用于在单细胞水平上同时分析基因组和转录组，以揭示基因组和转录组的变异及其相关性。 | 单个细胞中的基因组DNA和总RNA。 | 基因组学 | NA | 实时PCR | NA | 基因组和转录组数据 | 单个细胞 |
| 558 | 2024-08-09 |
Comparative analysis of single-cell RNA sequencing data from mouse spermatogonial and mesenchymal stem cells to identify differentially expressed genes and transcriptional regulators of germline cells
2018-07, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.26303
PMID:29194616
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞RNA测序数据，分析了小鼠精原干细胞和间充质干细胞中差异表达基因及调控生殖细胞转录的因子 | 本研究首次鉴定了1,584个上调的差异表达基因，并识别了12个基础转录因子和3个序列特异性转录因子，以及两个重要的蛋白质相互作用网络中的蛋白质复合物 | NA | 揭示精原干细胞生物学的分子机制，并为细胞类型转换方法和生殖细胞的生产提供候选因子 | 小鼠精原干细胞和间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 12个精原干细胞和16个间充质干细胞 |
| 559 | 2024-08-09 |
Cross-platform single cell analysis of kidney development shows stromal cells express Gdnf
2018-02-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2017.11.006
PMID:29183737
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研究论文 | 本研究使用三种独立平台（Drop-Seq、Chromium 10x Genomics和Fluidigm C1）进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，研究E14.5小鼠肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制 | 通过一种新的整合监督计算策略，成功地协调和比较了所有三种技术平台的细胞谱，并意外发现间质细胞表达GDNF，这推翻了之前认为的只有肾小管祖细胞是GDNF唯一来源的观点 | 使用无监督方法ICGS未能识别和确认16种不同细胞群体的存在 | 研究肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制 | E14.5小鼠肾脏的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | E14.5小鼠肾脏样本 |
| 560 | 2024-08-09 |
Transcriptional Regulation and Genes Involved in First Lineage Specification During Preimplantation Development
2018, Advances in anatomy, embryology, and cell biology
DOI:10.1007/978-3-319-63187-5_4
PMID:29177763
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review | 本文综述了哺乳动物植入前发育过程中第一谱系指定相关的转录调控机制和关键基因 | 强调了通过基因组操作、活体成像、单细胞转录组学和功能缺失研究获得的最新见解 | NA | 探讨哺乳动物植入前发育中第一谱系指定的转录调控和相关基因 | 转录因子如Oct4、Sox2、Nanog、Cdx2和Eomes在细胞谱系指定中的作用 | NA | NA | 基因组操作、活体成像、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |