单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptome Analyses Reveal Molecular Signals to Intrinsic and Acquired Paclitaxel Resistance in Esophageal Squamous Cancer Cells
2018-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2018.01.059
PMID:29410067
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research paper | 本研究通过低剂量长期处理紫杉醇诱导食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞产生紫杉醇耐药性，并利用群体RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析基因表达谱，揭示了内在和获得性紫杉醇耐药的分子信号。 | 本研究首次发现卡非佐米（CFZ）通过激活HIF-1信号通路，能够减弱紫杉醇耐药性，为食管鳞状细胞癌等癌症的治疗提供了一种新的联合疗法。 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌中紫杉醇耐药的分子机制，并探索新的联合疗法。 | 食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞及其紫杉醇耐药细胞。 | digital pathology | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 37个KYSE-30细胞和73个紫杉醇耐药KYSE-30细胞（Taxol-R） |
| 522 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell fate potential assay of murine hematopoietic progenitors in vitro
2018-04, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2018.01.005
PMID:29410050
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research paper | 本文详细介绍了开发一种体外高通量单细胞培养 assay，用于测量单个小鼠骨髓前体细胞向五个髓系分化的能力 | 本文开发了一种新的体外高通量单细胞培养 assay，用于评估小鼠造血前体细胞的命运潜力 | NA | 测试基于单细胞转录组学提出的高分辨率造血系统模型的预测 | 小鼠骨髓造血前体细胞的单细胞命运潜力 | digital pathology | NA | flow cytometry | NA | single-cell transcriptomics | 单个小鼠骨髓前体细胞 |
| 523 | 2024-08-09 |
Graded Arrays of Spinal and Supraspinal V2a Interneuron Subtypes Underlie Forelimb and Hindlimb Motor Control
2018-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.01.023
PMID:29398364
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research paper | 本文研究了脊髓和脊上V2a中间神经元亚型的分级排列如何影响前肢和后肢的运动控制 | 发现了两种主要的V2a中间神经元类型，它们在发育过程中形成，并通过单细胞RNA测序揭示了这些神经元包含多个亚型 | NA | 揭示脊髓中V2a中间神经元的分子和解剖组织，以及它们如何影响特定区域的运动输出 | 脊髓和脊上V2a中间神经元及其在运动控制中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 524 | 2024-08-09 |
Chromatin Modification and Global Transcriptional Silencing in the Oocyte Mediated by the mRNA Decay Activator ZFP36L2
2018-02-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.01.006
PMID:29408237
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研究论文 | 本文报道了在卵母细胞中，ZFP36L2这一mRNA降解激活因子介导的染色质修饰和全局转录沉默的机制 | 首次发现卵母细胞中的全局转录沉默依赖于一个mRNA降解激活因子ZFP36L2 | NA | 揭示ZFP36L2在卵母细胞生长过程中的作用及其对染色质修饰和全局转录的影响 | 卵母细胞中的ZFP36L2及其对转录和染色质修饰调控因子的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠卵母细胞 |
| 525 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Glioblastoma Cells
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7659-1_12
PMID:29392698
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研究论文 | 本文描述了使用C1 Fluidigm系统从单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞生成和分析cDNA文库的方法 | 采用单细胞RNA测序技术（sc-RNASeq），相较于传统的批量RNASeq，能更好地理解高度异质性细胞群中的基因表达模式，并识别稀有细胞的转录特征 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤细胞中的应用 | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（sc-RNASeq） | NA | RNA | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 |
| 526 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding evolution of the placenta: insights from transcriptomics
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.13115.1
PMID:29416852
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研究论文 | 本文通过转录组学研究探讨了哺乳动物胎盘的进化，特别是在真兽类和有袋类哺乳动物中的进化，并扩展到脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 文章提出未来研究应关注胎盘早期发育阶段的基因表达，并尝试涵盖所有主要哺乳动物群体，以及通过单细胞转录组学技术在人类和老鼠以外的物种中进行研究 | 目前的研究主要集中在真兽类胎盘成熟期、真兽类和有袋类的繁殖策略以及子宫在植入期的蜕膜反应，尚未全面覆盖所有哺乳动物群体 | 旨在通过基因转录研究深入理解胎盘的结构与功能关系，以及其在不同哺乳动物中的进化 | 研究对象包括真兽类和有袋类哺乳动物的胎盘，以及脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 转录组学 | NA | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 527 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of the Healthy and Diseased Heart Reveals Cytoskeleton-Associated Protein 4 as a New Modulator of Fibroblasts Activation
2018-07-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠心脏组织中获取高质量RNA的方法，用于健康和病变心脏的自动单细胞测序。 | 本文首次将单细胞测序技术应用于成年心脏组织，揭示了细胞骨架相关蛋白4作为纤维母细胞激活的新调节因子。 | NA | 研究健康和病变心脏中转录组差异以及基因表达的细胞类型特异性变化。 | 成年小鼠心脏组织的单细胞RNA测序。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | RNA | 成年小鼠心脏组织 |
| 528 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation in B-cell maturation and its dysregulation in autoimmunity
2018-07, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/cmi.2017.133
PMID:29375128
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综述 | 本文综述了B细胞成熟过程中的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的失调 | 利用新一代测序、单细胞测序和DNA甲基化测序等现代技术，深入理解B细胞生物学及其在自身免疫发展中的作用 | NA | 总结表观遗传修饰在B细胞激活和分化中的研究进展，特别是在自身免疫条件下 | B细胞的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 下一代测序, 单细胞测序, DNA甲基化测序 | NA | DNA | NA |
| 529 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome sequencing: A new approach for the study of mammalian sex determination
2018-06-15, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2018.01.013
PMID:29371022
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在哺乳动物性别决定研究中的应用 | scRNA-seq技术能够全面且无偏地识别和分类细胞群，追踪细胞发育轨迹，并描述控制其分化的转录动力学 | scRNA-seq技术仍存在一些实验方法上的局限性 | 探讨scRNA-seq技术在哺乳动物性别决定研究中的应用及其未来发展 | 哺乳动物性别决定过程中的细胞群及其发育轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 530 | 2024-08-09 |
ST Spot Detector: a web-based application for automatic spot and tissue detection for spatial Transcriptomics image datasets
2018-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty030
PMID:29360929
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research paper | 本文介绍了一个名为ST Spot Detector的网络工具，用于自动检测空间转录组学图像数据集中的斑点和组织 | ST Spot Detector通过用户友好的界面自动化并简化了图像与转录组数据的校准过程 | NA | 开发一个自动化工具，以简化空间转录组学数据与图像的校准过程 | 空间转录组学图像数据集中的斑点和组织检测 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 531 | 2024-08-09 |
Circulating plasmablasts are elevated and produce pathogenic anti-endothelial cell autoantibodies in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2018-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.201747460
PMID:29369345
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研究论文 | 本文研究了特发性肺动脉高压（IPAH）中循环浆母细胞的水平及其在疾病发病机制中的作用 | 首次详细描述了IPAH中浆母细胞产生的IgA自身抗体及其对内皮细胞的影响 | NA | 评估IPAH中激活B细胞（浆母细胞）的水平，并表征这些浆母细胞衍生的重组抗体 | 特发性肺动脉高压（IPAH）中的浆母细胞及其产生的抗体 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA |
| 532 | 2024-08-09 |
Systems biology of embryonic development: Prospects for a complete understanding of the Caenorhabditis elegans embryo
2018-05, Wiley interdisciplinary reviews. Developmental biology
DOI:10.1002/wdev.314
PMID:29369536
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研究论文 | 本文探讨了系统生物学框架如何帮助全面理解秀丽隐杆线虫胚胎中的胚胎调控关系 | 结合现代基因组学工具和发育生物学，特别是利用秀丽隐杆线虫胚胎的小尺寸和强大的遗传及基因组工具，以细胞分辨率理解mRNA表达和调控 | 目前的建模和扰动实验主要集中在单个细胞类型或基因上，需要改进方法以扩展到整个基因组和生物体 | 旨在通过系统生物学框架全面理解秀丽隐杆线虫胚胎的发育调控关系 | 秀丽隐杆线虫胚胎的基因表达和调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 533 | 2024-08-09 |
dropClust: efficient clustering of ultra-large scRNA-seq data
2018-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky007
PMID:29361178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dropClust的新型聚类算法，该算法利用局部敏感哈希技术对超大规模的单细胞RNA测序数据进行高效聚类 | dropClust在执行时间、聚类准确性和检测次要细胞亚型方面优于现有的最佳实践方法 | NA | 开发一种适用于高维单细胞数据的聚类方法，以提高处理大规模数据时的效率和准确性 | 超大规模的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | 局部敏感哈希 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 数万个单细胞 |
| 534 | 2024-08-09 |
Review: Somatic mutations in neurodegeneration
2018-04, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12465
PMID:29369391
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综述 | 本文综述了体细胞突变在神经退行性疾病中的作用，特别是晚发性散发性神经退行性疾病 | 探讨了体细胞突变在神经退行性疾病中的潜在作用，尤其是通过单细胞测序技术的进步 | 单细胞测序技术仍存在误差，且需要进一步改进 | 探讨体细胞突变在神经退行性疾病中的作用及其与疾病发展的关系 | 主要关注散发性晚发性神经退行性疾病，如帕金森病、阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-08-09 |
Cell-cell signaling in blood vessel development and function
2018-03, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201708610
PMID:29363489
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综述 | 本文综述了血管发育过程中细胞间信号传导的作用及其对血管功能的影响 | 单细胞RNA测序技术为解析器官内血管多样性和动静脉层次结构中的转录多样性提供了新方法 | 器官内血管多样性和动静脉层次结构复杂，增加了血管细胞分子特征化的难度 | 探讨血管发育及其在健康和疾病中的功能 | 血液血管及其在器官发育和功能中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 536 | 2024-08-09 |
Coordination of olfactory receptor choice with guidance receptor expression and function in olfactory sensory neurons
2018-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007164
PMID:29385124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析新生嗅觉感觉神经元，探讨了嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了嗅觉感觉神经元中特定嗅觉受体表达与轴突导向基因表达之间的关系 | 研究主要集中在斑马鱼幼体，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探讨嗅觉感觉神经元中嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 新生嗅觉感觉神经元及其表达的嗅觉受体和轴突导向基因 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 56个嗅觉标记蛋白阳性感觉神经元 |
| 537 | 2024-08-09 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
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研究论文 | 本研究探讨了利用锡中卟啉（SnMP）作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效，特别是在化疗诱导的抗肿瘤免疫反应背景下针对血红素氧化酶-1（HO-1）的作用。 | 首次评估SnMP作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的应用，并展示了其与PD-1阻断相当的疗效。 | 研究主要基于小鼠模型和临床数据分析，尚未进行人体临床试验。 | 研究SnMP作为新型免疫检查点疗法在癌症治疗中的潜在应用。 | 评估SnMP在乳腺癌模型中的疗效及其对化疗诱导的CD8 T细胞免疫抑制的影响。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用乳腺癌患者的数据和乳腺癌小鼠模型进行研究 |
| 538 | 2024-08-09 |
Conserved properties of dentate gyrus neurogenesis across postnatal development revealed by single-cell RNA sequencing
2018-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-017-0056-2
PMID:29335606
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了出生后、幼年和成年小鼠齿状回细胞类型的分子动力学和多样性 | 发现了不同静止和增殖的前体细胞类型，并通过短暂的中介状态与神经母细胞阶段和完全成熟的颗粒细胞相联系 | NA | 探讨发育期和成年期齿状回神经发生的关系 | 齿状回的细胞类型及其分子动态变化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后、幼年和成年小鼠 |
| 539 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the developing lateral geniculate nucleus reveals insights into circuit assembly and refinement
2018-01-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1717871115
PMID:29343640
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了发育中的背侧外侧膝状核（LGN）在四个时间点的全转录组基因表达，揭示了细胞类型特异性标记及其在电路组装和细化过程中的动态变化 | 本研究首次提供了LGN在发育过程中多个细胞类型的全转录组基因表达图谱，并发现与突触和电路发育相关的基因在非神经元细胞类型中的表达比例比之前认识的要高 | NA | 探索中枢神经系统在早期模式化和细胞类型特异性之后，基因表达变化如何影响电路组装和细化的后期阶段 | 背侧外侧膝状核（LGN）的基因表达及其在视觉结构中的电路组装和细化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个时间点的背侧外侧膝状核（LGN）样本 |
| 540 | 2024-08-09 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 本文提出了一种通用的零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE），用于从单细胞RNA测序数据中提取信号 | ZINB-WaVE模型能够处理零膨胀（dropouts）、过度离散和数据计数性质，无需预先归一化步骤 | NA | 开发一种新的方法来更稳定和准确地从单细胞RNA测序数据中提取低维表示 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE） | 基因表达数据 | NA |