单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Thymus Organogenesis Resolves Cell Types and Developmental Maturation
2018-06-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.04.015
PMID:29884461
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，构建了一个胸腺器官发生的高分辨率转录组图谱，解析了细胞类型和发育成熟过程 | 首次在单细胞分辨率下全面捕捉胸腺器官发生的转录组框架，并揭示了胸腺上皮细胞的成熟动态及其在暴露于外源视黄酸时的内在能力 | NA | 研究胸腺发育的关键过程，并为生物学发现和胸腺器官发生的分子分析提供转录组框架 | 胸腺发育过程中的细胞类型和发育成熟 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 24,279个细胞 |
| 382 | 2024-08-09 |
SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology
2018-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1446-9
PMID:29871653
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research paper | 本文报道了一种微流控系统，该系统能够从单个细胞中物理分离核RNA（nucRNA）和细胞质RNA（cytRNA），并实现单细胞整合的nucRNA和cytRNA测序（SINC-seq） | SINC-seq构建了每个细胞的两个独立的RNA-seq文库，nucRNA和cytRNA，量化了亚细胞区室的基因表达，并将它们结合起来创建了新颖的单细胞RNA-seq数据 | NA | 利用SINC-seq发现细胞质RNA和核RNA之间的相关性的不同性质，这些性质反映了单细胞的瞬态生理状态 | 单个细胞的核RNA和细胞质RNA | NA | NA | SINC-seq | NA | RNA-seq | 单个细胞 |
| 383 | 2024-08-09 |
Progressive Recruitment of Mesenchymal Progenitors Reveals a Time-Dependent Process of Cell Fate Acquisition in Mouse and Human Nephrogenesis
2018-06-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.05.010
PMID:29870722
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研究论文 | 本文通过高分辨率图像分析和三维重建技术，研究了人类和小鼠肾脏发育过程中间充质前体细胞向肾单位前体细胞的渐进性招募过程 | 提出了一个时间依赖性的招募模型，用于解释肾单位极性和模式化的形成 | NA | 揭示人类和小鼠肾脏发育中细胞命运获取的时间依赖性过程 | 人类和小鼠的肾脏发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 384 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of HIV-specific resident memory CD8+ T cells in human lymphoid tissue
2018-06-01, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aar4526
PMID:29858286
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研究论文 | 研究通过比较血液、胸导管淋巴液和淋巴组织中CD8 T细胞的特性，揭示了HIV特异性记忆CD8 T细胞在淋巴组织中的存在和特征 | 首次展示了淋巴组织中HIV特异性记忆CD8 T细胞的表型、转录和表观遗传特征，并发现这些细胞在自发控制HIV复制的个体中富集了效应相关免疫基因 | 研究主要集中在淋巴组织，未涉及其他可能影响HIV特异性CD8 T细胞分布的组织 | 探讨HIV感染中CD8 T细胞介导的保护机制，特别是在淋巴组织中的作用 | HIV特异性记忆CD8 T细胞在淋巴组织中的分布和特性 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同物种的血液、胸导管淋巴液和淋巴组织样本 |
| 385 | 2024-08-09 |
Cnidarian Cell Type Diversity and Regulation Revealed by Whole-Organism Single-Cell RNA-Seq
2018-05-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.019
PMID:29856957
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研究论文 | 本研究通过全组织单细胞RNA测序技术，揭示了刺胞动物Nematostella vectensis的细胞类型多样性和调控机制 | 首次对非两侧对称动物Nematostella vectensis进行了全组织单细胞转录组分析，揭示了其细胞类型的复杂性和特异性基因表达的调控代码 | NA | 探索动物细胞类型多样性和特异性基因表达调控的进化机制 | 刺胞动物Nematostella vectensis的成体和幼体细胞类型及其基因调控程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 386 | 2024-08-09 |
ShinyCortex: Exploring Single-Cell Transcriptome Data From the Developing Human Cortex
2018, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2018.00315
PMID:29867326
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研究论文 | 本文介绍了ShinyCortex资源，该资源整合了来自发育中的人类和小鼠皮质的多项scRNA-seq研究数据，以便进一步分析 | ShinyCortex提供了一个基于R的动态且易于访问的平台，用于生物学家探索scRNA-seq数据 | NA | 探索单细胞转录组数据在发育中的人类皮质研究中的应用 | 发育中的人类和小鼠皮质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 387 | 2024-08-09 |
The Use of the Fluidigm C1 for RNA Expression Analyses of Single Cells
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.55
PMID:29851244
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研究论文 | 本文描述了使用Fluidigm C1系统进行单细胞RNA表达分析的流程 | 开发了基于微流控技术的自动化平台，用于同时分离数十个单细胞并进行RNA测序分析 | NA | 理解单细胞水平上的转录异质性，以揭示发育和疾病中的基因调控机制 | 单细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数十个单细胞 |
| 388 | 2024-08-09 |
Introduction to Single-Cell RNA Sequencing
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.57
PMID:29851283
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在生物学研究中的应用 | scRNA-seq通过分离单个细胞并生成测序文库，允许以空前的分辨率评估细胞群体和生物系统的基本生物学特性 | NA | 介绍和讨论当前使用的最常见的scRNA-seq协议及其数据分析基础，以及在规划和设计scRNA-seq项目时需要考虑的因素 | 单细胞RNA测序技术及其数据分析方法 | 生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | 文本 | NA |
| 389 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Protozoan and Metazoan Parasites
2018-09, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2018.04.009
PMID:29807759
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术（scRNAseq）探讨了原生动物和后生动物寄生虫的转录组特征 | 利用scRNAseq技术无偏差地表征细胞群组成 | NA | 探讨scRNAseq技术在寄生虫学中的应用潜力 | 原生动物和后生动物寄生虫的单细胞转录组 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | 转录组数据 | NA |
| 390 | 2024-08-09 |
Tracing the temporal-spatial transcriptome landscapes of the human fetal digestive tract using single-cell RNA-sequencing
2018-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-018-0105-4
PMID:29802404
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿消化道主要器官（包括食道、胃、小肠和大肠）在6至25周妊娠期以及成人大肠的转录组时空景观 | 首次系统揭示了这些细胞类型的关键生物学特征，包括发育过程、信号传导途径、细胞周期、营养消化吸收代谢及转录因子网络，并通过比较胚胎和成人阶段的转录组轮廓，深入研究了大肠的分化与成熟过程 | NA | 研究人类胎儿消化道及成人大肠的基因调控网络 | 人类胎儿消化道的主要器官及成人大肠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共分析了5,227个单个细胞，并清晰识别了40种细胞类型 |
| 391 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNAs exchange during zygotic genome activation in goat
2018-10-01, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioy118
PMID:29771291
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研究论文 | 本文研究了山羊中合子基因组激活（ZGA）过程中长非编码RNA（lncRNA）的交换情况 | 首次在山羊中确定了ZGA阶段，并使用单细胞RNA测序技术识别了关键分子候选物 | 研究主要集中在山羊的早期胚胎阶段，未涉及后续发育阶段 | 探讨山羊早期胚胎发育中ZGA过程及其调控机制 | 山羊的早期胚胎和lncRNA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 800个mRNA和250个lncRNA |
| 392 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology and disease
2018-08, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-018-0021-7
PMID:29789704
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在研究发育、生理和疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够揭示细胞群体中的异质性，区分复杂细胞群体中的所有细胞类型 | 尽管技术不断进步，但仍存在一些限制需要克服 | 提高对正常和疾病相关生理过程的理解，并发现新的治疗途径 | 单细胞RNA测序技术在发育、生理和疾病研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单个细胞 |
| 393 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Mouse Glomerulus
2018-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2018030238
PMID:29794128
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研究论文 | 本研究使用基于纳米液滴的高通量转录组测序技术，对纯化的野生型小鼠肾小球细胞进行了单细胞转录组分析 | 首次揭示了健康肾小球细胞群中的细胞异质性，并发现了新的标记基因和亚群 | NA | 全面表征肾小球细胞的基因表达，并为健康和疾病状态下肾小球功能的单细胞水平解析奠定基础 | 小鼠肾小球的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 基于纳米液滴的高通量转录组测序 | NA | 转录组 | 近13,000个单细胞 |
| 394 | 2024-08-09 |
Interpretable dimensionality reduction of single cell transcriptome data with deep generative models
2018-05-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04368-5
PMID:29784946
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scvis的稳健统计模型，用于捕捉和可视化单细胞基因表达数据中的低维结构 | scvis模型能够同时保留数据的局部和全局邻域结构，并且对数据点的数量具有鲁棒性，还能学习概率参数映射函数以添加新数据点到现有嵌入中 | NA | 开发一种新的方法来解释单细胞转录组数据中的结构 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度生成模型 | 基因表达数据 | 四组单细胞RNA测序数据 |
| 395 | 2024-08-09 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
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研究论文 | 本文开发了一种转基因斑马鱼模型，用于评估内耳和侧线毛细胞在其原始组织环境中的翻译组 | 该模型通过表达GFP和HA标记基因，使得斑马鱼幼体的毛细胞mRNA可以通过免疫沉淀方法富集，从而在不诱导基因表达变化的情况下识别新的毛细胞表达基因 | NA | 研究斑马鱼毛细胞特异性基因表达的变化 | 斑马鱼的毛细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | mRNA | NA |
| 396 | 2024-08-09 |
Current and Future Methods for mRNA Analysis: A Drive Toward Single Molecule Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7834-2_11
PMID:29767365
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综述 | 本文综述了当前和未来的mRNA分析方法，特别是单分子测序技术的发展 | 介绍了长读长RNA测序和单细胞RNA测序等新技术，这些技术在从头组装转录组和异构体定量方面具有优势 | 短读长RNA测序在从头转录组组装和异构体定量方面存在局限性 | 探讨当前RNA测序技术的现状及其未来发展方向 | 转录组，包括mRNA和其他非编码RNA | 生物信息学 | NA | RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 397 | 2024-08-09 |
Muscle fiber type diversity revealed by anti-myosin heavy chain antibodies
2018-10, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.14502
PMID:29761627
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研究论文 | 本文通过抗肌球蛋白重链抗体揭示了肌肉纤维类型的多样性 | 本文利用特定的抗肌球蛋白重链抗体，为定义骨骼肌中的纤维类型、功能特性及其在肌肉疾病中的变化提供了强有力的工具 | NA | 探讨肌球蛋白重链的不同形式在肌肉纤维类型多样性中的作用 | 骨骼肌中的纤维类型及其在肌肉疾病中的变化 | NA | 肌肉疾病 | 抗体技术 | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-09 |
In silico analysis of single-cell RNA sequencing data from 3 and 7 days old mouse spermatogonial stem cells to identify their differentially expressed genes and transcriptional regulators
2018-09, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.27066
PMID:29749669
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研究论文 | 本研究通过分析3天和7天龄小鼠精原干细胞的单细胞RNA测序数据，识别差异表达基因及其转录调控因子 | 本研究发现了68个上调基因和203个下调基因，并识别了这些基因的主要转录调控因子，这些因子可能在精原干细胞的发育过程中起关键作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序数据分析，识别不同发育阶段小鼠精原干细胞的差异表达基因及其调控因子 | 3天和7天龄小鼠精原干细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3天和7天龄小鼠精原干细胞 |
| 399 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Meets Lineage Tracing
2018-Aug-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.04.014
PMID:29754780
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综述 | 本文讨论了基于转录组的细胞谱系轨迹预测算法、单细胞遗传谱系追踪以及这些技术在干细胞和癌症研究中的结合应用 | 近年来，技术的发展使得单细胞转录组学与遗传谱系追踪策略得以结合 | 单细胞转录组学提供的详细表型信息并不一定能反映遗传关系 | 重建组织或生物体内细胞间的谱系关系 | 细胞谱系关系及其在干细胞和癌症研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 400 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq of human induced pluripotent stem cells reveals cellular heterogeneity and cell state transitions between subpopulations
2018-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223925.117
PMID:29752298
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了18,787个人类诱导多能干细胞，揭示了细胞异质性和亚群间的细胞状态转换 | 开发了一种无监督聚类方法，提高了预测准确性和特异性，并创新性地预测了细胞在亚群间的转换 | NA | 研究人类诱导多能干细胞的细胞异质性和细胞状态转换 | 人类诱导多能干细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 18,787个人类诱导多能干细胞 |