单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2024-08-09	Gene expression: Single-cell RNA sequencing of collecting duct cells 2018-01, Nature reviews. Nephrology DOI:10.1038/nrneph.2017.163 PMID:29151598	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
82	2024-08-09	Spatial Transcriptomics: Constructing a Single-Cell Resolution Transcriptome-Wide Expression Atlas 2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-7213-5_7 PMID:29130193	研究论文	本文描述了一种结合原位杂交（ISH）和单细胞mRNA测序（scRNAseq）的方法，旨在构建一个具有单细胞分辨率的基因表达图谱。	该方法通过一系列ISH实验和图像配准及基因表达平均化处理，实现了对感兴趣的动物或组织的高分辨率和中覆盖度的基因表达图谱的构建。	NA	构建一个具有单细胞分辨率的基因表达图谱。	动物或组织的基因表达。	数字病理学	NA	原位杂交（ISH），单细胞mRNA测序（scRNAseq）	NA	图像，基因表达数据	NA
83	2024-08-09	Polysome-profiling in small tissue samples 2018-01-09, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx940 PMID:29069469	研究论文	本文优化了一种非线性蔗糖梯度方法，用于在小组织样本中富集高效翻译的mRNA，减少了样本处理量，并结合smart-seq2单细胞RNA测序技术，实现了小组织样本的翻译组分析。	提出了一种优化的非线性蔗糖梯度方法，减少了样本处理量，适用于大规模研究设计、原代细胞和生物库中收集的冷冻组织样本。	NA	优化polysome-profiling技术，使其适用于小组织样本和大规模实验设计。	小组织样本中的高效翻译mRNA。	NA	NA	polysome-profiling, smart-seq2单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
84	2024-08-09	Fluctuation localization imaging-based fluorescence in situ hybridization (fliFISH) for accurate detection and counting of RNA copies in single cells 2018-01-25, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx874 PMID:29040675	研究论文	本文介绍了一种基于波动定位成像的荧光原位杂交技术（fliFISH），用于准确检测和计数单细胞中的RNA拷贝	fliFISH技术利用可开关荧光染料的开关周期来设定真实信号和虚假信号之间的定量阈值，从而提高了smFISH技术的精确度	NA	开发一种新的技术以提高单细胞中RNA拷贝检测和计数的准确性	单细胞中的RNA拷贝	分子生物学	糖尿病	荧光原位杂交（FISH）	NA	图像	小鼠胰岛细胞
85	2024-08-09	SCPortalen: human and mouse single-cell centric database 2018-01-04, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx949 PMID:29045713	研究论文	本文介绍了单细胞中心数据库'SCPortalen'的开发，该数据库旨在整合和标准化人类和小鼠的单细胞转录组数据，以便于比较和重用。	SCPortalen数据库通过手动筛选和标准化元数据，以及进行质量评估和数据处理，提供了一个高质量的单细胞数据平台。	NA	开发一个能够整合和标准化不同来源的单细胞转录组数据的数据库，以支持研究人员对特定细胞类型或群体异质性的研究。	人类和小鼠的单细胞转录组数据。	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据，图像文件	涵盖了从INSDC站点公开的人类和小鼠单细胞转录组数据集。
86	2024-08-09	DIMM-SC: a Dirichlet mixture model for clustering droplet-based single cell transcriptomic data 2018-01-01, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btx490 PMID:29036318	研究论文	本文开发了一种名为DIMM-SC的Dirichlet混合模型，用于聚类基于液滴的单细胞转录组数据	DIMM-SC模型能够显式地建模scRNA-Seq实验中的UMI计数数据，并通过Dirichlet混合先验表征不同细胞簇之间的变异	NA	开发一种新的统计方法和计算工具，用于分析基于液滴的单细胞转录组数据	基于液滴的单细胞转录组数据	生物信息学	系统性硬化症	scRNA-Seq	Dirichlet混合模型	转录组数据	数千个单细胞
87	2024-08-09	Dissecting human gliomas by single-cell RNA sequencing 2018-01-10, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/nox126 PMID:29016805	综述	本文综述了通过单细胞RNA测序技术在临床胶质瘤样本中的应用，重点介绍了RNA表达谱分析	提供了对胶质瘤生物学、肿瘤异质性、癌细胞谱系、癌症干细胞程序、肿瘤微环境和胶质瘤分类的新见解	NA	探讨单细胞分析技术在胶质瘤研究中的应用	人胶质瘤	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	临床胶质瘤样本
88	2024-08-09	VDJdb: a curated database of T-cell receptor sequences with known antigen specificity 2018-01-04, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx760 PMID:28977646	研究论文	本文介绍了VDJdb数据库，该数据库收集并整合了已知抗原特异性的T细胞受体序列，为T细胞受体谱数据注释提供了一个通用平台	VDJdb数据库整合了已发表的T细胞特异性检测结果，将抗原特异性与T细胞受体序列相结合，为T细胞受体谱数据注释提供了一个多功能工具	NA	旨在解码T细胞受体基因序列中包含的抗原特异性，以加深对适应性免疫系统的理解，并推动转化医学领域的发展	T细胞受体序列及其抗原特异性	生物信息学	NA	免疫谱系测序技术（RepSeq），单细胞RNA测序技术	NA	序列数据	大量从供体样本中获得的T细胞受体序列
89	2024-08-09	Functional genomics of stromal cells in chronic inflammatory diseases 2018-Jan, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000000455 PMID:28984647	综述	本文综述了利用功能基因组学和单细胞技术研究慢性炎症疾病中基质细胞的最新进展	采用高维策略如mRNA测序、质谱流式细胞术和荧光激活细胞分选，提供了对类风湿关节炎、炎症性肠病和癌症中病变组织的详细视图	NA	探讨基质细胞在慢性炎症疾病中的功能和病理作用	基质细胞，包括成纤维细胞、内皮细胞、周细胞和间充质前体细胞	功能基因组学	炎症性疾病	mRNA测序、质谱流式细胞术、荧光激活细胞分选	NA	单细胞RNA-seq	大量患者组织样本
90	2024-08-09	Single-cell sequencing to quantify genomic integrity in cancer 2018-01, The international journal of biochemistry & cell biology DOI:10.1016/j.biocel.2017.09.016 PMID:28951245	综述	本文综述了单细胞DNA测序（sc-seq）技术在癌症诊断、预后和治疗中的最新进展及其对改善癌症患者护理的潜在贡献	sc-seq技术使得能够研究来自原发肿瘤、转移瘤和循环肿瘤细胞的单个癌细胞基因组，揭示了其他方法无法检测到的肿瘤间和肿瘤内异质性	NA	探讨sc-seq技术在癌症诊断和治疗中的应用及未来展望	单细胞DNA测序技术及其在癌症研究中的应用	数字病理学	癌症	单细胞DNA测序（sc-seq）	NA	基因组数据	NA
91	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing to explore immune cell heterogeneity 2018-01, Nature reviews. Immunology DOI:10.1038/nri.2017.76 PMID:28787399	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在探索免疫细胞异质性方面的应用	讨论了如何利用scRNA-seq技术解析免疫系统的异质性，包括识别健康和疾病中的新型免疫细胞亚群，描述细胞群体内的随机异质性，以及构建免疫细胞的发育‘轨迹’	NA	探讨scRNA-seq技术在解析免疫系统异质性方面的应用及未来发展方向	免疫细胞的异质性	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
92	2024-08-09	Vibrissa sensory neurons: Linking distinct morphology to specific physiology and function 2018-Jan-01, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2017.06.033 PMID:28673712	研究论文	本文探讨了啮齿动物的触须感觉神经元，通过形态学和电生理特征的结合，研究其生理特性和功能	文章提出使用单细胞转录组测序和光遗传学辅助的在体电生理技术，填补了触须感觉系统中形态学定义的神经元类型与其生理特性和功能之间的知识空白	NA	旨在揭示触须感觉神经元的形态学特征与其生理功能之间的联系	啮齿动物的触须感觉神经元及其在物体定位和辨别中的作用	神经科学	NA	单细胞转录组测序，光遗传学	NA	电生理记录	多个不同类型的三叉神经（TG）感觉神经元