单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 92 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Three-step transcriptional priming that drives the commitment of multipotent progenitors toward B cells
2018-01-15, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.309575.117
PMID:29440259
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研究论文 | 本研究通过使用含有tamoxifen诱导型Id3的多能前体细胞体外系统，揭示了B细胞系承诺过程中转录因子网络的“时间流逝”动态变化 | 发现了在关键转录因子程序启动之前存在的意外转录前激活现象，并提出了三步转录因子网络模型 | NA | 揭示B细胞系承诺过程中转录因子网络的动态变化 | 多能前体细胞向B细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 蛋白质相互作用组, 表观基因组 | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Identification of Disease Susceptibility Alleles in the Next Generation Sequencing Era
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7471-9_1
PMID:29423790
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研究论文 | 本文综述了下一代测序（NGS）技术在识别疾病易感等位基因中的应用 | NGS技术的发展使得快速且经济地分析全基因组和外显子成为可能，并能解决如体细胞变异等特定问题 | 尽管NGS技术存在局限性，但其对识别致病变异的影响是显著的 | 探讨NGS技术如何与实验和计算策略结合，以识别对疾病发展和进展有因果效应的变异 | 研究对象包括罕见单基因疾病和常见异质性疾病中的致病变异 | NA | NA | NGS | NA | 基因组数据 | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Using Fluidigm C1 to Generate Single-Cell Full-Length cDNA Libraries for mRNA Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7471-9_11
PMID:29423800
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研究论文 | 本文描述了一种使用微流控设备（C1™ IFC）合成单细胞全长cDNA的方法，用于mRNA测序 | 采用微流控技术自动化合成单细胞全长cDNA，提高了数据质量和实验效率 | NA | 研究单细胞RNA测序技术，以深入理解细胞异质性、细胞分化、疾病进展和基因调控 | 单细胞全长cDNA的合成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 单细胞 |
| 64 | 2024-08-09 |
Gene Manipulation with Micro RNAs at Single-Human Cancer Cell
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7601-0_18
PMID:29435936
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研究论文 | 本文描述了一种使用微小RNA（miRNA）在单个人类癌细胞中操纵多个与癌症相关基因的协议，以研究这些基因在致癌过程中的相互作用 | 首次提出使用miRNA在单个细胞水平上操纵多个癌症相关基因，以深入研究致癌过程中的基因交互作用 | NA | 研究多个基因在致癌过程中的相互作用 | 单个人类癌细胞中的多个癌症相关基因 | NA | 癌症 | miRNA | NA | 转录组 | 单个细胞 |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Glioblastoma Cells
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7659-1_12
PMID:29392698
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研究论文 | 本文描述了使用C1 Fluidigm系统从单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞生成和分析cDNA文库的方法 | 采用单细胞RNA测序技术（sc-RNASeq），相较于传统的批量RNASeq，能更好地理解高度异质性细胞群中的基因表达模式，并识别稀有细胞的转录特征 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤细胞中的应用 | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（sc-RNASeq） | NA | RNA | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 |
| 66 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding evolution of the placenta: insights from transcriptomics
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.13115.1
PMID:29416852
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研究论文 | 本文通过转录组学研究探讨了哺乳动物胎盘的进化，特别是在真兽类和有袋类哺乳动物中的进化，并扩展到脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 文章提出未来研究应关注胎盘早期发育阶段的基因表达，并尝试涵盖所有主要哺乳动物群体，以及通过单细胞转录组学技术在人类和老鼠以外的物种中进行研究 | 目前的研究主要集中在真兽类胎盘成熟期、真兽类和有袋类的繁殖策略以及子宫在植入期的蜕膜反应，尚未全面覆盖所有哺乳动物群体 | 旨在通过基因转录研究深入理解胎盘的结构与功能关系，以及其在不同哺乳动物中的进化 | 研究对象包括真兽类和有袋类哺乳动物的胎盘，以及脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 转录组学 | NA | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Coordination of olfactory receptor choice with guidance receptor expression and function in olfactory sensory neurons
2018-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007164
PMID:29385124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析新生嗅觉感觉神经元，探讨了嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了嗅觉感觉神经元中特定嗅觉受体表达与轴突导向基因表达之间的关系 | 研究主要集中在斑马鱼幼体，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探讨嗅觉感觉神经元中嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 新生嗅觉感觉神经元及其表达的嗅觉受体和轴突导向基因 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 56个嗅觉标记蛋白阳性感觉神经元 |
| 68 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the developing lateral geniculate nucleus reveals insights into circuit assembly and refinement
2018-01-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1717871115
PMID:29343640
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了发育中的背侧外侧膝状核（LGN）在四个时间点的全转录组基因表达，揭示了细胞类型特异性标记及其在电路组装和细化过程中的动态变化 | 本研究首次提供了LGN在发育过程中多个细胞类型的全转录组基因表达图谱，并发现与突触和电路发育相关的基因在非神经元细胞类型中的表达比例比之前认识的要高 | NA | 探索中枢神经系统在早期模式化和细胞类型特异性之后，基因表达变化如何影响电路组装和细化的后期阶段 | 背侧外侧膝状核（LGN）的基因表达及其在视觉结构中的电路组装和细化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个时间点的背侧外侧膝状核（LGN）样本 |
| 69 | 2024-08-09 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 本文提出了一种通用的零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE），用于从单细胞RNA测序数据中提取信号 | ZINB-WaVE模型能够处理零膨胀（dropouts）、过度离散和数据计数性质，无需预先归一化步骤 | NA | 开发一种新的方法来更稳定和准确地从单细胞RNA测序数据中提取低维表示 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE） | 基因表达数据 | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Cellular Diversity and Intercommunication in the Mouse Heart
2018-01-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.072
PMID:29346760
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏非心肌细胞的转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络 | 本研究首次详细分析了小鼠心脏非心肌细胞的单细胞转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络，并发现了心脏基因表达中的性别二态性 | NA | 理解心脏发育和正常器官功能，并为制定精确的治疗策略以对抗心脏病提供基础 | 小鼠心脏的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本文提出了一种模型，其中活跃的神经干细胞（NSCs）的命运与共享微环境中邻近NSCs的总数相关联 | 使用敲入报告基因和单细胞RNA测序技术，发现Wnt靶标Troy可以识别活跃和静止的NSCs，并揭示了NSCs在稳态或损伤响应中的快速扩增和部分返回静止状态的行为 | NSCs的分子特征、自我更新能力和命运行为仍未完全明确 | 研究神经干细胞在成年小鼠侧脑室下区的微环境中的行为和调控机制 | 神经干细胞（NSCs）及其在微环境中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 成年小鼠的神经干细胞 |
| 72 | 2024-08-09 |
Reply to Edemir: Physiological regulation and single-cell RNA sequencing
2018-01-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1720333115
PMID:29311339
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
The epigenetic control of stemness in CD8+ T cell fate commitment
2018-Jan-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah6499
PMID:29326266
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白甲基转移酶Suv39h1在感染后激活的小鼠CD8 T细胞中通过H3K9三甲基化调控干细胞相关记忆基因表达的作用 | 首次揭示了Suv39h1在CD8 T细胞效应分化过程中通过标记染色质沉默干细胞/记忆基因的关键作用 | NA | 探究染色质动态变化如何影响基因表达程序，进而控制CD8+ T细胞的命运承诺 | CD8+ T细胞的命运承诺及其与干细胞特性的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠CD8 T细胞 |
| 74 | 2024-08-09 |
Clonal analysis of lineage fate in native haematopoiesis
2018-01-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25168
PMID:29323290
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研究论文 | 本研究使用转座子标记技术在未受干扰的造血过程中对前体细胞和干细胞的命运进行克隆追踪 | 研究揭示了在未受干扰的造血过程中，巨核细胞谱系主要独立于其他造血命运，并表明传统的长期造血干细胞是巨核细胞限制性前体细胞的重要来源 | NA | 探讨在未受干扰的造血过程中，造血干细胞和多能前体细胞的谱系命运 | 造血干细胞和多能前体细胞 | NA | NA | 转座子标记技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 75 | 2024-08-09 |
Exploration of the Germline Genome of the Ciliate Chilodonella uncinata through Single-Cell Omics (Transcriptomics and Genomics)
2018-01-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01836-17
PMID:29317511
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术探索纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组结构 | 首次使用单细胞转录组学和基因组学技术，克服了获取纯化生殖系DNA的困难，揭示了奇洛登尼亚生殖系基因组的结构特征 | 研究仅限于奇洛登尼亚这一种纤毛虫，且依赖于其高度碎片化的体细胞基因组 | 探索纤毛虫生殖系与体细胞基因组之间的基因组重排进化 | 纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 有限数量的奇洛登尼亚样本 |
| 76 | 2024-08-09 |
Variation in Activity State, Axonal Projection, and Position Define the Transcriptional Identity of Individual Neocortical Projection Neurons
2018-01-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.046
PMID:29320739
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研究论文 | 本文通过比较单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达谱，揭示了转录子类型主要反映了轴突投射模式、皮质层位置和神经元活动状态 | 本文首次展示了轴突投射模式、皮质层位置和活动状态如何定义个体神经元的转录身份及其在每个神经元亚型中的转录异质性 | NA | 探讨细胞过程如何贡献于神经元亚型指定和转录异质性 | 单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,023个细胞响应 |
| 77 | 2024-08-09 |
Single-Cell Expression Profiling and Proteomics of Primordial Germ Cells, Spermatogonial Stem Cells, Adult Germ Stem Cells, and Oocytes
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/5584_2017_117
PMID:29299873
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综述 | 本文综述了利用现代分子技术对不同类型的人类生殖细胞进行单细胞表达谱和蛋白质组学分析的研究进展 | 介绍了针对单细胞分析优化的现代分子技术，如单细胞荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）等 | NA | 探讨和理解生殖细胞和干细胞的分子基础、细胞命运可塑性和决定机制 | 原始生殖细胞（PGCs）、精原干细胞（SSCs）、成人生殖干细胞（haGSCs）和卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）、液相色谱-串联质谱（LC-MSMS） | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
SIDR: simultaneous isolation and parallel sequencing of genomic DNA and total RNA from single cells
2018-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223263.117
PMID:29208629
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研究论文 | 本文报道了一种名为SIDR的新方法，用于从单个细胞中同时分离基因组DNA和总RNA，该方法通过低渗裂解保留核膜完整性，并使用抗体偶联的磁性微珠捕获细胞裂解物，实现了高回收率和低交叉污染。 | SIDR方法能够同时高效地从单个细胞中分离基因组DNA和总RNA，适用于单细胞水平的基因组和转录组测序分析。 | 尽管SIDR-seq在捕获拷贝数和单核苷酸变异方面比传统的单细胞RNA测序更准确，但拷贝数变异与相应基因表达水平之间存在正相关关系。 | 开发一种新技术，用于在单细胞水平上同时分析基因组和转录组，以揭示基因组和转录组的变异及其相关性。 | 单个细胞中的基因组DNA和总RNA。 | 基因组学 | NA | 实时PCR | NA | 基因组和转录组数据 | 单个细胞 |
| 79 | 2024-08-09 |
Transcriptional Regulation and Genes Involved in First Lineage Specification During Preimplantation Development
2018, Advances in anatomy, embryology, and cell biology
DOI:10.1007/978-3-319-63187-5_4
PMID:29177763
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review | 本文综述了哺乳动物植入前发育过程中第一谱系指定相关的转录调控机制和关键基因 | 强调了通过基因组操作、活体成像、单细胞转录组学和功能缺失研究获得的最新见解 | NA | 探讨哺乳动物植入前发育中第一谱系指定的转录调控和相关基因 | 转录因子如Oct4、Sox2、Nanog、Cdx2和Eomes在细胞谱系指定中的作用 | NA | NA | 基因组操作、活体成像、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Unsupervised Trajectory Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Imaging Data Reveals Alternative Tuft Cell Origins in the Gut
2018-01-24, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2017.10.012
PMID:29153838
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研究论文 | 本文介绍了一种无监督算法p-Creode，用于从单细胞数据中推断可重复的细胞状态发展过渡，并应用于多种数据类型以验证其在肠道特化细胞起源分析中的有效性 | p-Creode算法能够从单细胞数据中生成多分支图，比较不同拓扑结构的图，并推断出统计上稳健的细胞状态过渡层次结构 | NA | 开发和验证一种新的计算工具，用于从单细胞数据中推断细胞状态的发展过渡 | 肠道中的特化细胞，特别是肠绒毛细胞的起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 图像数据 | NA |