单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 92 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing of Rare Immune Cell Populations
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.01553
PMID:30022984
|
研究论文 | 本文描述了采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术研究罕见免疫细胞在其微解剖生态位中的经验 | scRNA-Seq技术的发展使得能够识别和表征以往在群体分析中常被忽视的罕见细胞类型，揭示了免疫系统的异质性和可塑性 | NA | 探索和表征罕见免疫细胞类型及其在免疫系统中的作用 | 罕见免疫细胞及其微解剖生态位 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-09 |
netSmooth: Network-smoothing based imputation for single cell RNA-seq
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.13511.3
PMID:29511531
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于网络扩散的方法netSmooth，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验中的基因表达值平滑处理 | netSmooth利用基因表达谱的协方差结构先验知识，改善了scRNA-seq实验的聚类结果 | NA | 旨在解决scRNA-seq实验中的技术偏差问题，如丢失值和高方差 | 单细胞RNA测序实验中的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 网络扩散模型 | 基因表达数据 | 涉及不同细胞群体、时间序列实验和癌症基因组学的scRNA-seq实验 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-09 |
A Guide to Single-Cell Transcriptomics in Adult Rodent Brain: The Medium Spiny Neuron Transcriptome Revisited
2018, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2018.00159
PMID:29970990
|
研究论文 | 本文分析并简化了从大脑中进行单细胞分离的关键步骤方法，并使用中棘神经元（MSN）作为示例展示了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据。 | 本文通过标准化单细胞分离的重要步骤，提高了数据的比较性，并通过高分辨率的单细胞测序重新定义了MSN的转录组。 | NA | 旨在通过单细胞转录组学技术深入理解大脑的细胞复杂性，并标准化单细胞分离技术以提高数据的可比性。 | 中棘神经元（MSN）及其亚型，特别是表达D1和D2多巴胺受体的MSN亚型。 | 数字病理学 | 精神疾病，神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-09 |
Single-Cell Non-coding RNA in Embryonic Development
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-0502-3_3
PMID:29943293
|
研究论文 | 本文关注单细胞非编码RNA在胚胎发育中的表达及其作用 | 采用单细胞RNA测序技术检测胚胎发育过程中非编码RNA的表达 | NA | 探讨非编码RNA在胚胎发育中的调控作用 | 非编码RNA如长非编码RNA、微小RNA、环状RNA、小核仁RNA和Piwi相互作用RNA | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
High Throughput Single Cell RNA Sequencing, Bioinformatics Analysis and Applications
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-0502-3_4
PMID:29943294
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的高通量生物信息学分析及其在癌症生物学中的应用 | scRNA-seq技术使得研究人员能够重新审视癌症生物学中的长期问题，如癌症转移、异质性和进化 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症生物学中的应用 | 单细胞RNA测序数据及其在癌症转移、异质性和进化中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | NGS | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-09 |
Application of Single Cell Sequencing in Cancer
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-0502-3_11
PMID:29943301
|
review | 本文综述了单细胞测序技术在癌症研究与应用中的现状 | 单细胞测序技术提供了前所未有的手段来表征肿瘤内异质性并分析癌细胞的基因组 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症诊断和预后应用中的潜力 | 癌症细胞及其基因组 | digital pathology | cancer | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Is Pooled CRISPR-Screening the Dawn of a New Era for Functional Genomics
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-0502-3_14
PMID:29943304
|
研究论文 | 本文综述了CRISPR-Cas9系统及其在遗传筛选中的应用，特别是CROP-seq、Perturb-seq和CRISPR-seq方法，这些方法结合了CRISPR和单细胞RNA测序，提高了基因编辑的速度、准确性和效率。 | 介绍了CROP-seq、Perturb-seq和CRISPR-seq等新方法，这些方法结合了CRISPR和单细胞RNA测序，为功能基因组学研究提供了更快速、准确和高效的手段。 | CRISPR-based方法虽然有所改进，但仍未能在所有方面超越传统方法，存在一定的局限性。 | 探讨CRISPR-Cas9系统在遗传筛选中的应用及其对功能基因组学研究的影响。 | CRISPR-Cas9系统及其在遗传筛选中的应用，特别是CROP-seq、Perturb-seq和CRISPR-seq方法。 | 功能基因组学 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | DNA, RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
Emergence of Bias During the Synthesis and Amplification of cDNA for scRNA-seq
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-0502-3_12
PMID:29943302
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术中cDNA合成和扩增过程中偏差的产生及其对测序结果的影响 | 介绍了当前几种改进的scRNA-seq方法，这些方法有助于减少和评估偏差 | 当前scRNA-seq技术在RNA逆转录和cDNA预扩增步骤中存在偏差，限制了定量准确性 | 探讨scRNA-seq技术中偏差的产生机制及其对测序协议的影响 | 单细胞RNA测序技术中的偏差问题 | 基因组学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Transcriptome analysis of PCOS arrested 2-cell embryos
2018, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2018.1467678
PMID:29912628
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多囊卵巢综合征（PCOS）患者停滞在2细胞阶段的胚胎的转录组特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析PCOS患者停滞在2细胞阶段胚胎的转录组差异表达基因 | NA | 探索多囊卵巢综合征患者胚胎早期发育停滞的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者停滞在2细胞阶段的胚胎 | NA | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | PCOS停滞2细胞胚胎、非PCOS停滞2细胞胚胎和非停滞2细胞胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
ShinyCortex: Exploring Single-Cell Transcriptome Data From the Developing Human Cortex
2018, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2018.00315
PMID:29867326
|
研究论文 | 本文介绍了ShinyCortex资源，该资源整合了来自发育中的人类和小鼠皮质的多项scRNA-seq研究数据，以便进一步分析 | ShinyCortex提供了一个基于R的动态且易于访问的平台，用于生物学家探索scRNA-seq数据 | NA | 探索单细胞转录组数据在发育中的人类皮质研究中的应用 | 发育中的人类和小鼠皮质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Current and Future Methods for mRNA Analysis: A Drive Toward Single Molecule Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7834-2_11
PMID:29767365
|
综述 | 本文综述了当前和未来的mRNA分析方法，特别是单分子测序技术的发展 | 介绍了长读长RNA测序和单细胞RNA测序等新技术，这些技术在从头组装转录组和异构体定量方面具有优势 | 短读长RNA测序在从头转录组组装和异构体定量方面存在局限性 | 探讨当前RNA测序技术的现状及其未来发展方向 | 转录组，包括mRNA和其他非编码RNA | 生物信息学 | NA | RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Next-Generation Immune Repertoire Sequencing as a Clue to Elucidate the Landscape of Immune Modulation by Host-Gut Microbiome Interactions
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.00668
PMID:29666626
|
研究论文 | 本文讨论了下一代免疫组库测序技术在营养与肠道免疫学领域的应用潜力 | 该技术结合单细胞转录组学/蛋白质组学，提供了揭示宿主-微生物免疫稳态新原理的关键工具 | 目前仍存在未解决的问题 | 探讨高吞吐量免疫受体测序在营养与肠道免疫学领域的应用 | 宿主与肠道微生物的免疫交互作用 | NA | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 单个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
Comparison of EpCAMhighCD44+ cancer stem cells with EpCAMhighCD44- tumor cells in colon cancer by single-cell sequencing
2018, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2018.1456605
PMID:29580161
|
研究论文 | 本研究通过单细胞全基因组测序技术，比较了结肠癌中EpCAM高表达CD44阳性和阴性肿瘤细胞的体细胞拷贝数变异（SCNAs） | 首次在单细胞水平上比较了结肠癌中EpCAM高表达CD44阳性和阴性肿瘤干细胞的SCNAs，揭示了它们在SCNAs模式上的相似性和差异性 | 研究样本量较小，仅涉及两个原发性结肠肿瘤的47个合格单细胞 | 旨在确定单个肿瘤干细胞（EpCAM高表达CD44阳性）和分化肿瘤细胞（EpCAM高表达CD44阴性）在体细胞拷贝数变异方面的差异 | 结肠癌中的EpCAM高表达CD44阳性和阴性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞全基因组测序（WGS） | NA | 基因组数据 | 47个合格单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
High-Throughput Single-Cell RNA Sequencing and Data Analysis
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7768-0_15
PMID:29605858
|
研究论文 | 本文描述了一种定制的高通量单细胞RNA测序（scRNA-seq）协议，结合流式细胞术和纳米级机器人系统，并介绍了用于识别细胞亚群和推导分化轨迹的先进数据分析算法 | 提出了一种结合流式细胞术和纳米级机器人系统的高通量scRNA-seq协议，并开发了用于识别细胞亚群和推导分化轨迹的先进数据分析算法 | scRNA-seq由于需要放大少量内源性细胞RNA，导致数据集中存在大量技术噪声，需要特殊的数据过滤和分析 | 旨在通过单细胞分辨率理解生物系统，揭示传统群体技术无法发现的新见解 | 单细胞转录组测序技术及其数据分析算法 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Regulators of Neuronal Migration and Maturation During Brain Development
2018, Journal of experimental neuroscience
DOI:10.1177/1179069518760783
PMID:29551912
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了大脑发育过程中神经迁移和成熟的调控因子 | 发现了DNMT1通过转录调控促进迁移后细胞的神经突复杂性，并首次报道了CCDC184基因在有丝分裂后中间神经元中的高表达及其与细胞粘附相关基因的正相关性 | 研究主要集中在单细胞转录组分析，未涉及更广泛的细胞和分子机制研究 | 探究大脑发育过程中γ-氨基丁酸表达的皮层中间神经元的迁移和成熟的调控机制 | 大脑发育过程中的神经迁移和成熟 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及多种中间神经元的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Recent advances in lineage differentiation from stem cells: hurdles and opportunities?
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.12596.1
PMID:29552337
|
research paper | 本文综述了干细胞谱系分化的最新进展，探讨了面临的挑战和机遇 | 利用单细胞转录组学和基因调控网络的计算模型来更好地理解谱系承诺，并推动现代基因编辑方法的发展 | 生成与天然细胞相似的成熟分化细胞仍然具有挑战性 | 探讨干细胞谱系分化的进展及其在人类发育、疾病建模和再生医学中的应用潜力 | 干细胞的谱系分化及其在医学领域的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学、基因编辑 | 基因调控网络的计算模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Data Analysis in Single-Cell Transcriptome Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7717-8_18
PMID:29536451
|
research paper | 本文主要介绍和讨论了单细胞转录组测序数据中的归一化和聚类分析的研究现状 | 提出了一个利用单细胞RNA测序发现和验证癌症干细胞的协议 | 单细胞转录组测序数据分析仍面临许多挑战 | 促进对细胞功能、疾病进展和治疗反应的理解 | 单细胞转录组测序数据的归一化和聚类分析 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Applications of Single-Cell Sequencing for Multiomics
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7717-8_19
PMID:29536452
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多组学中的应用及其面临的挑战 | 单细胞测序技术提供了更高分辨率的细胞差异，并更好地理解了个体细胞在微环境中的生存和适应的遗传和表观遗传机制 | 单细胞测序由于起始材料量极少、样本损失和污染，以及在样本准备过程中需要大量扩增导致的数据覆盖不均、噪声和量化不准确等问题，使得其执行和下游数据分析更具挑战性 | 综述当前单细胞测序的策略和挑战，包括单细胞转录组、基因组和表观基因组 | 单细胞的序列或染色质信息 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Novel mutational landscapes and expression signatures of lung squamous cell carcinoma
2018-Jan-26, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.23716
PMID:29484121
|
研究论文 | 本研究通过外显子测序和RNA测序分析了16个由致癌物诱导的小鼠肺鳞状细胞癌肿瘤和8个正常小鼠肺组织样本，并在单细胞水平上进行了RNA测序，以深入了解肺鳞状细胞癌的病理生物学。 | 研究发现了59个在小鼠肺鳞状细胞癌肿瘤中反复突变的癌症基因，并识别出一种表达特征，可作为肺鳞状细胞癌肿瘤的有效分类器和肺癌患者生存结果的强预测因子。 | NA | 增加对肺鳞状细胞癌病理生物学的理解 | 肺鳞状细胞癌肿瘤和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 外显子测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 16个肺鳞状细胞癌肿瘤样本和8个正常肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Regulatory Architecture of the LβT2 Gonadotrope Cell Underlying the Response to Gonadotropin-Releasing Hormone
2018, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2018.00034
PMID:29487567
|
研究论文 | 本研究整合了LβT2细胞在GnRH刺激下的转录组和全基因组染色质可及性状态，并使用Gel bead-in-Emulsion Drop-seq技术检测了细胞间转录反应的变异性。 | 首次进行了LβT2细胞的全基因组表观遗传和单细胞转录组学特征研究。 | NA | 研究LβT2细胞在GnRH刺激下的基因调控机制和单细胞转录组反应变异性。 | LβT2小鼠垂体细胞系在GnRH刺激下的表观遗传和转录组学响应。 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq, RNA-seq, Gel bead-in-Emulsion Drop-seq | NA | 基因组, 转录组 | 1,992个未处理细胞和1,889个GnRH处理细胞 | NA | NA | NA | NA |