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当前共找到 92 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Maturing Human CD127+ CCR7+ PDL1+ Dendritic Cells Express AIRE in the Absence of Tissue Restricted Antigens
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.02902
PMID:30692988
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研究论文 | 本研究识别并分析了人类扁桃体中表达AIRE的树突状细胞及其特征 | 首次在人类外周组织中明确识别AIRE表达细胞为树突状细胞，并发现其表达与组织限制性抗原无关 | 研究主要基于扁桃体组织，未验证其他外周组织中的情况 | 探索人类外周组织中AIRE表达细胞的来源和功能特征 | 人类扁桃体组织中的AIRE+树突状细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术,CyTOF,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 人类扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本研究揭示了成年小鼠脑室下区神经干细胞通过感知生态位占用情况来调节自身数量的新机制 | 发现Wnt靶基因Troy可同时标记活跃和静息态神经干细胞，并证实干细胞数量在共享生态位中随时间波动的随机命运决定模型 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究神经干细胞的分子特征、自我更新潜能和命运决定机制 | 成年小鼠脑室下区神经干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因谱系追踪,命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 提出一种通用灵活的单细胞RNA测序数据信号提取方法ZINB-WaVE | 开发了零膨胀负二项模型，能同时处理数据中的零膨胀、过度离散和计数特性 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的低维表示方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ZINB-WaVE（零膨胀负二项模型） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
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研究论文 | 开发了一种转基因斑马鱼模型，用于在原生组织环境中分析内耳和侧线毛细胞的翻译组 | 创建了首个用于斑马鱼毛细胞特异性翻译组分析的RiboTag转基因模型，避免了组织解离导致的基因表达变化 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果向哺乳动物系统的直接转化需要进一步验证 | 开发一种能够在原生组织环境中特异性分析斑马鱼毛细胞基因表达的方法 | 斑马鱼内耳器官和侧线神经丘中的毛细胞 | 功能基因组学 | 听力障碍 | RiboTag技术，RNA-Seq，免疫沉淀 | 转基因动物模型 | 转录组数据 | 斑马鱼幼虫 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
States and Origins of Mammalian Embryonic Pluripotency In Vivo and in a Dish
2018, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2017.11.002
PMID:29477162
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综述 | 探讨哺乳动物早期胚胎多能性状态及其在体内外的起源与维持机制 | 通过单细胞转录组学揭示不同物种胚胎发育中细胞互作与命运决定的新机制 | 主要基于比较研究，尚未建立统一的跨物种多能性理论框架 | 解析哺乳动物早期胚胎多能性的发育原理与物种差异 | 小鼠和人类等哺乳动物的早期胚胎及多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多物种胚胎样本（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2024-11-15 |
Single-cell RNA sequencing of the mammalian pineal gland identifies two pinealocyte subtypes and cell type-specific daily patterns of gene expression
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0205883
PMID:30347410
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了大鼠松果体转录组，识别出两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出大鼠松果体中的两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 研究仅限于大鼠松果体，结果可能不适用于其他物种 | 通过单细胞RNA测序技术分析大鼠松果体细胞的组成及其基因表达的每日变化模式 | 大鼠松果体细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约17,000个松果体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of experience-dependent transcriptomic states in the mouse visual cortex
2018-01, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-017-0029-5
PMID:29230054
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研究论文 | 本文探讨了小鼠视觉皮层中经历依赖的转录组状态的单细胞分析 | 识别了30种细胞类型中显著且不同的刺激响应，揭示了611个刺激响应基因 | 尚缺乏对所有皮层细胞类型转录响应多样性的全面理解 | 研究小鼠视觉皮层在光照刺激后的转录变化 | 小鼠视觉皮层中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 发育性脑障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Bloody Zebrafish: Novel Methods in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00124
PMID:30374440
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研究论文 | 本文讨论了斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的应用，以及新技术如何改变该领域的理解 | 介绍了斑马鱼模型在造血研究中的新应用，以及单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学和大数据处理等新技术的使用 | NA | 探讨斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的益处以及新技术的影响 | 斑马鱼模型及其在造血研究中的应用 | 数字病理学 | 恶性血液病 | 单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 大数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
The Evolution of Gene-Specific Transcriptional Noise Is Driven by Selection at the Pathway Level
2018-01, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.117.300467
PMID:29097405
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组数据研究了家鼠基因特异性转录噪声的进化驱动力 | 首次揭示了生物途径层面的自然选择对基因特异性转录噪声的影响 | NA | 探讨基因特异性转录噪声的进化驱动力 | 家鼠的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Bringing Renal Biopsy Interpretation Into the Molecular Age With Single-Cell RNA Sequencing
2018-01, Seminars in nephrology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.semnephrol.2017.09.005
PMID:29291760
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肾活检解释中的应用及其对肾脏疾病研究的影响 | 单细胞RNA测序技术能够同时测量数千个单细胞中的数千个基因表达，为全面描述人类肾脏疾病提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在肾活检中的应用及其对肾脏疾病理解的潜在影响 | 肾活检样本及其在急性肾损伤、慢性肾脏病和同种异体移植功能障碍中的应用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
The European Bioinformatics Institute in 2017: data coordination and integration
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx1154
PMID:29186510
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research paper | 本文介绍了欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）在2017年如何通过提供开放数据、开源软件和分析工具以及技术基础设施来支持全球生命科学研究，并整合日益多样化的数据类型 | EMBL-EBI通过整合高质量的生物成像、生物银行和其他类型的分子数据，以及参与Open Targets、植物表型标准（MIAPPE）和人类细胞图谱数据协调平台等项目，展示了其在数据整合和服务开发方面的深入参与 | NA | 支持全球生命科学研究，整合多样化数据类型，以便各学科的生物学家能够更详细地探索生命 | EMBL-EBI提供的开放数据、开源软件、分析工具和技术基础设施 | 生物信息学 | NA | 细胞成像和单细胞测序技术 | NA | 高维数据 | 数据存储量在不到两年内翻倍至120PB | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Patch-Seq Protocol to Analyze the Electrophysiology, Morphology and Transcriptome of Whole Single Neurons Derived From Human Pluripotent Stem Cells
2018, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2018.00261
PMID:30147644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Patch-seq的新方法，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、膜片钳电生理记录和形态学分析，用于全面分析从人多能干细胞衍生的单个神经元的电生理、形态和转录组特征。 | Patch-seq方法的创新之处在于它能够同时进行多模态的神经元分析，揭示功能特性、形态和基因表达之间的联系。 | NA | 研究目的是通过Patch-seq方法深入剖析神经元的类型和状态，揭示人类神经多样性的分子基础，并探索脑部疾病的细胞机制。 | 研究对象是从人胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的单个神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 研究中使用了从健康受试者衍生的胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的神经元。 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Precursors of human CD4+ cytotoxic T lymphocytes identified by single-cell transcriptome analysis
2018-01-19, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aan8664
PMID:29352091
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CD4-CTL）的异质性、转录谱和克隆性 | 首次在人类中识别出CD4-CTL前体细胞群体，并探讨了其与CD4-CTL效应细胞的关系 | NA | 研究CD4-CTL的生物学特性及其在人类中的生成机制 | 人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞及其前体细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过9000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-09 |
A systematic performance evaluation of clustering methods for single-cell RNA-seq data
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.15666.3
PMID:30271584
|
研究论文 | 本文对14种基于不同算法的聚类方法在单细胞RNA-seq数据上的性能进行了系统且可扩展的评估 | 首次系统评估了多种聚类方法在单细胞RNA-seq数据上的性能，并探讨了共识聚类的效果 | 评估主要基于公开的单细胞RNA-seq数据集和模拟数据，可能未涵盖所有可能的数据情况 | 评估不同聚类方法在单细胞RNA-seq数据上的性能，以识别最优方法 | 14种聚类算法在单细胞RNA-seq数据上的性能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 单细胞RNA-seq数据 | 使用了九个公开的单细胞RNA-seq数据集以及三个模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-09 |
An accessible, interactive GenePattern Notebook for analysis and exploration of single-cell transcriptomic data
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.15830.2
PMID:31316748
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研究论文 | 本文介绍了一种交互式GenePattern Notebook，用于单细胞转录组数据的分析和探索，无需编程知识 | 提供了一个易于使用的界面，使得非编程用户也能进行单细胞RNA测序数据的分析 | NA | 开发一种无需编程的工具，以便更广泛的用户群体能够分析单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-09 |
scClustViz - Single-cell RNAseq cluster assessment and visualization
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.16198.2
PMID:31016009
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scClustViz的R Shiny软件工具，用于单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的聚类评估和可视化 | scClustViz提供了一个简单的交互式图形用户界面，用于探索scRNAseq数据并评估聚类结果的生物学相关性 | NA | 开发一种工具，用于评估和可视化单细胞RNA测序数据的聚类结果 | 单细胞RNA测序数据及其聚类结果的生物学相关性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-09 |
False signals induced by single-cell imputation
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.16613.2
PMID:30906525
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研究论文 | 本文评估了使用六种不同方法进行单细胞RNA测序数据插补时产生假阳性或不可重复差异表达的风险 | 首次系统评估了不同插补方法在单细胞RNA测序数据中引入假阳性的程度，并提出了减少这些影响的策略 | 所有插补方法都降低了细胞类型特异性标记的可重复性，尽管可以通过选择具有较大效应量和显著性的标记来缓解 | 评估单细胞RNA测序数据插补方法的可靠性和潜在风险 | 单细胞RNA测序数据的插补方法及其对基因表达分析的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-09 |
Comparison of SureSelect and Nextera Exome Capture Performance in Single-Cell Sequencing
2018, Human heredity
IF:1.1Q4
DOI:10.1159/000490506
PMID:30669152
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研究论文 | 本研究比较了Agilent SureSelectXT Target Enrichment System与Nextera rapid capture在单细胞全外显子测序中的性能 | 首次详细比较了两种不同外显子捕获试剂盒在单细胞全外显子测序中的性能 | 研究样本数量有限，仅基于12个高产量细胞进行分析 | 评估不同外显子捕获试剂盒在单细胞全外显子测序中的性能 | 从黑色素瘤样本中分离的192个单细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞全外显子测序 | NA | DNA | 192个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-09 |
Comparison of clustering tools in R for medium-sized 10x Genomics single-cell RNA-sequencing data
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.15809.2
PMID:30228881
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研究论文 | 本文比较了R语言中多种聚类工具对中等规模的10x Genomics单细胞RNA测序数据的性能 | 首次系统地评估了多种聚类方法在10x Genomics单细胞RNA测序数据上的准确性、运行时间和鲁棒性 | 研究结果表明不同方法的聚类结果差异较大，选择合适的聚类工具对数据解读至关重要 | 评估不同聚类工具在10x Genomics单细胞RNA测序数据上的性能 | 10x Genomics单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类方法 | 基因表达数据 | 包括一个黄金标准数据集和多个白银标准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-09 |
Technical Advances in Single-Cell RNA Sequencing and Applications in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2018.00582
PMID:30581771
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在正常和恶性造血中的最新进展及其应用 | scRNA-seq技术的发展改变了我们对许多生物现象的理解，包括器官发育和癌症发生 | NA | 旨在进一步理解造血层次结构，并阐明个性化治疗和精准医学方法在临床治疗血液恶性肿瘤中的应用 | 正常和恶性造血细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |