单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-08-09	Multimodal profiling of single-cell morphology, electrophysiology, and gene expression using Patch-seq 2017-Dec, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/nprot.2017.120 PMID:29189773	研究论文	本文介绍了Patch-seq技术，该技术结合了全细胞膜片钳记录、免疫组织化学和单细胞RNA测序，用于全面分析小鼠脑切片中单个神经元的形态学、电生理学和基因表达特征	Patch-seq技术首次实现了对单个神经元的多模态分析，包括形态学、电生理学和基因表达	该技术需要熟练的电生理学家、分子生物学家和生物统计学家的共同努力，且整个过程需要约两周时间	探索神经元之间多维表型变异性的相关性，并在单细胞水平上关联基因表达与表型	小鼠脑切片中的单个神经元	NA	NA	Patch-seq, 全细胞膜片钳记录, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序	NA	形态学数据, 电生理数据, 转录组数据	单个神经元
22	2024-08-09	The DNA Methyltransferase 1 (DNMT1) Controls the Shape and Dynamics of Migrating POA-Derived Interneurons Fated for the Murine Cerebral Cortex 2017-12-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhw341 PMID:29117290	研究论文	研究探讨了DNA甲基转移酶1（DNMT1）在调控由前脑区域POA衍生的GABA能中间神经元迁移形态和动态中的作用	首次揭示了DNMT1在维持迁移形态中的作用，并通过负调控Pak6影响神经突生成	研究主要集中在DNMT1的删除对迁移和成年皮质中间神经元数量的影响，可能需要进一步研究DNMT1在其他细胞类型或发育阶段的作用	识别调控中间神经元迁移过程的因素	由POA衍生的GABA能中间神经元	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	涉及小鼠迁移GABA能POA衍生细胞
23	2024-08-09	Single-cell transcriptomic analysis of oligodendrocyte lineage cells 2017-12, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.conb.2017.10.005 PMID:29126015	综述	本文综述了单细胞转录组学在揭示少突胶质细胞系细胞异质性方面的最新进展	提出少突胶质细胞及其前体细胞在中枢神经系统中具有不同的形态和区域功能差异，并涉及其他功能过程如与轴突的代谢耦合	NA	探讨少突胶质细胞系细胞的异质性及其与功能状态的关系	少突胶质细胞及其前体细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
24	2024-08-09	IRF3 and type I interferons fuel a fatal response to myocardial infarction 2017-Dec, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/nm.4428 PMID:29106401	研究论文	研究揭示了心肌梗死（MI）中IRF3和I型干扰素通过激活炎症反应导致致命后果的机制	首次展示了心肌梗死后，缺血细胞死亡和细胞碎片被巨噬细胞摄取激活IRF3和I型干扰素产生的过程，并发现这一机制在心肌梗死后的炎症反应中起关键作用	研究主要在老鼠模型上进行，需要进一步在人类中验证这些发现	探讨心肌梗死后的炎症反应机制及其潜在的治疗靶点	心肌梗死后的炎症反应及其分子驱动因素	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	4215个从梗死和非梗死心脏分离的白细胞
25	2024-08-09	Single-cell RNA-seq reveals a distinct transcriptome signature of aneuploid hematopoietic cells 2017-12-21, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood-2017-08-803353 PMID:29030335	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞，以揭示非整倍体造血细胞的转录组特征	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了非整倍体细胞与二倍体细胞在转录组水平上的差异，并探讨了染色体增减对细胞功能的影响	研究样本量有限，且仅包括健康供体和骨髓衰竭患者，可能限制了结果的普遍性	探讨非整倍体细胞在转录组水平上的特征及其对细胞功能的影响	健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞	数字病理学	骨髓衰竭	单细胞RNA测序	NA	转录组	共分析了391个对照细胞和588个患者细胞
26	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity among early lymphoid progenitors 2017-12-15, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.201797105 PMID:29030486	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术揭示了早期淋巴祖细胞的发育异质性	本文首次识别了一个新的亚群，作为B细胞定向分化的直接前体，并揭示了B220CD117CD19NK1.1祖细胞在单细胞水平上的异质性	NA	研究早期淋巴祖细胞的发育异质性及其潜在的细胞分化关系	B220CD117CD19NK1.1未定型的造血祖细胞及其亚群	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	多个B220CD117CD19NK1.1祖细胞及其亚群的单细胞
27	2024-08-09	Pathologic Stimulus Determines Lineage Commitment of Cardiac C-kit+ Cells 2017-Dec-12, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.117.030137 PMID:29021323	研究论文	研究不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响	首次揭示了不同病理刺激对心脏c-kit+细胞最终命运的影响，并发现p53在c-kit+细胞向心肌细胞分化中的关键作用	心肌细胞从c-kit+细胞形成的总体速率仍低于临床相关水平	探讨不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响	心脏c-kit+细胞	NA	心血管疾病	单细胞测序	NA	细胞	心脏CD45-c-kit+细胞
28	2024-08-09	Linnorm: improved statistical analysis for single cell RNA-seq expression data 2017-Dec-15, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx828 PMID:28981748	研究论文	Linnorm是一种新的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据标准化和转换方法，旨在去除技术噪声并同时保留生物变异，从而改进现有的统计方法	Linnorm在速度、技术噪声去除和细胞异质性保留方面显示出优势，能改进现有方法在发现新亚型、细胞伪时间排序、聚类分析等方面的应用	NA	开发和评估一种新的scRNA-seq数据标准化和转换方法Linnorm	scRNA-seq数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用真实的scRNA-seq数据进行比较
29	2024-08-09	APE1/Ref-1 knockdown in pancreatic ductal adenocarcinoma - characterizing gene expression changes and identifying novel pathways using single-cell RNA sequencing 2017-12, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.12138 PMID:28922540	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了胰腺导管腺癌中APE1/Ref-1敲低后的基因表达变化，并识别了新的相关通路	首次使用单细胞RNA测序技术研究APE1/Ref-1敲低后的基因表达变化，并发现多个与APE1相关的新通路	研究主要集中在细胞系中，未来需在临床样本中验证这些发现	探究APE1/Ref-1在胰腺导管腺癌中的基因表达调控作用及新通路	胰腺导管腺癌细胞中的APE1/Ref-1蛋白	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个胰腺癌细胞系
30	2024-08-09	Single cell transcriptome analysis of muscle satellite cells reveals widespread transcriptional heterogeneity 2017-Dec-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2017.09.014 PMID:28893664	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析肌肉卫星细胞的转录组，揭示了广泛的转录异质性	本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了肌肉卫星细胞在多个层面的转录异质性，并提出了基因表达“指纹”可能与功能多样性相关的假设	目前对肌肉卫星细胞异质性的自然和范围的理解尚不完整	探索肌肉卫星细胞的转录异质性及其对功能多样性的影响	肌肉卫星细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	新鲜分离的肌肉卫星细胞
31	2024-08-09	Single-cell RNA-sequencing of the brain 2017-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1186/s40169-017-0150-9 PMID:28597408	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在解析大脑细胞异质性及其特定功能和状态中的应用	scRNA-seq技术使得研究人员能够在大脑多个区域中识别出多种细胞亚群，确定基因特征和新细胞标记物，并解决功能差异	由于大脑的复杂性，仍有许多工作需要完成，包括定义特定的大脑细胞类型和功能	旨在通过scRNA-seq技术深入理解大脑细胞的基因组、转录组和表观基因组景观，以及它们在发育、健康和疾病中的整体功能	哺乳动物大脑中的细胞异质性及其特定功能和状态	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	涉及多个小鼠大脑区域的研究
32	2024-08-09	Single-cell sequencing and tumorigenesis: improved understanding of tumor evolution and metastasis 2017-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1186/s40169-017-0145-6 PMID:28405930	综述	本文综述了单细胞测序技术在理解肿瘤演化和转移中的应用及其最新进展	单细胞测序技术提供了高分辨率的基因组和基因表达图谱，有助于研究癌症中的复杂分子异质性	单细胞测序技术在临床应用前仍需克服重大障碍	探讨单细胞测序技术在改善患者护理中的临床应用前景	单细胞测序技术及其在肿瘤基因组和转录组异质性研究中的应用	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	基因组和转录组数据	NA