单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35 篇文献，本页显示第 21 - 35 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
Raman-Activated Droplet Sorting (RADS) for Label-Free High-Throughput Screening of Microalgal Single-Cells
2017-11-21, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.7b03884
PMID:29099582
|
研究论文 | 本文介绍了一种集成化的拉曼激活液滴分选（RADS）微流控系统，用于无标记和高通量地筛选活细胞 | 该系统通过使用AXT合成的工业微藻Haematococcus pluvialis作为模型，实现了比现有RACS系统更高的吞吐量，并保持了细胞的活力 | NA | 开发一种无标记和高通量的活细胞筛选方法 | 工业微藻Haematococcus pluvialis的单细胞 | 微流控技术 | NA | 拉曼微光谱分析 | NA | 细胞 | 混合了不同AXT水平的Haematococcus pluvialis细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals a signature of sexual commitment in malaria parasites
2017-11-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24280
PMID:29094698
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在性分化过程中的转录变化特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，分析了AP2-G调控的性分化相关基因表达变化 | 研究仅限于特定的AP2-G敲降株系和NF54野生型疟原虫，可能不适用于所有疟原虫株系 | 探究疟原虫性分化过程中的转录调控机制 | 疟原虫的性分化过程及其相关基因表达 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过18,000个单个疟原虫转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-09 |
Inferring Relevant Cell Types for Complex Traits by Using Single-Cell Gene Expression
2017-Nov-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2017.09.009
PMID:29106824
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RolyPoly的回归型多基因模型，用于从全基因组关联研究（GWAS）汇总统计数据和基因表达数据中优先考虑与复杂性状相关的细胞类型和基因 | RolyPoly模型能够利用来自批量组织或单细胞RNA测序的表达数据，为理解常见变异对复杂性状贡献细胞类型的影响提供了一个强大的框架 | 以往研究受限于难以表征或稀有细胞群体的功能注释缺乏，导致细胞分辨率受限 | 解决单细胞RNA测序与感兴趣表型之间联系的不足 | 复杂性状相关的细胞类型和基因 | 基因组学 | 阿尔茨海默病，精神分裂症 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | 回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-09 |
Combating subclonal evolution of resistant cancer phenotypes
2017-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01174-3
PMID:29093439
|
研究论文 | 本研究追踪了四种乳腺癌在多年治疗过程中的遗传和表型亚克隆进化，以更好地理解乳腺癌如何变得耐药 | 通过批量和单细胞RNA测序揭示了治疗后恶性表型的获得，包括增强的间质和生长因子信号传导，这可能促进耐药性，以及减少的抗原呈递和TNF-α信号传导，这可能使免疫系统逃避 | 研究仅追踪了四种乳腺癌样本，可能无法完全代表所有乳腺癌的耐药性进化情况 | 理解乳腺癌如何通过亚克隆进化变得耐药，并探索针对性的治疗策略 | 乳腺癌的遗传和表型亚克隆进化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 四种乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-09 |
Neuromedin B Expression Defines the Mouse Retrotrapezoid Nucleus
2017-11-29, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2055-17.2017
PMID:29066557
|
研究论文 | 本文通过多重杂交和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠延髓旁面部区域的RTN神经元的表型多样性，发现Neuromedin B mRNA可以作为RTN神经元的单一特异性标记物。 | 本文首次证明了Neuromedin B mRNA可以作为小鼠RTN神经元的单一特异性标记物，并揭示了RTN神经元的表型多样性。 | 本文主要集中在小鼠模型上，未涉及其他物种，且对于高表达Neuromedin B mRNA的RTN神经元的功能尚未明确。 | 研究小鼠RTN神经元的表型多样性及其特异性标记物。 | 小鼠RTN神经元及其表型多样性。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，多重杂交 | NA | RNA | 雄性和雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-09 |
Accounting for technical noise in differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2017-Nov-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx754
PMID:29036714
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TASC的统计框架，用于在单细胞RNA测序数据中考虑细胞间的技术差异，以准确估计基因的生物学变异并检测差异表达基因 | TASC框架采用经验贝叶斯方法，通过使用外部RNA spike-ins可靠地建模细胞特异性dropout率和放大偏差，并能调整协变量以进一步消除细胞大小和细胞周期差异带来的混杂影响 | NA | 开发一种方法来调整单细胞RNA测序数据中的技术噪声，以提高差异表达分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声和差异表达基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层混合模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-09 |
Single-cell gene expression analysis reveals regulators of distinct cell subpopulations among developing human neurons
2017-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223313.117
PMID:29030469
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中的人类神经元的基因表达，揭示了神经前体细胞亚型的调控机制 | 本研究采用无监督的高分辨率策略，识别细胞发育的分支点，追踪亚群的随机转录动力学，阐明调控网络，并发现关键调控因子 | NA | 揭示个体人类神经前体细胞分化为成熟神经元的随机动力学和调控机制 | 发育中的人类神经元及其神经前体细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-09 |
powsimR: power analysis for bulk and single cell RNA-seq experiments
2017-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx435
PMID:29036287
|
研究论文 | PowsimR 是一个灵活的工具，用于模拟和评估批量及单细胞 RNA-seq 数据中的差异表达，适用于事前和事后功效分析 | PowsimR 提供了对批量和单细胞 RNA-seq 数据进行差异表达模拟和评估的功能，这在现有工具中较为少见 | NA | 优化 RNA-seq 实验设计并评估和比较检测差异表达基因的能力 | 批量和单细胞 RNA-seq 数据中的差异表达 | RNA 测序 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-09 |
Network embedding-based representation learning for single cell RNA-seq data
2017-Nov-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx750
PMID:28977434
|
研究论文 | 本文提出了一种基于网络嵌入的单细胞RNA测序数据表示学习方法SCRL | SCRL方法能够有效实现数据驱动的非线性投影，并结合先验生物学知识（如通路信息）学习更有意义的低维表示 | NA | 克服单细胞RNA测序数据中的高噪声和低覆盖率问题，提高数据处理的效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络嵌入 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-09 |
Long-term expansion of alveolar stem cells derived from human iPS cells in organoids
2017-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4448
PMID:28967890
|
研究论文 | 本文报道了一种从人诱导多能干细胞（hiPSCs）高效生成并长期扩展含有SFTPC肺泡干细胞的肺泡类器官（AOs）的方法 | 本文首次实现了从hiPSCs中稳定扩展肺泡类器官，并展示了其在药物毒理学研究中的应用 | NA | 开发一种新的方法来模拟人类肺泡并应用于疾病建模和再生医学 | 人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的肺泡上皮细胞类型II（AT2）细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-09 |
Developmental biology: Single-cell RNA sequencing identifies novel kidney cell types in zebrafish
2017-11, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/nrneph.2017.137
PMID:28944777
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-09 |
A short review of variants calling for single-cell-sequencing data with applications
2017-11, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.09.018
PMID:28951246
|
综述 | 本文综述了单细胞测序数据中变异检测的方法及其应用 | 介绍了两种流行的基因组扩增方法并比较了它们的能力，以及几种用于单核苷酸多态性和拷贝数变异检测的流行模型 | 单细胞测序需要额外的基因组扩增步骤，这会产生大量偏差，对使用批量细胞测序方法提出了挑战 | 旨在为开发专门的分析方法以及使用现有工具提供指导 | 单细胞测序数据中的变异检测 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Technologies for Cardiac Stem Cell Studies
2017-11-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2017.0050
PMID:28859577
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在心脏干细胞研究中的最新进展及其应用 | 单细胞测序技术为干细胞和再生医学研究提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在心脏干细胞研究中的应用，以理解心脏发育和再生的机制 | 心脏干细胞（CSCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-09 |
Proinflammatory Dual Receptor T Cells in Chronic Graft-versus-Host Disease
2017-Nov, Biology of blood and marrow transplantation : journal of the American Society for Blood and Marrow Transplantation
DOI:10.1016/j.bbmt.2017.07.016
PMID:28750779
|
研究论文 | 本文研究了慢性移植物抗宿主病（cGVHD）中双T细胞受体（TCR）细胞的作用 | 首次揭示了双TCR细胞在cGVHD中的病理作用，并指出了Tbet驱动的T细胞功能作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨双TCR细胞在慢性移植物抗宿主病中的潜在作用 | 慢性移植物抗宿主病患者中的双TCR细胞 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-09 |
Genome-wide identification of genes essential for podocyte cytoskeletons based on single-cell RNA sequencing
2017-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2017.04.022
PMID:28709640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对20个鼠足细胞进行分析，鉴定出对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 通过单细胞RNA测序技术，扩展了足细胞细胞骨架关键基因的列表 | NA | 鉴定对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 鼠足细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个鼠足细胞 | NA | NA | NA | NA |