单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32 篇文献，本页显示第 21 - 32 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
The promise of spatial transcriptomics for neuroscience in the era of molecular cell typing
2017-10-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aan6827
PMID:28983044
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综述 | 本文综述了空间转录组学在神经科学中的应用前景，特别是在分子细胞类型鉴定时代的重要性 | 新兴的空间转录组学方法有望通过在组织中定位分子定义的细胞类型，同时检测形态、活动或连接性，填补分子细胞类型与形态学、生理学和行为相关性之间的空白 | 目前空间转录组学方法仍面临挑战，包括技术要求和实际应用中的困难 | 探讨空间转录组学方法在连接分子细胞类型与神经功能、发育和疾病中的应用 | 神经科学中的细胞类型及其在功能电路中的作用 | 分子细胞类型鉴定 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22 | 2024-08-09 |
Impact of sequencing depth and read length on single cell RNA sequencing data of T cells
2017-10-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-12989-x
PMID:28986563
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研究论文 | 研究了读长和测序深度对单细胞RNA测序数据质量的影响 | 探讨了读长和测序深度对基因表达谱质量、细胞类型识别及TCRαβ重建的影响 | 研究仅限于8个公开的单细胞RNA测序数据集 | 评估读长和测序深度对单细胞RNA测序数据质量的影响 | T细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 1,305个单细胞 |
| 23 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Human Pancreas Reveals Transcriptional Signatures of Aging and Somatic Mutation Patterns
2017-Oct-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.09.004
PMID:28965763
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了人类胰腺细胞在衰老过程中的转录特征和体细胞突变模式 | 本文首次在健康衰老的内分泌细胞中发现了新的突变特征，并展示了使用单细胞RNA测序数据研究衰老过程中遗传和转录过程的可行性 | NA | 研究人类胰腺细胞在衰老过程中的转录特征和体细胞突变模式 | 人类胰腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2,544个人类胰腺细胞，来自8个跨越60年生命周期的捐赠者 |
| 24 | 2024-08-09 |
SAIC: an iterative clustering approach for analysis of single cell RNA-seq data
2017-Oct-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-4019-5
PMID:28984204
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAIC的新算法，用于通过迭代聚类方法分析单细胞RNA-seq数据，以识别最佳的特征基因集来区分不同的细胞群 | SAIC算法通过迭代聚类方法进行全面搜索，以找到最佳参数，从而识别出能最好地区分细胞群的特征基因集 | NA | 开发一种有效的算法，用于识别根据表达模式将单细胞分离成不同群组的最优基因子集 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 迭代聚类算法 | 基因表达数据 | 两个已发表的单细胞RNA-seq数据集 |
| 25 | 2024-08-09 |
Dissecting hematopoietic and renal cell heterogeneity in adult zebrafish at single-cell resolution using RNA sequencing
2017-Oct-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20170976
PMID:28878000
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研究论文 | 本研究利用大规模并行单细胞RNA测序技术，解析成年斑马鱼肾脏骨髓中的细胞异质性，构建了一个全面的分子图谱。 | 本研究首次提供了成年斑马鱼肾脏和骨髓细胞的全面单细胞转录组分析，并发现了新的细胞类型，如两种自然杀伤免疫细胞、红细胞前体造血干细胞和祖细胞、粘蛋白分泌的肾细胞以及肾干细胞/祖细胞。 | NA | 研究目的是定义斑马鱼肾脏骨髓中的细胞异质性，并构建一个全面的分子图谱。 | 研究对象包括斑马鱼的肾脏和骨髓细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼的肾脏和骨髓细胞 |
| 26 | 2024-08-09 |
The Drosophila embryo at single-cell transcriptome resolution
2017-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aan3235
PMID:28860209
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术对精确分期的果蝇胚胎进行研究，并开发了一种计算映射策略DistMap，以重建胚胎并预测接近单细胞分辨率的空间基因表达。 | 本文创新性地使用了单细胞测序技术，并开发了DistMap计算映射策略和DVEX数据库，能够生成三维虚拟原位杂交并计算基因表达梯度。 | NA | 旨在重建果蝇胚胎并预测接近单细胞分辨率的空间基因表达。 | 果蝇胚胎的单细胞转录组。 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | DistMap计算映射策略 | 转录组数据 | 约6000个细胞 |
| 27 | 2024-08-09 |
Psychrophilic proteases dramatically reduce single-cell RNA-seq artifacts: a molecular atlas of kidney development
2017-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.151142
PMID:28851704
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研究论文 | 本文介绍了一种使用低温活性蛋白酶的单细胞RNA测序分离方法，该方法在6°C或更低温度下进行，有效减少了基因表达的伪影，并生成新生小鼠肾脏的单细胞分辨率基因表达图谱。 | 使用来自嗜冷微生物的低温活性蛋白酶，在6°C或更低温度下进行单细胞RNA测序，有效减少了基因表达的伪影。 | 传统的单细胞RNA测序方法在37°C下酶解组织，可能导致基因表达模式的伪影变化。 | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，减少基因表达伪影，并生成新生小鼠肾脏的基因表达图谱。 | 新生小鼠肾脏的单细胞RNA测序。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20,424个单细胞 |
| 28 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainage
2017-Oct, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.14294
PMID:28802076
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了酸矿排水（AMD）中Hydrotalea属微生物的生活方式及其基于CRISPR的种群历史 | 首次通过单细胞测序技术分析了早期AMD样本中Hydrotalea属微生物的基因组，并发现了两种共存的CRISPR-Cas位点及其在种群中的异质性 | 研究仅限于早期AMD样本中的Hydrotalea属微生物，未涉及其他阶段或其他环境中的微生物群落动态 | 探究酸矿排水环境中微生物群落动态，特别是早期发展阶段的微生物种群历史和适应性 | Hydrotalea属微生物及其在酸矿排水环境中的适应性和种群历史 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 来自早期AMD样本的单细胞 |
| 29 | 2024-08-09 |
Genetics: Taking single-cell transcriptomics to the bedside
2017-10, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/nrclinonc.2017.117
PMID:28762386
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-09 |
Lack of human cytomegalovirus expression in single cells from glioblastoma tumors and cell lines
2017-10, Journal of neurovirology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s13365-017-0543-y
PMID:28695489
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术检测人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤肿瘤和细胞系中的表达情况 | 首次在单细胞水平上严格测试人类巨细胞病毒RNA在胶质母细胞瘤样本中的表达 | 仅分析了五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系的样本 | 探讨人类巨细胞病毒与胶质母细胞瘤之间的关系，并评估单细胞数据在肿瘤病毒学中的潜在应用 | 人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系 |
| 31 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics of pluripotent stem cells: reprogramming and differentiation
2017-Oct, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2017.06.003
PMID:28675884
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在多能干细胞重编程和分化中的应用及其最新进展和重要发现 | 单细胞转录组学技术提供了高分辨率的细胞状态识别和细胞群体内异质性解析的新视角 | NA | 探讨单细胞转录组学在多能干细胞研究中的应用 | 多能干细胞的重编程和分化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 32 | 2024-08-09 |
ASAP: a web-based platform for the analysis and interactive visualization of single-cell RNA-seq data
2017-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx337
PMID:28541377
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研究论文 | 本文介绍了一个名为ASAP的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的分析和交互式可视化 | ASAP平台整合了多种常用算法和高级可视化工具，使缺乏计算专业知识的研究人员也能轻松处理和分析单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个用户友好的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的全面分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 91个鼠细胞，涉及五种不同的细胞类型 |