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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-09 |
JingleBells: A Repository of Immune-Related Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2017-05-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1700272
PMID:28416714
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研究论文 | 本文介绍了JingleBells数据库,该数据库收集并标准化了免疫相关的单细胞RNA测序数据,便于分析和可视化 | JingleBells数据库提供了统一格式的单细胞RNA测序数据,并附带可视化教程,使得非计算生物学家也能利用这些数据 | NA | 旨在促进免疫相关单细胞RNA测序数据的重用和可视化 | 免疫相关的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 多个公开可用的免疫相关单细胞RNA测序数据集 |
22 | 2024-08-09 |
An immunoaffinity-based method for isolating ultrapure adult astrocytes based on ATP1B2 targeting by the ACSA-2 antibody
2017-05-26, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.M116.765313
PMID:28373281
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研究论文 | 本文介绍了一种基于ACSA-2抗体靶向ATP1B2的免疫亲和方法,用于从成年大脑中分离超纯星形胶质细胞 | 首次展示了ACSA-2抗体在成年组织中分离细胞的实用性,并首次鉴定了ACSA-2表位为ATP1B2 | NA | 探索星形胶质细胞的分子机制及其在中枢神经系统中的作用 | 星形胶质细胞及其在中枢神经系统中的分布和表达 | NA | NA | 单细胞测序、过表达和敲降实验、免疫印迹和免疫组织化学 | NA | 细胞 | 多个中枢神经系统损伤和疾病模型中的星形胶质细胞 |
23 | 2024-08-09 |
Reference component analysis of single-cell transcriptomes elucidates cellular heterogeneity in human colorectal tumors
2017-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/ng.3818
PMID:28319088
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析结直肠肿瘤及其微环境的转录异质性,并开发了一种名为参考成分分析(RCA)的算法来提高单细胞转录组聚类的准确性 | 开发了参考成分分析(RCA)算法,显著提高了单细胞转录组聚类的准确性,并发现了两种不同的癌相关成纤维细胞(CAFs)亚型 | NA | 阐明人类结直肠肿瘤中的细胞异质性 | 结直肠肿瘤及其微环境的转录异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 参考成分分析(RCA) | 转录组 | 11个结直肠肿瘤及匹配的正常黏膜样本 |
24 | 2024-08-09 |
cgCorrect: a method to correct for confounding cell-cell variation due to cell growth in single-cell transcriptomics
2017-05-11, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aa609a
PMID:28198357
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cgCorrect的统计框架,用于校正单细胞转录组数据中由于细胞生长引起的细胞间变异 | cgCorrect框架能够基于细胞周期中细胞体积与转录本数量成比例增加的假设,校正细胞大小差异带来的影响 | NA | 开发一种方法来校正单细胞转录组数据中由于细胞生长引起的细胞间变异 | 单细胞转录组数据中的细胞大小差异 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 转录组数据 | 模拟数据和小鼠血液干细胞及前体细胞的单细胞定量实时PCR数据,以及小鼠胚胎干细胞的单细胞RNA测序数据 |
25 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of small microbial eukaryotes: limitations and potential
2017-05, The ISME journal
DOI:10.1038/ismej.2016.190
PMID:28060364
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在小型微生物真核生物研究中的局限性和潜力 | 单细胞转录组学在微生物真核生物研究中具有巨大的未开发潜力 | 在小型微生物真核生物中,单细胞转录组学的转录恢复率较低,且基因表达水平的随机性较高 | 探讨单细胞RNA-seq在小型微生物真核生物研究中的应用 | 小型微生物真核生物 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组 | 两个小型原生生物(8和15 μm) |
26 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing: The future of genome biology is now
2017-05-04, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2016.1201618
PMID:27442339
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在基因组学研究中的应用及其对未来科学和社会的影响 | 介绍了更敏感和自动化的方法,提高了数据质量和通量,减少了操作时间 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在基因组学研究中的应用及其对未来科学和社会的影响 | 单细胞RNA测序技术及其在复杂多细胞生物中的转录组景观研究 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |