单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 26 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-10-06
Identification of preoptic sleep neurons using retrograde labelling and gene profiling
2017-05-25, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过逆向标记和基因分析技术识别了下丘脑视前区的睡眠神经元 首次基于神经元投射目标识别视前区睡眠神经元群体并发现其分子标记 NA 解析视前区睡眠控制神经回路机制 下丘脑视前区GABA能神经元 神经科学 睡眠障碍 逆向标记,双向光遗传学操作,光电极记录,翻译核糖体亲和纯化,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,电生理记录数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2025-10-06
Proliferation Drives Aging-Related Functional Decline in a Subpopulation of the Hematopoietic Stem Cell Compartment
2017-05-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了造血干细胞衰老过程中JAK/STAT信号驱动增殖导致p53介导功能衰退的机制 首次在衰老造血干细胞中发现携带p53特征的特殊亚群,并揭示JAK2V617F驱动增殖与该亚群扩增的因果关系 研究主要基于小鼠模型,人类造血干细胞衰老机制可能有所不同 探究造血干细胞衰老过程中分子机制和细胞异质性 小鼠造血干细胞 单细胞生物学 衰老相关疾病 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 老年小鼠造血干细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2025-10-06
Lineage-dependent spatial and functional organization of the mammalian enteric nervous system
2017-05-19, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了小鼠肠道神经系统由迁移后神经嵴祖细胞形成的重叠克隆单元构成,并阐明了其空间功能组织机制 发现肠道神经系统的无定形神经胶质网络由重叠的克隆单元组成,揭示了谱系关系在周围神经系统组织中的基础作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他哺乳动物中验证 探究哺乳动物肠道神经系统的空间和功能组织机制 小鼠肠道神经系统 发育生物学 NA 单细胞转录组学,诱变分析 NA 基因表达数据,功能活动数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2025-10-06
Vitamin A-Retinoic Acid Signaling Regulates Hematopoietic Stem Cell Dormancy
2017-May-18, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了维生素A-视黄酸信号通路调控造血干细胞休眠的分子机制 首次发现休眠造血干细胞具有低Myc水平和高视黄酸程序表达特征,并建立了Gprc5c控制的报告小鼠模型 研究主要基于小鼠模型,人类造血干细胞的相关机制仍需进一步验证 探索造血干细胞休眠状态的分子特征及其调控机制 休眠造血干细胞(dHSCs) 单细胞生物学 血液系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2025-10-06
Alternative TSSs are co-regulated in single cells in the mouse brain
2017-05-11, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA-seq数据揭示了小鼠大脑中替代转录起始位点在单细胞水平上的共调控机制 首次在单细胞水平研究替代转录起始位点的使用模式,发现同一细胞类型中不同TSS之间存在高度相关性 依赖于已发表的单细胞RNA-seq数据集,未进行实验验证 探究单细胞中替代转录起始位点的表达调控模式 小鼠大脑细胞 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 数千个细胞 NA single-cell RNA-seq NA NA
6 2025-10-06
A Gene Regulatory Network Balances Neural and Mesoderm Specification during Vertebrate Trunk Development
2017-05-08, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞(NMPs)的分子特征及其分化调控机制 首次识别了NMPs的分子特征,并揭示了整合视黄酸(RA)和Wnt信号的转录调控网络如何平衡神经和中胚层组织的生成 NA 解析脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞的分化调控机制 脊椎动物胚胎中的神经中胚层祖细胞(NMPs) 发育生物学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2025-10-06
SC3: consensus clustering of single-cell RNA-seq data
2017-May, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了一种用于单细胞RNA-seq数据无监督聚类的用户友好工具SC3 通过共识方法整合多个聚类解决方案,实现了高精度和鲁棒性的单细胞聚类 NA 开发单细胞RNA-seq数据的共识聚类方法 单细胞转录组数据 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 共识聚类 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2025-10-06
Heterogeneity of hypothalamic pro-opiomelanocortin-expressing neurons revealed by single-cell RNA sequencing
2017-05, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑POMC神经元的异质性 首次在单细胞水平系统揭示POMC神经元的分子异质性,发现传统认知外的A+P+神经元亚群及其差异表达模式 研究仅基于163个小鼠神经元样本,样本量有限;仅关注基因表达层面,未验证功能差异 探究下丘脑弓状核POMC神经元的分子异质性 小鼠下丘脑弓状核POMC神经元 单细胞组学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 无监督聚类分析 单细胞基因表达数据 163个小鼠神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2024-08-07
Selective Photomechanical Detachment and Retrieval of Divided Sister Cells from Enclosed Microfluidics for Downstream Analyses
2017-05-23, ACS nano IF:15.8Q1
research paper 本研究开发了一种光机械方法,用于从封闭的微流控室中有选择地分离和可靠地检索目标细胞,以便进行进一步分析。 首次使用碳纳米管-聚二甲基硅氧烷复合表面和纳秒脉冲激光诱导的剪切力来分离细胞,并保持细胞活性和分子表达水平。 NA 开发一种新的方法来分离和检索封闭微流控室中的姐妹细胞,以便进行下游分析。 癌症干细胞样细胞的自更新和分化过程中的基因变化。 microfluidics NA photomechanical method NA single-cell transcriptome 96个单细胞 NA NA NA NA
10 2024-08-09
Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells
2017-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提出了一种新技术,用于在分离和测序前识别细胞的形态和功能,以便更容易地鉴定亚型特异性标记 该技术克服了单细胞RNA测序的许多障碍,并可能适用于非神经元细胞类型和具有微小变化的稀有细胞群体 需要严格的验证方法来确保聚类包含具有相同功能的细胞 旨在识别定义各种细胞亚群的基因表达,并研究与特定视觉功能相关的脑目标 视网膜神经节细胞的亚型 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 许多单细胞的测序深度超过2000万读数 NA NA NA NA
11 2024-08-09
DTWscore: differential expression and cell clustering analysis for time-series single-cell RNA-seq data
2017-May-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种基于动态时间规整评分(DTWscore)的算法,用于时间序列单细胞RNA测序数据中的差异表达和细胞聚类分析 提出了一种结合动态时间规整评分和时间序列数据的算法,用于检测单细胞RNA测序样本中的基因表达变化并恢复潜在的细胞类型 研究仅限于在R框架内实现和可用的方法 开发一种新算法,用于分析时间序列单细胞RNA测序数据中的基因表达模式和细胞类型 时间序列单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 动态时间规整评分 时间序列数据 多个时间点的单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA
12 2024-08-09
Cell fixation and preservation for droplet-based single-cell transcriptomics
2017-05-19, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本文研究了使用化学固定方法来稳定和保存细胞,以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 提出了一种简单的细胞固定方法,可以稳定和保存细胞数周,而不影响单细胞RNA测序数据的质量 未提及 开发一种新的细胞固定和保存方法,以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 人源和鼠源的细胞,以及果蝇胚胎、小鼠后脑和 cerebellum 细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 数千个单细胞 NA NA NA NA
13 2024-08-09
Isolation of the Side Population in Myc-induced T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia in Zebrafish
2017-05-04, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文描述了一种在斑马鱼中分离Myc诱导的T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)旁系细胞群的方法 首次在斑马鱼T-ALL模型中描述了如何分离旁系细胞群,并提出了通过单细胞转录组学研究这些细胞遗传特征的可能性 目前尚无已知的斑马鱼细胞表面标记物来确认这些旁系细胞是否具有癌症干细胞样特性 研究斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 NA T细胞急性淋巴母细胞白血病 流式细胞术 NA 细胞 多个斑马鱼胚胎 NA NA NA NA
14 2024-08-09
Hierarchical Specification of Pruriceptors by Runt-Domain Transcription Factor Runx1
2017-05-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 本文研究了Runx1转录因子在背根神经节(DRG)感觉神经元中的作用,特别是其在瘙痒感受器发育中的功能 首次揭示了Runx1在瘙痒感受器发育中的双重作用,早期促进NPPB细胞形成,后期转变为基因抑制因子 NA 探讨Runx1在瘙痒感受器发育中的作用及其对感觉神经元形成不同感觉模式的控制机制 背根神经节中的感觉神经元及其在瘙痒信息传递中的作用 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用雌雄两性的小鼠进行行为学研究 NA NA NA NA
15 2024-08-09
Spatially resolved transcriptome profiling in model plant species
2017-May-08, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 本文介绍了一种在多种模式植物系统中生成和研究高分辨率空间解析功能轮廓的新方法 首次提出了一种适用于广泛模式植物系统的高通量空间转录组分析方法 NA 探索复杂生物系统的功能特征,特别是在植物中的空间表达谱 模式被子植物和裸子植物的微切片 NA NA 空间转录组分析 NA 转录组数据 在拟南芥中分析了八个花序组织域中的141个基因和189条通路的表达水平 NA NA NA NA
16 2024-08-09
Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer
2017-05-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术对乳腺癌组织进行转录组分析,揭示了肿瘤细胞和免疫细胞的异质性 首次在单细胞水平上全面分析了乳腺癌肿瘤细胞及其周围微环境中的免疫细胞 研究样本仅来自11名患者,可能影响结果的普遍性 探讨乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中免疫细胞的转录组异质性 乳腺癌肿瘤细胞及其周围的基质和免疫细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 515个细胞来自11名患者 NA NA NA NA
17 2024-08-09
Single cell RNA sequencing to dissect the molecular heterogeneity in lupus nephritis
2017-May-04, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检组织,以揭示疾病的分子异质性 首次展示了scRNA-seq在常规护理中获取样本的可行性,并揭示了皮肤活检作为肾病标志物的潜力 NA 探讨狼疮性肾炎的分子异质性,并寻找新的诊断和治疗标志物 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤组织 数字病理学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 人类肾和皮肤活检组织样本 NA NA NA NA
18 2024-08-09
Pseudotemporal Ordering of Single Cells Reveals Metabolic Control of Postnatal β Cell Proliferation
2017-May-02, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了出生后β细胞增殖的代谢调控机制 首次提供了出生后β细胞状态变化的高分辨率分子特征,并揭示了氨基酸代谢、线粒体功能及Srf/Jun/Fos转录因子在β细胞增殖中的作用 NA 探究出生后β细胞增殖的调控机制,并寻找新的治疗靶点以促进β细胞再生 出生后β细胞的转录组动态变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个出生后时间点的β细胞样本 NA NA NA NA
19 2024-08-09
Human organomics: a fresh approach to understanding human development using single-cell transcriptomics
2017-05-01, Development (Cambridge, England)
research paper 本文总结了利用单细胞转录组学技术在类器官上进行的研究方法,并讨论了将这些技术应用于生成人体发育和疾病的器官水平机制模型的机遇与挑战 利用创新的单细胞转录组学技术,从多能干细胞重现人体器官发生过程,解析类器官的组成部分并重建细胞分化过程中的谱系轨迹 NA 探索人体发育生物学,生成人体发育和疾病的器官水平机制模型 人体器官发育过程及疾病机制 digital pathology NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
20 2024-08-09
Conditional knockin of Dnmt3a R878H initiates acute myeloid leukemia with mTOR pathway involvement
2017-05-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
research paper 本文通过生成Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠,研究了R882H突变在人类急性髓系白血病(AML)中的特征。 首次通过条件性敲入技术生成Dnmt3a R878H小鼠模型,揭示了该突变在AML中的分子和表观遗传学变化。 NA 探索Dnmt3a R878H突变在急性髓系白血病中的作用及其分子机制。 Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠及其在AML中的表型和分子特征。 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 转录组和DNA甲基化数据 Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠 NA NA NA NA
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