单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 330 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived neurons respond to convulsant drugs when co-cultured with hiPSC-derived astrocytes
2017-08-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2017.06.010
PMID:28666936
|
研究论文 | 本文研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时对致痉挛药物的反应 | 首次探讨了hiPSC衍生的神经元与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养系统在药物诱导癫痫风险评估中的应用 | 尚未完全解决hiPSC衍生的神经元在药物诱导癫痫风险评估中的应用，尤其是在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养的情况下 | 探讨hiPSC衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时如何用于评估药物诱导的癫痫风险 | hiPSC衍生的神经元和星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 共培养8周的hiPSC衍生的神经元与星形胶质细胞 |
| 162 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing made simple
2017-07-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/547125a
PMID:28682345
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-09 |
Identifying Cell Subpopulations and Their Genetic Drivers from Single-Cell RNA-Seq Data Using a Biclustering Approach
2017-Jul, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2017.0049
PMID:28657835
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研究论文 | 本文介绍了一种基于SNN-Cliq算法的快速简单迭代双聚类方法BiSNN-Walk，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞亚群及其相关的遗传驱动因子 | BiSNN-Walk方法返回一个按可靠性排序的聚类列表，并根据基因与相关细胞聚类的关联程度对基因进行排序，使结果更具生物学解释性 | NA | 开发一种新的双聚类方法，用于分析单细胞RNA测序数据，以识别细胞亚群及其遗传驱动因子 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其遗传驱动因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法 | 基因表达数据 | 三项大型单细胞RNA测序研究 |
| 164 | 2024-08-09 |
IFNγ-Dependent Tissue-Immune Homeostasis Is Co-opted in the Tumor Microenvironment
2017-Jun-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.06.016
PMID:28666115
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研究论文 | 本文探讨了IFNγ依赖的组织免疫稳态在肿瘤微环境中的作用 | 发现IFNγ依赖的稳态程序在多种人类原发性肿瘤中富集，并影响患者的生存 | NA | 研究免疫稳态如何影响肿瘤监测及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫单核吞噬细胞在健康组织中的稳态程序及其在肿瘤中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类原发性肿瘤样本，包括黑色素瘤 |
| 165 | 2024-08-09 |
BRIE: transcriptome-wide splicing quantification in single cells
2017-06-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1248-5
PMID:28655331
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研究论文 | 本文介绍了BRIE模型，用于单细胞转录组中剪接事件的定量分析 | BRIE模型通过学习序列特征的先验分布，解决了单细胞RNA测序技术在RNA加工事件分析中的局限性 | NA | 探索单细胞RNA测序实验中RNA加工的随机性 | 单细胞转录组中的剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 转录组数据 | NA |
| 166 | 2024-08-09 |
Independent regulation of gene expression level and noise by histone modifications
2017-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1005585
PMID:28665997
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研究论文 | 研究通过计算分析单细胞RNA测序数据和酵母流式细胞术实验，探讨了组蛋白修饰在人类胚胎细胞和酵母中独立调控基因表达水平和噪声的机制 | 揭示了组蛋白修饰通过影响基因表达的爆发大小和频率，实现对基因表达水平和噪声的独立调控，扩展了“组蛋白密码”假说 | NA | 探讨组蛋白修饰如何独立调控基因表达水平和噪声 | 人类胚胎细胞和酵母中的基因表达噪声 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 167 | 2024-08-09 |
Time-lapse observation and transcriptome analysis of a case with repeated multiple pronuclei after IVF/ICSI
2017-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-017-0972-9
PMID:28643089
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研究论文 | 本研究通过时间流逝观察和转录组分析，探讨了一位患者在接受体外受精（IVF）和胞浆内单精子注射（ICSI）后反复形成多原核合子的原因 | 本研究首次通过时间流逝观察和转录组分析，识别了影响原核形成的几个候选基因，为不孕症提供了新的病因 | 本研究为个案研究，样本量较小，需要进一步的大样本研究验证结果 | 探讨IVF/ICSI后反复形成多原核合子的原因 | 一位不明原因原发性不孕患者的多原核合子 | NA | 不孕症 | 荧光原位杂交（FISH），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者1例，捐赠者4例 |
| 168 | 2024-08-09 |
Inflammatory Ly6Chi monocytes and their conversion to M2 macrophages drive atherosclerosis regression
2017-Aug-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI75005
PMID:28650342
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研究论文 | 研究探讨了在正常血脂小鼠中，炎症性Ly6Chi单核细胞转化为M2巨噬细胞在动脉粥样硬化消退中的起源和功能需求 | 首次证实了Ly6Chi炎症性单核细胞的持续招募及其通过STAT6依赖性极化为M2状态在动脉粥样硬化炎症消退和斑块消退中的必要性 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 开发促进动脉粥样硬化消退的治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的M2巨噬细胞和Ly6Chi单核细胞 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了WT、Ccr2-/-、Cx3cr1-/-和Ccr5-/-等多种基因型的小鼠进行移植实验 |
| 169 | 2024-08-09 |
A TRPV1-to-secretagogin regulatory axis controls pancreatic β-cell survival by modulating protein turnover
2017-07-14, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201695347
PMID:28637794
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研究论文 | 本文探讨了TRPV1通道通过招募Sp1转录因子诱导secretagogin表达，从而调控胰腺β细胞生存和胰岛素释放的机制 | 揭示了TRPV1与secretagogin之间的调控轴，这一机制在糖尿病胰腺中对维持β细胞结构完整性和信号传递能力至关重要 | NA | 研究TRPV1与secretagogin在胰腺β细胞生存和胰岛素释放中的调控作用 | 胰腺β细胞、TRPV1通道、secretagogin蛋白 | 生物医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自糖尿病供体的β细胞和secretagogin敲除小鼠的胰腺胰岛 |
| 170 | 2024-08-09 |
Reconstructing cell cycle pseudo time-series via single-cell transcriptome data
2017-06-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-00039-z
PMID:28630425
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研究论文 | 本文开发了一种基于旅行商问题和隐马尔可夫模型的计算方法reCAT，用于从非同步单细胞转录组数据中恢复细胞周期时间序列 | reCAT方法能够准确可靠地恢复细胞周期，并展示细胞周期相关基因的表达波峰，以及细胞周期中的甲基化变化 | NA | 研究单细胞转录组数据中的细胞周期解析 | 单细胞转录组数据中的细胞周期阶段 | 生物信息学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 隐马尔可夫模型 | 转录组数据 | 多个数据集 |
| 171 | 2024-08-09 |
Dosage compensation in the process of inactivation/reactivation during both germ cell development and early embryogenesis in mouse
2017-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-03829-z
PMID:28623283
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研究论文 | 本研究通过获取小鼠在生殖细胞发育和早期胚胎发生过程中经历失活/再激活的细胞的RNA-seq数据，特别是单细胞RNA-seq数据，计算X:A比率，以探讨哺乳动物中X染色体的上调机制。 | 本研究提供了直接证据，表明单个活跃的X染色体的平均基因剂量被上调，以达到与两个活跃的X染色体和两份常染色体相似的水平。 | NA | 探讨哺乳动物中X染色体的失活和上调机制。 | 小鼠在生殖细胞发育和早期胚胎发生过程中经历失活/再激活的细胞。 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据，特别是单细胞RNA-seq数据 | 多个小鼠预植入胚胎的单个细胞 |
| 172 | 2024-08-09 |
Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing
2017-Jun-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.05.035
PMID:28622514
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了肝癌患者肿瘤浸润T细胞的转录组特征 | 首次详细描述了肝癌中11种T细胞亚群的分子和功能特性及其发育轨迹，并鉴定了各亚群的特征基因 | 研究样本仅来自六名肝细胞癌患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肝癌中浸润T细胞的景观，为免疫治疗和临床反应预测提供依据 | 肝细胞癌患者的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5,063个单个T细胞，来自六名肝细胞癌患者的外周血、肿瘤和邻近正常组织 |
| 173 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome of early embryos and cultured embryonic stem cells of cynomolgus monkeys
2017, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/sdata.2017.67
PMID:28649393
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研究论文 | 本文提供了食蟹猴早期胚胎和培养的胚胎干细胞的单细胞转录组数据集 | 首次提供了食蟹猴早期胚胎和胚胎干细胞的单细胞转录组数据，填补了灵长类动物胚胎发育研究的空白 | NA | 研究灵长类动物，包括人类的发育生物学过程 | 食蟹猴的早期胚胎细胞、原始生殖细胞和胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 174 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing of the brain
2017-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1186/s40169-017-0150-9
PMID:28597408
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在解析大脑细胞异质性及其特定功能和状态中的应用 | scRNA-seq技术使得研究人员能够在大脑多个区域中识别出多种细胞亚群，确定基因特征和新细胞标记物，并解决功能差异 | 由于大脑的复杂性，仍有许多工作需要完成，包括定义特定的大脑细胞类型和功能 | 旨在通过scRNA-seq技术深入理解大脑细胞的基因组、转录组和表观基因组景观，以及它们在发育、健康和疾病中的整体功能 | 哺乳动物大脑中的细胞异质性及其特定功能和状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及多个小鼠大脑区域的研究 |
| 175 | 2024-08-09 |
Multilineage communication regulates human liver bud development from pluripotency
2017-06-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature22796
PMID:28614297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从多能性细胞出发，在二维和三维培养系统中重建肝细胞样谱系进展，并探讨异型细胞间相互作用对肝芽发育的影响 | 首次通过三维肝芽类器官模型，揭示了肝细胞前体细胞在肝芽发育中的谱系分化和迁移特征，以及血管内皮生长因子在促进内皮网络形成和肝细胞前体分化中的作用 | NA | 探讨多谱系细胞间通信在人肝芽从多能性细胞发育过程中的作用 | 肝细胞样谱系进展、肝芽类器官发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 176 | 2024-08-09 |
Generation of Single-Cell Transcript Variability by Repression
2017-Jun-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2017.05.028
PMID:28602650
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了Dictyostelium分化过程中转录变异性的产生机制，发现这种变异性主要由抑制而非激活驱动 | 本研究揭示了细胞间差异的产生可能是转录调控基本机制的直接结果，并提出了一个简单的转录产物生成模型，其中表达由转录事件的频率而非幅度控制 | NA | 探讨基因表达变异性的产生机制及其在细胞命运多样性中的作用 | Dictyostelium分化过程中的单细胞转录变异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录数据 | NA |
| 177 | 2024-08-09 |
Single-Cell mRNA Sequencing in Cancer Research: Integrating the Genomic Fingerprint
2017, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2017.00073
PMID:28620412
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综述 | 本文综述了单细胞mRNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中的最新进展，特别是其在评估肿瘤内异质性中的应用 | scRNA-seq与DNA测序结合，能够推断基因组改变对基因表达的影响，并可靠地区分肿瘤细胞与非肿瘤细胞 | 讨论了scRNA-seq与DNA测序结合的挑战和前景 | 评估肿瘤内异质性 | 单细胞mRNA测序在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 178 | 2024-08-09 |
Revealing allele-specific gene expression by single-cell transcriptomics
2017-09, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.05.029
PMID:28578186
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在常染色体和X染色体基因背景下研究等位基因特异性表达（ASE）的最新进展，并回顾了用于识别单倍型相位的生物信息学工具。 | 单细胞测序技术提供了前所未有的分辨率和规模，对生物学和医学产生了重大影响。 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在等位基因特异性表达研究中的应用。 | 常染色体和X染色体基因的等位基因特异性表达。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 179 | 2024-08-09 |
The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection
2017-08-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20170252
PMID:28572171
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研究论文 | 本文比较了四种全基因组扩增试剂盒在Ion Proton平台上检测拷贝数变异的性能 | 首次针对Ion Proton平台进行不同全基因组扩增策略的性能比较研究 | NA | 评估四种商业化全基因组扩增试剂盒在Ion Proton平台上检测拷贝数变异的性能 | 六种不同核型的细胞系 | 基因组学 | NA | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | 六种不同核型的细胞系 |
| 180 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Expanded Clones of Islet Antigen-Reactive CD4+ T Cells in Peripheral Blood of Subjects with Type 1 Diabetes
2017-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1700172
PMID:28566371
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1型糖尿病患者和健康对照组外周血中胰岛抗原反应性CD4+记忆T细胞的TCR克隆型和转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了1型糖尿病患者外周血中胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的扩展克隆，并发现这些克隆具有独特的抗原特异性和表型 | 研究样本量较小，且未涉及更广泛的疾病阶段和人群 | 探讨1型糖尿病患者外周血中胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | 1型糖尿病患者和健康对照组的外周血中的胰岛抗原反应性CD4+记忆T细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及1型糖尿病患者和健康对照组的外周血样本 |