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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainage
2017-Oct, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.14294
PMID:28802076
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了酸矿排水(AMD)中Hydrotalea属微生物的生活方式及其基于CRISPR的种群历史 | 首次通过单细胞测序技术分析了早期AMD样本中Hydrotalea属微生物的基因组,并发现了两种共存的CRISPR-Cas位点及其在种群中的异质性 | 研究仅限于早期AMD样本中的Hydrotalea属微生物,未涉及其他阶段或其他环境中的微生物群落动态 | 探究酸矿排水环境中微生物群落动态,特别是早期发展阶段的微生物种群历史和适应性 | Hydrotalea属微生物及其在酸矿排水环境中的适应性和种群历史 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 来自早期AMD样本的单细胞 |
142 | 2024-08-09 |
Current research development of single cell genome in urological tumor
2017-09, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.08.003
PMID:28802562
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综述 | 本文综述了单细胞基因组技术在泌尿系统肿瘤(包括肾癌、膀胱癌和前列腺癌)中的最新进展和应用 | 介绍了单细胞基因组技术在检测个体癌细胞基因组病变中的新进展,以及其在肿瘤异质性研究中的应用 | NA | 探讨单细胞基因组技术在泌尿系统肿瘤研究中的应用及其在早期诊断、靶向治疗和预后判断中的潜力 | 泌尿系统肿瘤,包括肾癌、膀胱癌和前列腺癌 | 数字病理学 | 泌尿系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA |
143 | 2024-08-09 |
Whole transcriptome profiling of taste bud cells
2017-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-07746-z
PMID:28790351
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠味觉细胞中两种不同亚群(Tas1r3表达的II型细胞和生理学上识别的III型细胞)的基因表达 | 研究揭示了II型细胞中调控刺激响应的基因上调,以及III型细胞中与神经功能相关的通路上调,并发现了与趋化性和轴突导向相关的高表达基因和通路 | NA | 探索味觉细胞中不同亚群的基因表达特征及其功能 | 小鼠味觉细胞中的II型和III型细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种不同亚群的小鼠味觉细胞 |
144 | 2024-08-09 |
Functional Virtual Flow Cytometry: A Visual Analytic Approach for Characterizing Single-Cell Gene Expression Patterns
2017, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2017/3035481
PMID:28798928
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞转录组研究检测细胞群分布模式的新工作流程 | 该工作流程使用基因共表达模块作为特征,而不是单个基因,从而可以交互式地探索细胞分布并快速解释基因特征 | NA | 旨在有效地提取基因特征,以有意义地区分细胞群 | 单细胞转录组数据中的细胞群分布模式 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 两个大型单细胞研究数据集 |
145 | 2024-08-09 |
Proinflammatory Dual Receptor T Cells in Chronic Graft-versus-Host Disease
2017-Nov, Biology of blood and marrow transplantation : journal of the American Society for Blood and Marrow Transplantation
DOI:10.1016/j.bbmt.2017.07.016
PMID:28750779
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研究论文 | 本文研究了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)中双T细胞受体(TCR)细胞的作用 | 首次揭示了双TCR细胞在cGVHD中的病理作用,并指出了Tbet驱动的T细胞功能作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨双TCR细胞在慢性移植物抗宿主病中的潜在作用 | 慢性移植物抗宿主病患者中的双TCR细胞 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
146 | 2024-08-09 |
Genetics: Taking single-cell transcriptomics to the bedside
2017-10, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/nrclinonc.2017.117
PMID:28762386
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
147 | 2024-08-09 |
Fusion of Regionally Specified hPSC-Derived Organoids Models Human Brain Development and Interneuron Migration
2017-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.07.007
PMID:28757360
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研究论文 | 本文描述了从人多能干细胞生成特定于内侧神经节隆起(MGE)和皮质区域的类器官,这些类器官能够重现MGE和皮质区域的发育过程 | 首次开发了模拟人内侧神经节隆起(MGE)发育的系统,并展示了区域特异性类器官融合后的活体成像分析 | NA | 提供一个平台用于生成特定区域的脑类器官,并模拟人中间神经元迁移 | 人多能干细胞衍生的MGE和皮质特定类器官 | 数字病理学 | NA | RNA测序(RNA-seq),转座酶可及染色质的高通量测序(ATAC-seq) | NA | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 |
148 | 2024-08-09 |
Environments Tune and Select Cellular Diversity
2017-09, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2017.07.006
PMID:28774723
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术进步及其在大样本应用中揭示的细胞间表达水平和分子间变异传播的显著差异 | 引入了新的定量方法,结合机制和统计模型,以系统性的方式阐明表型多样性的驱动因素 | NA | 揭示细胞间表达水平和分子间变异传播的机制 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 数据 | 大样本 |
149 | 2024-08-09 |
Adventitial SCA-1+ Progenitor Cell Gene Sequencing Reveals the Mechanisms of Cell Migration in Response to Hyperlipidemia
2017-08-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2017.06.011
PMID:28757161
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了野生型和ApoE缺陷型小鼠的SCA-1+前体细胞基因,揭示了高脂血症诱导的细胞迁移机制 | 首次详细探讨了SCA-1前体细胞在高脂血症诱导的动脉粥样硬化中的作用及其分子机制 | NA | 研究高脂血症对血管前体细胞迁移功能的影响及其分子机制 | SCA-1+前体细胞和ApoE缺陷型小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和ApoE缺陷型小鼠的SCA-1+前体细胞 |
150 | 2024-08-09 |
An approach to suppress the evolution of resistance in BRAFV600E-mutant cancer
2017-Aug, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4369
PMID:28714990
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研究论文 | 本文通过建模研究了靶向治疗下BRAF基因扩增在肿瘤进化中的选择和传播机制 | 本文首次通过单细胞测序和多重荧光原位杂交分析,揭示了BRAF基因扩增在肿瘤治疗后的平行进化轨迹,并提出了通过同时靶向RAF、MEK和ERK激酶来提高适应性阈值,从而防止耐药性进化的治疗策略 | 本文主要基于小鼠模型进行研究,其结果在人体中的适用性尚需进一步验证 | 研究靶向治疗下肿瘤进化的机制,并探索有效的治疗策略以抑制耐药性的产生 | BRAFV600E突变肿瘤中的BRAF基因扩增 | 数字病理学 | 肺癌,黑色素瘤 | 单细胞测序,多重荧光原位杂交 | NA | 基因组数据 | 11个患者来源的肿瘤异种移植模型(PDXs) |
151 | 2024-08-09 |
InDrops and Drop-seq technologies for single-cell sequencing
2017-07-25, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c7lc90070h
PMID:28721415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
152 | 2024-08-09 |
Perspective on droplet-based single-cell sequencing
2017-07-25, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c7lc90069d
PMID:28721425
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
153 | 2024-08-09 |
Genome-wide identification of genes essential for podocyte cytoskeletons based on single-cell RNA sequencing
2017-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2017.04.022
PMID:28709640
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对20个鼠足细胞进行分析,鉴定出对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 通过单细胞RNA测序技术,扩展了足细胞细胞骨架关键基因的列表 | NA | 鉴定对足细胞细胞骨架至关重要的基因 | 鼠足细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个鼠足细胞 |
154 | 2024-08-09 |
Lack of human cytomegalovirus expression in single cells from glioblastoma tumors and cell lines
2017-10, Journal of neurovirology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s13365-017-0543-y
PMID:28695489
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术检测人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤肿瘤和细胞系中的表达情况 | 首次在单细胞水平上严格测试人类巨细胞病毒RNA在胶质母细胞瘤样本中的表达 | 仅分析了五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系的样本 | 探讨人类巨细胞病毒与胶质母细胞瘤之间的关系,并评估单细胞数据在肿瘤病毒学中的潜在应用 | 人类巨细胞病毒在胶质母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个胶质母细胞瘤肿瘤和两个细胞系 |
155 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals an altered gene expression pattern as a result of CRISPR/cas9-mediated deletion of Gene 33/Mig6 and chronic exposure to hexavalent chromium in human lung epithelial cells
2017-09-01, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2017.07.003
PMID:28688920
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了CRISPR/cas9介导的Gene 33/Mig6缺失及慢性暴露于六价铬的人肺上皮细胞中基因表达模式的变化 | 首次揭示了Gene 33缺失和六价铬暴露联合作用下肺上皮细胞的基因表达模式和表型变化,特别是UCHL1基因的上调 | 未详细描述细胞形态的明显变化 | 探究Gene 33缺失和六价铬暴露对肺上皮细胞基因表达和表型的影响 | BEAS-2B肺上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CRISPR/cas9 | 基因表达数据 | 83个差异表达基因 |
156 | 2024-08-09 |
Massively parallel whole genome amplification for single-cell sequencing using droplet microfluidics
2017-07-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-05436-4
PMID:28701744
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研究论文 | 介绍了一种名为单液滴多重置换扩增(sd-MDA)的方法,用于大规模并行扩增单细胞基因组,同时保持序列准确性和特异性 | 该方法通过在微流控通道中使用被动液滴融合技术,实现了数万个单细胞在数百万皮升液滴中的分隔和全基因组扩增,提高了扩增的通量和质量 | NA | 进一步理解复杂生物系统中的遗传多样性 | 单细胞基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组序列 | 数万个单细胞 |
157 | 2024-08-09 |
Gene expression profiles of brain endothelial cells during embryonic development at bulk and single-cell levels
2017-07-11, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aag2476
PMID:28698213
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研究论文 | 本文通过翻译核糖体亲和纯化和单细胞RNA测序技术,生成了小鼠胚胎脑内皮细胞的高分辨率基因表达谱,以探索脑血管发育和分化的分子机制 | 本文首次在批量和单细胞水平上分析了脑内皮细胞在胚胎发育过程中的基因表达变化,并识别了与血脑屏障成熟相关的特定转录因子 | NA | 探索脑内皮细胞在胚胎发育过程中的分子机制 | 小鼠胚胎脑内皮细胞的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎脑内皮细胞 |
158 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of East-Asian pancreatic islets cells
2017-07-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-05266-4
PMID:28694456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在东亚人群中进行胰腺胰岛细胞的单细胞RNA测序,并发现了与欧洲人群不同的基因表达特征 | 样本量较小,仅包括三名东亚非糖尿病患者 | 评估东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 东亚人群的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 448个胰岛细胞,来自三名东亚非糖尿病患者 |
159 | 2024-08-09 |
Massively parallel nanowell-based single-cell gene expression profiling
2017-07-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-3893-1
PMID:28687070
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研究论文 | 本文介绍了一种新型纳米孔单细胞RNA测序系统ICELL8,该系统能够高效处理数千个细胞样本,提供单细胞水平的基因表达谱分析 | ICELL8系统采用含有5,184个纳米孔的微芯片,每个纳米孔包含预印的寡核苷酸编码多聚dT、独特的孔条形码和独特的分子标识符,实现了简单且高通量的单细胞表达谱分析 | NA | 开发一种简单且高通量的单细胞表达谱分析方法 | 人源和鼠源的培养细胞以及鼠源的实体组织样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过一千个人源和鼠源培养细胞以及468个鼠源胰腺胰岛细胞 |
160 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics of pluripotent stem cells: reprogramming and differentiation
2017-Oct, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2017.06.003
PMID:28675884
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在多能干细胞重编程和分化中的应用及其最新进展和重要发现 | 单细胞转录组学技术提供了高分辨率的细胞状态识别和细胞群体内异质性解析的新视角 | NA | 探讨单细胞转录组学在多能干细胞研究中的应用 | 多能干细胞的重编程和分化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |