单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 331 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Novel approaches in function-driven single-cell genomics
2017-07-01, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fux009
PMID:28591840
|
综述 | 本文综述了功能驱动单细胞基因组学的策略及其未来发展方向 | 提出了一种基于功能的筛选方法，用于从复杂的微生物群落中靶向分离和单细胞基因组测序，从而聚焦于具有特定表型或代谢特征的细胞 | NA | 旨在提高对微生物群落功能及其未表征基因产物空间的理解 | 环境微生物群落及其在生物地球化学中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Selective Photomechanical Detachment and Retrieval of Divided Sister Cells from Enclosed Microfluidics for Downstream Analyses
2017-05-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.7b00413
PMID:28480715
|
research paper | 本研究开发了一种光机械方法，用于从封闭的微流控室中有选择地分离和可靠地检索目标细胞，以便进行进一步分析。 | 首次使用碳纳米管-聚二甲基硅氧烷复合表面和纳秒脉冲激光诱导的剪切力来分离细胞，并保持细胞活性和分子表达水平。 | NA | 开发一种新的方法来分离和检索封闭微流控室中的姐妹细胞，以便进行下游分析。 | 癌症干细胞样细胞的自更新和分化过程中的基因变化。 | microfluidics | NA | photomechanical method | NA | single-cell transcriptome | 96个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
Extracting Intercellular Signaling Network of Cancer Tissues using Ligand-Receptor Expression Patterns from Whole-tumor and Single-cell Transcriptomes
2017-08-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-09307-w
PMID:28821810
|
研究论文 | 本文通过分析公共癌症转录组数据库中的配体-受体表达模式，构建了癌症组织中的细胞间信号网络。 | 本文首次利用全肿瘤和单细胞转录组数据，构建了细胞间通信网络，揭示了癌症细胞间的信号交换机制。 | NA | 研究癌症细胞间的通信机制，以揭示癌症进展和预后的分子标志。 | 癌症组织中的细胞间信号网络。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过2,500对配体-受体对 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
shinyheatmap: Ultra fast low memory heatmap web interface for big data genomics
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0176334
PMID:28493881
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为shinyheatmap的先进用户友好型热图软件套件，能够在网络浏览器中高效创建高度可定制的静态和交互式生物热图 | shinyheatmap具有低内存占用特性，特别适合于交互式可视化由于大小限制而无法在内存中计算的极大数据集。此外，它内置了高性能的web插件fastheatmap，能够快速绘制包含多达105-107行的数据集的交互式热图，显著超越了之前的热图渲染速度基准 | NA | 开发一种能够高效处理和可视化大型基因组数据集的工具 | 转录组学、代谢组学、宏基因组学等下一代测序领域产生的大数据集 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 数值数据 | 数据集大小可达105-107行 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-07 |
Functional characterization of human pluripotent stem cell-derived arterial endothelial cells
2017-07-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1702295114
PMID:28696312
|
研究论文 | 本文报道了从人多能干细胞中衍生出的动脉内皮细胞，这些细胞在体外和体内表现出动脉特异性功能 | 结合单细胞RNA测序和双报告人胚胎干细胞系，识别调控动脉内皮细胞分化的因子，并开发了一种无异种成分的培养协议 | NA | 研究人多能干细胞衍生的动脉内皮细胞的功能特性 | 人多能干细胞衍生的动脉内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个人的胚胎和诱导多能干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-07 |
MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community complexity
2017-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14306
PMID:28112173
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的实验和生物信息学框架metaSort，用于从微生物组样本中有效构建细菌基因组 | metaSort采用流式细胞术和单细胞测序方法，结合新的计算算法，从排序的迷你微生物组中高效恢复高质量基因组 | NA | 提高从复杂或新颖微生物群落中获取微生物基因组的能力 | 微生物组样本中的细菌基因组 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 75个高质量基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals widespread monoallelic gene expression in individual rice mesophyll cells
2017-Oct-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2017.09.011
PMID:36659292
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了水稻叶肉细胞中广泛存在的单等位基因表达现象 | 开发了一种单细胞RNA测序协议，首次在个体植物细胞水平上研究了单等位基因表达的普遍性及其潜在机制 | 研究仅限于水稻的特定品种和杂交后代，可能限制了结果的普遍性 | 探究植物细胞中单等位基因表达的普遍性和机制 | 水稻的叶肉细胞及其杂交后代 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括indica（93-11）和japonica（Nipponbare）纯系及其F1互交杂交后代 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
MR-seq: measuring a single cell's transcriptome repeatedly by RNA-seq
2017-Mar-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2017.01.029
PMID:36659282
|
research paper | 本文介绍了一种名为MR-seq的新型单细胞RNA-seq技术，该技术通过重复测量单个细胞的转录组，能够统计评估技术变异并识别两个单细胞之间的差异表达基因。 | MR-seq技术提高了阳性预测值，并能应用于早期小鼠胚胎，识别出数百个候选的胚胎内异质性基因。 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA-seq技术，用于检测少量细胞间的差异表达基因。 | 单细胞转录组和小鼠早期胚胎。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 每个单细胞测量两次 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Neural Stem Cells
2017-Apr, Current pharmacology reports
DOI:10.1007/s40495-017-0084-3
PMID:29862164
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在神经干细胞（NSCs）研究中的最新进展 | 介绍了scRNA-seq技术及其在NSC研究中的应用，探讨了该技术在基础研究和再生医学中的未来方向 | 讨论了scRNA-seq技术面临的挑战 | 探讨scRNA-seq技术在神经干细胞研究中的应用及其未来发展 | 成年中枢神经系统中的神经干细胞（NSCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Growth and Morphogenesis during Early Heart Development in Amniotes
2017-Nov-22, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd4040020
PMID:29367549
|
综述 | 本文综述了羊膜动物早期心脏发育中的生长和形态发生过程 | 讨论了基于固定样本分析之外的新方法，如克隆分析、单细胞测序、活体成像和数据定量分析，可能在未来对早期心脏管区域化和形态发生的理解带来新的见解 | 心脏形态发生是一个复杂且动态的三维过程，目前对其细胞基础的理解尚不充分 | 探讨心脏形态发生和区域化的最新进展，并重新解释区域基因表达模式 | 羊膜动物早期心脏发育中的生长和形态发生 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Developmental Emergence of Adult Neural Stem Cells as Revealed by Single-Cell Transcriptional Profiling
2017-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.017
PMID:29281841
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析胚胎期小鼠大脑皮层，以揭示成年神经干细胞的起源和发展 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了成年神经干细胞从胚胎前体细胞到成年的转录身份维持过程 | NA | 探讨成年神经干细胞的起源和发展过程 | 胚胎期小鼠大脑皮层的细胞类型及其转录特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个发育时间点的胚胎小鼠大脑皮层样本 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq study determines the ontogeny of macrophages in glioblastomas
2017-Dec-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1375-z
PMID:29262851
|
研究论文 | 本文通过大规模单细胞RNA测序分析，揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在复杂肿瘤微环境中的新作用和新生物标志物 | 本文通过单细胞RNA测序技术，首次详细揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的新作用 | NA | 研究胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
[Study on the spatial expression of trophectoderm cells in human embryonic prenatal blastocysts]
2017-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:29263466
|
研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 首次确定了从人类囊胚中分离出的极性和壁滋养层细胞的全局基因表达模式 | NA | 研究人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 人类胚胎前卵泡期囊胚中的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自辅助生殖技术的Gardner评分5AA囊胚，采集于受精后第6天 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
A Single-Cell RNA Sequencing Study Reveals Cellular and Molecular Dynamics of the Hippocampal Neurogenic Niche
2017-Dec-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.11.050
PMID:29241552
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究，揭示了海马神经发生微环境的细胞和分子动力学 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了齿状回细胞，并识别了独特的细胞类型特异性标记，定义了神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段及转录动力学 | NA | 全面理解成年神经发生 | 神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段、分子决定因素以及微环境的细胞和分子组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 所有非神经细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and extrinsic regulatory heterogeneity in yeast responding to stress
2017-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2004050
PMID:29240790
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在盐胁迫下和无胁迫条件下，单个酿酒酵母细胞的转录异质性，并探讨了影响应激响应转录组的细胞协变量 | 本研究揭示了酵母细胞在应激前后的显著调控变异，并发现部分细胞在一定程度上解耦了核糖体蛋白基因表达与环境应激反应，这与细胞周期有关但与酵母超日代谢周期无关 | NA | 探究同源细胞群体中个体细胞在应激耐受性上的显著变异及其本质 | 酿酒酵母细胞在盐胁迫下的转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个酿酒酵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Estimation of immune cell content in tumour tissue using single-cell RNA-seq data
2017-12-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02289-3
PMID:29230012
|
研究论文 | 本文通过数学解卷积方法，利用肿瘤来源的单细胞RNA测序数据中的指示特异性和细胞类型特异的参考基因表达谱（RGEPs），深入分析了如何从批量基因表达数据中推导出实体肿瘤的细胞组成 | 本文证明了肿瘤来源的RGEPs对于成功解卷积至关重要，而外周血的RGEPs是不够的 | NA | 预测患者对免疫治疗的反应 | 实体肿瘤的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
scRNASeqDB: A Database for RNA-Seq Based Gene Expression Profiles in Human Single Cells
2017-Dec-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes8120368
PMID:29206167
|
research paper | 本文介绍了scRNASeqDB数据库，该数据库收集并整理了几乎所有目前可用的人类单细胞转录组数据集，涵盖200种人类细胞系或细胞类型及13,440个样本 | scRNASeqDB是首个能够全面收集、整理和比较人类单细胞RNA测序数据表达特征的数据库 | NA | 构建一个全面的人类单细胞RNA测序数据表达特征数据库 | 人类单细胞转录组数据集 | natural language processing | NA | scRNA-Seq | NA | text | 涵盖200种人类细胞系或细胞类型及13,440个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Transcriptional Noise and Somatic Mutations in the Aging Pancreas
2017-12-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2017.11.009
PMID:29211979
|
研究论文 | 研究探讨了胰腺β细胞异质性的潜在机制及其功能意义 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了随着年龄增长，胰腺细胞转录噪声增加和体细胞突变积累的现象 | NA | 探讨胰腺β细胞异质性的机制及其功能意义 | 人类胰腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
High-Resolution Single-Cell Sequencing of Malaria Parasites
2017-12-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evx256
PMID:29220419
|
研究论文 | 本文介绍了一种高分辨率的单细胞测序方法，用于分析恶性疟原虫的多重感染 | 通过荧光激活细胞分选和全基因组测序，实现了对恶性疟原虫基因组的高效、近完整捕获 | NA | 旨在理解恶性疟原虫感染的复杂性 | 恶性疟原虫的单细胞基因组 | 基因组学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 48个单细胞基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
Synaptic and peptidergic connectome of a neurosecretory center in the annelid brain
2017-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.26349
PMID:29199953
|
研究论文 | 本研究利用透射电子显微镜和基因表达图谱分析了海洋环节动物幼体脑中神经分泌中心的突触和肽能连接组 | 首次重建了78个神经分泌神经元，并绘制了它们在脑中的突触连接，揭示了神经分泌中心内广泛的肽能信号网络及其与突触脑的连接 | NA | 理解动物脑中神经分泌中心的功能 | 神经分泌中心的细胞类型、突触和肽能网络 | 神经科学 | NA | 透射电子显微镜、基因表达图谱 | NA | 单细胞转录组数据 | 78个神经分泌神经元 | NA | NA | NA | NA |