单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 331 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Molecular interrogation of hypothalamic organization reveals distinct dopamine neuronal subtypes
2017-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/nn.4462
PMID:27991900
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑中62种神经元亚型，特别是发现共表达Onecut3和Nmur2基因的多巴胺神经元亚型 | 首次使用单细胞RNA测序系统绘制下丘脑神经元身份图谱，发现具有任务依赖性神经递质转换能力的多巴胺神经元新亚型 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制研究需要进一步实验证实 | 解析下丘脑神经元多样性及其组织结构和功能 | 下丘脑神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Cerebral cortical neuron diversity and development at single-cell resolution
2017-02, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2016.11.001
PMID:27888678
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究大脑皮层神经元多样性和发育的最新进展 | 将单细胞RNA测序技术应用于神经元分类，提供全基因组基因表达模式作为新的分类标准 | 仅回顾早期研究成果，尚未涉及具体实验数据验证 | 阐明神经元亚型及其发育过程 | 大脑皮层神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数十万个单细胞转录组构建的参考图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
XACT Noncoding RNA Competes with XIST in the Control of X Chromosome Activity during Human Early Development
2017-01-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.10.014
PMID:27989768
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研究论文 | 本研究揭示了人类早期胚胎发育中X染色体活性调控的新机制，发现非编码RNA XACT与XIST在活性X染色体上共同激活并积累 | 首次发现人类特异性X染色体调控机制，揭示XACT和XIST在早期胚胎中的拮抗作用，以及XIST在此时期呈现异常分散结构 | 功能研究主要在转基因小鼠细胞中进行，需在人类胚胎中进一步验证 | 探究人类早期发育过程中X染色体剂量补偿的调控机制 | 人类早期着床前胚胎和naive人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，成像技术 | NA | RNA测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-07 |
Environments Tune and Select Cellular Diversity
2017-09, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2017.07.006
PMID:28774723
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研究论文 | 探讨单细胞测序技术揭示的细胞间表达变异及其在细胞间传递的机制 | 应用系统生物学方法结合机制与统计模型解析表型多样性的驱动因素 | NA | 阐明环境因素如何调控和选择细胞多样性 | 单细胞表达变异与表型多样性 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | 机制模型、统计模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2024-08-05 |
SIDEseq: A Cell Similarity Measure Defined by Shared Identified Differentially Expressed Genes for Single-Cell RNA sequencing Data
2017-Jun, Statistics in biosciences
IF:0.8Q4
DOI:10.1007/s12561-017-9194-z
PMID:30774736
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研究论文 | 本文介绍了一种新颖的相似性度量SIDEseq，用于评估单细胞RNA测序数据中的细胞间相似性 | SIDEseq通过整合所有DE基因列表信息，提供了一种全新的细胞相似性度量方法，能够从全局视角调查细胞间关系 | 研究中没有提及特定的局限性，可能未考虑全部类型的细胞异质性 | 探讨如何通过单细胞RNA测序数据识别细胞亚群体 | 人类卵巢癌scRNA测序数据和公共人类胚胎scRNA测序数据以及几个模拟数据集 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个数据集，包括人类卵巢癌和公共人类胚胎数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-05 |
STRT-seq-2i: dual-index 5' single cell and nucleus RNA-seq on an addressable microwell array
2017-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-16546-4
PMID:29180631
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRT-seq-2i的新型单细胞RNA测序技术 | STRT-seq-2i结合了可寻址的9600微孔阵列和高通量成像，具有竞争性成本的独特优势 | 该研究未提及对老龄化人脑样本的具体应用效果 | 研究旨在提高对单细胞RNA测序技术的高通量应用能力 | 研究对象包括新鲜的小鼠皮质细胞和冷冻的死后人类皮质核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞 RNA 数据 | 使用了新鲜小鼠皮质细胞和冷冻人类皮质核的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-05 |
Dissecting Cell-Type Composition and Activity-Dependent Transcriptional State in Mammalian Brains by Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq
2017-Dec-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2017.11.017
PMID:29220646
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研究论文 | 本文提出了一种新的单核RNA测序方法，可以有效地分析成年哺乳动物大脑中的细胞类型组成和活性依赖的转录状态 | 创新点在于结合了蔗糖梯度纯化和液滴微流体技术，开发出无酶解和无核Sorting的高通量单核RNA-seq方法 | 研究未提及样本来源的具体多样性和可能的生物学变异性 | 研究成年哺乳动物大脑中细胞多样性及其活性依赖的转录状态 | 成年小鼠皮层组织中的约18,000个细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA-seq | NA | RNA数据 | 约18,000个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reconstructs fate conversion from fibroblast to cardiomyocyte
2017-11-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24454
PMID:29072293
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学重构了成纤维细胞向心肌细胞的命运转换 | 揭示了在成纤维细胞转化为心肌细胞过程中，细胞异质性及重编程的分子机制 | 重编程过程的异步特性以及细胞间的固有异质性使得传统的批量基因组技术难以研究这一过程 | 探索成纤维细胞向心肌细胞转化的机制及相关基因表达变化 | 小鼠成纤维细胞及其转化为诱导心肌细胞的过程 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-05 |
The neuropeptide NMU amplifies ILC2-driven allergic lung inflammation
2017-09-21, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24029
PMID:28902842
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研究论文 | 这篇文章探讨了神经肽NMU在ILC2驱动的过敏性肺炎症中的作用 | 首次揭示了NMUR1信号通路在促进ILC2炎性反应中的重要性 | 尚未详细阐明ILC2在维持稳态与促进炎症之间的信号转导机制 | 识别指引ILC2促进稳态与炎症的分子信号 | 小鼠肺部常驻ILC的单细胞RNA测序和刺激后的分析 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-05 |
CBP/Catenin antagonists: Targeting LSCs' Achilles heel
2017-08, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2017.04.010
PMID:28479420
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评论 | 这篇文章讨论了利用小分子特异性CBP/catenin拮抗剂靶向白血病干细胞的机制 | 创新点在于识别和验证了一种针对LSCs/CSCs的共同“阿基琉斯之踵”的安全有效机制 | 对LSCs和正常内源性造血干细胞之间关键机制的识别仍然是一个主要挑战 | 本文旨在研究针对白血病干细胞的治疗策略 | 研究对象为慢性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序，单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of an In Vitro Model of Human Interneuron Development Reveals Temporal Dynamics of Cell Type Production and Maturation
2017-Mar-08, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2017.02.014
PMID:28279351
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research paper | 这篇文章描述了一种从人类胚胎干细胞生成皮质抑制神经元的协议，并分析了不同细胞类型的特性和成熟时间过程 | 文章创新性在于揭示了细胞类型的产生和成熟时间动态，模拟了体内神经元和胶质细胞的生成时间模式 | 文中未具体提及实验样本的多样性和研究的长期效果 | 研究人类抑制神经元的生成及其在神经精神疾病中的潜在应用 | 主要研究对象为从人类胚胎干细胞生成的皮质抑制神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 使用人类胚胎干细胞产生的皮质抑制神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-05 |
Dense and accurate whole-chromosome haplotyping of individual genomes
2017-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01389-4
PMID:29101320
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研究论文 | 本文介绍了一种整合相位策略，用于对个体基因组进行密集且准确的全染色体单倍型分析 | 提出了一种新颖的整合相位策略，通过结合不同的测序技术实现高效的单倍型分析 | 缺乏对更广泛生物样本的验证，目前结果主要基于特定个体NA12878 | 研究旨在提高基因组分析中对单倍型信息的获取和利用 | 研究对象为人类基因组中的单倍型信息 | 数字病理学 | NA | 链特异性单细胞测序、PacBio数据、10X Genomics链接读测序 | NA | 基因组数据 | 使用了10个Strand-seq文库和10倍覆盖的PacBio数据或10X Genomics链接读数据 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-05 |
Systematic single-cell analysis provides new insights into heterogeneity and plasticity of the pancreas
2017-09, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2017.06.021
PMID:28951822
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综述 | 该综述探讨了单细胞分析在胰腺细胞类型背景下的内源性β细胞再生机制的最新文献 | 介绍了单细胞技术如何提供胰腺内部细胞异质性的高分子分辨率 | 相关信息未指明具体的研究限制 | 旨在系统地表征和解开所有胰腺细胞类型的转录程序 | 关注胰腺中不同细胞类型的再生潜力 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱细胞分析, 流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-05 |
Next-generation molecular diagnosis: single-cell sequencing from bench to bedside
2017-03, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-016-2368-x
PMID:27738745
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综述 | 本综述提供了单细胞测序在基因组医学中诊断应用的现状和前景概述 | 该文章强调了单细胞测序在新生物标志物识别和靶向治疗中的潜力，促进了基因组医学的下一步发展 | NA | 简要说明单细胞测序在早期疾病检测和诊断中的应用 | 单细胞测序在胚前基因诊断、非侵入性产前诊断和循环肿瘤细胞分析中的使用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Granatum: a graphical single-cell RNA-Seq analysis pipeline for genomics scientists
2017-Dec-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0492-3
PMID:29202807
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研究论文 | 本文介绍了Granatum，一个基于网络的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析管道，旨在使分析过程更广泛地适用于研究人员 | Granatum通过提供一个易于使用的图形界面，使没有编程技能的实验室科学家也能进行scRNA-Seq数据分析 | NA | 开发一个用户友好的scRNA-Seq数据分析工具，以促进单细胞RNA测序技术的广泛应用 | 单细胞RNA测序数据分析 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
The promise of single-cell RNA sequencing for kidney disease investigation
2017-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2017.06.033
PMID:28893418
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在肾脏疾病研究中的应用前景 | scRNA-seq技术能够在细胞分辨率下生成大量转录组数据，有助于发现新的细胞类型、状态和动态变化 | scRNA-seq数据分析存在计算挑战，且现有软件工具需进一步优化 | 探讨scRNA-seq技术在肾脏发育和疾病研究中的应用潜力 | 单细胞RNA测序技术及其在肾脏疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity in endometrioid adenocarcinoma tissues
2017-10-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-14676-3
PMID:29079795
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研究论文 | 本研究利用新开发的单细胞分析技术，对具有鳞状分化的子宫内膜样腺癌组织中的肌层浸润侧（M侧）和子宫内膜侧（E侧）进行了单细胞转录组分析，并分析了从同一组织中衍生的球状培养物，以识别体内干细胞性的潜在调节因子。 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了子宫内膜样腺癌组织中的异质性，特别是E侧的癌细胞具有高度恶性特征，包括高表达与球状体特定肿瘤发生相关的标记物SOX2，以及E侧存在更多的上皮间质转化（EMT）细胞。 | 本研究仅限于对特定子宫内膜样腺癌组织的分析，其结果可能不适用于所有类型的子宫内膜样腺癌。 | 旨在通过单细胞转录组分析揭示子宫内膜样腺癌组织中的异质性，并探讨其对预后的影响。 | 研究对象为具有鳞状分化的子宫内膜样腺癌组织及其衍生的球状培养物。 | 数字病理学 | 子宫内膜样腺癌 | 单细胞分析 | NA | 转录组 | 研究涉及子宫内膜样腺癌组织的肌层浸润侧和子宫内膜侧，以及从同一组织中衍生的球状培养物。 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Simultaneous epitope and transcriptome measurement in single cells
2017-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4380
PMID:28759029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CITE-seq的方法，该方法通过使用寡核苷酸标记的抗体，将细胞蛋白质和转录组测量整合到单细胞读出中 | CITE-seq方法能够同时测量单细胞中的表位和转录组，这是传统单细胞RNA测序所不能提供的 | NA | 开发一种能够同时测量单细胞中表位和转录组的新方法 | 单细胞中的表位和转录组 | 生物技术 | NA | CITE-seq | NA | 转录组数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-07 |
Discovering sparse transcription factor codes for cell states and state transitions during development
2017-03-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.20488
PMID:28296636
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研究论文 | 本文通过计算分析基因表达水平，发现了一组稀疏的基因子集在B细胞和T细胞发育谱系中的表达模式，并开发了一种统计框架来同时推断谱系转换和决定这些关系的基因 | 本文开发了一种新的统计框架，能够同时推断细胞谱系转换和关键基因，并将其应用于早期造血、肠道和人类皮质发育的单细胞RNA测序数据分析 | NA | 确定多能细胞在发育过程中做出的谱系选择顺序，并识别影响这些选择的基因 | B细胞和T细胞发育谱系中的细胞状态和状态转换 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 基因表达数据 | 早期造血、肠道和人类皮质发育的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
Model-based branching point detection in single-cell data by K-branches clustering
2017-Oct-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx325
PMID:28582478
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研究论文 | 本文提出了一种基于K-Branches聚类的方法，用于在单细胞数据中检测分支点，通过局部拟合半线来表示细胞的分化轨迹 | 引入了一种类似于K-Means的聚类算法，并提出了改进的GAP统计量模型选择方法，以确定最佳描述数据的线数量 | NA | 旨在通过单细胞技术识别细胞群体中的异质性，推断细胞发育和谱系树 | 单细胞RNA-Seq数据、单细胞qPCR数据以及人工数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-Seq、单细胞qPCR | K-Branches聚类算法 | 单细胞数据 | 包括造血过程中髓系祖细胞的分化、小鼠胚泡发育、人类髓系单核白血病以及人工数据 | NA | NA | NA | NA |