单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 330 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-09 |
Identification of preoptic sleep neurons using retrograde labelling and gene profiling
2017-05-25, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature22350
PMID:28514446
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研究论文 | 本文通过逆行标记和基因分析技术，识别了视前区睡眠神经元的投射目标及其分子标记 | 首次通过光遗传学和药理遗传学方法，确定了视前区GABA能神经元投射到结节乳头体核的睡眠活性和促进睡眠的作用，并鉴定了这些神经元的候选分子标记 | 文章未提及具体的局限性 | 旨在揭示视前区在睡眠生成中的电路机制 | 视前区睡眠神经元及其分子标记 | 神经科学 | NA | 光遗传学、药理遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 202 | 2024-08-09 |
Lineage-dependent spatial and functional organization of the mammalian enteric nervous system
2017-05-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam7511
PMID:28522527
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研究论文 | 本文研究了哺乳动物肠神经系统（ENS）的谱系依赖性空间和功能组织 | 揭示了ENS由迁移后神经嵴来源的祖细胞形成的重叠克隆单元组成，并展示了克隆相关肠神经元在网络刺激下的同步活动 | NA | 探讨肠神经系统的组织结构及其功能机制 | 哺乳动物的肠神经系统 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学和突变分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠ENS的多个样本 |
| 203 | 2024-08-09 |
Cell fixation and preservation for droplet-based single-cell transcriptomics
2017-05-19, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-017-0383-5
PMID:28526029
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研究论文 | 本文研究了使用化学固定方法来稳定和保存细胞，以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 | 提出了一种简单的细胞固定方法，可以稳定和保存细胞数周，而不影响单细胞RNA测序数据的质量 | 未提及 | 开发一种新的细胞固定和保存方法，以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 | 人源和鼠源的细胞，以及果蝇胚胎、小鼠后脑和 cerebellum 细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单细胞 |
| 204 | 2024-08-09 |
Alternative TSSs are co-regulated in single cells in the mouse brain
2017-05-11, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20167374
PMID:28495919
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠大脑中单细胞内替代转录起始位点（TSSs）的使用情况 | 首次研究了单细胞中替代TSSs的使用情况，发现这些TSSs并非独立表达，而是受到共同因素的调控 | 研究依赖于先前发表的单细胞RNA测序数据集 | 探究单细胞中替代TSSs的使用及其调控机制 | 小鼠大脑中的单细胞 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 |
| 205 | 2024-08-09 |
Isolation of the Side Population in Myc-induced T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia in Zebrafish
2017-05-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55711
PMID:28518092
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研究论文 | 本文描述了一种在斑马鱼中分离Myc诱导的T细胞急性淋巴母细胞白血病（T-ALL）旁系细胞群的方法 | 首次在斑马鱼T-ALL模型中描述了如何分离旁系细胞群，并提出了通过单细胞转录组学研究这些细胞遗传特征的可能性 | 目前尚无已知的斑马鱼细胞表面标记物来确认这些旁系细胞是否具有癌症干细胞样特性 | 研究斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 | 斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 | NA | T细胞急性淋巴母细胞白血病 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个斑马鱼胚胎 |
| 206 | 2024-08-09 |
Probabilistic modeling of bifurcations in single-cell gene expression data using a Bayesian mixture of factor analyzers
2017-Mar-15, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.11087.1
PMID:28503665
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研究论文 | 本文提出了一种基于贝叶斯层次混合因子分析器的生成式、完全概率模型，用于单细胞转录组数据中的分叉建模 | 本文首次提出了一个生成式、完全概率模型，用于从单细胞转录组数据中推断分叉结构，并具有独特的层次先验结构，能够自动确定驱动分叉过程的基因 | 文章讨论了这种统一概率方法在实际生物信息学分析中的优缺点 | 研究单细胞转录组数据中的分叉建模 | 单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 贝叶斯层次混合因子分析器 | 因子分析器 | 转录组数据 | 大样本数据集 |
| 207 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing deciphers a convergent evolution of copy number alterations from primary to circulating tumor cells
2017-08, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.216788.116
PMID:28487279
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中的拷贝数变异，揭示了从原发肿瘤到循环肿瘤细胞的拷贝数变异的趋同进化过程 | 首次揭示了原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中拷贝数变异的趋同进化机制，并发现了影响基因和基因的局灶性拷贝数变异在循环肿瘤细胞中的普遍存在 | 研究样本量较小，仅涉及23名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中拷贝数变异的进化机制及其在癌症转移中的作用 | 原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中的拷贝数变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 97个循环肿瘤细胞来自23名患者 |
| 208 | 2024-08-09 |
Single-cell template strand sequencing by Strand-seq enables the characterization of individual homologs
2017-Jun, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2017.029
PMID:28492527
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Strand-seq的单细胞测序技术，该技术通过限制序列分析仅限于DNA复制过程中使用的模板链，从而能够在单个细胞中解析同源染色体的个体序列 | Strand-seq技术通过仅测序模板链，保留了每个同源染色体的结构和身份，这是对传统单细胞测序协议的重要改进 | NA | 研究同源染色体在单细胞中的基因组序列，以支持无拷贝数基因组重排（如倒位和易位）、构建染色体长度单体型、改进基因组组装、映射姐妹染色单体交换事件和探索细胞异质性等研究 | 单细胞中的同源染色体基因组序列 | 基因组学 | NA | Strand-seq | NA | DNA序列 | 单个细胞 |
| 209 | 2024-08-09 |
Hierarchical Specification of Pruriceptors by Runt-Domain Transcription Factor Runx1
2017-05-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0094-17.2017
PMID:28476948
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研究论文 | 本文研究了Runx1转录因子在背根神经节（DRG）感觉神经元中的作用，特别是其在瘙痒感受器发育中的功能 | 首次揭示了Runx1在瘙痒感受器发育中的双重作用，早期促进NPPB细胞形成，后期转变为基因抑制因子 | NA | 探讨Runx1在瘙痒感受器发育中的作用及其对感觉神经元形成不同感觉模式的控制机制 | 背根神经节中的感觉神经元及其在瘙痒信息传递中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用雌雄两性的小鼠进行行为学研究 |
| 210 | 2024-08-09 |
Vitamin A-Retinoic Acid Signaling Regulates Hematopoietic Stem Cell Dormancy
2017-May-18, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.04.018
PMID:28479188
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了静止期造血干细胞（dHSCs）从静止状态向细胞周期进入的连续发展路径，并探讨了维生素A-视黄酸信号通路对其调控机制的影响。 | 首次展示了dHSCs从静止状态过渡到细胞周期进入的连续发展路径，并揭示了低Myc水平和高视黄酸程序表达是dHSCs的特征。 | NA | 探究静止期造血干细胞的分子身份及其维持或退出静止状态的调控机制。 | 静止期造血干细胞（dHSCs）及其在维生素A-视黄酸信号通路调控下的行为。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 211 | 2024-08-09 |
Spatially resolved transcriptome profiling in model plant species
2017-May-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/nplants.2017.61
PMID:28481330
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研究论文 | 本文介绍了一种在多种模式植物系统中生成和研究高分辨率空间解析功能轮廓的新方法 | 首次提出了一种适用于广泛模式植物系统的高通量空间转录组分析方法 | NA | 探索复杂生物系统的功能特征，特别是在植物中的空间表达谱 | 模式被子植物和裸子植物的微切片 | NA | NA | 空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 在拟南芥中分析了八个花序组织域中的141个基因和189条通路的表达水平 |
| 212 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer
2017-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms15081
PMID:28474673
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术对乳腺癌组织进行转录组分析，揭示了肿瘤细胞和免疫细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上全面分析了乳腺癌肿瘤细胞及其周围微环境中的免疫细胞 | 研究样本仅来自11名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中免疫细胞的转录组异质性 | 乳腺癌肿瘤细胞及其周围的基质和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 515个细胞来自11名患者 |
| 213 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing to dissect the molecular heterogeneity in lupus nephritis
2017-May-04, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.93009
PMID:28469080
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检组织，以揭示疾病的分子异质性 | 首次展示了scRNA-seq在常规护理中获取样本的可行性，并揭示了皮肤活检作为肾病标志物的潜力 | NA | 探讨狼疮性肾炎的分子异质性，并寻找新的诊断和治疗标志物 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤组织 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类肾和皮肤活检组织样本 |
| 214 | 2024-08-09 |
Pseudotemporal Ordering of Single Cells Reveals Metabolic Control of Postnatal β Cell Proliferation
2017-May-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2017.04.014
PMID:28467932
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了出生后β细胞增殖的代谢调控机制 | 首次提供了出生后β细胞状态变化的高分辨率分子特征，并揭示了氨基酸代谢、线粒体功能及Srf/Jun/Fos转录因子在β细胞增殖中的作用 | NA | 探究出生后β细胞增殖的调控机制，并寻找新的治疗靶点以促进β细胞再生 | 出生后β细胞的转录组动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个出生后时间点的β细胞样本 |
| 215 | 2024-08-09 |
Human organomics: a fresh approach to understanding human development using single-cell transcriptomics
2017-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.150458
PMID:28465333
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research paper | 本文总结了利用单细胞转录组学技术在类器官上进行的研究方法，并讨论了将这些技术应用于生成人体发育和疾病的器官水平机制模型的机遇与挑战 | 利用创新的单细胞转录组学技术，从多能干细胞重现人体器官发生过程，解析类器官的组成部分并重建细胞分化过程中的谱系轨迹 | NA | 探索人体发育生物学，生成人体发育和疾病的器官水平机制模型 | 人体器官发育过程及疾病机制 | digital pathology | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 216 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Maps Development of Human Germline Cells and Gonadal Niche Interactions
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.03.007
PMID:28457750
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了超过2,000个人类胚胎的性腺细胞及其性腺微环境细胞，揭示了人类胎儿生殖细胞（FGCs）的发育轨迹和异质性 | 发现了女性FGCs经历四个不同的连续阶段，以及男性FGCs的发育阶段，并观察到FGCs与其性腺微环境细胞之间的相互信号作用 | NA | 探讨人类胎儿生殖细胞的发育轨迹和异质性 | 人类胎儿生殖细胞及其性腺微环境细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 超过2,000个人类胚胎的性腺细胞及其性腺微环境细胞 |
| 217 | 2024-08-09 |
Prospective isolation of NKX2-1-expressing human lung progenitors derived from pluripotent stem cells
2017-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI89950
PMID:28463226
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研究论文 | 本文通过工程化和体外发育分化NKX2-1GFP报告的多能干细胞，生成并分离出表达NKX2-1的人类原始肺前体细胞，这些细胞最初缺乏分化肺谱系标记，并在特定3D培养中展示肺上皮成熟。 | 首次成功分离并追踪NKX2-1表达的人类肺前体细胞，并进行了实时成像和时间序列全局转录组分析，揭示了早期肺发育的进化保守基因签名。 | NA | 验证人类胎儿发育期间肺上皮细胞是否全部源自表达NKX2-1的胚胎内胚层前体细胞的假设。 | 人类肺前体细胞及其在肺发育中的作用。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 218 | 2024-08-09 |
Conditional knockin of Dnmt3a R878H initiates acute myeloid leukemia with mTOR pathway involvement
2017-05-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1703476114
PMID:28461508
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research paper | 本文通过生成Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠，研究了R882H突变在人类急性髓系白血病（AML）中的特征。 | 首次通过条件性敲入技术生成Dnmt3a R878H小鼠模型，揭示了该突变在AML中的分子和表观遗传学变化。 | NA | 探索Dnmt3a R878H突变在急性髓系白血病中的作用及其分子机制。 | Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠及其在AML中的表型和分子特征。 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和DNA甲基化数据 | Dnmt3a R878H条件性敲入小鼠 |
| 219 | 2024-08-09 |
A Gene Regulatory Network Balances Neural and Mesoderm Specification during Vertebrate Trunk Development
2017-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.04.002
PMID:28457792
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术，识别神经中胚层前体细胞（NMPs）的分子特征，并逆向工程其分化调控机制 | 揭示了一个转录调控网络，该网络整合了相互对抗的视黄酸（RA）和Wnt信号，以决定细胞进入和退出NMP状态的速率 | NA | 研究脊椎动物躯干发育过程中神经和中胚层分化平衡的基因调控网络 | 神经中胚层前体细胞（NMPs）及其分化调控机制 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 220 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of hypothalamic pro-opiomelanocortin-expressing neurons revealed by single-cell RNA sequencing
2017-05, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2017.02.007
PMID:28462073
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了下丘脑中表达前阿片黑素皮质素原（POMC）神经元的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分类了POMC神经元的不同亚型，并分析了它们的基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人类研究来验证结果 | 探索下丘脑中POMC神经元的异质性及其在体重控制中的作用 | 下丘脑中的POMC神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 163个神经元样本 |