单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 17 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Pancreas
2016-10-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.09.002
PMID:27693023
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术构建了人类胰腺细胞图谱 | 开发了结合FACS、机器人和CEL-Seq2协议的自动化平台，首次在单细胞水平系统解析人类胰腺细胞类型 | 样本来源于已故器官捐献者，可能无法完全代表健康人群的胰腺状态 | 建立人类胰腺细胞类型及其标记基因的完整目录 | 人类胰腺细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单胰腺细胞（来自已故器官捐献者） | NA | 单细胞RNA-seq | CEL-Seq2 | 结合FACS和机器人的自动化单细胞转录组平台 |
| 2 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Human Pancreatic Islets in Health and Type 2 Diabetes
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.08.020
PMID:27667667
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析健康人和2型糖尿病患者胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平全面表征人类胰岛各细胞类型的转录程序，包括罕见的δ、γ、ε和星状细胞，并发现α、β和腺泡细胞的亚群 | 功能验证研究尚未完成，发现的候选基因需要进一步实验确认 | 研究人类胰岛细胞在健康和2型糖尿病状态下的转录组特征 | 人类胰岛细胞，包括健康供体和2型糖尿病供体 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Molecular Diversity of Midbrain Development in Mouse, Human, and Stem Cells
2016-Oct-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.09.027
PMID:27716510
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类、小鼠和干细胞来源的中脑发育分子多样性 | 首次在单细胞水平系统定义了人类胚胎腹侧中脑的细胞类型，并建立了评估干细胞来源多巴胺神经元保真度的定量方法 | 研究主要关注发育早期阶段，成年阶段的细胞类型变化仍需进一步探索 | 解析中脑发育的分子程序，为帕金森病细胞替代疗法提供基础 | 人类和小鼠的胚胎腹侧中脑组织，以及人类多能干细胞来源的多巴胺神经元 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠中脑发育多个阶段的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
scphaser: haplotype inference using single-cell RNA-seq data
2016-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw484
PMID:27497440
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研究论文 | 开发了一个用于利用单细胞RNA测序数据进行单倍型推断的R软件包 | 首次利用单细胞RNA-seq数据中的等位基因波动特性进行单倍型推断，能够对稀有变异和基因内远距离变异进行分型 | NA | 开发基于单细胞RNA测序数据的单倍型推断方法 | 人类和小鼠的转录组区域 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2024-08-05 |
Single-cell analyses of transcriptional heterogeneity in squamous cell carcinoma of urinary bladder
2016-10-04, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.11803
PMID:27602771
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研究论文 | 本研究对膀胱鳞状细胞癌中的转录异质性进行了单细胞分析 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了膀胱鳞状细胞癌中细胞表达的异质性及其潜在机制 | 本研究主要集中在膀胱鳞状细胞癌中，可能不适用于其他癌症类型 | 探索膀胱鳞状细胞癌的细胞功能异质性及其机制 | 人类膀胱鳞状细胞癌及相应的生理正常上皮 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 单细胞样本，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Developing and Regenerating Spiral Ganglion Neurons
2016-Oct, Current pharmacology reports
DOI:10.1007/s40495-016-0064-z
PMID:28758056
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了耳蜗螺旋神经节神经元（SGNs）的发育和再生过程 | 利用Fludigm C1工作流程或Drop-seq技术进行单细胞转录组测序，揭示细胞间的变异性，并通过伪时间排序描述分化轨迹 | NA | 开发新的策略以指导高效的SGN再生 | 耳蜗螺旋神经节神经元（SGNs）的发育和再生 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-09 |
A statistical approach for identifying differential distributions in single-cell RNA-seq experiments
2016-10-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-1077-y
PMID:27782827
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于在存在不同表达状态的情况下，表征生物条件内和之间的表达差异 | 该方法能够检测到比均值偏移更复杂的基因表达分布的细微差异，并能表征这些差异 | NA | 旨在量化细胞异质性，并表征在不同生物条件下的表达差异 | 单细胞RNA测序实验中的基因表达差异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-09 |
Massive and parallel expression profiling using microarrayed single-cell sequencing
2016-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms13182
PMID:27739429
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MASC-seq的新技术，该技术通过微阵列基础的条形码技术实现单细胞表达模式的并行大规模分析 | MASC-seq技术能够在低成本（0.13美元/细胞）下实现高吞吐量和稳健性的单细胞分析，比商业系统成本低两个数量级 | NA | 加速对微妙克隆动态的研究，并提供对疾病发展和其它生物过程的关键见解 | 单细胞转录组 | NA | NA | 微阵列技术 | NA | 转录组数据 | 每天可分析数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Human Pancreatic Islets-New Kids on the Block
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.09.012
PMID:27732832
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研究论文 | 本文报道了从非糖尿病和2型糖尿病供体中分离出的单个胰腺细胞的转录组 | 首次对人类胰腺胰岛的单细胞进行RNA测序，提供了对胰岛转录组的深入了解 | NA | 探索人类胰腺胰岛中单个细胞的转录组 | 非糖尿病和2型糖尿病供体的胰腺细胞 | 基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-09 |
Je, a versatile suite to handle multiplexed NGS libraries with unique molecular identifiers
2016-Oct-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-1284-2
PMID:27717304
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研究论文 | 本文介绍了Je工具套件，用于处理带有唯一分子标识符（UMI）的多种NGS文库，支持复杂的条码策略，提取UMI并过滤考虑UMI的读取重复 | Je工具套件能够处理复杂的条码配置，提取UMI并过滤读取重复，这在现有工具中是不支持的 | NA | 开发一个能够处理复杂条码策略的工具套件，以提高NGS数据分析的准确性 | 带有UMI的多种NGS文库 | 生物信息学 | NA | NGS | NA | 序列数据 | 使用公开可用的scRNA-seq和iCLIP数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-09 |
Out of Many, One: Computational Reconstruction of Mouse Skin using Single-Cell Transcriptomics
2016-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.09.009
PMID:27716520
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术对小鼠皮肤进行计算重建 | 揭示了不同皮肤区域转录程序的空间和伪时间差异，以及皮肤干细胞群体中的共同基础程序 | NA | 全面重建哺乳动物皮肤的复杂性 | 小鼠皮肤及其干细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Map of the Human and Mouse Pancreas Reveals Inter- and Intra-cell Population Structure
2016-10-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.08.011
PMID:27667365
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研究论文 | 本文采用基于液滴的单细胞RNA测序方法，分析了来自四个人类供体和两种小鼠品系的超过12,000个胰腺细胞的转录组 | 首次详细描绘了人类和小鼠胰腺的单细胞转录组图谱，揭示了细胞间和细胞内的群体结构 | NA | 揭示胰腺中不同细胞类型的复杂相互作用及其基因表达模式 | 人类和小鼠的胰腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12,000个胰腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-09 |
Protein C receptor (PROCR) is a negative regulator of Th17 pathogenicity
2016-10-17, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20151118
PMID:27670590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析病原性与非病原性Th17细胞，发现蛋白C受体（PROCR）作为Th17细胞表面分子，通过调控Th17细胞分化和病原性基因表达，影响Th17细胞在自身免疫疾病中的作用 | 首次揭示PROCR作为Th17细胞的负调控因子，通过调控Th17细胞分化和病原性基因表达，影响Th17细胞在自身免疫疾病中的作用 | NA | 探讨蛋白C受体（PROCR）在Th17细胞分化和病原性中的作用 | Th17细胞及其在自身免疫疾病中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 病原性与非病原性Th17细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-09 |
RNA Sequencing of Single Human Islet Cells Reveals Type 2 Diabetes Genes
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.08.018
PMID:27667665
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了1,492个人类胰腺α、β、δ和PP细胞的转录组，以揭示2型糖尿病相关的基因 | 本研究发现的245个在2型糖尿病中表达失调的基因中，92%的基因此前未与胰岛细胞功能或生长相关联 | NA | 揭示2型糖尿病相关的基因 | 人类胰腺α、β、δ和PP细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1,492个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-09 |
End Sequence Analysis Toolkit (ESAT) expands the extractable information from single-cell RNA-seq data
2016-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.207902.116
PMID:27470110
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研究论文 | 本文介绍了End Sequence Analysis Toolkit (ESAT)，该工具能够从单细胞RNA-seq数据中提取更多信息 | ESAT能够检测到传统计算方法无法识别的LPS刺激下3'-isoform的缩短，并能识别出复杂的细胞类型和激素分泌与血管化的相互作用 | NA | 开发一种新的计算工具，用于分析RNA-seq数据中的转录末端信息 | 单细胞和批量RNA-seq数据 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 1000个单个胰腺胰岛细胞的cDNA文库 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses of X Chromosome inactivation dynamics and pluripotency during differentiation
2016-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.201954.115
PMID:27486082
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，系统分析了小鼠胚胎干细胞在不同发育阶段的X染色体失活动态和多能性变化 | 首次揭示了X染色体失活状态在不同发育阶段的显著变异性，并发现了与女性胚胎干细胞延迟进展相关的新通路 | NA | 探讨胚胎发育过程中多能性、分化和X染色体失活之间的关系及其机制 | 小鼠胚胎干细胞在不同发育阶段的X染色体失活动态和多能性变化 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of the Human Endocrine Pancreas
2016-10, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db16-0405
PMID:27364731
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对来自不同年龄和糖尿病类型的捐献者的人类内分泌胰腺进行分析 | 首次展示了糖尿病患者α-和β-细胞的表达特征与儿童相似，表明存在部分去分化过程，并发现Sonic hedgehog信号通路在人类α-细胞增殖中的激活 | NA | 揭示人类内分泌胰腺细胞的异质性并检测稀有细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个死亡器官捐献者的胰岛，包括儿童、健康成年人和1型或2型糖尿病患者 | NA | NA | NA | NA |