单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 11 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals molecular and functional platelet bias of aged haematopoietic stem cells
2016-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms11075
PMID:27009448
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示衰老造血干细胞在分子和功能上向血小板分化的偏向性 | 首次在单细胞水平识别出衰老造血干细胞中分子血小板启动和功能血小板偏向性增加，并发现一类专门产生血小板的HSCs新亚群 | NA | 探究衰老造血干细胞谱系输出改变的机制 | 衰老造血干细胞(HSCs) | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity
2016-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.3728
PMID:26752769
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研究论文 | 开发了可并行进行单细胞全基因组甲基化组和转录组测序的scM&T-seq方法，用于探索转录与表观遗传变异之间的关联 | 首次实现了单细胞水平上甲基化组和转录组的并行测序，发现了异质性甲基化远端调控元件与多能性基因转录之间未被认知的关联 | 仅对61个小鼠胚胎干细胞进行了分析，样本规模有限 | 探索单细胞水平转录与表观遗传变异之间的关联 | 小鼠胚胎干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞全基因组甲基化测序, 单细胞转录组测序 | NA | 甲基化数据, 转录组数据 | 61个小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | scM&T-seq（单细胞甲基化组和转录组测序） |
| 3 | 2025-10-06 |
Assessing similarity to primary tissue and cortical layer identity in induced pluripotent stem cell-derived cortical neurons through single-cell transcriptomics
2016-Mar-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddv637
PMID:26740550
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研究论文 | 通过单细胞转录组学评估iPSC来源的皮质神经元与原始组织的相似性及皮质层身份 | 首次在单细胞分辨率系统评估iPSC来源皮质神经元与原始皮质神经元的相似性，发现神经元层标记共表达现象 | 现有层标记可能无法完全区分所有细胞的皮质层身份 | 评估iPSC来源皮质神经元与原始组织的相似性及层身份特征 | iPSC来源的皮质神经元 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RT-qPCR, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals activation of unique gene groups as a consequence of stem cell-parenchymal cell fusion
2016-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep23270
PMID:26997336
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了间充质干细胞与心肌细胞融合后基因表达的独特变化 | 发现融合细胞在短时间内表现出独特的转录组变化，包括表达多能性和心脏前体基因，以及与癌症相关的基因 | 文章未明确提及研究的具体局限性 | 探究间充质干细胞与心肌细胞融合后的表型多样化和相关时间进程 | 间充质干细胞与心肌细胞的融合细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-09 |
Sequential transcriptional waves direct the differentiation of newborn neurons in the mouse neocortex
2016-Mar-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aad8361
PMID:26940868
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研究论文 | 本文通过高时间分辨率技术结合单细胞转录组学，研究了小鼠新皮质中新生的神经元如何从室管膜区（VZ）的前体细胞中分化出来，并动态地指定其身份 | 本文首次揭示了早期转录波如何指导神经元分化事件的顺序和节奏，为从未分化细胞中逆向工程特定类别的皮质神经元提供了路线图 | NA | 研究神经元身份如何在前体细胞分裂时动态指定 | 小鼠新皮质中的新生神经元分化过程 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-09 |
Use of the Fluidigm C1 platform for RNA sequencing of single mouse pancreatic islet cells
2016-Mar-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1602306113
PMID:26951663
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研究论文 | 本研究评估了Fluidigm C1平台用于单个小鼠胰岛细胞的RNA测序 | 首次使用Fluidigm C1平台进行单个小鼠胰岛细胞的RNA测序，并识别了不同类型的胰岛细胞及其特异性转录因子和通路 | 由于细胞活力低、测序质量差或污染，281个细胞被排除在分析之外，且C1 Fluidigm细胞捕获过程存在局限性，导致细胞污染和基因表达模式改变 | 评估Fluidigm C1平台用于单个胰岛细胞RNA测序的适用性，并提供高质量基因表达数据集 | 小鼠胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 622个细胞，其中341个具有高质量基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing for Precise Cancer Research: Progress and Prospects
2016-Mar-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-15-1907
PMID:26941284
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序技术在精确癌症研究中的进展和前景 | 开发了多种单细胞测序方法，能够全面精确地分析癌细胞的基因组、转录组和表观基因组 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的应用、挑战和前景 | 癌细胞的基因组、转录组和表观基因组 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-09 |
Epigenomics: Parallel single-cell sequencing
2016-Mar, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg.2016.5
PMID:26806414
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-09 |
Assessment of megabase-scale somatic copy number variation using single-cell sequencing
2016-Mar, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.198937.115
PMID:26772196
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研究论文 | 本文开发了一种方法，用于在单个体细胞中可靠地检测兆碱基尺度的体细胞拷贝数变异（CNVs） | 本文首次严格测试了单细胞测序在CNV检测中的性能，并开发了一种新方法来可靠地检测兆碱基尺度的体细胞CNVs | NA | 研究体细胞中兆碱基尺度的拷贝数变异是否被容忍或甚至被正向选择 | 体细胞中的兆碱基尺度拷贝数变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 跨组织的8%-9%的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-09 |
Characterizing transcriptional heterogeneity through pathway and gene set overdispersion analysis
2016-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.3734
PMID:26780092
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研究论文 | 本文开发了一种名为PAGODA的方法，用于通过分析基因集在测量细胞间的协调变异性来解析转录异质性的多个方面 | 提出了路径和基因集过度分散分析（PAGODA）方法，用于从单细胞RNA-seq数据中识别转录异质性的多个方面 | NA | 开发新方法以从单细胞RNA-seq数据中识别转录异质性的多个方面 | 单细胞RNA-seq数据中的转录异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-09 |
Does mouse embryo primordial germ cell activation start before implantation as suggested by single-cell transcriptomics dynamics?
2016-Mar, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gav072
PMID:26740066
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组动力学分析，探讨了小鼠胚胎原生殖细胞（PGC）在植入前是否开始激活，以及转录因子TCFAP2C对DNA甲基转移酶3-样（Dnmt3l）的潜在调控作用。 | 发现了小鼠PGC标记物在植入前至少在胚胎日3.25开始激活，并识别出新的稳定PE和EPI标记物，这些发现对从多能细胞中衍生生殖细胞具有重要意义。 | 由于Dnmt3l受TCFAP2C调控的结果基于计算预测的DNA甲基化基序、Chip-Seq和转录组数据，需要功能性研究来验证这一结果。 | 评估早期植入前事件的时间，并更好地理解内细胞团（ICM）分化为原始内胚层（PE）和外胚层（EPI）的过程。 | 小鼠胚胎的原生殖细胞（PGC）和内细胞团（ICM）分化为原始内胚层（PE）和外胚层（EPI）的过程。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 基于三个独立的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |