单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 9 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data
2016-Feb-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0888-1
PMID:26887813
|
研究论文 | 提出一种从单细胞RNA测序数据中检测低质量细胞的通用方法 | 使用超过20个生物和技术特征组成的精选特征集，相比传统方法分类准确率提高30%以上 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中低质量细胞的检测方法 | CD4+ T细胞、骨髓树突状细胞和小鼠胚胎干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过5,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Integration of electrophysiological recordings with single-cell RNA-seq data identifies neuronal subtypes
2016-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3443
PMID:26689544
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研究论文 | 开发了一种结合电生理记录和单细胞RNA测序的方法来识别神经元亚型 | 首次将全细胞膜片钳记录与单细胞转录组测序相结合，揭示了神经元电生理特性与分子表型之间的直接联系 | 研究仅限于小鼠新皮质锥体细胞和中间神经元，样本规模相对有限 | 探索神经元电生理特性与分子表型之间的关系并识别神经元亚型 | 小鼠脑切片中的新皮质锥体细胞和中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳记录, 逆转录, cDNA扩增 | NA | 电生理记录数据, 转录组数据 | 单个新皮质锥体细胞和中间神经元 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台 | Illumina文库制备和测序 |
| 3 | 2024-08-09 |
Discrete distributional differential expression (D3E)--a tool for gene expression analysis of single-cell RNA-seq data
2016-Feb-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-0944-6
PMID:26927822
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研究论文 | 本文介绍了一种针对单细胞RNA测序数据设计的离散分布式差异基因表达分析工具D(3)E | D(3)E算法能够检测表达变化，即使在平均水平不变的情况下，并能通过分析模型量化生物学上有意义的属性 | NA | 开发和评估一种新的单细胞RNA测序数据差异基因表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | 使用合成数据进行评估，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-09 |
Culture-independent method for identification of microbial enzyme-encoding genes by activity-based single-cell sequencing using a water-in-oil microdroplet platform
2016-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep22259
PMID:26915788
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研究论文 | 本文介绍了一种基于活性单细胞测序的非培养方法，用于识别环境微生物中编码代谢活性酶的基因 | 该方法通过在水-油微滴平台中封装环境微生物细胞并使用荧光底物筛选活性细胞，实现了对未培养细菌细胞中目标酶编码基因的识别 | NA | 开发一种非培养方法，用于识别环境微生物中编码工业价值酶的基因 | 环境微生物中的β-葡萄糖苷酶基因 | NA | NA | 活性单细胞测序 | NA | 基因组 | 从海洋样本中成功识别了14个新的β-葡萄糖苷酶基因 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-09 |
Resolving rates of mutation in the brain using single-neuron genomics
2016-Feb-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.12966
PMID:26901440
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研究论文 | 本文通过单神经元基因组学方法重新分析了大脑中体细胞突变率，特别是LINE-1元素的逆转座事件 | 提出了单细胞测序、生物信息学分析和验证方法中的问题，导致大量假阳性结果，重新分析结果显示突变频率远低于先前报道 | 文章未明确提及具体的研究局限性 | 探究体细胞突变是否为大脑细胞提供功能多样性，并通过单神经元基因组学方法直接测量人类大脑中的体细胞突变率 | 人类大脑中的体细胞突变率，特别是LINE-1元素的逆转座事件 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptome Study as Big Data
2016-Feb, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2016.01.005
PMID:26876720
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究中大数据技术的应用，提出了一种处理和分析scRNA-seq数据的工作流程 | 提出了一个针对scRNA-seq数据特性和单细胞研究目标的工作流程 | NA | 探讨如何有效存储、处理和分析scRNA-seq数据 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-09 |
Single-Cell Gene Expression Analyses Reveal Heterogeneous Responsiveness of Fetal Innate Lymphoid Progenitors to Notch Signaling
2016-Feb-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.01.015
PMID:26832410
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research paper | 本研究通过结合单细胞转录组学和克隆培养策略，揭示了胎儿先天淋巴细胞前体对Notch信号的异质性反应 | 本研究首次详细描述了ILC发育的过渡阶段多样性及其转录特征，并展示了它们对Notch信号的差异依赖性 | NA | 研究Notch信号在胎儿先天淋巴细胞发育中的作用 | 胎儿先天淋巴细胞前体及其对Notch信号的反应 | digital pathology | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及αLP1和αLP2两种淋巴细胞前体群体 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-09 |
Adult mouse cortical cell taxonomy revealed by single cell transcriptomics
2016-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/nn.4216
PMID:26727548
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了成年小鼠初级视觉皮层的细胞分类 | 首次构建了成年小鼠初级视觉皮层的细胞分类，并识别了49种转录组细胞类型 | NA | 揭示神经系统中细胞类型的多样性 | 成年小鼠的初级视觉皮层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 49种转录组细胞类型，包括23种GABA能细胞、19种谷氨酸能细胞和7种非神经元细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes reveal characteristic features of human pancreatic islet cell types
2016-Feb, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201540946
PMID:26691212
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了70个来自人类胰腺胰岛的细胞，揭示了不同胰岛细胞亚型的特征性转录组特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术全面解析了人类胰腺胰岛细胞的异质性，并验证了先前描述的标记基因，同时识别了特定表达的转录因子 | 研究样本量较小，仅包含70个细胞，可能无法完全代表所有人类胰腺胰岛细胞的多样性 | 解析人类胰腺胰岛细胞的细胞组成，并为所有主要细胞类型建立转录组 | 人类胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 70个来自人类胰腺胰岛的细胞 | NA | NA | NA | NA |