单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-07	Defining the three cell lineages of the human blastocyst by single-cell RNA-seq 2015-Oct-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.131235 PMID:26487783	correction	纠正了先前发表在《Development》杂志上的文章中的图3标签错误	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
2	2024-08-09	Characterizing noise structure in single-cell RNA-seq distinguishes genuine from technical stochastic allelic expression 2015-Oct-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms9687 PMID:26489834	研究论文	本文描述并验证了一种生成统计模型，该模型通过外部RNA spike-ins准确量化单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的技术噪声，并区分真正的随机等位基因表达与技术性随机等位基因表达。	本文提出了一种新的生成统计模型，能够准确区分单细胞RNA测序中的生物变异与技术噪声。	文章未明确提及具体的局限性。	研究旨在区分单细胞RNA测序中的生物变异与技术噪声，并量化技术噪声对随机等位基因表达的影响。	研究对象为单细胞RNA测序中的随机等位基因表达模式。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	生成统计模型	RNA	文章未提供具体的样本数量。
3	2024-08-09	Single-cell RNA-Seq resolves cellular complexity in sensory organs from the neonatal inner ear 2015-Oct-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms9557 PMID:26469390	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了新生小鼠内耳的椭圆囊和耳蜗感觉上皮细胞的转录组	首次通过单细胞RNA测序揭示了内耳感觉上皮细胞的复杂性和亚群特征	研究仅限于新生小鼠的内耳感觉上皮细胞	探究内耳感觉上皮细胞的转录组特征及其在发育过程中的分化	新生小鼠的椭圆囊和耳蜗感觉上皮细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	301个单细胞
4	2024-08-09	Intrinsic Age-Dependent Changes and Cell-Cell Contacts Regulate Nephron Progenitor Lifespan 2015-Oct-12, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2015.09.009 PMID:26460946	研究论文	本文研究了胎儿发育期间，肾元前体细胞的寿命受内在年龄依赖性变化和细胞间接触调控的机制	通过移植实验比较了老和年轻前体细胞在同一年轻微环境中的植入情况，发现老前体细胞在年轻邻居环绕下寿命显著延长	NA	探索控制前体细胞寿命的内在和外在机制	肾元前体细胞的寿命及其调控机制	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	NA
5	2024-08-09	An assessment of the amount of untapped fold level novelty in under-sampled areas of the tree of life 2015-Oct-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/srep14717 PMID:26434770	研究论文	本文探讨了通过单细胞测序、元基因组学和高通量培养技术获取的未培养和采样不足的门类基因组对蛋白质折叠空间多样性的潜在影响	研究发现，采样不足的门类基因组中存在大量未被当前蛋白质家族和折叠轮廓库覆盖的序列，且新折叠的发现率可能高达36%	尽管新折叠的发现率较高，但这些发现最终对全球新折叠的发现影响有限	评估未培养和采样不足的生物体对蛋白质折叠空间多样性的贡献	未培养和采样不足的门类基因组	NA	NA	单细胞测序, 元基因组学	NA	序列数据	NA
6	2024-08-09	Somatic mutation in single human neurons tracks developmental and transcriptional history 2015-Oct-02, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aab1785 PMID:26430121	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了人脑皮层中36个神经元的体细胞单核苷酸变异（SNVs），揭示了这些变异与神经元发育和转录活动的关系	首次通过单细胞测序技术详细分析了人脑皮层神经元的体细胞SNVs，并揭示了这些变异与神经元发育和转录活动的关联	研究样本仅来自三位正常个体，可能限制了结果的普遍性	探讨人脑皮层神经元中的体细胞单核苷酸变异及其与神经元发育和转录历史的关系	人脑皮层中的神经元	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	DNA序列	36个神经元样本来自三位正常个体
7	2024-08-09	The first five years of single-cell cancer genomics and beyond 2015-Oct, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.191098.115 PMID:26430160	review	本文回顾了单细胞测序技术在癌症基因组学领域的五年进展及其未来应用前景	单细胞测序技术为解决传统批量肿瘤测量难以回答的癌症生物学关键问题提供了新工具	目前的技术和研究应用仅触及了冰山一角，仍有大量未探索的应用领域	探讨单细胞测序技术在癌症研究与医学中的进展及其未来应用	癌症的进化、多样性以及罕见细胞在肿瘤进展中的作用	digital pathology	NA	单细胞测序（SCS）	NA	基因组数据	NA
8	2024-08-09	Dynamic transcriptional symmetry-breaking in pre-implantation mammalian embryo development revealed by single-cell RNA-seq 2015-Oct-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.123950 PMID:26395495	研究论文	通过分析来自小鼠和人早期胚胎的单细胞转录组数据，揭示了哺乳动物早期胚胎发育中动态转录对称性破缺的现象	首次揭示了早期胚胎分裂阶段即出现的细胞间转录偏差，并发现这种偏差遵循二项分布模式，以及后续合子转录激活进一步加剧了这种偏差	NA	探究哺乳动物早期胚胎发育中首次出现不对称性的时机及其如何发展以指导不同细胞命运	小鼠和人类早期胚胎的单细胞转录组	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠和人类早期胚胎的单细胞
9	2024-08-09	Oscope identifies oscillatory genes in unsynchronized single-cell RNA-seq experiments 2015-Oct, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/nmeth.3549 PMID:26301841	研究论文	本文介绍了一种名为Oscope的统计方法，用于在非同步单细胞RNA测序实验中识别和表征振荡基因的转录动力学	Oscope方法能够在非同步细胞群体的单细胞RNA测序数据中识别振荡基因	文章未明确提及	开发和验证一种新的统计方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别振荡基因	振荡基因的转录动力学	基因表达	NA	单细胞RNA测序	统计模型	RNA测序数据	多个数据集
10	2024-08-09	Sincell: an R/Bioconductor package for statistical assessment of cell-state hierarchies from single-cell RNA-seq 2015-Oct-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btv368 PMID:26099264	研究论文	介绍了一个名为Sincell的R/Bioconductor包，用于从单细胞RNA测序数据中评估细胞状态层次结构	Sincell包引入了新的算法，为细胞状态层次结构提供统计支持，并考虑了单细胞RNA测序中的随机因素	NA	开发和验证一个用于评估单细胞RNA测序数据中细胞状态层次结构的计算工具	单细胞RNA测序数据中的细胞状态层次结构	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA