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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics using spliced leader PCR: Evidence for multiple losses of photosynthesis in polykrikoid dinoflagellates
2015-Jul-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-015-1636-8
PMID:26183220
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研究论文 | 本文利用拼接领导者PCR(SLPCR)技术,对海洋沉积物中的单细胞多克里科斯·勒布里亚(Polykrikos lebouriae)进行转录组分析,探讨其光合作用的丢失情况 | 本文首次使用SLPCR技术对单细胞多克里科斯·勒布里亚进行转录组分析,并发现其保留了祖先的peridinin质体,而其近亲则独立地多次丢失了光合作用 | NA | 探讨多克里科斯·勒布里亚的光合作用丢失情况及其在多克里科斯类甲藻中的意义 | 多克里科斯·勒布里亚(Polykrikos lebouriae) | 基因组学 | NA | 拼接领导者PCR(SLPCR) | NA | 转录组 | 单细胞分离物 |
2 | 2024-08-09 |
Structure of silent transcription intervals and noise characteristics of mammalian genes
2015-Jul-27, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20156257
PMID:26215071
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研究论文 | 本文通过单等位基因时间流逝记录技术,研究了哺乳动物基因沉默转录间隔区的结构及其噪声特性 | 首次揭示了哺乳动物基因沉默间隔区的结构,并阐明了其对基因产物波动的影响 | 研究仅限于小鼠细胞,可能不完全适用于其他哺乳动物 | 探究哺乳动物基因转录的随机性和沉默间隔区的结构 | 哺乳动物基因的转录过程及其对基因产物波动的影响 | 分子生物学 | NA | 单等位基因时间流逝记录技术 | NA | 时间序列数据 | 小鼠细胞 |
3 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq transcriptome analysis of linear and circular RNAs in mouse preimplantation embryos
2015-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-015-0706-1
PMID:26201400
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研究论文 | 本文开发了一种单细胞通用poly(A)-独立RNA测序(SUPeR-seq)方法,用于从单个细胞中测序polyadenylated和non-polyadenylated RNA,并分析了小鼠植入前胚胎中的circRNAs和线性转录本 | 开发了SUPeR-seq方法,能够同时测序polyadenylated和non-polyadenylated RNA,并发现了2891个circRNAs和913个新的线性转录本 | NA | 揭示哺乳动物早期胚胎发育过程中circRNAs的调控机制 | 小鼠植入前胚胎中的circRNAs和线性转录本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
4 | 2024-08-09 |
Delineating cancer evolution with single-cell sequencing
2015-Jul-15, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aac8319
PMID:26180099
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术探讨肿瘤内异质性和罕见亚群 | 单细胞测序技术为癌症研究和医学提供了强大的工具 | NA | 揭示癌症进化过程 | 肿瘤内异质性和罕见亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-09 |
Whole-Transcriptome Amplification of Single Cells for Next-Generation Sequencing
2015-Jul-01, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/0471142727.mb0720s111
PMID:26131855
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研究论文 | 本文描述了从细胞到下一代测序(NGS)的整个工作流程,包括细胞质量检测、细胞裂解、gDNA去除、全转录组扩增和NGS文库制备 | 介绍了用于单细胞转录组分析的全转录组扩增技术,以适应NGS平台对RNA量的要求 | NA | 阐明健康和疾病中的细胞变异性 | 单细胞转录组 | 基因组学 | 癌症 | NGS | NA | RNA | 单个细胞 |
6 | 2024-08-09 |
MERFISHing for spatial context
2015-Jul, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2015.05.002
PMID:26013647
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研究论文 | 介绍了一种名为MERFISH的新技术,该技术扩展了单分子成像技术,用于分析数千个基因的拷贝数和定位模式 | MERFISH技术在空间转录组学领域取得了重大进展,具有在免疫学中的潜在应用 | NA | 推动空间转录组学的发展,探索其在免疫学中的应用 | 数千个基因的拷贝数和定位模式 | 空间转录组学 | NA | MERFISH | NA | 基因数据 | 数千个基因 |
7 | 2024-08-09 |
Emerging single-cell technologies in immunology
2015-Jul, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1189/jlb.6RU0115-020R
PMID:25908734
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综述 | 本文综述了新兴的单细胞技术在免疫学中的应用及其对免疫反应研究的贡献 | 介绍了单细胞技术在免疫学中的创新应用,如微流控技术和单细胞RNA测序,以及质谱流式细胞术在蛋白质水平分析中的进展 | 传统研究工具如多色流式细胞术或基于显微镜的方法可能忽略了个体细胞的特定贡献 | 探讨免疫细胞多样性的基础和结果,以及这些多样性如何影响宿主免疫防御反应的研究 | 免疫细胞及其在宿主防御中的作用 | 免疫学 | NA | 微流控技术,单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
8 | 2024-08-09 |
Applications for single cell trajectory analysis in inner ear development and regeneration
2015-Jul, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-014-2079-2
PMID:25532874
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研究论文 | 本文讨论了单细胞轨迹分析在耳内发育和再生中的应用,介绍了三种不同的方法:主成分分析、'Monocle'算法和自组织映射,并使用先前发表的qRT-PCR数据集进行分析 | 本文展示了单细胞轨迹分析在耳内发育和再生研究中的独特优势 | 每种方法都有其局限性,如数据处理复杂性和对细胞数量的依赖 | 探讨单细胞轨迹分析在耳内发育和再生中的应用 | 耳内发育和再生的单神经母细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞轨迹分析 | 主成分分析、'Monocle'算法、自组织映射 | 基因表达数据 | 从发育中的小鼠内耳分离的单神经母细胞 |