单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-07	BASiCS: Bayesian Analysis of Single-Cell Sequencing Data 2015-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1004333 PMID:26107944	研究论文	BASiCS是一个综合的贝叶斯分层模型，用于分析单细胞测序数据，能够估计细胞特异性归一化常数，量化技术变异性，并分解表达计数的总变异性为技术和生物成分	BASiCS模型通过引入人工合成的spike-in基因来量化技术变异性，并提供了一个直观的检测标准来识别高度或低度变异的基因	NA	开发和验证一个用于分析单细胞mRNA测序数据的新方法，以识别细胞间基因表达的真实异质性	单细胞mRNA测序数据中的基因表达变异性	生物信息学	NA	单细胞测序	贝叶斯分层模型	基因表达数据	使用了来自小鼠胚胎干细胞的基因表达测量数据
2	2024-08-09	Marrying microfluidics and microwells for parallel, high-throughput single-cell genomics 2015-Jun-20, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-015-0695-0 PMID:26087845	研究论文	本文介绍了一种基于微孔的创新平台，用于单细胞RNA测序（RNA-seq），结合了成本效益、可扩展性和并行性	该平台为单细胞基因组学提供了高吞吐量的平行处理能力，开启了新的生物学研究途径	NA	开发一种高效的单细胞RNA测序技术	单细胞RNA测序	数字病理学	NA	RNA-seq	NA	NA	NA
3	2024-08-09	Single-cell mRNA sequencing identifies subclonal heterogeneity in anti-cancer drug responses of lung adenocarcinoma cells 2015-Jun-19, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-015-0692-3 PMID:26084335	研究论文	本文通过单细胞mRNA测序技术，研究了肺腺癌细胞对抗癌药物反应的亚克隆异质性	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了肺腺癌细胞对抗癌药物反应的亚克隆异质性，并识别出与抗癌药物耐药性相关的候选肿瘤细胞亚群	NA	研究肿瘤内异质性如何影响治疗结果，并探索个性化抗癌治疗的可能性	肺腺癌细胞及其对抗癌药物的反应	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	34个来自肺腺癌患者肿瘤异种移植的肿瘤细胞
4	2024-08-09	Linking Micronuclei to Chromosome Fragmentation 2015-Jun-18, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2015.06.005 PMID:26091034	研究论文	文章通过结合活细胞成像和单细胞测序技术，研究了人类癌细胞中染色体重排的分子机制	首次使用活细胞成像和单细胞测序技术结合的方法，揭示了微核中染色体经常发生类似染色体碎裂的重排	NA	探索人类癌细胞中染色体重排的分子机制	人类癌细胞中的染色体重排	NA	癌症	活细胞成像和单细胞测序	NA	图像和序列数据	NA
5	2024-08-09	Deep sequencing reveals cell-type-specific patterns of single-cell transcriptome variation 2015-Jun-09, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-015-0683-4 PMID:26056000	研究论文	本文通过深度测序揭示了不同细胞类型中单细胞转录组变异的模式	开发了过滤基因以进行可靠定量的方法，并校准了生物变异	需要仔细分析以利用单细胞RNA测序数据，并考虑技术变异	探讨转录组状态与细胞表型之间的关系，并解决单细胞转录组学面临的分析挑战	来自五种小鼠组织和两种大鼠组织的91个细胞和18个细胞，以及30个稀释至单细胞水平的批量RNA对照样本	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	91个小鼠细胞，18个大鼠细胞，30个对照样本
6	2024-08-09	Scalable microfluidics for single-cell RNA printing and sequencing 2015-Jun-06, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-015-0684-3 PMID:26047807	研究论文	本文介绍了一种用于单细胞RNA打印和测序的可扩展微流控平台	开发了一种简单平台，用于在密封的皮升微孔中捕获单细胞裂解物，并能够打印RNA在玻璃上或捕获RNA在珠子上	NA	开发一种高效、低成本的工具，用于大规模单细胞转录组学研究	单细胞RNA	数字病理学	NA	RNA-Seq	NA	RNA	数百个单细胞
7	2024-08-09	Identification of cell types from single-cell transcriptomes using a novel clustering method 2015-Jun-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btv088 PMID:25805722	研究论文	本文介绍了一种名为共享最近邻（SNN）-Cliq的新算法，用于从单细胞转录组数据中识别细胞类型	SNN-Cliq算法利用共享最近邻的概念，在处理高维数据方面显示出优势，并在多种合成和真实实验数据集上优于现有方法	NA	开发一种新的计算方法来聚类单细胞转录组数据，以准确识别细胞类型	单细胞转录组数据	生物信息学	NA	单细胞转录组测序	SNN-Cliq算法	基因表达数据	多种合成和真实实验数据集
8	2024-08-09	The coexistence of Sjögren's syndrome and primary biliary cirrhosis: a comprehensive review 2015-Jun, Clinical reviews in allergy & immunology IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s12016-015-8471-1 PMID:25682089	综述	本文全面回顾了干燥综合征与原发性胆汁性肝硬化共存的情况	探讨了B细胞、细胞毒性T细胞和辅助T细胞在慢性炎症中的作用，以及雌激素受体在疾病中的潜在影响	尽管有现有数据，治疗方案仍然不尽如人意，且近期研究（如使用利妥昔单抗的B细胞耗竭）仅部分有益	探讨干燥综合征与原发性胆汁性肝硬化共存的机制及治疗策略	干燥综合征与原发性胆汁性肝硬化	NA	自身免疫性疾病	NA	NA	NA	NA