单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-09	ID4 controls mammary stem cells and marks breast cancers with a stem cell-like phenotype 2015-Mar-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms7548 PMID:25813983	研究论文	本研究揭示了抑制分化4（ID4）在乳腺干细胞自我更新中的关键作用，并标记了具有干细胞样表型的一类基底样乳腺癌（BLBC）	首次证明ID4是乳腺干细胞自我更新的关键调节因子，并将其与BLBC的病因联系起来	NA	探讨基底样乳腺癌的细胞起源和病因	乳腺干细胞和基底样乳腺癌	数字病理学	乳腺癌	单细胞转录组学	NA	转录组数据	使用ID4GFP敲入报告小鼠模型和人类BLBC样本
2	2024-08-09	Genomic expansion of domain archaea highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling 2015-Mar-16, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2015.01.014 PMID:25702576	研究论文	本研究通过基因组解析的宏基因组分析，探讨了古菌在陆地地下生物地球化学循环中的多样性、基因组大小、代谢能力和潜在作用	首次使用无培养方法重建了古菌的完整基因组，并解析了两个新的古菌门，揭示了古菌在碳和氢代谢中的重要作用	NA	研究古菌在陆地地下生物地球化学循环中的作用	古菌的多样性、基因组大小、代谢能力和潜在作用	基因组学	NA	宏基因组分析	NA	DNA	从科罗拉多河附近的含水层采集的复杂沉积物和浮游生物群落样本，以及151个新的古菌序列
3	2024-08-09	Brain structure. Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq 2015-Mar-06, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aaa1934 PMID:25700174	研究论文	本文利用大规模单细胞RNA测序技术对小鼠体感皮层和海马CA1区域的细胞进行分类	发现了47个分子上独特的亚类，包括皮层中所有已知的主要细胞类型，并识别出许多标记基因，这些基因与已知的细胞类型、形态和位置相匹配	NA	揭示小鼠皮层和海马中的细胞类型	小鼠体感皮层和海马CA1区域的细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	大规模单细胞样本
4	2024-08-09	Sexual cell-fate reprogramming in the ovary by DMRT1 2015-Mar-16, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2015.01.034 PMID:25683803	研究论文	本文研究了DMRT1转录因子在卵巢中对细胞性别命运重编程的影响	首次展示了DMRT1在卵巢中不仅必要而且足以指定雄性细胞身份，并通过单细胞RNA测序识别了动态表达的候选介质	NA	探讨DMRT1在卵巢中对细胞性别命运重编程的作用及其在人类性别发育障碍中的潜在影响	DMRT1转录因子及其在卵巢中的表达对细胞性别命运的影响	NA	性别发育障碍	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
5	2024-08-09	Computational and analytical challenges in single-cell transcriptomics 2015-Mar, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/nrg3833 PMID:25628217	研究论文	本文探讨了单细胞转录组学中的计算和分析挑战	本文强调了单细胞RNA测序数据分析所需的新计算策略	需要克服特定的计算和分析挑战	探讨单细胞转录组学中的计算和分析问题	单细胞转录组学数据	生物信息学	NA	RNA测序	NA	转录组数据	大量单细胞
6	2024-08-09	Integrated genome and transcriptome sequencing of the same cell 2015-Mar, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/nbt.3129 PMID:25599178	研究论文	本文介绍了一种准线性扩增策略，用于从同一细胞中定量测序基因组DNA和mRNA，无需在扩增前物理分离核酸	提出了一种集成基因组和转录组测序的新方法，能够在同一细胞中同时测序基因组DNA和mRNA	NA	旨在解决从同一细胞中同时测序基因组DNA和mRNA的挑战	单细胞基因组和转录组	基因组学	NA	基因组和转录组测序	NA	基因组DNA和mRNA	单个细胞
7	2024-08-09	WemIQ: an accurate and robust isoform quantification method for RNA-seq data 2015-Mar-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btu757 PMID:25406327	研究论文	本文介绍了一种名为WemIQ的RNA-seq数据isoform定量方法，该方法通过加权对数似然期望最大化算法有效分配reads，提高了isoform和基因表达的定量精度。	WemIQ通过集成有效的偏差去除和加权期望最大化算法，显著提高了isoform和基因表达的定量精度，并能区分单细胞RNA-seq数据中的偏差异质性和真实生物异质性。	NA	开发一种准确且稳健的RNA-seq数据isoform定量方法。	RNA-seq数据的isoform表达定量。	基因组学	NA	RNA-seq	期望最大化算法	RNA-seq数据	NA