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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Discovery of biclonal origin and a novel oncogene SLC12A5 in colon cancer by single-cell sequencing
2014-Jun, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/cr.2014.43
PMID:24699064
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了一例结肠癌样本,揭示了肿瘤细胞群体中的两个独立克隆,并发现了一个新的致癌基因SLC12A5。 | 首次在单细胞层面提供了全外显子水平的证据,支持结肠癌可能具有双克隆起源,并表明在群体中低频突变在个体层面也可能发挥重要的促癌作用。 | NA | 通过单细胞测序技术揭示结肠癌的克隆关系并识别关键驱动基因。 | 结肠癌样本及其细胞群体。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 22例(1例单细胞测序,21例全组织外显子测序) |
2 | 2024-08-09 |
Single cell sequencing approaches for complex biological systems
2014-Jun, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2014.06.004
PMID:25016438
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在复杂生物系统中的最新进展及其在揭示生物系统中的应用 | 讨论了单细胞测序技术带来的新颖生物学观察 | NA | 增强我们对生物系统背后原理的理解 | 单细胞的基因、表观遗传和转录状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
3 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma
2014-Jun-20, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1254257
PMID:24925914
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了五例原发性胶质母细胞瘤中的430个细胞,揭示了肿瘤内异质性及其对疾病生物学、预后和治疗的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胶质母细胞瘤内部的多重调控程序异质性,并揭示了其对疾病预后的潜在影响 | NA | 揭示胶质母细胞瘤内部的异质性及其对疾病生物学、预后和治疗的影响 | 原发性胶质母细胞瘤中的细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 430个细胞,来自五例原发性胶质母细胞瘤 |
4 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic paracrine control of cellular variation
2014-Jun-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13437
PMID:24919153
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠骨髓来源的树突状细胞在不同实验条件下的基因表达变异 | 揭示了细胞间旁分泌信号在控制细胞异质性中的重要作用,并展示了多细胞群体建立复杂动态响应的一般策略 | NA | 探索单细胞水平上基因表达变异的本质及其功能 | 小鼠骨髓来源的树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,700个单细胞样本 |
5 | 2024-08-09 |
ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly
2014-Jun-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btu266
PMID:24931996
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ExSPAnder的算法,用于在标准和单细胞测序项目中准确解析重复序列 | ExSPAnder算法能够有效利用来自单个或多个读对库的信息,解决了传统组装器在处理单细胞项目时假设均匀读覆盖的问题 | NA | 开发一种能够在单细胞测序项目中准确解析重复序列的算法 | 下一代测序技术中的重复序列解析问题 | 生物信息学 | NA | NGS | NA | DNA序列 | NA |
6 | 2024-08-09 |
Validation of noise models for single-cell transcriptomics
2014-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2930
PMID:24747814
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研究论文 | 本文通过单分子荧光原位杂交技术验证了用于校正单细胞转录组学中技术变异性的噪声模型 | 提出了用于校正单细胞转录组学中采样噪声和全局细胞间测序效率变异的噪声模型 | NA | 验证噪声模型在单细胞转录组学中的应用 | 单细胞转录组学中的技术变异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交 | 噪声模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |