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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
PyClone: statistical inference of clonal population structure in cancer
2014-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2883
PMID:24633410
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研究论文 | 介绍了一种用于推断癌症克隆种群结构的统计模型PyClone | PyClone是一种贝叶斯聚类方法,能够将深度测序的体细胞突变分组为假定的克隆簇,同时估计它们的细胞流行率并考虑由片段拷贝数变化和正常细胞污染引入的等位基因不平衡 | NA | 推断癌症中的克隆种群结构 | 深度测序的体细胞突变 | 数字病理学 | 癌症 | 深度测序 | 贝叶斯聚类方法 | 测序数据 | NA |
2 | 2024-08-09 |
The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells
2014-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2859
PMID:24658644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Monocle的无监督算法,该算法利用单细胞RNA-Seq数据提高转录组动态的时间分辨率 | Monocle算法能够揭示细胞分化过程中的开关样表达变化、连续的基因调控波以及未知的调控因子 | NA | 定义细胞分化等时间过程的转录动力学 | 单细胞RNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞RNA-Seq数据 |