单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 55 篇文献，本页显示第 41 - 55 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals T helper cells synthesizing steroids de novo to contribute to immune homeostasis
2014-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.04.011
PMID:24813893
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和定量PCR分析，揭示了T辅助2细胞（Th2细胞）在体内外产生孕烯醇酮，并探讨了其在免疫抑制中的作用 | 首次报道了Th2细胞能够从头合成孕烯醇酮，并提出孕烯醇酮作为“淋巴类固醇”的概念 | NA | 探讨Th2细胞合成孕烯醇酮的机制及其在免疫调节中的作用 | T辅助2细胞（Th2细胞）及其合成的孕烯醇酮 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，定量PCR | NA | RNA | NA |
| 42 | 2024-08-09 |
How to infer relative fitness from a sample of genomic sequences
2014-Jul, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.113.160986
PMID:24770330
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研究论文 | 本文展示了通过分析从适应性多样但无结构的无性群体中随机抽取的中等数量基因组样本的重构谱系树形状，来预测样本内个体相对适应性的方法 | 提出了一种启发式算法，通过识别重构树中快速合并的谱系来推断适应性排序，并验证了其与实际适应性的强相关性 | 推断准确性随样本大小单调增加，但样本量达到200时性能接近饱和 | 开发一种方法来推断从单细胞测序肿瘤和监测病毒爆发中获得的基因组的相对适应性 | 基因组序列的相对适应性 | NA | NA | 单细胞测序 | 线性判别器 | 基因组序列 | 中等数量（约200） |
| 43 | 2024-08-09 |
Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing
2014-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1402030111
PMID:24782542
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研究论文 | 本文介绍了一种在微流控平台上进行的单细胞全转录组测序技术，该技术提高了mRNA检测的灵敏度和测量精度 | 将单细胞RNA-Seq技术与微流控平台结合，提高了检测灵敏度和实验通量 | NA | 验证微流控技术在单细胞全转录组分析中的优势 | 单个小鼠胚胎细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 文本 | 94个单细胞文库 |
| 44 | 2024-08-09 |
Validation of noise models for single-cell transcriptomics
2014-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2930
PMID:24747814
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研究论文 | 本文通过单分子荧光原位杂交技术验证了用于校正单细胞转录组学中技术变异性的噪声模型 | 提出了用于校正单细胞转录组学中采样噪声和全局细胞间测序效率变异的噪声模型 | NA | 验证噪声模型在单细胞转录组学中的应用 | 单细胞转录组学中的技术变异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交 | 噪声模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 45 | 2024-08-09 |
Reconstructing lineage hierarchies of the distal lung epithelium using single-cell RNA-seq
2014-May-15, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13173
PMID:24739965
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，重建了小鼠远端肺上皮细胞的分化谱系层次结构 | 采用微流控单细胞RNA测序技术，避免了传统转录组分析中的集合平均效应，能够直接测量发育中的肺内各种细胞类型及其层次结构 | NA | 揭示控制肺祖细胞沿不同谱系分化为成熟肺泡细胞类型的机制 | 小鼠远端肺上皮细胞的分化谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 198个单细胞 |
| 46 | 2024-08-09 |
The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells
2014-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2859
PMID:24658644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Monocle的无监督算法，该算法利用单细胞RNA-Seq数据提高转录组动态的时间分辨率 | Monocle算法能够揭示细胞分化过程中的开关样表达变化、连续的基因调控波以及未知的调控因子 | NA | 定义细胞分化等时间过程的转录动力学 | 单细胞RNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞RNA-Seq数据 |
| 47 | 2024-08-09 |
Massively parallel single-cell RNA-seq for marker-free decomposition of tissues into cell types
2014-Feb-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1247651
PMID:24531970
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研究论文 | 本文介绍了一种自动化的大规模并行单细胞RNA测序方法，用于分析数千个单细胞在体内的转录状态，并结合无监督分类算法，对脾脏组织的细胞类型进行从头鉴定。 | 本文创新性地使用大规模并行单细胞RNA测序技术，结合无监督分类算法，实现了对复杂组织中细胞类型的全面分解。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法，用于解析多细胞生物中由异质细胞类型组成的复杂器官的细胞组成。 | 研究对象包括脾脏组织中的树突状细胞和其他造血细胞类型。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督分类算法 | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 48 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2771
PMID:24524131
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Entering the era of single-cell transcriptomics in biology and medicine
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2764
PMID:24524133
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
The promise of single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2769
PMID:24524134
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic, random monoallelic gene expression in mammalian cells
2014-Jan-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1245316
PMID:24408435
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哺乳动物细胞中动态且随机的单等位基因表达现象 | 首次在单细胞水平上进行全基因组范围内的等位基因表达分析，发现了大量的单等位基因表达现象，并揭示了其随机性和动态性 | NA | 研究哺乳动物细胞中单等位基因表达的动态性和随机性 | 小鼠着床前胚胎的单细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 混合背景的小鼠着床前胚胎细胞 |
| 52 | 2024-08-09 |
Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2
2014-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2014.006
PMID:24385147
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research paper | 本文介绍了使用Smart-seq2方法从单个细胞中进行全长RNA-seq的详细协议 | Smart-seq2方法优化了灵敏度、准确性和全长转录本覆盖范围 | 目前方法缺乏链特异性，且无法检测非多聚腺苷酸化（polyA(-)）RNA | 揭示细胞间变异的程度、功能和起源 | 单个细胞中的基因表达 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 单个细胞 |
| 53 | 2024-08-09 |
Quantitative single-cell RNA-seq with unique molecular identifiers
2014-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2772
PMID:24363023
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研究论文 | 本文介绍了使用独特分子标识符（UMI）进行定量单细胞RNA测序的方法，以减少cDNA合成和扩增过程中的量化误差。 | 通过使用分子标签和微流体样品制备技术，实现了mRNA捕获效率的五倍提升，并几乎消除了扩增噪声。 | NA | 提高单细胞RNA测序的定量准确性，以揭示细胞异质性和肿瘤微进化。 | 单细胞RNA测序中的cDNA合成和扩增过程。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
From single-cell to cell-pool transcriptomes: stochasticity in gene expression and RNA splicing
2014-Mar, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.161034.113
PMID:24299736
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研究论文 | 本文使用SMART-seq单细胞RNA测序技术研究GM12878淋巴母细胞系，通过插入量化标准估计每个基因的RNA分子绝对数量，并探讨细胞间基因表达和RNA剪接的随机性 | 本文通过池/分割设计直接测量技术随机性，发现细胞间表达存在显著差异，并评估了细胞间可变剪接和等位基因偏倚的差异 | NA | 探索细胞间基因表达、转录处理和编辑以及调控模块活性的变异 | GM12878淋巴母细胞系的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(SMART-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及50,000至300,000个转录本每细胞 |
| 55 | 2024-08-09 |
Serotonergic neuron regulation informed by in vivo single-cell transcriptomics
2014-Feb, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.13-240267
PMID:24192459
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研究论文 | 本文通过使用单细胞转录组学技术，研究了背侧中缝（DR）的血清素能（5-HT）神经元在抑郁症和焦虑症中的分子组成和潜在药物靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析，识别了超过500种G蛋白偶联受体（GPCRs），并发现催产素和溶血磷脂酸1受体与α1-肾上腺素受体共同刺激DR 5-HT神经元的放电活动 | NA | 揭示血清素能神经元的分子调控机制 | 背侧中缝的血清素能神经元 | NA | 抑郁症，焦虑症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个血清素能神经元 |