单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 11 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-05 |
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2694
PMID:24141493
|
研究论文 | 该文章比较了不同的单细胞RNA扩增方法的敏感性和准确性 | 系统评估了多种单细胞RNA-seq方法的性能，并显示出在较小的测序读取数下仍能准确测量单细胞转录组 | 未提及具体的限制 | 探讨单细胞转录组分析的有效性 | 比较不同的单细胞RNA扩增方法 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了不同数量的单细胞样本 |
| 2 | 2024-08-09 |
Reconstructing each cell's genome within complex microbial communities-dream or reality?
2014, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2014.00771
PMID:25620966
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研究论文 | 本文探讨了在复杂微生物群落中重建每个细胞基因组的方法及其挑战 | 介绍了单细胞基因组学作为解决微生物生态学和环境微生物学中未培养微生物基因组信息获取问题的新方法 | 讨论了方法学限制和固有偏差，基于环境和基准数据评估了实现目标的距离 | 旨在从环境中每个细胞中恢复基因组序列，以更好地理解群落代谢潜力并提供实验工作基础 | 复杂微生物群落中的每个细胞基因组 | 环境微生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3 | 2024-08-09 |
Comparison of multiple displacement amplification (MDA) and multiple annealing and looping-based amplification cycles (MALBAC) in single-cell sequencing
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0114520
PMID:25485707
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研究论文 | 本文比较了两种广泛应用于单细胞测序的扩增方法：多重置换扩增（MDA）和基于多重退火和循环扩增的环化（MALBAC） | MALBAC作为一种结合了改进的MDA和调整后的PCR的方法，具有更高的均匀性、特异性和可重复性 | NA | 比较不同扩增方法在单细胞测序中的效果 | 单细胞测序中的扩增方法 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 单个精子样本 |
| 4 | 2024-08-09 |
Diverse and widespread contamination evident in the unmapped depths of high throughput sequencing data
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0110808
PMID:25354084
|
研究论文 | 本文探讨了高通量测序数据中未映射深度的广泛污染问题，并分析了其对实验结果的影响 | 首次系统地研究了高通量测序数据中的污染问题，并提出了污染对实验结果影响的证据 | 负控制库在恢复低频污染物的有限能力未得到充分控制 | 揭示高通量测序数据中污染的普遍性和多样性，并评估其对实验结果的影响 | 高通量测序数据中的污染物分布及其对实验结果的影响 | 基因组学 | NA | 高通量测序 | NA | DNA序列 | 四项单细胞测序实验 |
| 5 | 2024-08-09 |
A quantitative comparison of single-cell whole genome amplification methods
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0105585
PMID:25136831
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研究论文 | 本文比较了三种单细胞全基因组扩增方法在E. coli DNA样本上的应用 | 首次对三种先进的单细胞全基因组扩增方法进行了定量比较 | 没有一种方法在所有标准上表现最佳，选择哪种扩增方法取决于实验的具体问题 | 评估不同单细胞全基因组扩增方法的性能 | E. coli DNA的单细胞和批量样本 | NA | NA | 全基因组扩增 | NA | DNA | 单细胞和批量样本 |
| 6 | 2024-08-09 |
CD8+ TCR transgenic strains expressing public versus private TCR targeting the respiratory syncytial virus K(d)M2(82-90) epitope demonstrate similar functional profiles
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0099249
PMID:24897427
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序选择T细胞受体序列，生成针对呼吸道合胞病毒K(d)M2(82-90)表位的公共和私有T细胞受体转基因小鼠，并评估这些转基因小鼠的CD8+ T细胞的增殖、细胞因子和细胞溶解活性 | 本文生成了新的、特征明确的转基因小鼠品系，为研究CD8+ T细胞反应的分子机制提供了新的机会 | NA | 研究CD8+ T细胞反应的分子机制 | 针对呼吸道合胞病毒K(d)M2(82-90)表位的公共和私有T细胞受体转基因小鼠的CD8+ T细胞功能 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞测序 | T细胞受体转基因小鼠 | 细胞 | TRBV13-1（私有）和TRBV13-2（公共）TCR转基因小鼠的细胞 |
| 7 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2771
PMID:24524131
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-09 |
Entering the era of single-cell transcriptomics in biology and medicine
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2764
PMID:24524133
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-09 |
The promise of single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2769
PMID:24524134
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic, random monoallelic gene expression in mammalian cells
2014-Jan-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1245316
PMID:24408435
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哺乳动物细胞中动态且随机的单等位基因表达现象 | 首次在单细胞水平上进行全基因组范围内的等位基因表达分析，发现了大量的单等位基因表达现象，并揭示了其随机性和动态性 | NA | 研究哺乳动物细胞中单等位基因表达的动态性和随机性 | 小鼠着床前胚胎的单细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 混合背景的小鼠着床前胚胎细胞 |
| 11 | 2024-08-09 |
Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2
2014-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2014.006
PMID:24385147
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research paper | 本文介绍了使用Smart-seq2方法从单个细胞中进行全长RNA-seq的详细协议 | Smart-seq2方法优化了灵敏度、准确性和全长转录本覆盖范围 | 目前方法缺乏链特异性，且无法检测非多聚腺苷酸化（polyA(-)）RNA | 揭示细胞间变异的程度、功能和起源 | 单个细胞中的基因表达 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 单个细胞 |