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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-09 |
RNA single-cell sequencing could lead to eight-cell embryo genetic testing
2013-Oct, Bioanalysis
IF:1.9Q3
PMID:24195119
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-09 |
Assembling single-cell genomes and mini-metagenomes from chimeric MDA products
2013-Oct, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2013.0084
PMID:24093227
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研究论文 | 本文介绍了用于识别和解析de Bruijn图中镶嵌边缘和复杂凸起的算法,显著提高了单细胞组装的质量,并描述了单细胞组装器SPAdes在捕获和测序“微生物暗物质”中的应用。 | 提出了新的算法来处理单细胞基因组学中的高镶嵌读取问题,并开发了SPAdes组装器,该组装器在单细胞细菌数据集上优于其他专门为单细胞测序设计的组装器。 | NA | 改进单细胞基因组和迷你元基因组的组装方法,以更好地进行全基因组测序。 | 单细胞基因组和迷你元基因组的组装算法及应用。 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | de Bruijn图 | 基因组数据 | 随机选择的单细胞组成的小池(迷你元基因组) |
3 | 2024-08-09 |
Single cells from human primary colorectal tumors exhibit polyfunctional heterogeneity in secretions of ELR+ CXC chemokines
2013-Oct, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c3ib40059j
PMID:23995780
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研究论文 | 本文通过微刻技术和亚纳升孔阵列直接分析了数千个人类原发性结直肠肿瘤和基质细胞分泌的ELR+ CXC趋化因子的分泌行为 | 首次详细描述了单个细胞分泌ELR+ CXC趋化因子的多功能异质性 | NA | 研究肿瘤细胞分泌状态的复杂性和动态变化 | 人类原发性结直肠肿瘤和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微刻技术 | NA | 细胞分泌物 | 数千个单细胞 |
4 | 2024-08-09 |
Distilled single-cell genome sequencing and de novo assembly for sparse microbial communities
2013-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btt420
PMID:23918251
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研究论文 | 本文介绍了一种新颖的分治方法,用于对微生物样本中所有不同基因组进行测序和从头组装,其测序成本和计算复杂度与基因组类型数量成正比,而非细胞数量。 | 提出了一种分治方法,通过减少与基因组类型数量成正比的测序成本和计算复杂度,有效降低了测序成本。 | NA | 旨在解决微生物样本中每个单细胞基因组识别的重要且具有挑战性的任务。 | 微生物样本中的单细胞基因组。 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 通常有数百万个细胞的微生物样本 |
5 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics for drug target discovery
2013-Oct, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2013.04.011
PMID:23725882
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组测序技术在药物靶点发现中的应用 | 介绍了新的样本制备技术、测序平台和生物信息学工具,提高了数据的数量和质量 | 单细胞测序技术仍处于相对初级阶段 | 探索单细胞测序技术在识别新药物靶点中的应用 | 单细胞转录组测序技术及其在药物靶点发现中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |