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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-09 |
Investigating evolutionary perspective of carcinogenesis with single-cell transcriptome analysis
2013-Dec, Chinese journal of cancer
DOI:10.5732/cjc.012.10291
PMID:23706768
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研究论文 | 本文开发了相变微流控装置用于大量单细胞的分子谱分析,并探讨了单细胞转录组分析技术在从进化角度研究白血病中耐药性发展中的应用。 | 本文采用单细胞技术克服了传统细胞裂解物中基因表达测量的细胞异质性问题,能够获取大量单细胞转录组数据,从而从进化角度研究癌症发生。 | NA | 研究癌症发生的进化视角以及白血病中耐药性的发展。 | 单细胞转录组数据及其在癌症治疗中的应用。 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量单细胞 |
22 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals bimodality in expression and splicing in immune cells
2013-Jun-13, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature12172
PMID:23685454
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了小鼠骨髓来源的树突状细胞(BMDCs)对脂多糖反应中的异质性 | 发现了先前未观察到的信使RNA丰度和剪接模式的双峰变异,并验证了这些变异 | NA | 揭示细胞间的功能多样性并解析细胞状态和调控回路 | 小鼠骨髓来源的树突状细胞(BMDCs) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用来自敲除小鼠的细胞进行研究 |
23 | 2024-08-09 |
Rapid bacterial genome sequencing: methods and applications in clinical microbiology
2013-Sep, Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
IF:10.9Q1
DOI:10.1111/1469-0691.12217
PMID:23601179
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综述 | 本文综述了高通量测序技术在临床微生物学中的应用及其革命性影响 | 高通量测序技术降低了测序成本并缩短了结果时间,使其在研究和诊断中更具吸引力 | NA | 探讨高通量测序技术如何革新临床微生物学及其未来潜力 | 包括目标DNA序列和抗原的快速鉴定、流行病学分型和病原体监测、以及抗生素抗性和毒力因子的研究 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | NA |
24 | 2024-08-09 |
Quartz-Seq: a highly reproducible and sensitive single-cell RNA sequencing method, reveals non-genetic gene-expression heterogeneity
2013-Apr-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/gb-2013-14-4-r31
PMID:23594475
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为Quartz-Seq的新型单细胞RNA测序方法,该方法具有更简单的实验流程和更高的重复性和灵敏度 | Quartz-Seq方法比现有方法更简单,重复性和灵敏度更高,能够定量检测各种非遗传细胞异质性 | NA | 开发一种高度可重复且敏感的单细胞RNA测序方法,以促进对非遗传细胞异质性的生物学角色和潜在机制的理解 | 单细胞RNA测序方法的开发及其在检测非遗传细胞异质性中的应用 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞 |
25 | 2024-08-09 |
Nearly finished genomes produced using gel microdroplet culturing reveal substantial intraspecies genomic diversity within the human microbiome
2013-May, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.142208.112
PMID:23493677
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研究论文 | 本文通过凝胶微滴培养技术揭示了人类微生物组中物种内基因组多样性 | 使用凝胶微滴培养技术减少了MDA反应中的偏差,并显著提高了基因组测序和组装的准确性 | MDA技术从单个染色体拷贝中存在放大偏差和大量特异性损失的问题 | 探索微生物基因组多样性,并改进基因组测序技术 | 人类口腔和粪便微生物组样本中的两种细菌物种 | NA | NA | 多重置换扩增(MDA) | NA | 基因组数据 | 数百至数千个遗传上相同的细胞 |
26 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in its prime
2013-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2523
PMID:23471069
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
27 | 2024-08-09 |
Inferring the kinetics of stochastic gene expression from single-cell RNA-sequencing data
2013-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/gb-2013-14-1-r7
PMID:23360624
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research paper | 本文开发了一种统计框架,用于从单细胞RNA测序数据中研究随机基因表达的动力学 | 提出了一个新的统计模型,能够从单细胞RNA测序数据中推断基因表达的动力学参数,并发现组蛋白修饰对转录爆发的影响 | NA | 研究基因表达的动力学特性 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | 统计模型 | 数据 | 小鼠胚胎干细胞的单细胞RNA测序数据集 |
28 | 2024-08-09 |
High-throughput sequencing for biology and medicine
2013, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/msb.2012.61
PMID:23340846
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综述 | 本文综述了高通量测序技术在生物学和医学领域的广泛应用及其带来的新见解 | 介绍了高通量测序技术在转录组动态、基因组结构和基因组变异分析方面的创新方法 | 讨论了高通量测序在生物学和健康领域未来可能面临的障碍 | 探讨高通量测序技术在生物学和医学领域的新应用及其对复杂生物系统的洞察 | 涉及转录组、基因组结构、基因组变异、单细胞测序等多个生物学和医学研究对象 | 基因组学 | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | NA |
29 | 2024-08-09 |
BayesHammer: Bayesian clustering for error correction in single-cell sequencing
2013, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/1471-2164-14-S1-S7
PMID:23368723
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研究论文 | 本文介绍了一种基于汉明图和贝叶斯子聚类的新型错误校正工具BAYESHAMMER,用于单细胞测序中的错误校正 | 引入了基于汉明图和贝叶斯子聚类的新算法,这些算法在单细胞测序项目中表现出色,并且比现有的多细胞测序错误校正工具更快 | NA | 开发一种适用于单细胞测序的错误校正工具,并验证其在多细胞测序数据中的性能 | 单细胞测序数据和多细胞测序数据的错误校正 | 测序技术 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯聚类 | 测序读取数据 | NA |
30 | 2024-08-09 |
Molecular characterization of heterogeneous mesenchymal stem cells with single-cell transcriptomes
2013 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2012.12.003
PMID:23266308
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综述 | 本文综述了间充质干细胞(MSC)的潜在治疗应用,并讨论了使用单细胞转录组分析对异质细胞群进行分子表征的系统方法 | 提出了一种基于单细胞转录组分析的系统方法,用于在没有已知生物标志物的情况下对异质细胞群进行分子表征 | NA | 探讨间充质干细胞的分子表征及其在再生医学中的治疗应用 | 间充质干细胞及其在不同临床情况下的治疗价值 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
31 | 2024-08-09 |
Cancer genome sequencing: understanding malignancy as a disease of the genome, its conformation, and its evolution
2013-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2012.10.018
PMID:23111104
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研究论文 | 本文探讨了癌症基因组测序技术的发展及其在理解癌症基因组结构和进化中的应用 | 介绍了高通量测序技术在癌症基因组和转录组变异分析中的新化学和计算技术,以及单细胞测序在研究肿瘤进化中的潜力 | NA | 研究癌症基因组测序技术,以更好地理解癌症作为基因组、其结构和进化的疾病 | 癌症基因组及其结构和进化 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | 涉及多种恶性肿瘤 |