单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-05	Development and applications of single-cell transcriptome analysis 2011-Apr, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/nmeth.1557 PMID:21451510	评论	本文回顾了单细胞转录组分析的历史、进展、潜在应用和未来发展	结合活细胞成像和谱系追踪的方法，能够揭示个体细胞的基因表达网络	NA	探讨基因型与表型之间的关系	单细胞转录组	数字病理学	NA	单细胞转录组分析	NA	NA	NA
2	2024-08-09	The transcriptome of a human polar body accurately reflects its sibling oocyte 2011-Nov-25, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1074/jbc.M111.289868 PMID:21953461	研究论文	本文通过单细胞转录组分析，研究了人类极体与其姐妹卵母细胞的转录组相似性	首次证明了人类极体的转录组可以准确反映其姐妹卵母细胞的转录组，为体外受精（IVF）中的卵母细胞质量评估提供了新的分子诊断方法	NA	开发一种可靠且准确的方法来评估体外受精前卵母细胞的质量	人类极体和卵母细胞的转录组	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	超过12,700个独特的mRNA和miRNA来自卵母细胞样本，5,431个mRNA来自姐妹极体
3	2024-08-09	Error correction of high-throughput sequencing datasets with non-uniform coverage 2011-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btr208 PMID:21685062	research paper	本文开发了一种名为Hammer的方法，用于对非均匀覆盖的高通量测序数据集进行错误校正	Hammer方法不依赖于均匀性假设，基于汉明图和简单的概率模型进行错误校正，适用于非均匀的单细胞测序数据	NA	解决非均匀覆盖的高通量测序数据集的错误校正问题	高通量测序数据集的错误校正方法	NA	NA	HTS	NA	sequencing reads	NA
4	2024-08-09	Future medical applications of single-cell sequencing in cancer 2011-May-31, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/gm247 PMID:21631906	综述	本文综述了单细胞测序技术在癌症诊断和治疗中的应用及其面临的挑战和技术细节	单细胞测序技术能够解析复杂细胞混合物中的基因组差异，如异质性肿瘤，这在以往的方法中是无法实现的	文章中未明确提及具体的局限性	探讨单细胞测序技术在医学中的应用，特别是在癌症的早期检测、循环肿瘤细胞监测、肿瘤内异质性测量和化疗指导中的应用	单细胞测序技术及其在癌症治疗中的应用	数字病理学	癌症	下一代测序方法	NA	基因组数据	单个细胞
5	2024-08-09	Characterization of the single-cell transcriptional landscape by highly multiplex RNA-seq 2011-Jul, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.110882.110 PMID:21543516	研究论文	本文描述了一种新的策略，通过高度多重RNA测序来表征单细胞转录组景观	提出了一种无需已知标记即可分类细胞类型的新策略，通过单细胞RNA测序生成表达谱并聚类形成二维细胞图	NA	旨在通过单细胞RNA测序技术揭示复杂组织中细胞类型的真实表达模式	单细胞转录组	基因表达分析	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	85个单细胞，两种不同类型
6	2024-08-09	A single-cell sequencing approach to the classification of large, vacuolated sulfur bacteria 2011-Jun, Systematic and applied microbiology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.syapm.2011.02.001 PMID:21498017	研究论文	本文通过单细胞测序方法对大型、含硫空泡细菌进行分类研究	提出了保留Beggiatoaceae科的建议，并增加了九个Candidatus种和七个新的Candidatus属	NA	通过基因测序和形态学分析，重新评估大型硫细菌的分类	非丝状和已知丝状的大型硫细菌，包括Thiomargarita namibiensis等	微生物学	NA	16S rRNA基因和内部转录间隔区（ITS）测序	NA	序列数据	128个近全长16S rRNA-ITS序列
7	2024-08-09	Tumour evolution inferred by single-cell sequencing 2011-Apr-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature09807 PMID:21399628	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了人类乳腺癌肿瘤的细胞群体结构和进化过程	利用流式细胞仪分离的细胞核、全基因组扩增和下一代测序技术，准确量化了个体细胞核内的基因组拷贝数	仅分析了两个乳腺癌病例，可能不足以代表所有乳腺癌的进化模式	探索肿瘤细胞的遗传异质性及其在肿瘤进化中的作用	人类乳腺癌肿瘤的细胞群体结构和进化	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	基因组数据	分析了200个单细胞样本，分别来自两个乳腺癌病例
8	2024-08-09	Capturing diversity of marine heterotrophic protists: one cell at a time 2011-Apr, The ISME journal DOI:10.1038/ismej.2010.155 PMID:20962875	研究论文	本文采用单细胞测序技术评估缅因湾小型（直径小于10微米）异养原生生物的组成	使用单细胞测序技术，相比传统环境PCR克隆方法，能更准确地评估原生生物群落组成，并能分析未培养原生生物群组的多个基因或整个基因组	现有的研究工具存在PCR和克隆偏差、低系统发育分辨率等显著限制	评估海洋中异养原生生物的多样性	小型异养原生生物	分子方法	NA	单细胞测序	NA	基因序列	单个细胞