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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of bone cancer pain model induced by Lewis lung cancer cells in male mice
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2636340
PMID:41758238
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了雄性小鼠中由Lewis肺癌细胞诱导的骨癌疼痛模型的脊髓细胞组成和分子特征 | 首次在骨癌疼痛模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地揭示了脊髓中多种细胞类型的比例变化和分子通路改变 | 研究仅针对雄性小鼠,未考虑性别差异;模型基于特定肺癌细胞系,可能无法完全代表其他癌症类型引起的骨痛 | 探究骨癌疼痛的分子机制,为开发新的治疗方法提供依据 | 雄性小鼠的L2-L4脊髓组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-09 |
TimeVault turns vault particles into molecular memory of transcriptional states: how to decode the cellular black box
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2026.2639760
PMID:41789510
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TimeVault的新技术,该技术能够将细胞内的转录状态以分子记忆的形式存储于活细胞中 | 通过重新利用穹窿核糖核蛋白颗粒来捕获和稳定多聚腺苷酸化mRNA,实现了在活细胞内长期存储内源性转录组,从而能够回顾性重建分子历史 | NA | 开发一种能够在活细胞内长期存储转录状态分子记忆的技术,以揭示瞬时基因表达与长期表型结果之间的因果关系 | 活细胞(包括应激反应模型和癌症模型中的细胞) | 分子生物学 | 癌症 | TimeVault技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-03-09 |
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了三维培养系统如何影响人骨髓和胎盘来源间充质干细胞的免疫调节能力,并揭示了ICAM-1在介导球体形成和增强免疫调节中的双重作用 | 首次通过三维培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异,并识别ICAM-1在球体形成和免疫调节中的关键双重功能 | 研究主要基于体外实验,体内验证有限,且仅聚焦于两种MSC来源,可能未涵盖其他组织来源的MSCs | 探究三维培养对MSCs免疫调节能力的影响及其机制,以优化干细胞治疗策略 | 人骨髓来源间充质干细胞和胎盘来源间充质干细胞 | 细胞生物学 | NA | qPCR、流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 两种来源的MSCs(骨髓和胎盘) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-03-09 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于坐标卷积神经网络的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法BP-Coord,通过整合坐标信息提升模型的空间感知能力 | 提出BP-Coord方法,通过引入坐标信息作为额外通道和双三次插值上采样层,解决了CNN在单细胞RNA测序数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | NA | 开发一种高效准确的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 五个公共单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-09 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示PI3K/AKT信号通路在三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异中的关键作用,并识别MYB基因为潜在治疗靶点 | 首次通过整合多组学数据(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)结合机器学习特征选择,系统阐明PI3K/AKT通路在TNBC预后差异中的核心机制,并发现传统中药桃红四物汤活性成分与MYB的强结合潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;分子对接结果需体外/体内实验确认;样本来源和批次效应可能影响结果泛化性 | 探究PI3K/AKT信号通路是否导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌的预后差异,并寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌患者的转录组数据及MYB基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | 机器学习特征选择算法 | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从GEO数据库下载的原始转录组数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-03-09 |
R-loop-driven molecular subtypes reveal prognostic and immunogenomic features in uterine corpus endometrial carcinoma
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了R-loop活性在子宫体子宫内膜癌中的预后意义,并识别出CSDE1作为关键预测基因,其通过SPP1通路与免疫细胞相互作用,影响肿瘤进展和免疫抑制 | 首次将R-loop活性与UCEC的分子亚型、预后及免疫基因组特征关联,并发现CSDE1在成纤维细胞中的特异性表达及其通过SPP1通路介导的免疫抑制机制 | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏大规模独立队列验证;功能实验仅限于CSDE1,其他R-loop基因的作用未深入探讨 | 阐明R-loop在子宫体子宫内膜癌中的预后价值和生物学机制,探索CSDE1作为潜在治疗靶点 | 子宫体子宫内膜癌患者样本及相关转录组、临床、突变和空间数据 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、拷贝数变异分析、体细胞突变比较 | 预后模型 | 转录组数据、临床数据、突变数据、空间数据 | 来自TCGA及公共数据库的UCEC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-09 |
Electrocorticographic, astrocytic and transcriptomic signatures in the triple transgenic mouse model of Alzheimer's disease submitted to stearoyl-CoA desaturase inhibition
2026-May-15, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110835
PMID:41539386
|
研究论文 | 本研究探讨了在阿尔茨海默病三转基因小鼠模型中,抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢和转录组的影响 | 首次结合脑电图记录、星形胶质细胞标记、脂滴分析和空间转录组学,全面评估SCD抑制对AD模型小鼠多维度病理特征的挽救作用 | 研究仅使用雌性小鼠,未涵盖性别差异;SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变 | 探究SCD抑制是否能恢复AD模型小鼠的睡眠障碍,并评估其对脑脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组的影响 | 野生型和三转基因阿尔茨海默病雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 脑电图记录、免疫组织化学、空间转录组学 | 三转基因小鼠模型 | 生理信号、图像、转录组数据 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠,接受SCD抑制剂或对照处理 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-03-09 |
The modified Zuojin formula (SQQT) associates ILC2-linked JAK-2/STAT5/c-Myc cascade and gastric metaplasia regression
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121345
PMID:41663001
|
研究论文 | 本研究探讨了改良左金方(SQQT)通过调节ILC2介导的JAK-2/STAT5/c-Myc通路治疗胃化生的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示胃化生患者中ILC2增加,并验证SQQT通过靶向JAK-2/STAT5/c-Myc通路抑制细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床样本量有限,且SQQT的具体活性成分作用机制需进一步验证 | 探究SQQT在胃化生免疫微环境中的作用机制 | 胃化生患者样本、小鼠模型(GM诱导)及GES-1细胞系 | 数字病理学 | 胃化生 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、组织学分析、细胞因子检测 | NA | RNA测序数据、图像数据、蛋白质数据 | 胃化生患者样本(未明确数量)、小鼠模型(剂量分组:1.69, 3.38, 6.76 g/kg SQQT) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-09 |
Construction of a multi-tissue immune atlas for Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) reveals granulocyte functional adaptation and underlying regulatory mechanisms
2026-May, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111215
PMID:41720367
|
研究论文 | 本研究通过整合血液、肝脏、脾脏和头肾的单细胞RNA测序数据,构建了中国半滑舌鳎的多组织免疫图谱,揭示了粒细胞的功能适应性和调控机制 | 首次构建了中国半滑舌鳎的多组织免疫图谱,识别了五个转录不同的粒细胞亚群,揭示了其组织特异性分布和发育轨迹,以及cxcr2/cxcr4轴和cd44b介导的通讯策略 | NA | 研究硬骨鱼粒细胞在不同组织微环境中的功能适应性和调控机制 | 中国半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-09 |
Spatial and multi-omics transcriptomic dissects platinum resistance in lung adenocarcinoma: a five-gene predictive model with tumor microenvironment dynamics
2026-Apr-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111952
PMID:41662930
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术识别肺腺癌铂类耐药相关分子亚型,并构建了一个五基因预测模型 | 首次结合空间转录组学和多组学分析,揭示了肿瘤微环境动态在铂类耐药中的作用,并开发出具有临床级诊断精度的五基因预测模型 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏大规模前瞻性临床队列验证 | 识别肺腺癌铂类耐药的分子亚型并构建预测模型 | 肺腺癌患者数据、A549/DDP细胞系、裸鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、多组学分析、生物信息学策略、一致性聚类、机器学习 | 监督主成分算法、诊断模型 | 转录组数据、空间转录组数据 | 公共数据集中的肺腺癌患者样本、A549/DDP细胞系、裸鼠模型 | NA | 空间转录组学、多组学技术 | NA | NA |
| 11 | 2026-03-09 |
Aberrant STING signalling promotes endothelial dysfunction and neurovascular injury in diabetic retinopathy
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06628-8
PMID:41419617
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研究论文 | 本研究揭示了cGAS/STING/IFN信号通路在内皮细胞中的异常激活是糖尿病视网膜病变中视网膜炎症和神经血管功能障碍的关键驱动因素 | 首次在糖尿病视网膜病变中明确了STING信号通路在内皮细胞中的特异性激活作用,并证实靶向该通路可改善视网膜炎症和神经血管功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且长期治疗效果和安全性尚未评估 | 探究STING信号通路在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用及其作为早期干预靶点的潜力 | 人类增殖性糖尿病视网膜病变纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类增殖性糖尿病视网膜病变和特发性黄斑裂孔患者的纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-09 |
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168175
PMID:41616982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定出ITIH2作为肝细胞癌的新型预后生物标志物,并揭示了其通过泛素化调控THBS1稳定性,进而激活PI3K/AKT通路促进肿瘤血管生成的分子机制 | 首次发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化依赖的THBS1调控激活PI3K/AKT通路,从而增强内皮细胞血管生成能力,促进肝细胞癌进展 | 研究样本量有限(仅使用两个患者的scRNA-seq数据),且主要依赖公共数据库(TCGA和ICGC)进行验证,缺乏大规模独立队列验证 | 探究肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展相互作用的分子机制,并寻找新的预后生物标志物 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,功能实验(集落形成、CCK-8、流式细胞术) | LASSO回归,多变量Cox回归,风险评分系统,列线图 | 单细胞RNA测序数据,临床样本数据,公共数据库(TCGA, ICGC) | 两个肝细胞癌患者的scRNA-seq数据(GSE166635),TCGA和ICGC数据库中的肝细胞癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-09 |
Multi-Omics Data Reveal Estrogen-Driven Dysregulation and Stromal-Epithelial Signaling Alterations in Endometrial Polyps
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504234R
PMID:41787252
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了子宫内膜息肉中雌激素驱动的失调及基质-上皮信号传导改变 | 首次在单细胞水平上结合多组学数据,识别了子宫内膜息肉中增强的雌激素信号、细胞组成变化及异常的基质-上皮互作,并利用体外类器官模型验证了上皮转录改变在息肉形成中的作用 | 研究样本可能有限,且体外类器官模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究子宫内膜息肉的发病机制,特别是雌激素信号和基质-上皮互作的作用 | 正常子宫内膜、息肉旁组织和息肉组织 | 数字病理学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 体外类器官模型 | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括正常、息肉旁和息肉组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-03-09 |
A supramolecular peptide reprograms PD-L1+ tumor-associated macrophages to enhance antitumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114657
PMID:41580126
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MH-PDBP的超分子肽纳米平台,用于重编程肺腺癌中PD-L1阳性的肿瘤相关巨噬细胞,以增强抗肿瘤免疫 | 首次通过金亲和自组装构建了靶向M2样巨噬细胞的超分子肽纳米平台,并证明其能通过促进PD-L1的溶酶体降解来重编程巨噬细胞表型 | 研究主要基于小鼠模型,其临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发一种通过重编程肿瘤相关巨噬细胞来克服肺腺癌免疫抑制微环境并增强免疫治疗效果的策略 | 肺腺癌中的PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、金亲和自组装、体内小鼠模型 | NA | 图像数据、测序数据 | 来自接受免疫检查点抑制剂治疗的肺腺癌患者的多重免疫组化数据及公共单细胞RNA测序数据,以及原位肺腺癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-03-09 |
Somatic cell dysfunction precedes testicular degeneration in a surgical model of cryptorchidism
2026-Mar-07, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-026-06330-9
PMID:41793492
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研究论文 | 本研究通过建立成年小鼠手术诱导的单侧隐睾模型,结合bulk RNA测序和单细胞RNA-seq数据分析,揭示了隐睾相关睾丸损伤中体细胞功能障碍的早期特征 | 首次在成年小鼠手术诱导的隐睾模型中,通过时序转录组分析揭示了体细胞(如Sertoli细胞和管周肌样细胞)功能障碍先于睾丸退化的分子机制 | 研究基于成年小鼠手术模型,需要在发育性隐睾模型和人类组织中进行验证以确立临床相关性 | 探究隐睾手术后睾丸持续损伤的分子和细胞机制 | 成年小鼠睾丸组织 | 数字病理学 | 隐睾症 | bulk RNA测序,单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据,组织学图像 | 小鼠睾丸组织在诱导后第0、3、7、10和14天收集,其中第0、3、7天的样本用于bulk RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-09 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-Mar-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了胃癌中的'危险区',揭示了其通过CCDC80+成纤维细胞诱导CD8+ T细胞功能障碍促进癌症进展的机制 | 首次定义了胃癌中具有空间特征的'危险区',并阐明了CCDC80+成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号招募并诱导CD8+ T细胞功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的空间转录组学数据,临床验证和机制深度有待进一步扩展 | 探究胃癌肿瘤微环境的异质性及其对治疗抵抗和预后的影响 | 小鼠侵袭性肿瘤和人类胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞分析 | XGBoost, LightGBM | 空间转录组数据,H&E切片图像 | 未明确指定具体样本数量,但包括小鼠和人类多个队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-09 |
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68587-x
PMID:41794821
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研究论文 | 本研究通过小鼠血管内损伤模型,揭示了血管周围间充质细胞通过IL33-ST2-OPN轴指导ST2+修复性巨噬细胞,促进血管损伤后新生内膜增生的机制 | 首次定义了IL33-ST2-OPN轴在血管周围间充质细胞与修复性巨噬细胞功能串扰中的作用,并利用局部水凝胶递送siRNA靶向Il33或Spp1,为预防再狭窄等血管疾病提供了潜在治疗策略 | 研究仅基于雄性小鼠模型,未涉及雌性或其他性别,且机制探索可能未涵盖所有免疫-基质细胞互作 | 探究血管损伤后免疫-基质细胞互作机制,以开发预防血管疾病的新疗法 | 雄性小鼠的血管周围间充质细胞、ST2+修复性巨噬细胞及血管平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-09 |
Selective weakening of population-coupled synaptic activity in vivo in a mouse model of amyloid-beta pathology
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69866-3
PMID:41794826
|
研究论文 | 本研究通过体内成像和空间转录组学技术,探究了阿尔茨海默病早期淀粉样蛋白病理下突触功能障碍的特定模式 | 揭示了早期AD相关突触病理并非全局性,而是集中于与群体活动强耦合的GABA能突触,并首次在体内观察到兴奋性和抑制性神经元组装中钙介导活动的变化 | 研究仅基于App小鼠模型,可能无法完全反映人类AD的复杂性;且专注于早期阶段,未涉及晚期病理变化 | 探究阿尔茨海默病早期淀粉样蛋白病理中突触功能障碍的空间特异性及其分子机制 | App小鼠模型中的兴奋性和抑制性神经元、GABA能轴突终扣、兴奋性树突棘以及小清蛋白阳性抑制性神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 体内突触结构/功能成像、空间转录组学、钙成像 | App小鼠模型 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-09 |
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43023-8
PMID:41794881
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-03-09 |
AI-enabled single-cell dissection of the palmitoylation landscape identifies a multicellular prognostic program in gastric cancer
2026-Mar-07, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01359-4
PMID:41794921
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研究论文 | 本研究利用AI技术结合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量队列数据,解析了胃癌中蛋白质S-棕榈酰化景观,并识别了一个与不良预后相关的多细胞程序 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量队列数据,系统描绘胃癌中棕榈酰化相关状态,并开发了一个87基因多细胞棕榈酰化特征用于风险分层 | 研究样本量相对有限(25个胃癌肿瘤),且主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 | 探究蛋白质S-棕榈酰化如何塑造胃癌肿瘤生态系统并影响临床结局 | 胃癌肿瘤中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | AI模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 119,931个细胞来自25个胃癌肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |