单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 33318 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-28 |
Perfluorooctanoic acid disrupts splenic immunity and antiviral responses in the LCMV model: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了全氟辛酸对脾脏免疫功能和抗病毒反应的破坏机制 | 首次在LCMV病毒感染模型中系统阐明PFOA通过细胞类型特异性机制导致免疫抑制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠，样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统的影响及其在病毒感染中的细胞特异性机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞，共13个注释细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-28 |
Unraveling Diabetes Mechanisms: A Computational scRNA-Seq Approach to Inflammation and Diabetes
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_50
PMID:41273592
|
研究论文 | 本研究通过计算分析单细胞RNA测序数据探索营养、炎症与糖尿病之间的分子机制关系 | 采用单细胞RNA测序数据和先进计算方法揭示饮食条件如何影响免疫反应并促进糖尿病发展的分子通路 | NA | 探索炎症与糖尿病之间的分子机制，识别关键基因表达谱和分子通路 | 单细胞RNA测序数据集GSE161872中的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
|
研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术，揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观，发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据，系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态，并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-11-28 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型揭示了PRMT5在表皮发育中的关键作用，发现其缺失会导致基底角质形成细胞出现衰老样表型和表皮分层缺陷 | 首次在体内证明PRMT5通过抑制Cdkn1a(p21)防止基底角质形成细胞衰老，并鉴定出一群非典型的基底角质形成细胞样细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类皮肤中验证；PRMT5的具体下游靶标和分子机制仍需进一步阐明 | 探究PRMT5在表皮发育和角质形成细胞维持中的作用机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠模型及其表皮组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-11-28 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示ENO1通过调控糖酵解促进骨肉瘤转移的作用机制 | 样本量较小（仅10例儿科骨肉瘤样本），需要更大样本验证 | 阐明骨肉瘤转移的潜在分子机制 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10例儿科骨肉瘤样本（分为原发无转移组、原发有转移组和转移灶组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-28 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨环境污染物对羟基苯甲酸甲酯在乳腺癌中的因果作用和分子机制 | 首次结合遗传学证据与多组学数据，提出MEP通过非雌激素受体依赖机制促进乳腺癌发生的新假说 | 研究主要基于生物信息学分析和遗传数据，需要后续实验验证 | 阐明环境污染物对羟基苯甲酸甲酯在乳腺癌发生中的因果作用和分子机制 | 乳腺癌患者和健康人群的遗传与分子数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 转录组分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组, 分子对接 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 尿MEP硫酸盐数据n=8285, FinnGen联盟乳腺癌数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制，发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性，结果具有探索性，需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据，RNA-seq数据，生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者（单细胞数据），713例多发性骨髓瘤患者（验证队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-28 |
IL1RA+ Myeloid-derived Suppressor Cells Activate Epithelial-mesenchymal Transition to Facilitate Lymphatic and Hepatic Metastasis in Pancreatic Ductal Carcinoma
2025-Nov-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00416
PMID:41306373
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IL1RA+髓源性抑制细胞在胰腺导管癌肝转移和淋巴结转移中发挥关键免疫抑制和促肿瘤作用 | 首次鉴定出IL1RA+ MDSCs作为胰腺导管癌转移的关键免疫抑制细胞亚型，并阐明其通过上调上皮间质转化促进转移的机制 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证；动物模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究胰腺导管癌肝转移和淋巴结转移中的关键免疫抑制细胞及其调控机制 | 胰腺导管癌患者的肿瘤组织和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，流式细胞术，ELISA，qRT-PCR，Western blotting，Transwell实验 | 患者来源异种移植小鼠模型 | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，细胞功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-11-28 |
Characterizing heterogeneous cis-regulatory elements in gene regulatory programs associated with breast cancer
2025-Nov-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01562-1
PMID:41299571
|
研究论文 | 通过单细胞表观基因组分析揭示乳腺癌中异质性顺式调控元件的特征 | 首次在临床样本中应用单细胞ATAC测序技术系统描绘乳腺癌多细胞生态系统中的顺式调控元件景观 | 样本量相对有限（38个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析乳腺癌中异质性顺式调控元件在基因调控程序中的作用 | 乳腺癌临床样本中的22,775个细胞 | 表观基因组学 | 乳腺癌 | scATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 表观基因组数据，基因表达数据 | 38个前瞻性收集的乳腺癌样本，22,775个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-11-28 |
Single cell RNA seq of the major cell types in the larva of the sea star, Patiria miniata
2025-Nov-27, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70100
PMID:41306072
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria miniata幼虫发育过程中的主要细胞类型及其基因表达轨迹 | 首次提供了海星幼虫发育的单细胞转录组图谱，发现原始生殖细胞与体腔囊细胞具有相似的基因表达谱，并揭示了外胚层上皮的高度异质性 | 研究主要聚焦于第3天幼虫，其他发育时间点的分析相对有限 | 研究海星发育过程中细胞类型分化和基因表达机制 | 海星Patiria miniata受精后1-4天的幼虫 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，原位RNA杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 海星幼虫发育1-4天的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-11-28 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂的动态调控机制 | 首次在单细胞水平提出UPR变阻器概念，开发了臂特异性指标来量化三臂协调性，发现IRE1/ATF6紧密耦合而PERK相对独立的调控模式 | 研究基于转录组数据推断UPR臂协调性，需要扰动实验和蛋白水平验证 | 探究胶质母细胞瘤中UPR三臂在单细胞分辨率下是否作为分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机效应模型，转录因子活性推断 | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞，验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | SMART-seq和10x Chromium单细胞测序平台 |
| 12 | 2025-11-28 |
Single-cell sequencing reveals the complexity of cutaneous T-cell lymphoma
2025-Nov-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04063-0
PMID:41307784
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示皮肤T细胞淋巴瘤复杂基因组和微环境方面的研究进展 | 系统总结单细胞测序在解析CTCL肿瘤异质性、微环境组成和细胞状态转变中的创新应用 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解皮肤T细胞淋巴瘤的发病机制 | 皮肤T细胞淋巴瘤及其微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2025-Nov-27, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示EGFR阳性肺腺癌在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 | 首次在EGFR阳性肺腺癌中整合治疗前后配对样本的单细胞转录组数据，系统分析福莫替尼对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本量有限，耐药机制仍需进一步验证 | 探究福莫替尼治疗EGFR阳性肺腺癌的细胞分子机制及肿瘤微环境变化 | EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后配对样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-11-28 |
Exploring tumor heterogeneity and drug resistance in cervical cancer through single-cell and bulk transcriptomics
2025-Nov-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04037-2
PMID:41307828
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术探索宫颈癌肿瘤异质性和耐药机制 | 发现PI3+NEO和SLC40A1+NEO细胞群在耐药性中的关键作用，并揭示LGALS9通过抑制T细胞功能促进免疫抑制微环境 | NA | 探索宫颈癌肿瘤异质性和耐药机制以改善治疗效果 | 宫颈癌组织和HSIL样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 伪时序分析, 细胞通讯分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-28 |
T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 3-mediated immunomodulation in myeloid cells and keratinocytes in the development of severe acne
2025-Nov-27, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00367-3
PMID:41307843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TIM3在重度痤疮发展中作为免疫检查点的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析揭示TIM3在重度痤疮中的免疫调节功能 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索重度痤疮的发病机制和潜在治疗靶点 | 重度痤疮患者组织样本、人永生化角质形成细胞(HaCaT)、痤疮丙酸杆菌诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 重度痤疮、普通痤疮和正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-28 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor requires actomyosin forces
2025-Nov-26, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了小鼠门牙发育过程中干细胞特化和生态位形成的时序关系 | 发现肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制Sox2+干细胞定位和维持其干性中的关键作用 | 研究仅限于小鼠门牙发育模型，未验证其他牙齿类型或物种 | 探究牙齿发育过程中干细胞特化与生态位形成的时序关系和机制 | 小鼠门牙发育过程中的上皮干细胞 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Sox2CreERT2/+; R26RmT/mG和Sox2CreERT2/+; R26RtdT/+胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-11-28 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2025-Nov-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
|
研究论文 | 提出一种基于深度Beta过程的单细胞RNA-seq数据自适应可解释因子分析方法 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择，并采用对抗学习策略进行批次校正 | NA | 开发自适应且可解释的因子分析方法用于单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度概率框架，Beta过程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-11-28 |
Temporal dynamics of uterine immune microenvironment remodeling in a murine model of adenomyosis
2025-Nov-26, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf057
PMID:41298316
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨了子宫腺肌症发展过程中子宫免疫微环境的动态变化 | 首次系统揭示了子宫腺肌症发展过程中先天免疫与适应性免疫的动态交互作用，并发现IL-6介导的信号通路在疾病早期起关键驱动作用 | 研究依赖单一动物模型、仅分析两个时间点、缺乏调节性T细胞的功能评估 | 阐明子宫腺肌症在受孕前子宫免疫微环境的演变过程 | 他莫昔芬诱导的小鼠子宫腺肌症模型 | 免疫学 | 子宫腺肌症 | 免疫荧光、流式细胞术、定量PCR | NA | 组织样本、分子表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-11-28 |
A biomimetic senotherapy replenishing MAT2A promotes wound regeneration in preclinical models
2025-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65659-2
PMID:41298385
|
研究论文 | 本研究揭示了MAT2A在糖尿病伤口愈合中的关键作用，并开发了一种基于仿生策略的靶向衰老疗法 | 发现MAT2A在周细胞中的下调通过细胞衰老和线粒体功能异常驱动巨噬细胞炎症训练免疫，并首次开发了周细胞膜包被的自扩增RNA纳米颗粒仿生疗法 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究糖尿病伤口中持续性炎症浸润的分子机制并开发促进伤口再生的治疗方法 | 周细胞、巨噬细胞、糖尿病伤口模型 | 分子生物学 | 糖尿病伤口 | 单细胞测序, 仿生纳米颗粒技术, 自扩增RNA技术 | Cspg4-CreER/+; Mat2a基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 蛋白质表达数据 | 基因工程小鼠及其伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-28 |
Extracellular matrix anchored neutrophils drive pulmonary fibrosis in mice
2025-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66633-8
PMID:41298466
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和ECM蛋白质组学技术，揭示了在矽肺小鼠模型中通过反向跨内皮迁移的嗜中性粒细胞通过ICAM1介导与细胞外基质相互作用驱动肺纤维化的新机制 | 首次发现反向跨内皮迁移的嗜中性粒细胞亚群通过ICAM1介导与细胞外基质相互作用促进肺纤维化，并阐明巨噬细胞来源的组织蛋白酶C在其中的关键作用 | 研究仅使用雄性小鼠，缺乏雌性动物数据；所有实验均在矽肺小鼠模型中进行，需要进一步验证在其他肺纤维化模型中的普适性 | 探究嗜中性粒细胞在肺纤维化发病机制中的具体作用及其与细胞外基质的相互作用 | 矽肺小鼠模型中的嗜中性粒细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ECM蛋白质组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 蛋白质组数据 | 雄性小鼠矽肺模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |