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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-12-30
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2026-Jan-13, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发阶段肿瘤微环境的差异,并发现了一群具有免疫调节潜能的galectin-9阳性初始B细胞 首次在早期复发的经典霍奇金淋巴瘤中识别出一群表达免疫抑制基因LGALS9的初始B细胞,并通过空间分析证实了其与TIM-3+ CD4+ T细胞及HRS细胞的近距离相互作用 NA 探究经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发阶段肿瘤微环境的差异,特别是非恶性B细胞在复发中的作用 经典霍奇金淋巴瘤患者的配对诊断和复发样本 数字病理学 霍奇金淋巴瘤 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白质表达数据 配对诊断和复发样本及独立验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2025-12-30
Spatial Transcriptomic Characteristics of the Aging Human Ovary
2026-Jan, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究整合单核RNA测序和空间转录组学,构建了12个人类卵巢组织的衰老图谱,揭示了卵巢衰老的时空动态和转录组变化 首次结合单核RNA测序和空间转录组学构建人类卵巢衰老的综合图谱,鉴定出新的内皮细胞亚型CLDN5 blood EDCs,并发现其作为半专业抗原呈递细胞在衰老中的独特功能 样本量相对较小(n=12),且年龄分布不均(如青春期前仅1例),可能限制统计效力 阐明人类卵巢衰老的时空动态和潜在机制 人类卵巢组织 空间转录组学 生殖系统疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 12个人类卵巢组织样本(年龄12-54岁) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3 2025-12-30
Myeloid-Derived CD38 Mediates Age-Related Endometrial Aging Through NAD+ Depletion
2026-Jan, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型揭示了CD38介导的NAD+耗竭在子宫内膜衰老中的关键作用,并提出了通过补充NAD前体或靶向CD38来改善高龄女性生育结局的策略 首次将CD38与子宫内膜衰老直接关联,并证明其通过NAD+耗竭驱动基质细胞衰老,为子宫衰老机制提供了新见解 研究基于小鼠模型,人类子宫内膜衰老的机制可能有所不同,且临床转化需进一步验证 阐明子宫衰老的分子机制,以解决年龄相关植入失败问题 小鼠的围植入期子宫组织 生殖生物学 生殖衰老 单细胞RNA测序,全局代谢组学分析 NA 代谢组数据,单细胞转录组数据 不同年龄小鼠的子宫组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2025-12-30
Integrating Single-Cell Sequencing, Machine Learning, and Molecular Docking to Elucidate the Molecular Network Linking Myocardial Infarction and DEHP Exposure
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序、机器学习和分子对接技术,揭示了环境塑化剂DEHP通过结合SLC2A3和MMP9等核心基因,在特定免疫细胞中加剧心肌梗死的分子机制 首次结合单细胞RNA测序、机器学习算法集成和分子对接模拟,系统解析了DEHP在心肌梗死中细胞类型特异性的促炎免疫失调网络,并识别出六个核心诊断生物标志物 研究主要基于公共转录组数据集和计算预测,缺乏体内或体外实验的直接功能验证 阐明DEHP暴露与心肌梗死发病机制之间的细胞类型特异性分子联系 DEHP(邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯)暴露下的免疫细胞与心肌梗死相关分子靶点 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接模拟 集成机器学习算法(11种算法) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个公共数据集(GSE66360, GSE60993, GSE61144, GSE48060, GSE141512, GSE269269),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2025-12-30
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了肠道微生物-胆汁酸-TLR3信号轴在驱动间质性膀胱炎膀胱损伤中的作用 首次结合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 研究主要基于实验模型,人类样本验证有限,且具体机制细节需进一步探索 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 多组学整合分析 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 NA 基因组, 代谢组, 转录组数据 NA NA 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA NA
6 2025-12-30
Venetoclax resistance in preclinical KMT2A-rearranged acute lymphoblastic leukemia models is characterized by high inter- and intra-model heterogeneity
2025-Dec-29, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型,揭示了Venetoclax耐药性的产生机制,并强调了其高度异质性 首次在KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病临床前模型中系统表征了Venetoclax耐药性的出现,揭示了肿瘤抑制因子TP53和促凋亡分子BAX的新发及已知致病性变异,并通过单细胞RNA测序发现了肿瘤微环境在耐药性发展中的潜在作用 研究基于临床前模型(细胞系和异种移植),其结果向临床转化的直接相关性尚需验证;耐药机制具有高度异质性,可能难以找到普适性的单一解决方案 阐明KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病对BCL-2抑制剂Venetoclax产生继发性耐药的机制 KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型 NA 急性淋巴细胞白血病 靶向DNA测序, mRNA测序, 单细胞mRNA测序, 蛋白质表达分析 NA 基因组序列数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 未明确具体样本数量,涉及KMT2A重排的ALL细胞系和异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2025-12-30
ADME Profiling of Quantum Dots and Immune Responses: Impact of Dynamic Inflammatory Mediator Changes on the Nervous System
2025-Dec-29, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 本研究系统评估了碲化镉量子点的体内分布、神经行为效应及细胞反应,揭示了其诱发持续性神经炎症并损害学习记忆功能的多细胞机制 首次通过单细胞RNA测序技术解析量子点诱导神经毒性的多细胞协调响应机制,明确了小胶质细胞、少突胶质前体细胞和内皮细胞在炎症、氧化及细胞应激通路中的关键作用 研究仅使用小鼠模型,未验证其他物种;量子点类型和表面修饰单一;长期神经毒性效应需进一步追踪 评估量子点的神经安全性并阐明其神经毒性机制 注射巯基丙酸修饰碲化镉量子点的小鼠模型 单细胞组学 神经毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠海马组织单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2025-12-30
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2025-Dec-29, Molecular and cellular biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴促进巨噬细胞-成纤维细胞交互作用,从而加速肛瘘愈合的分子机制 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF轴调控巨噬细胞M1极化和成纤维细胞功能的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证;NF-κB抑制剂的反转实验仅部分验证通路参与 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子作用机制 肛瘘伤口愈合过程、巨噬细胞与成纤维细胞的交互作用 生物信息学与分子生物学 肛瘘 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR NA 基因表达数据、测序数据、体外实验数据、体内实验数据 转录组数据集(GSE28914, GSE203244)、小鼠肛瘘模型 NA 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA NA
9 2025-12-30
Biomimetic Liposome Coloaded ES-Cu and PFK15 Amplify Cuproptosis through Inhibition of Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes for Rheumatoid Arthritis Therapy
2025-Dec-29, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本文开发了一种仿生脂质体用于共递送ES-Cu和PFK15,通过抑制类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(RAFLS)的糖酵解来放大铜死亡,从而治疗类风湿关节炎 首次通过单细胞RNA测序揭示RAFLS中过度活跃的糖酵解是抵抗铜死亡的关键机制,并提出并验证了抑制糖酵解可放大铜死亡的假设,开发了基于RAFLS膜融合的靶向仿生脂质体递送系统 NA 开发一种通过放大铜死亡来治疗类风湿关节炎的新策略 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(RAFLS) NA 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2025-12-30
Glycosylated IgG antibodies contribute to the recovery of haemorrhagic fever with renal syndrome patients
2025-Dec-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析肾综合征出血热患者的B细胞亚群,结合超高效液相色谱分析IgG糖基化特征,揭示了IgG N-糖基化在抗汉坦病毒感染和临床恢复中的关键作用 首次系统研究了肾综合征出血热患者中IgG的糖基化特征,发现岩藻糖基化增加和双分N-乙酰葡糖胺减少与恢复期相关,并揭示了抗体分泌记忆B细胞和浆母细胞亚群与IgG Fc区半乳糖基化/唾液酸化的正相关性 样本量未明确说明,研究主要基于外周血单核细胞,未涉及组织特异性分析,且糖基化相关基因的具体名称在摘要中未完整列出 探究肾综合征出血热患者中IgG糖基化特征及其在抗病毒免疫和临床恢复中的作用 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞和IgG抗体 免疫学 肾综合征出血热 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 超高效液相色谱 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 色谱数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2025-12-30
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞分析,探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合起来,在牙周炎中进行综合分析,并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键生物标志物的表达 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证,且样本量有限 识别和表征与牙周炎中缺氧和铜死亡过程相关的关键生物标志物,以深入理解其分子机制 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 生物信息学 牙周炎 转录组分析,单细胞RNA测序 机器学习(Boruta算法,LASSO回归,递归特征消除) 基因表达数据(转录组数据) 使用了来自GEO数据库的多个数据集(如GSE16134, GSE10334, GSE152042),具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2025-12-30
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组测序分析,揭示了高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组测序以及TCGA和CGGA数据库,系统分析了高级别IDH突变型星形细胞瘤的恶性进展,并识别出一个与不良预后相关的免疫抑制性肿瘤细胞亚群 研究样本量相对有限,且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或功能验证实验的进一步支持 探究高级别IDH突变型星形细胞瘤的恶性进展机制,并识别其独特的肿瘤细胞亚群 高级别(WHO 3-4级)和低级别(WHO 2级)IDH突变型星形细胞瘤患者样本 数字病理学 星形细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组测序 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,公共数据库(TCGA, CGGA)数据 未明确指定具体样本数量,但包括高级别和低级别IDH突变型星形细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
13 2025-12-30
Targeting SPP1-CD44-Hedgehog Axis Elicits Therapeutic Effects in Hepatocellular Carcinoma by Suppressing Intratumoral Fibrosis
2025-Dec-28, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过转录组学、免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了SPP1通过SPP1-CD44-GLI1轴促进肝细胞癌(HCC)内肿瘤纤维化和进展的机制,并评估了靶向该轴的潜在治疗价值 首次将SPP1与HCC内肿瘤纤维化直接关联,并阐明其通过SPP1-CD44信号激活Hedgehog通路和GLI1来驱动肝星状细胞活化的新机制 研究主要基于体外和动物模型,缺乏直接的人类临床试验验证;样本量相对有限,且未涵盖所有HCC亚型 探索HCC中内肿瘤纤维化的关键介导因子及其治疗靶点 肝细胞癌(HCC)组织、肝星状细胞(HSCs)和xenograft模型 癌症生物学 肝细胞癌 转录组学分析、免疫组化、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞共培养、基因集富集分析、差异基因表达分析、细胞间相互作用预测 xenograft模型 RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、组织图像数据 372个HCC样本(公开数据集)、103个HCC组织样本、228,564个活细胞(单细胞分析) NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2025-12-30
Controllability of the gene regulatory network in zebrafish embryogenesis
2025-Dec-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据重建斑马鱼胚胎发育过程中的基因调控网络,并分析其可控性 首次在斑马鱼胚胎发育全过程中,基于单细胞数据重建基因调控网络并评估其可控性,发现发育后期网络可控性增强 研究基于推断的基因调控网络,可能存在网络重建的不确定性;未进行实验验证关键转录因子的功能 探究斑马鱼胚胎发育过程中基因调控网络的可控性 斑马鱼胚胎发育过程中的基因调控网络 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 网络可控性理论 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2025-12-30
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2025-Dec-28, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过多模态分子和空间分析,识别出NNT作为肥胖相关结直肠癌的潜在预后生物标志物 结合转录组数据、临床验证和空间转录组分析,首次在肥胖相关结直肠癌中揭示NNT的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 研究依赖于公共数据集和独立队列的验证,可能受样本异质性限制,且空间分析仅针对候选基因 识别反映肥胖相关肿瘤特征的分子生物标志物并分层患者预后 结直肠癌患者,包括正常、健康体重和肥胖样本 数字病理学 结直肠癌 转录组分析、免疫组织化学、空间转录组分析 NA 转录组数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据 基于TCGA-COADREAD数据集和独立验证队列,具体样本数未明确 NA 空间转录组学 GeoMx DSP NA
16 2025-12-30
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2025-Dec-27, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种结合10x Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术,用于研究小鼠大脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术,能够同时解析小鼠大脑组织中细胞类型的空间分布和转录组特征 该方案主要针对小鼠大脑组织,可能不直接适用于其他组织或物种;实验步骤较为复杂,需要专业设备和技术支持 开发一种实验方案,用于研究小鼠大脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化 小鼠大脑组织 数字病理学 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个年龄的小鼠大脑组织样本 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA-seq 10x Visium, 10x FLEX 10x Visium空间转录组学平台和10x FLEX单细胞RNA测序技术
17 2025-12-30
Identification of novel fibroblast subsets in diffuse cutaneous systemic sclerosis
2025-Dec-27, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别了弥漫性皮肤系统性硬化症中新的成纤维细胞亚群,并探讨了CD9和FHL1的功能作用 首次在系统性硬化症中识别出以CD9和FHL1上调为特征的新型成纤维细胞亚群,并揭示了FHL1在细胞外基质产生调控中的功能角色及其与VGLL3的机制联系 研究基于培养的皮肤成纤维细胞,可能无法完全反映体内微环境;样本量未明确说明,可能限制统计效力 识别系统性硬化症中的新型成纤维细胞亚群并确定其功能作用 来自健康供体和弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 单细胞组学 系统性硬化症 单细胞RNA测序,siRNA敲低实验,蛋白水平验证 NA RNA测序数据,蛋白表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2025-12-30
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2025-Dec-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过神经嵴谱系追踪、单细胞和空间转录组学等方法,发现成年小鼠软脑膜中存在神经嵴来源的多能细胞,这些细胞在缺血性中风后能被重新激活,通过特定信号通路促进血管修复 首次识别成年小鼠软脑膜中持续存在的神经嵴来源多能细胞,并揭示其在脑损伤后通过SDF1α-CXCR4信号通路被招募至受损血管,通过β-catenin和STAT3通路调控,以多效蛋白介导的信号恢复血管完整性 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体细胞激活和修复机制的分子细节仍需进一步探索 探究成年大脑中是否存在神经嵴来源的多能细胞,并研究其在脑损伤后血管修复中的作用 成年小鼠的软脑膜组织及缺血性中风模型 神经科学 中风 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 相互作用组建模, 活体成像 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
19 2025-12-30
Endoplasmic reticulum stress exacerbates ischemia-reperfusion-induced pulmonary endothelial barrier dysfunction by activating TXNDC5
2025-Dec-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了内质网应激通过激活TXNDC5加剧肺缺血再灌注损伤中肺内皮屏障功能障碍的机制 首次揭示内质网应激通过ATF6-TXNDC5轴调控肺内皮屏障功能,并构建了基于TXNDC5的LIRI早期预警模型 研究主要基于动物和细胞模型,临床验证样本量有限,需进一步大规模临床研究确认 探究TXNDC5在肺缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 大鼠肺缺血再灌注模型、人脐静脉内皮细胞、LIRI患者血浆样本 基础医学研究 肺缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序、ChIP-seq、血浆蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 动物模型和细胞实验,临床患者血浆样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2025-12-30
Spatial and single-cell transcriptomics landscape of adenomyosis
2025-Dec-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,深入剖析了子宫腺肌症的细胞和分子景观,并评估了GnRHa治疗的影响 首次在单细胞和空间转录组学水平上全面描绘了子宫腺肌症的细胞组成和分子特征,并揭示了纤毛上皮细胞和免疫-血管生成互作在疾病发病机制中的潜在作用 样本量相对较小,且主要基于转录组数据,功能验证有待进一步深入 旨在解析子宫腺肌症的病因和细胞分子机制,并评估GnRHa治疗对子宫内特定细胞生态位的影响 子宫腺肌症患者(包括未治疗和GnRHa治疗组)和对照参与者的子宫组织样本 数字病理学 子宫腺肌症 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,免疫组织化学 NA 转录组数据,图像数据 15名参与者用于测序(11名患者,4名对照),额外13名用于验证(11名患者,2名对照),并整合了公开的单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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