单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38530 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-19 |
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Jun, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110954
PMID:41780836
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，系统探索了电针对近视豚鼠视网膜细胞功能的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示电针调节近视豚鼠视网膜细胞功能的分子机制，特别是对光感受器视锥细胞、Müller胶质细胞和小胶质细胞的调控作用 | 研究仅基于豚鼠模型，未在人体中进行验证；样本量相对有限；机制研究主要依赖基因表达分析，缺乏更深入的体内功能验证 | 阐明电针干预通过调节视网膜细胞功能抑制近视进展的具体细胞机制 | 近视豚鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR, Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-04-19 |
Multimodal transcriptomics identifies metallothionein as a novel pathway in primary sclerosing cholangitis
2026-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001432
PMID:40560681
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序技术，在原发性硬化性胆管炎（PSC）肝脏样本中识别出金属硫蛋白作为新的疾病通路 | 首次在PSC中通过多模态转录组学方法揭示金属硫蛋白通路，并将其定位至纤维化病变边缘的特定肝细胞亚型 | 样本量相对有限，且主要基于移植肝脏样本，可能无法完全代表疾病早期阶段 | 探究PSC的疾病机制并识别潜在治疗靶点 | 人类肝脏样本（PSC患者和疾病对照）以及小鼠模型 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学，单核RNA测序（snRNA-seq），免疫组织化学 | NA | 转录组数据，空间定位数据 | 30例人类肝脏样本（23例PSC，7例疾病对照），以及小鼠模型 | NA | 空间转录组学，单核RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-19 |
An etiology-stratified single-cell atlas identifies FABP4 as a prognostic marker for MASLD-related HCC
2026-May, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.10.026
PMID:41205757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，揭示了HBV感染和MASLD对肝细胞癌肿瘤微环境的影响，并鉴定出FABP4作为MASLD相关HCC的潜在预后生物标志物 | 首次基于病因分层比较HBV-MASLD不同组合HCC的肿瘤微环境，发现HBV+MASLD+ HCC患者免疫治疗后预后最佳，并鉴定出FABP4通过促进血管正常化和增强CD8+ T细胞浸润改善预后 | 样本量较小（12例单细胞测序），需要在更大队列中验证FABP4的预后价值 | 比较不同病因HCC的肿瘤微环境差异，寻找病因特异性预后生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织、TCGA-LIHC数据库、免疫治疗HCC队列、小鼠模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、多重免疫组化、体外实验、体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据、bulk RNA-seq数据、组织切片图像 | 12例HCC患者的配对肿瘤和癌旁组织（单细胞测序），224例样本（免疫组化验证），TCGA-LIHC队列及两个免疫治疗HCC队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-19 |
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70108
PMID:41732956
|
研究论文 | 本研究通过分析牙周肉芽组织的细菌组和细胞谱，探索其生物学本质和转化潜力 | 首次结合16S rRNA测序、单细胞测序和组织学评估，比较不同来源牙周肉芽组织的细菌组和细胞特征，揭示骨缺损来源肉芽组织具有牙周健康相关特征和更高比例的间充质干细胞 | 样本量有限（49例），且未进行长期随访或功能验证研究 | 探索牙周肉芽组织的生物学特征及其在牙周再生中的潜在应用 | 牙周肉芽组织样本，包括骨缺损、拔牙窝和牙根表面的组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 16S rRNA测序, 单细胞测序 | NA | 序列数据, 组织学图像 | 49例严重牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-04-19 |
Developmental neurotoxicity of thyroid hormone system-disrupting chemicals: a systems-level exploration using multi-omics approach
2026-May, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04303-4
PMID:41654649
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探索甲状腺激素系统干扰化学物对发育神经毒性的影响 | 采用多组学整合分析揭示不同THSDCs在分子层面的收敛性扰动，特别是能量代谢和细胞骨架组织方面 | 研究仅针对两种THSDCs，且样本限于大鼠模型，可能无法完全反映人类情况 | 探究甲状腺激素系统干扰化学物如何影响母体甲状腺激素稳态和后代大脑发育 | 怀孕大鼠及其后代 | NA | NA | 多组学分析，包括蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物和空间转录组数据 | 怀孕大鼠及其后代，具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-19 |
Revealing the Heterogeneity of Renal Tubular Epithelial Cell Senescence and Its Impact on Renal Fibrosis via Single-Cell Sequencing and Spatial Omics Technologies
2026-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504960R
PMID:41996177
|
综述 | 本文系统综述了单细胞测序和空间组学技术在揭示肾小管上皮细胞衰老异质性及其对肾纤维化影响中的应用 | 利用单细胞测序和空间组学技术，首次系统分析了肾小管上皮细胞衰老的异质性特征、空间分布模式及其与纤维化的因果关系，突破了传统研究将其视为同质实体的局限 | NA | 揭示肾小管上皮细胞衰老的异质性及其对肾纤维化的影响机制 | 肾小管上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序, 空间组学 | NA | 单细胞测序数据, 空间组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-19 |
Deciphering MFAP5+ Fibroblasts in Pancreatic Cancer Progression via Multi-Regional Single-Cell RNA Sequencing With Experimental Validation
2026-Apr-17, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70114
PMID:41995689
|
研究论文 | 本研究通过多区域单细胞RNA测序结合实验验证，揭示了胰腺导管腺癌中MFAP5+成纤维细胞通过促进血管生成驱动肿瘤进展的机制 | 首次系统阐明了MFAP5+成纤维细胞在PDAC肿瘤微环境中的空间分布、功能特性及其与内皮细胞的互作网络，发现了MFAP5+成纤维细胞-内皮细胞轴这一潜在治疗靶点 | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能机制验证仍需更深入的体内外实验；样本量相对有限，需更大队列验证结论的普适性 | 探究胰腺导管腺癌中MFAP5+成纤维细胞的功能、空间分布及其与肿瘤微环境的互作机制 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的MFAP5+成纤维细胞及相关内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 59,829个细胞（整合多区域采样数据与公共数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-19 |
Spatial Mapping of the Precancer-to-Cancer Transition in Breast and Prostate
2026-Apr-17, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0012
PMID:41997105
|
研究论文 | 本研究通过空间映射技术揭示了乳腺癌和前列腺癌从癌前病变向侵袭性癌症过渡的基因表达特征和结构变化 | 开发了一种整合体积重建与空间转录组学的多模态连续切片工作流程，首次在完整肿瘤中识别出癌前与侵袭区域之间的过渡连接 | 研究样本量相对有限（51个病例），且主要关注特定癌症类型，可能无法完全代表所有癌症亚型 | 探索乳腺癌和前列腺癌从癌前状态向侵袭性癌症转变的分子和空间特征 | 乳腺癌和前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 光片显微镜,空间转录组学 | NA | 图像,空间转录组数据 | 51个病例的319个空间分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-19 |
Spatial transcriptomic atlas of murine neurotoxocariasis reveals region-specific host responses and dysfunction in the brain
2026-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72114-3
PMID:41997914
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学和行为学分析，在小鼠模型中揭示了犬弓蛔虫幼虫在大脑中引起的区域特异性神经损伤、血管重塑和免疫反应，并探讨了其与运动学习和记忆障碍的关联 | 首次综合运用空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学和行为学方法，系统描绘了神经弓蛔虫病的宿主-寄生虫界面，揭示了寄生虫的免疫调节和发育调控转录程序 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；未详细探讨寄生虫长期感染的影响 | 阐明神经弓蛔虫病的病理机制，并验证小鼠模型作为研究蠕虫诱导神经系统疾病的平台 | 感染犬弓蛔虫的小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 神经感染性疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 脂质组学, 行为学分析 | NA | 转录组数据, 脂质组数据, 行为数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-19 |
Dedifferentiation-driven oncogenic stemness promotes tumor-sustaining adaptability in the intestinal epithelium
2026-Apr-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08669-2
PMID:41997917
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型揭示了去分化驱动的致癌干细胞在肠道肿瘤发生中的关键作用，并阐明了其与Notch信号异常和代谢可塑性协同促进肿瘤的机制 | 首次证明去分化来源的致癌干细胞比内源性突变干细胞具有更强的肿瘤维持能力，并系统揭示了去分化过程中Notch信号异常和代谢可塑性的协同作用机制 | 研究基于特定基因组合（Smad4缺失和β-catenin激活）的小鼠模型，其在人类散发性结肠腺瘤中的普适性仍需进一步验证 | 探究肠道上皮细胞去分化驱动的肿瘤发生机制及其生物学决定因素 | Smad4:β-catenin双基因修饰小鼠的肠道上皮细胞和肿瘤组织 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-19 |
Antiviral CD4+ T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2026-Apr-17, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01586-7
PMID:41998201
|
研究论文 | 本研究探讨了老年人对流感疫苗的CD4+ T细胞和髓系细胞反应减弱的现象 | 结合体外和离体免疫测定与单细胞转录组学，揭示了老年人T辅助细胞和髓系细胞亚群中干扰素转录特征的减弱 | 研究主要关注细胞免疫反应，未全面评估疫苗对临床结局的实际影响 | 研究老年人对流感疫苗的细胞免疫反应特征 | 老年人和年轻成年人的免疫细胞 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-04-19 |
Integrative single-cell analysis reveals endothelial diversity in the vasa vasorum of human atherosclerosis
2026-Apr-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10095-1
PMID:41998210
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据，揭示了人类动脉粥样硬化斑块内血管内皮细胞的异质性，并识别出与疾病进展相关的关键内皮亚群 | 首次整合多个单细胞RNA测序研究，构建了人类动脉粥样硬化的内皮细胞转录组图谱，系统揭示了内皮细胞亚群的异质性及其在疾病中的功能分化 | 研究基于已发表的五个单细胞测序数据集进行整合分析，可能存在批次效应；样本来源和数量可能限制某些罕见亚群的发现 | 解析动脉粥样硬化斑块内血管内皮细胞的异质性及其在疾病进展中的功能角色 | 人类动脉粥样硬化斑块中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析模型 | 单细胞转录组数据 | 17,367个血管内皮细胞，来自五个单细胞RNA测序研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-19 |
Roles of mitophagy and immune infiltration in Parkinson's disease: new perspectives from bioinformatics analysis and A53T transgenic mice
2026-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02243-4
PMID:41998308
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和A53T转基因小鼠模型，探讨了线粒体自噬和免疫浸润在帕金森病中的作用 | 结合生物信息学分析和单细胞RNA测序数据，识别并验证了五个关键线粒体自噬相关基因在帕金森病中枢神经系统和外周免疫细胞中的差异表达 | 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型，人类样本验证有限，机制细节仍需进一步实验探索 | 阐明线粒体自噬在帕金森病发病机制和进展中的精确作用 | 帕金森病患者样本、α-突触核蛋白A53T转基因小鼠模型、中枢神经系统细胞（如星形胶质细胞、多巴胺神经元）和外周免疫细胞（如CD4+ T细胞、CD8+ T细胞） | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、转基因小鼠模型 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE178265和PRJNA1145007）及A53T转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-04-19 |
Feature-preserving manifold approximation and projection to analyze single-cell data
2026-Apr-17, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00970-6
PMID:41998372
|
研究论文 | 本文介绍了FeatureMAP框架，一种通过成对切空间嵌入增强流形学习的方法，用于可视化单细胞数据并保留基因级信息 | 提出FeatureMAP框架，整合UMAP与主成分分析，保留聚类结构和特征变异，引入基因贡献、基因变异轨迹及核心与过渡状态等新分析概念 | NA | 改进单细胞数据的可视化分析，以更好地理解细胞异质性和动态变化 | 单细胞RNA测序数据，包括胰腺发育和T细胞耗竭的合成与真实数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, PCA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-19 |
A Method for Imputing scRNA-seq Data Based on Mobile Graph Convolutional Generative Adversarial Networks
2026-Apr-17, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11380-8
PMID:41998476
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-04-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Distinct Epithelial Subpopulation Driving Resistance to Neoadjuvant Chemoimmunotherapy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2026-Apr-17, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00337-1
PMID:41998494
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-04-19 |
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-Apr-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08091-4
PMID:41998635
|
研究论文 | 本研究阐明了天然化合物18-β-甘草次酸通过靶向DOT1L-HMGB1-cGAS轴，减轻氧化应激和炎症，从而缓解肌腱病的分子机制 | 首次揭示了GA通过诱导HMGB1的K43甲基化，破坏HMGB1-cGAS相互作用，进而通过Mul1促进cGAS降解，从而抑制NLRP3炎症小体激活的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，临床转化效果仍需进一步验证 | 阐明18-β-甘草次酸缓解肌腱病的分子机制，重点关注其在氧化应激背景下对HMGB1-cGAS-STING轴和NLRP3炎症小体激活的调控作用 | 临床肌腱病样本、大鼠肌腱病模型、过氧化氢诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 | 数字病理学 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、药理学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及临床样本、动物组织和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-04-19 |
Biomimetic KeMA hydrogel encapsulating CAP-EVs-MEF2C for inhibiting inflammation and senescence in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04416-z
PMID:41998644
|
研究论文 | 本研究开发了一种封装CAP修饰的MEF2C过表达巨噬细胞来源的细胞外囊泡的KeMA水凝胶，用于调节MEF2C/P21/CDK2轴，减轻软骨终板软骨细胞的炎症和髓核细胞的衰老，以延缓椎间盘退变进展 | 利用单细胞RNA测序识别MEF2C作为关键调控因子，并开发了具有靶向递送和缓释特性的仿生水凝胶系统 | NA | 开发一种新型治疗系统以减缓椎间盘退变 | 软骨终板软骨细胞和髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-19 |
Single-cell transcriptomics identify mechanical-memory-associated cell states in metastatic HR+ breast cancer
2026-Apr-17, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02280-1
PMID:41998694
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-04-19 |
Dissecting Pirtobrutinib Resistance in Mantle Cell Lymphoma Through Single-Cell Multi-Omics
2026-Apr-17, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70304
PMID:41998849
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术剖析了套细胞淋巴瘤患者对非共价BTK抑制剂Pirtobrutinib产生耐药性的分子机制 | 首次在纵向患者样本中整合单细胞RNA测序、ATAC测序和DNA测序，揭示了Pirtobrutinib耐药性的遗传与非遗传双重途径，并发现染色质调节因子RAD21和SMC3作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，且为观察性研究，需进一步功能验证和更大规模队列验证 | 阐明套细胞淋巴瘤对Pirtobrutinib产生耐药性的分子机制 | 复发/难治性套细胞淋巴瘤患者的纵向样本 | 单细胞多组学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞DNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 纵向收集的套细胞淋巴瘤患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | NA |