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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets
IF:2.5Q2
DOI:10.1080/09537104.2026.2651849
PMID:41918402
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研究论文 | 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学,系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 | 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析,系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因,并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 | 研究主要基于计算生物学和体外数据验证,缺乏体内实验的直接功能验证;样本量可能有限,且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 | 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制,并探索其治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物(罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕)的靶点 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 | hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据(具体样本数未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-04-02 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本的单细胞转录组数据,构建了一个基于癌症干细胞样细胞特征的12基因签名,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次在患者样本中识别出具有癌症干细胞样特征的罕见细胞群,并基于此构建了CARS评分系统,揭示了其与索拉非尼耐药性和免疫检查点抑制剂敏感性的关联 | 研究基于单细胞转录组数据,样本量有限,需要更大规模的临床验证来确认CARS的预测价值 | 开发一个基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因签名,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌患者样本中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 基因签名评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法,整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究,系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据,结合孟德尔随机化框架,识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断,需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-04-02 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了多囊肾病囊肿微环境中受损细胞、特征基因及细胞通讯模式 | 首次应用10x Genomics Visium空间基因表达技术于多囊肾病研究,结合单细胞测序数据进行点解卷积,增强了空间分辨率并识别了囊肿相关的基因特征和细胞通讯 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类多囊肾病,且空间转录组学技术本身存在分辨率限制 | 探究多囊肾病囊肿微环境的细胞组成、基因表达变化及细胞间通讯模式 | 野生型和Pkd1缺陷型小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及野生型和Pkd1缺陷型小鼠肾脏 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Genomics Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 5 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术,识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇,并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光,苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析,细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据,图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学,总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 6 | 2026-04-02 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Apr, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和顺序免疫荧光技术,揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域,揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏中的情况可能有所不同;技术方法可能无法完全捕捉细胞间相互作用的复杂性 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 顺序免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-Apr, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了二维单层和三维球体两种人源肝脏微组织模型对乙酰氨基酚暴露的细胞反应差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了2D与3D肝脏微组织对药物暴露的转录组反应,揭示了氧气可用性与药物代谢之间的动态相互作用 | 仅使用单一药物(乙酰氨基酚)进行验证,暴露时间固定为24小时,未涵盖其他肝毒性药物或更长时间点的反应 | 评估和比较不同体外肝脏模型(2D单层与3D球体)在预测药物性肝损伤方面的生理相关性和机制差异 | 由原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的二维单层和三维球体肝脏微组织 | 单细胞转录组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异,特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异,并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小(4名男性和5名女性患者),且仅关注了前交叉韧带,未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像 | 9名患者(4名男性,5名女性)的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-04-02 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 本研究探讨了代谢减重手术对肥胖青少年2型糖尿病患者早期肾损伤的缓解作用及其分子机制 | 首次在青少年2型糖尿病肥胖患者中,通过配对肾活检样本,结合单细胞RNA测序、代谢组学和蛋白质组学,系统揭示了垂直袖状胃切除术后肾脏的结构和分子适应性变化,并发现了mTORC1/JAK/STAT信号通路的下调 | 样本量较小(n=5),且为观察性研究,无法完全排除混杂因素的影响 | 探究代谢减重手术如何缓解肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 患有2型糖尿病和严重肥胖的青少年 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,代谢组学,蛋白质组学,组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,组织学图像,临床数据 | 5名青少年(IMPROVE-T2D队列)的配对肾活检样本;64名青少年(Teen-LABS队列)的循环蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-02 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了在闭合性头部损伤模型中,炎症小体适配蛋白ASC如何促进持续的神经炎症和轻度认知障碍 | 首次在单细胞水平揭示ASC在闭合性头部损伤后微胶质细胞中的选择性表达,并证明其在维持神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠模型中的皮质组织,特别是微胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-02 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Hmx2和Dmrt2在肾脏闰细胞亚型分化中的关键作用及其相互调控关系 | 首次明确了Hmx2和Dmrt2作为相互排斥的转录因子,分别调控B型和A型闰细胞的分化命运,并发现Dmrt2缺失时Hmx3表达激活的新补偿机制 | 未在Foxp1缺陷小鼠中通过Dmrt2敲入挽救闰细胞分化缺陷,表明可能存在其他调控通路 | 探究肾脏闰细胞亚型分化的转录调控机制 | 小鼠肾脏闰细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 条件性基因敲除、基因敲入、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、尿液酸化数据 | 小鼠模型及人类肾脏单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-02 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-Apr, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 本研究探讨了母体肥胖如何通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了母体肥胖通过增强AP-1转录因子对炎症基因启动子的可及性,直接抑制神经发生关键因子的机制 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;体外实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明母体肥胖影响胚胎神经发育的分子机制 | 母体肥胖小鼠模型中的胚胎(E11.5和E13.5)及神经源性细胞 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, Gene Ontology分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 小鼠胚胎(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-02 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
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研究论文 | 本文开发了一种名为人工土壤(ArtSoil)的合成植物生长培养基,旨在模拟自然土壤条件,以更准确地研究植物生长 | 通过结合土壤提取物(ASE)来维持土壤微生物群和土壤因子,同时无需糖补充,为实验室植物生长提供了更接近自然的替代方案 | NA | 开发一种合成生长培养基,以在实验室条件下更准确地模拟土壤环境,用于植物生理学和组学研究 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-04-02 |
Single Cell Analysis Reveals Dynamic Changes of Distinct Cell Populations in Human Nickel Allergy
2026-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70108
PMID:41090989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析,揭示了人类镍过敏中不同细胞群体的动态变化 | 首次在单细胞水平上识别了镍特异性激活的内皮细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和CCR7+树突状细胞,并明确了皮肤驻留T细胞在早期过敏反应中的非参与性 | 样本量有限,仅分析了镍过敏患者,且时间点仅限于8小时和72小时 | 探究人类镍过敏中不同细胞类型在致敏和激发阶段的作用机制 | 镍过敏患者的皮肤样本 | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 镍过敏患者的皮肤样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-02 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和单细胞RNA-seq数据分析,揭示了Chlamydia muridarum如何通过劫持杯状细胞并激活IDO1/kyneurine轴,驱动克罗恩病在特定肠道区域(如近端结肠)的炎症反应 | 首次鉴定出Chlamydia muridarum作为区域限制性炎症的必要且充分驱动因子,并阐明了其通过杯状细胞IDO1/kyneurine轴促进结肠特异性炎症的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA-seq数据集分析,需要进一步实验验证其在人体中的直接适用性 | 探究克罗恩病区域特异性炎症的调控因素 | 小鼠模型中的肠道炎症及人类克罗恩病患者的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq | TNF驱动的小鼠模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-04-02 |
In vivo CRISPR screens identify CBX4 as an epigenetic regulator for cancer immunotherapy
2026-Mar-31, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200564
PMID:41915438
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现CBX4是癌症免疫治疗的关键表观遗传调控因子 | 首次通过体内CRISPR筛选鉴定出CBX4作为表观遗传免疫检查点,揭示了其通过沉默逆转录转座子调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肝癌患者数据,在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探索表观遗传调控因子在肿瘤免疫治疗耐药中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型、接受新辅助抗PD-1治疗的肝癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 体内CRISPR-Cas9筛选、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CRISPR筛选模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-02 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析,揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 | 首次在CTEPH中整合多组学数据(单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化)进行互补分析,并识别出具有遗传支持的新型候选基因(如ETS1和FGR)及其诊断潜力 | 样本量相对有限,且为观察性研究,需进一步功能验证和更大队列验证 | 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 | 未明确具体样本数,涉及CTEPH患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
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研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架,用于空间转录组学数据插补,并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略,利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域;2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示;3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN),在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战,实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据,自然图像 | 多种组织类型(包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-02 |
Biomimetic Bamboo-Inspired Bone Repair Scaffold: Reversing Degraded States and Promoting Mesenchymal Stem Cell Differentiation
2026-Mar-31, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00387
PMID:41915781
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研究论文 | 本研究报道了一种受竹子和骨小梁结构启发的多功能骨修复支架,旨在通过上调关键基因逆转骨质疏松中骨髓间充质干细胞的衰老表型,从而促进骨再生 | 设计了一种结合聚乳酸纳米取向纤维和I型胶原的仿生支架,其独特的纺锤形互连孔隙结构模拟了骨小梁的管腔陷窝,并通过上调Slc25a33和Crabp1基因来逆转细胞衰老 | 研究主要在老年骨质疏松大鼠模型中进行,尚未在更广泛的骨质疏松模型或临床患者中验证其长期安全性和有效性 | 开发一种能够逆转骨髓间充质干细胞衰老、促进骨质疏松性骨缺损修复的新型骨支架材料 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)、老年骨质疏松大鼠 | 组织工程与再生医学 | 骨质疏松症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、组织学数据、力学性能数据 | 15月龄老年骨质疏松大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |