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当前共找到 45745 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-13 |
Plcg2 Deficiency Leads to Sex-Associated Divergent Effects on Glial Transcriptomes
2027-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70252
PMID:43001663
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析野生型、杂合子和纯合子Plcg2缺陷小鼠大脑，揭示了Plcg2缺失对胶质细胞转录组的性别相关差异影响。 | 首次在无淀粉样蛋白或tau病理的情况下，系统构建了不同Plcg2基因型和性别组合的胶质细胞转录组图谱，并发现基因型与性别交互作用对神经退行性疾病相关通路存在差异性调控。 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅关注胶质细胞转录组，未涉及蛋白质水平或功能验证；未明确Plcg2缺失的具体分子机制。 | 探究Plcg2缺失在无病理背景下对小鼠大脑胶质细胞转录组的生理影响及其性别相关差异。 | 野生型、杂合子和纯合子Plcg2缺陷小鼠的大脑胶质细胞。 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-11-13 |
Network pharmacology and single-cell sequencing analysis of gastrodin in anticancer effects against colorectal cancer by regulating key target genes and the tumor immune microenvironment
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103076
PMID:42879954
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研究论文 | 该研究通过网络药理学和单细胞测序分析天麻素抗结直肠癌的作用机制，识别关键靶基因并探讨肿瘤免疫微环境的调控 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、多种机器学习算法和分子对接系统揭示天麻素抗结直肠癌的分子机制，并发现NFE2L3为核心靶点 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探索天麻素抗结直肠癌的作用机制，识别关键靶基因及其对肿瘤免疫微环境的调控 | 结直肠癌组织和细胞系、天麻素潜在靶点 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、网络药理学、分子对接 | LASSO回归、支持向量机、随机森林 | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-11-13 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomics identifies a HERC5-linked immune-attenuated risk program for pulmonary metastasis/relapse in osteosarcoma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103070
PMID:42858644
|
研究论文 | 本研究整合批量与单细胞转录组学，构建了一个紧凑的转录组风险评分，并揭示了骨肉瘤肺转移/复发相关的免疫衰减和HERC5关联程序 | 开发了基于9个基因的骨肉瘤肺转移/复发风险评分，首次将HERC5与抗原呈递程序关联，并结合单细胞投影和虚拟基因敲除分析揭示免疫衰减机制 | 需要在未来进行验证，外部验证集AUC较低（0.728），且仅依赖于转录组数据 | 开发紧凑的转录组肺转移/复发风险评分，并表征相关的免疫和单细胞程序 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学, 机器学习 | 骨肉瘤, 肺癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, LASSO回归, WGCNA, 单细胞投影, 虚拟基因敲除 | LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TARGET-OS队列和GSE21257验证集（具体样本数未在摘要中明确） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-11-13 |
A renal cyst-clear cell renal cell carcinoma comorbidity analysis identifies a FOXM1-positive epithelial COL6A1-CD44 axis that remodels fibroblasts
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103064
PMID:42860124
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研究论文 | 本文通过肾囊肿与透明细胞肾细胞癌的共病分析，识别出一个由FOXM1阳性上皮细胞驱动的COL6A1-CD44轴，该轴可重塑成纤维细胞。 | 首次利用广泛的肾囊肿相关疾病基因框架识别与ccRCC共享的分子程序；结合孟德尔随机化、随机生存森林、单细胞与空间转录组学、虚拟基因敲除及分子对接等多层次方法；提出FOXM1+上皮-COL6A1-CD44-F5_SFRP2+成纤维细胞通讯模型；发现异牡荆素作为潜在FOXM1靶向化合物。 | 未建模特定囊性疾病或直接的囊肿到癌症进展过程；体外实验结果需进一步体内验证；通信模型仅为可测试的假设。 | 识别肾囊肿与透明细胞肾细胞癌共享的分子程序，并探究其细胞间通讯机制及潜在治疗靶点。 | 肾囊肿疾病与透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者样本及公共数据集（TCGA-KIRC等）。 | 数字病理学, 机器学习 | 肾癌, 肾囊肿 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机生存森林, Scissor, SCENIC, scTenifoldKnk, RCTD, CellChat | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-11-13 |
Hypoxia-induced SATB homeobox 2 increases hypoxia-inducible factor-1-dependent tumorigenesis and drives bevacizumab resistance in lung adenocarcinoma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103069
PMID:42896440
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研究论文 | 该文揭示缺氧诱导的SATB2作为表观遗传调控因子，与HIF-1α和p300形成正反馈回路，促进肺腺癌进展并驱动贝伐珠单抗耐药 | 首次鉴定SATB2为肺腺癌中缺氧诱导的表观遗传调控因子，揭示HIF-1α（而非HIF-2α）直接结合SATB2启动子促进其表达，并阐明SATB2-p300-HIF-1α轴通过促进H3K27乙酰化和RNA聚合酶II延伸来放大缺氧转录程序的新机制 | 研究主要基于细胞模型和小鼠肿瘤模型，缺乏大规模临床队列验证；SATB2-p300-HIF-1α轴的临床转化价值仍需进一步临床试验验证 | 探究缺氧信号与肿瘤微环境重塑之间的表观遗传协调机制，阐明SATB2在肺腺癌进展和抗血管生成治疗耐药中的作用 | 肺腺癌细胞模型、小鼠肿瘤模型及肺腺癌患者样本 | 数字病理, 表观遗传学, 肿瘤生物学 | 肺癌 | 空间转录组学, 基于参考的细胞类型去卷积, 染色质免疫共沉淀, 免疫组化 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-11-13 |
Single-cell spatial transcriptomics identifies SERPINE1 as a vascular endothelial mediator of cisplatin resistance in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103063
PMID:42868713
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和生物信息学分析，鉴定头颈部鳞状细胞癌中与顺铂耐药相关的血管内皮细胞状态，并确定SERPINE1为关键介导基因 | 首次从血管内皮细胞角度揭示顺铂耐药机制，发现SERPINE1作为内皮介导顺铂耐药的关键基因，并揭示其与HPV状态相关的血管微环境差异 | 摘要未明确说明，可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验、单细胞和空间转录组数据的具体样本数未披露 | 阐明血管微环境及其在不同HPV状态下的变异对头颈部鳞状细胞癌顺铂耐药的贡献 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤样本中的细胞，尤其是肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-11-13 |
Machine learning and multi-omics analyses reveal CLDN1 as a candidate marker associated with colorectal cancer invasion and nutlin-3a (-) response
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103078
PMID:42868715
|
研究论文 | 整合转录组学、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学和体外实验，揭示CLDN1作为与结直肠癌侵袭及Nutlin-3a(-)反应相关的候选标志物 | 首次整合多种机器学习算法、单细胞RNA测序和空间转录组学系统筛选并验证CLDN1作为结直肠癌侵袭和Nutlin-3a(-)反应相关的候选标志物 | 需要进一步独立和前瞻性验证以确定其临床诊断、预后和治疗反应相关性 | 整合多组学和机器学习方法筛选结直肠癌相关候选标志物并表征其生物学和临床相关性 | 结直肠癌患者样本及结直肠癌细胞系 | 多组学分析、机器学习、数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组化 | 多种机器学习算法（特征选择）、CNN? | 基因表达数据、图像、文本 | GSE44861、GSE44076、TCGA-COAD队列、GSE231559单细胞数据及空间转录组数据，具体样本数未在摘要中说明 | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Illumina测序平台, 10x Genomics单细胞和空间平台 | NA |
| 8 | 2026-11-13 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a DLL4-associated tip-like endothelial niche linked to neoadjuvant chemotherapy non-response in muscle-invasive bladder cancer
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103067
PMID:42874537
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组数据、计算分析和体外实验，揭示了与肌层浸润性膀胱癌新辅助化疗无反应相关的DLL4相关尖端样内皮生态位 | 首次识别出与化疗无反应相关的TipEC_2尖端样内皮亚群，并发现DLL4是该内皮状态的关键特征；提出DLL4-NOTCH3信号通路作为血管重塑与治疗耐药之间的潜在分子联系 | 研究主要基于转录组数据和体外实验，缺乏更大规模的临床验证队列和体内功能实验验证；DLL4-NOTCH3信号通路的具体机制仍需进一步深入研究 | 表征与膀胱癌化疗反应相关的内皮细胞程序和细胞间通讯，探索化疗耐药的血管机制 | 肌层浸润性膀胱癌患者的内皮细胞、恶性细胞及化疗耐药膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-11-13 |
Single-cell and bulk transcriptomic analysis of inflammation-metabolism programs and the tumor microenvironment of colorectal cancer liver metastasis
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103077
PMID:42906454
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk转录组数据分析结直肠癌肝转移中的炎症-代谢程序及肿瘤微环境特征 | 整合单细胞与bulk转录组数据，在患者层面配对比较原发结直肠癌与匹配肝转移的细胞组成和转录程序，并分析配体-受体共表达及扩散图拟时序 | 患者数量有限、横断面采样、跨平台一致性弱，且缺乏实验验证，配体-受体和轨迹结果仅具有假设生成意义 | 解析结直肠癌原发灶与匹配肝转移之间免疫、基质和代谢程序的差异及肿瘤微环境特征 | 结直肠癌患者的原发肿瘤、匹配肝转移组织及外周血单个核细胞样本 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌, 肝转移 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞数据来自6例患者的15个样本（6个原发癌、6个匹配肝转移、3个PBMC）；bulk数据来自18例患者的54个样本（正常结肠、原发癌和肝转移） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-11-13 |
Integrative single-cell and computational pathology analyses reveal a C11orf24-associated stem-like epithelial population linked to tumor microenvironment remodeling and immune evasion in bladder cancer
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103082
PMID:42906452
|
研究论文 | 该文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和计算病理学，揭示了膀胱癌中与C11orf24相关的干性上皮细胞群体，并构建了预后模型 | 首次在膀胱癌中鉴定出位于分化层级顶端的HStem干性上皮细胞群体，并发现C11orf24作为潜在干性调控因子；整合单细胞、空间转录组与深度学习病理图像构建预后模型 | 药物基因组学分析仅为预测性结果，需实验验证；功能实验主要针对C11orf24，其他机制未充分验证 | 表征膀胱癌中与干性相关的上皮细胞群体及其临床意义 | 膀胱癌（BLCA）患者样本中的上皮细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学, 计算病理学 | 深度学习 | 图像, 文本 | 13例未经治疗的膀胱癌样本共92,218个细胞，以及独立批量队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-11-13 |
Single-cell transcriptomic and immune microenvironment analyses reveal a TIMP1-associated OLFM4⁺ tumor epithelial program linked to colorectal cancer progression and immune evasion
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103066
PMID:42887063
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了一种与结直肠癌进展和免疫逃逸相关的TIMP1相关OLFM4⁺肿瘤上皮细胞程序，并构建了预后风险评分模型。 | 识别了正常-腺瘤-癌序列中与进展相关的C3 OLFM4⁺肿瘤上皮亚型，揭示了其干性、代谢活跃、与成纤维细胞WNT2B-FZD/LRP信号交互及免疫逃逸特征，构建了OLFM4⁺肿瘤细胞风险评分（OTRS），并验证了TIMP1对结直肠癌细胞恶性行为的作用。 | TIMP1功能仅在体外实验中进行评估，缺乏体内模型验证；OTRS模型的临床适用性仍需更大规模独立队列验证。 | 定义与结直肠癌进展相关的上皮状态，阐明OLFM4⁺肿瘤上皮亚型的分子特征、微环境交互及预后价值。 | 正常结直肠黏膜、腺瘤和肿瘤组织中的细胞，以及结直肠癌细胞系。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 单细胞转录组数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-11-13 |
Integrative multi-omics analysis identifies SLCO1B3 as a prognostic marker and functional oncogenic driver in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103088
PMID:42933147
|
研究论文 | 该研究通过整合多组学数据，鉴定SLCO1B3为头颈部鳞状细胞癌的预后标志物及功能性致癌驱动因子 | 首次整合bulk转录组、单细胞RNA测序、hdWGCNA和空间转录组学等多组学方法，系统揭示SLCO1B3在HNSCC中维持干性和恶性表型的功能作用 | 体外功能实验仅使用SCC9细胞系，缺乏体内动物模型验证；SLCO1B3作为治疗靶点的临床转化潜力尚需进一步研究 | 探究脂质代谢相关转运蛋白SLCO1B3在头颈部鳞状细胞癌中的临床相关性和生物学功能 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本及SCC9细胞系 | 数字病理学、机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | bulk转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、hdWGCNA、体外功能缺失实验 | hdWGCNA、CytoTRACE、拟时序轨迹分析 | 转录组数据、图像、文本 | TCGA及多个独立队列的bulk转录组数据、单细胞RNA测序数据及空间转录组数据，以及SCC9细胞系体外实验 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-11-13 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing with ML algorithms identified MYBL2 as a candidate transcriptomic biomarker for diagnosing laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC)
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103095
PMID:42966320
|
研究论文 | 该研究整合单细胞和bulk RNA测序数据及机器学习算法，鉴定出MYBL2作为喉鳞状细胞癌诊断的候选转录组生物标志物 | 结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和机器学习算法进行多队列整合分析，发现MYBL2作为LSCC的稳健诊断生物标志物，并揭示其与增殖程序和肿瘤微环境连接模式的关联 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 鉴定跨队列稳健一致的喉鳞状细胞癌生物标志物，并阐明其生物学作用 | 喉鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-11-13 |
MANF promotes cell fitness and attenuates bortezomib sensitivity in multiple myeloma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103094
PMID:42966321
|
研究论文 | 该文通过分析公共CRISPR依赖性数据和MMRF CoMMpass队列，并结合单细胞RNA测序及体外功能实验，揭示MANF在多发性骨髓瘤中支持细胞适应性并调节硼替佐米敏感性 | 首次将MANF鉴定为多发性骨髓瘤优先依赖的候选基因，并系统阐明其在细胞增殖、细胞周期、IRE1α-XBP1s通路动态及硼替佐米敏感性中的作用 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞系模型，缺乏体内动物实验和原代患者样本的功能验证，MANF依赖性机制尚未完全阐明 | 识别支持骨髓瘤细胞适应性的分子依赖，并探索复发难治性多发性骨髓瘤的潜在治疗脆弱性 | 多发性骨髓瘤细胞系RPMI-8226和OPM-2，以及MMRF CoMMpass队列中的多发性骨髓瘤患者数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | CRISPR依赖性分析、单细胞RNA测序、转录组测序、siRNA敲低、基因 rescue | NA | 文本、基因表达数据、图像 | MMRF CoMMpass队列患者样本及RPMI-8226和OPM-2两种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-11-13 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals inflammatory metabolic programs in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103087
PMID:42971052
|
研究论文 | 该研究整合批量与单细胞转录组数据，揭示胰腺导管腺癌中炎症相关的代谢转录程序 | 整合批量与单细胞转录组数据，系统评估犬尿氨酸、花生四烯酸、炎症小体和谷氨酰胺相关代谢模块在PDAC中的表达，并发现髓系细胞中活性最高 | 仅提供转录组学框架，缺乏代谢通量或临床效用的直接证据，需未来机制和多组学验证 | 表征胰腺导管腺癌中炎症相关的代谢程序 | 胰腺导管腺癌的原发和转移肿瘤组织及细胞 | 转录组学 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | NA | 转录组数据、基因表达数据 | 三个公共数据集：TCGA-PAAD批量RNA-seq、GSE62452组织微阵列（33,297个探针，60对匹配样本）、GSE154778单细胞RNA-seq（14,926个单细胞） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-11-13 |
Molecular mechanism of microplastic intake promoting gastric epithelial cell carcinogenesis
2026-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103101
PMID:42981821
|
研究论文 | 该研究探讨了微塑料摄入对胃上皮细胞癌变的影响及其分子机制 | 首次在胃癌和正常胃组织中鉴定出11种微塑料，并结合多组学分析揭示SDHA作为代谢调节因子的作用 | 需要进一步的功能研究来确定这些变化是否促进胃肿瘤进展 | 探索微塑料对胃上皮细胞癌变的影响和机制 | 胃组织样本（4例健康对照和4例胃癌患者）、GES-1细胞、裸鼠 | 数字病理学 | 胃癌 | 拉曼光谱、Py-GC/MS、蛋白质组学、代谢组学、单细胞测序、分子生物学技术 | NA | 图像、文本 | 8例胃组织样本（4例健康对照和4例胃癌患者）、GES-1细胞、裸鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-11-13 |
scMINA: an interpretable workflow for paired scRNA-scATAC multiome integration and regulatory prioritization
2026-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag140
PMID:43011234
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研究论文 | 该文提出scMINA可解释工作流用于配对scRNA-seq和scATAC-seq多组学数据的整合与调控特征优先级分析 | 将多模态整合、技术协变量校正与基于可解释人工智能的归因策略相结合，实现细胞状态相关基因和转录因子的可解释优先级排序 | 仅在阿尔茨海默病脑细胞图谱数据上验证，未在更多疾病或数据集中评估，监管推断的可解释性仍有限 | 解决配对单细胞多组学数据分析中的模态特异技术变异、整合复杂性和下游调控推断可解释性不足的问题 | 配对scRNA-seq和scATAC-seq单细胞多组学数据，以及阿尔茨海默病脑细胞图谱中的胶质细胞群体 | 单细胞多组学分析 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, scATAC-seq | 可解释人工智能归因模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, single-cell multi-omics | NA | NA |
| 18 | 2026-11-13 |
Integrated Short-and Long-Read Single-Cell Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Isoform Diversity During Ovarian Development in Baoshan Pigs
2026-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202604384R
PMID:43018425
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研究论文 | 该研究整合Illumina短读长和Oxford Nanopore长读长单细胞RNA测序技术，对保山猪1、3、5、8月龄卵巢组织进行测序分析，揭示了卵巢发育过程中的细胞异质性和转录本异构体多样性 | 首次整合短读长和长读长单细胞测序技术对保山猪卵巢发育进行全转录组分析，鉴定了大量非冗余异构体和可变剪接事件，揭示了卵巢发育过程中细胞组成和信号传导的动态变化 | 研究仅涉及保山猪单一品种，样本时间点有限（4个发育阶段），未进行功能验证实验，长读长单细胞测序的细胞通量相对较低 | 构建保山猪卵巢发育的综合转录组图谱，解析卵巢发育过程中的细胞动态、细胞间通讯和转录本异构体多样性 | 保山猪卵巢组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，短读长测序，长读长测序 | NA | 单细胞转录组数据，图像 | 24,646个高质量单细胞，来自保山猪1、3、5、8月龄共4个发育阶段的卵巢组织 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-11-13 |
Correlative insights into luteolin regulating the macrophage-p53-CCNB1/CDK1 axis associated with cell-cycle control in hepatocellular carcinoma
2026-Nov-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154768
PMID:42950621
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研究论文 | 本文结合生物信息学、转录组富集分析、免疫浸润评估和单细胞测序，研究木犀草素通过调控巨噬细胞极化并经p53-CCNB1/CDK1轴影响肝细胞癌细胞周期的作用机制 | 揭示木犀草素通过逆转M2型巨噬细胞极化、下调IL-10/TGF-β1、经ATM依赖的p53磷酸化恢复p53功能，进而抑制CCNB1/CDK1复合物活性并诱导G2/M期阻滞和细胞衰老的新机制 | 巨噬细胞极化状态与p53功能之间的因果方向、木犀草素的主要细胞靶点、巨噬细胞极化的蛋白水平表型验证、CCNB1/CDK1抑制的p53依赖性以及免疫逃逸的直接实验证据仍有待阐明 | 阐明木犀草素在肝细胞癌演进中的干预作用，并揭示巨噬细胞极化通过p53信号通路影响该过程的机制 | 肝细胞癌、肿瘤相关巨噬细胞、木犀草素 | 数字病理, 机器学习 | 肝癌 | 单细胞测序, 生物信息学分析, 转录组富集分析, 免疫浸润评估 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-11-13 |
LCK regulates apoptosis and intercellular communication networks in neuroblastoma
2026-Nov-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154777
PMID:42956699
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研究论文 | 本研究探讨了神经母细胞瘤中LCK在阿霉素治疗后的表达变化、与阿霉素的分子对接及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次结合单细胞转录组学、CellChat细胞通讯分析和分子对接，揭示LCK在神经母细胞瘤凋亡调控和细胞间通讯网络中的潜在作用 | 研究主要基于计算和转录数据分析，缺乏实验验证来确立LCK的功能作用 | 探究LCK在神经母细胞瘤中的表达变化、与阿霉素的相互作用及其在肿瘤免疫微环境中的角色 | 神经母细胞瘤细胞及患者样本（对照、非转移性和转移性样本） | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学、分子对接 | CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |