单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 37913 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-30
Clonal differentiation of plasmablasts undergoing oral immunotherapy in patients with milk allergy
2026-Apr, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析,表征了接受口服免疫治疗的牛奶过敏患者中浆母细胞的克隆分化特征 首次在口服免疫治疗背景下,利用单细胞转录组学和B细胞免疫受体分析,揭示了浆母细胞的克隆扩增、IgD克隆识别过敏原以及克隆树中超过80%匹配CDR克隆的发现 研究仅涉及2名牛奶过敏患者,样本量较小,可能限制结果的普遍性 旨在表征接受口服免疫治疗的过敏患者中浆母细胞的谱系特征 牛奶过敏患者中接受口服免疫治疗的浆母细胞 免疫学 牛奶过敏 单细胞转录组学分析、B细胞免疫受体分析、重组抗体谱分析 NA 单细胞RNA-seq数据、免疫受体序列数据 2名牛奶过敏患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-30
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究探讨了纤维蛋白原消耗对胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤生长和转移的影响 首次在PDAC患者来源的异种移植模型中,使用临床测试中的反义寡核苷酸或脂质纳米颗粒递送siRNA技术平台来消耗纤维蛋白原,并结合蛋白质组学和空间转录组学分析其机制 纤维蛋白原消耗在脾内注射模型中未影响肝脏定植,表明其对转移晚期阶段可能无效 评估纤维蛋白原在PDAC肿瘤进展和转移中的作用,探索其作为治疗靶点的潜力 胰腺导管腺癌(PDAC)患者来源的异种移植模型 数字病理学 胰腺癌 反义寡核苷酸、脂质纳米颗粒递送siRNA、蛋白质组学、空间转录组学 NA 蛋白质组数据、空间转录组数据 3种PDAC患者来源的异种移植模型 NA 空间转录组学 NA NA
3 2026-03-30
The plastic stomatal development in grasses and its implications in crop improvement
2026-Apr, Journal of plant physiology IF:4.0Q1
综述 本文综述了禾本科植物气孔发育的物种特异性机制及其在作物改良中的应用潜力 系统总结了禾本科植物四细胞气孔复合体的独特发育机制、可塑性及其关键调控因子,并强调了整合单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学和人工智能等多组学方法在加速新型调控因子发现和基因型-表型关联研究中的应用 NA 阐明禾本科植物气孔发育的物种特异性机制,为通过遗传改良提高作物水分利用效率和抗旱性提供理论框架和可行靶点 禾本科植物(特别是谷物作物)的气孔发育 植物生物学与作物遗传改良 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学、全基因组关联研究、人工智能驱动的数据挖掘 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
4 2026-03-30
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了早期MF中基质和免疫细胞的独特基因表达模式 首次在单细胞水平上系统描述了早期MF与AD皮肤病变的转录组差异,包括角质形成细胞的干扰素反应增强、成纤维细胞的肿瘤相关程序、髓系细胞的免疫调节基因表达以及恶性T细胞的耗竭标志物表达 样本量相对较小,且研究仅关注早期阶段,未涵盖MF的进展阶段或其他皮肤淋巴瘤类型 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的分子标记 早期蕈样肉芽肿、特应性皮炎及健康对照的皮肤组织样本 数字病理学 皮肤淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及早期MF、AD和健康对照样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-03-30
A Tumor Microenvironment-Derived CAF-VEGF Model and Its Application in Biomarker Screening for HCC
2026-Apr, Cell biochemistry and function IF:2.8Q3
研究论文 本研究构建了一个基于肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞和血管内皮生长因子的预后评分模型,用于评估肝细胞癌患者的预后,并筛选出关键生物标志物 首次结合单细胞测序数据构建了CAF-VEGF预后评分模型,并发现ESCO2和WDHD1两个新基因通过调控血管生成促进肝细胞癌进展 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 开发肝细胞癌预后评估模型并筛选关键生物标志物 肝细胞癌组织及其邻近正常组织 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 COX回归模型,LASSO回归模型 单细胞测序数据 未明确具体样本数量(使用GEO数据库数据) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-03-30
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究阐明了心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬,从而减轻心肌缺血/再灌注损伤的分子机制 揭示了GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20的相互作用,减少BNIP3在K131位的泛素化,从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制 NA 阐明GPX4在心肌缺血/再灌注损伤中的作用及分子机制 心肌细胞、GPX4蛋白、BNIP3蛋白、USP20蛋白 NA 心血管疾病 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞测序 NA 空间转录组数据、空间蛋白质组数据、单细胞测序数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 NA NA
7 2026-03-30
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定以及孟德尔随机化和共定位分析,揭示了阿尔茨海默病和重度抑郁症中CD4+ T细胞活化的免疫介导机制及潜在药物靶点 首次在CD4+ T细胞活化动态过程中应用单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合的方法,识别出具有时间特异性因果模式的基因,并验证了90%以上基因在独立数据集中的可靠性 研究主要聚焦于CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型或组织特异性效应,且机制验证仍需进一步实验研究 探究神经精神疾病中免疫介导的致病机制并识别潜在药物靶点 阿尔茨海默病和重度抑郁症患者相关的CD4+ T细胞 单细胞组学 神经精神疾病 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化分析 孟德尔随机化模型 单细胞转录组数据, 基因组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-30
WGCNA and machine learning identify mitochondria programmed cell death-related genes as diagnostic biomarkers for septic shock
2026-Mar-28, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合GEO公共数据集,利用WGCNA和机器学习方法,鉴定出与脓毒性休克相关的线粒体程序性细胞死亡基因作为诊断生物标志物 首次系统性地整合WGCNA与机器学习(LASSO回归和Boruta算法)来识别脓毒性休克的诊断基因,并通过单细胞转录组分析、免疫浸润评分和调控网络构建,深入探讨了候选基因的免疫调控特性 研究主要基于公共数据集和临床血液样本,可能受到样本来源和数量的限制,且动物模型结果需进一步在人体中验证 探索线粒体程序性细胞死亡相关基因在脓毒性休克中的诊断价值及其在发病机制中的作用 脓毒性休克患者、临床血液样本以及CLP诱导的脓毒性休克小鼠模型 机器学习 脓毒性休克 WGCNA、LASSO回归、Boruta算法、单细胞转录组分析、ssGSEA、qRT-PCR、WB、IF LASSO回归、Boruta算法 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 GEO公共数据集、独立队列验证样本、临床血液样本、CLP诱导的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-03-30
Bulk and single-cell transcriptome analyses combined with molecular simulations identify ferritinophagy as a key target for resveratrol in osteoarthritis
2026-Mar-28, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合转录组数据、机器学习方法和分子模拟,揭示了白藜芦醇通过抑制NCOA4介导的铁蛋白自噬来缓解骨关节炎软骨细胞损伤的分子机制 首次结合批量与单细胞转录组分析及分子模拟,将铁蛋白自噬确定为白藜芦醇治疗骨关节炎的关键靶点,并验证了其通过调控NCOA4等核心蛋白发挥保护作用 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和规模有限 探究白藜芦醇是否通过调控铁蛋白自噬网络保护软骨,为骨关节炎治疗提供新靶点 人类关节软骨细胞(在IL-1β诱导的炎症模型中) 生物信息学与计算生物学 骨关节炎 转录组测序、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、透射电子显微镜、免疫荧光 机器学习方法(如加权基因共表达网络分析) 转录组数据(批量与单细胞)、蛋白质表达数据、细胞图像数据 未明确具体样本数量,涉及人类关节软骨细胞体外模型 NA 转录组测序 NA NA
10 2026-03-30
February in focus in HCB: spatial transcriptomics
2026-Mar-28, Histochemistry and cell biology IF:2.1Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11 2026-03-30
PTBP1 knockdown reprograms glioma stem cells into neuronal-like cells and suppresses tumorigenesis via the DUSP5-ERK1/2 signaling pathway
2026-Mar-28, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过深度学习形态分类、单细胞RNA-seq分析和实验验证,揭示了PTBP1通过DUSP5-ERK1/2信号通路调控胶质瘤干细胞增殖和分化的新机制,并开发了一种靶向PTBP1的纳米治疗策略 首次将胶质瘤细胞形态与患者生存时间关联,并发现PTBP1通过调控DUSP5表达和ERK1/2磷酸化动态影响胶质瘤干细胞命运,同时将白血病药物venetoclax重新用于胶质瘤治疗 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究胶质瘤干细胞增殖和分化的调控机制,并开发新的治疗策略 胶质瘤患者样本、小鼠模型、胶质瘤干细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 深度学习形态分类、组织透明化3D成像、转录组分析、单细胞RNA-seq、慢病毒敲低、基于结构的药物筛选 深度学习模型 图像、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 65例胶质瘤患者H&E染色标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-30
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析,识别出一种名为Th7R的IL-7R CCR6⁺ Th1样CD4⁺ T细胞群,该细胞群与Tpex CD8⁺ T细胞在肿瘤微环境中形成空间和数量上的伙伴关系,共同介导抗肿瘤免疫 首次发现并命名了Th7R CD4⁺ T细胞群,揭示了其与Tpex CD8⁺ T细胞的伙伴关系及其在抗肿瘤免疫中的关键作用,包括表达淋巴毒素-β和CXCL13,并与三级淋巴结构和高内皮小静脉相关 研究主要基于肺癌和部分肾细胞癌患者样本,可能不适用于所有癌症类型;且临床前小鼠模型的结果需进一步验证 探究CD4⁺ T细胞在肿瘤微环境中如何与Tpex CD8⁺ T细胞合作以介导抗肿瘤免疫 肺癌和肾细胞癌患者的肿瘤、淋巴结和外周血样本,以及临床前小鼠模型 免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、质谱流式分析 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据、质谱流式数据 主要来自肺癌患者,部分来自肾细胞癌患者,包括外周血、肿瘤和淋巴结样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
13 2026-03-30
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2026-Mar-27, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文探讨了Seurat和Scanpy软件包在单细胞RNA测序分析中的算法差异及其对结果的影响 揭示了Seurat和Scanpy在多个分析步骤中输出结果的显著差异,并量化了这些差异相当于减少5%读取或20%细胞分析带来的变异性 研究主要关注Seurat和Scanpy两个软件包,可能未涵盖其他单细胞分析工具 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本更新对结果可重复性的影响 单细胞RNA测序数据分析流程 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达矩阵 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-30
Geometric quantification of cell phenotype transition manifolds with information geometry
2026-Mar-27, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为SCIM的几何引导方法,利用信息几何学量化细胞表型转换(CPT)的低维流形 SCIM方法首次将单细胞基因表达谱嵌入为高斯分布,并自然定义Fisher度量,从而直接量化CPT流形的几何特性 方法依赖于RNA速度计算信息速度,可能受限于RNA速度估计的准确性 量化细胞表型转换过程中的低维流形几何结构 单细胞基因表达数据 机器学习 NA 单细胞测序 信息几何学方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-30
CEP170 as a novel molecular link between centrosomal function and cerebral cortical development
2026-Mar-26, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本文揭示了CEP170作为中心体功能与大脑皮层发育之间的新型分子联系,通过调控神经祖细胞增殖和神经元迁移影响皮层结构 首次将CEP170确定为连接中心体功能与大脑皮层发育的关键分子,并阐明了其通过中心体-微管相互作用调控神经发育的机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类大脑皮层发育中的CEP170功能验证尚不充分 探究CEP170在皮层发育中的作用及其与神经发育障碍的关联 小鼠胚胎皮层、人类发育中皮层、CEP170敲除细胞 神经发育生物学 神经发育障碍 Western blotting, qPCR, scRNA-seq, 空间转录组学, 子宫内电穿孔, CRISPR/Cas9, 流式细胞术, 微管再生实验, 免疫荧光显微镜, 共免疫沉淀 基因敲除模型, RNA干扰模型 蛋白质表达数据, 转录组数据, 图像数据 小鼠胚胎皮层样本、人类发育皮层样本、CEP170敲除细胞系 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
16 2026-03-30
Genome-wide identification and characterization of QTLs for transcriptional noise in human midbrain cells
2026-Mar-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过分析155名个体的诱导多能干细胞来源中脑细胞的单细胞RNA测序数据,在全基因组范围内识别并表征了转录噪声的数量性状位点,揭示了其与精神分裂症等人类性状的关联 首次在全基因组范围内系统识别转录噪声的数量性状位点,并发现其与精神分裂症关联信号的富集,以及疾病状态下特定神经元类型的转录噪声显著改变 研究主要基于诱导多能干细胞来源的细胞模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本量相对有限;功能验证有待进一步深入 探究遗传变异如何调控基因表达的细胞间变异(转录噪声),及其与人类性状(特别是精神分裂症)的关联机制 155名个体的诱导多能干细胞来源的中脑细胞,以及精神分裂症患者的大脑单细胞RNA测序数据 单细胞转录组学 精神分裂症 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 NA 单细胞RNA测序数据,基因型数据 155名个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-30
A circRNA Neoantigen Vaccine Elicits Potent Antitumor Immunity and Synergizes with Checkpoint Blockade in Melanoma
2026-Mar-26, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究开发了一种编码黑色素瘤新抗原的circRNA疫苗,并系统阐明了其在黑色素瘤中的治疗潜力与免疫机制 首次将具有稳定共价闭合结构的circRNA工程化为新抗原表达的新型载体,并系统揭示了该疫苗重塑肿瘤免疫微环境、增强T细胞抗肿瘤反应以及与检查点阻断疗法协同作用的机制 研究主要在临床前小鼠模型中进行,其向人类临床应用的转化效果仍需进一步验证 开发新型癌症免疫疗法,评估circRNA新抗原疫苗的抗肿瘤效力并阐明其作用机制 黑色素瘤小鼠模型、肿瘤细胞、免疫细胞(特别是T细胞和髓系细胞) 癌症免疫学、分子生物学 黑色素瘤 circRNA疫苗技术、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-03-30
Conserved ductular reaction mechanisms in biliary atresia and PSC derived from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-26, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了原发性硬化性胆管炎和胆道闭锁中导管反应的保守机制 利用单细胞和空间转录组学技术,首次系统比较了PSC和BA中导管反应的纤维炎症微环境,识别了跨疾病共享的保守机制 需要更多早期和晚期疾病样本,特别是非肝硬化PSC样本,以全面验证机制 探究原发性硬化性胆管炎和胆道闭锁中导管反应的保守纤维炎症机制 原发性硬化性胆管炎和胆道闭锁患者的肝脏组织样本 数字病理学 肝胆疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
19 2026-03-30
Mitochondria orchestrated immune microenvironment and response in health and disease-clinically relevant outlook and recommendations
2026-Mar-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
综述 本文系统综述了线粒体与免疫微环境之间的相互作用,包括线粒体在免疫细胞中的调控模式、细胞间线粒体通讯机制、疾病中的线粒体-免疫重塑病理机制、新型分析技术及靶向治疗策略 打破线粒体仅作为细胞能量工厂的传统认知,强调其通过代谢重编程、动力学重塑、自噬调控和细胞间通讯等多种方式精确调控免疫细胞功能,并指出线粒体-免疫重塑在多种疾病中存在三个保守检查点,为通用治疗靶点提供新视角 NA 深入理解线粒体的免疫调控功能,为开发新型免疫治疗策略提供理论支持和临床参考 线粒体与免疫微环境的相互作用,涵盖免疫细胞、细胞间通讯及多种疾病模型 NA 心血管疾病、自身免疫疾病、肿瘤、衰老 单细胞测序、多组学分析 NA NA NA NA NA NA NA
20 2026-03-30
Lipid Metabolism and Neurodegeneration: Mechanistic Insights and Therapeutic Targets
2026-Mar-26, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 本文综述了脂质代谢在维持大脑稳态中的作用及其与神经炎症和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病)进展的关联,并探讨了靶向脂质通路的治疗策略 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核转录组学等先进技术揭示了不同细胞类型中脂质代谢的特异性改变,并提出了脂质组学作为早期诊断和治疗监测的生物标志物来源 NA 探讨脂质代谢与神经退行性疾病之间的机制联系,并识别潜在的治疗靶点 大脑中的脂质代谢途径、神经炎症过程以及神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病) 神经科学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核转录组学、脂质组学 NA 转录组数据、脂质组数据 NA NA 单细胞RNA测序、单核转录组学 NA NA
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