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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-15 |
Multi-platform analysis of the tumor immune microenvironment associated with breast cancer subtypes
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2610535
PMID:41530924
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研究论文 | 本研究通过多平台分析探讨了乳腺癌PAM50亚型中肿瘤免疫微环境的差异 | 结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和两种反卷积算法,全面解析乳腺癌亚型特异的免疫景观 | 未提及样本量限制或技术方法的潜在偏差 | 探索乳腺癌分子亚型与肿瘤免疫微环境之间的关联 | 乳腺癌肿瘤组织及其免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、反卷积算法 | NA | 图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-01-15 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了结核病诱导的肌成纤维细胞作为肺病理驱动因素的关键作用 | 首次在结核病研究中结合单细胞RNA测序和空间转录组学,识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群作为疾病严重程度和细菌负荷的关联因素,并揭示了其与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究样本量有限,且部分发现依赖于非人灵长类动物模型,需进一步在更大规模人类队列中验证 | 探究结核病肺免疫病理的细胞驱动因素 | 结核病感染者和未感染者的肺组织 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 来自结核病感染者和未感染者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-01-15 |
Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveal Novel Inflammatory Macrophage Subtypes and Biomarkers in Periodontitis
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103983
PMID:41172679
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析,揭示了牙周炎中新型炎症巨噬细胞亚型及其生物标志物 | 识别了牙周炎相关的新型巨噬细胞亚群,并利用机器学习构建了具有诊断潜力的基因特征 | 研究样本可能有限,体外验证仅基于THP-1来源的巨噬细胞,未涵盖所有临床亚型 | 探索牙周炎中巨噬细胞的异质性、分子特征及其临床诊断与预后意义 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-01-15 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术鉴定了人脱落乳牙干细胞的功能亚群,并验证了BAMBI+亚群在血管生成和软骨形成方面的优越能力 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统解析人脱落乳牙干细胞的异质性,并成功鉴定出具有高增殖、软骨生成和血管生成能力的BAMBI+功能亚群 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内功能验证;样本来源相对单一 | 鉴定人脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标志物,为干细胞精准应用提供理论基础 | 人脱落乳牙干细胞(SHEDs) | 单细胞组学 | 口腔颌面部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、Western blot、组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-01-15 |
Mendelian Randomization and ScTranscriptomics Reveal a Lipid Low Malignant Cells Driving Immunosuppression and Matrix Remodeling in Oral squamous cell carcinoma
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104009
PMID:41237591
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序,揭示了口腔鳞状细胞癌中脂质代谢低表达的恶性细胞亚群与不良预后及免疫抑制、基质重塑的关联 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学,识别出与甘油磷脂代谢低相关的Lipid_Low恶性细胞亚群,并关联其与OSCC患者不良预后、迁移能力、增殖活性及免疫逃逸特性 | NA | 探究口腔鳞状细胞癌中脂质代谢与预后风险的关联 | 口腔鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-01-15 |
Hepatic CD4 T Cells Predict Hepatocellular Carcinoma Risk on Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis Patients
2026-Feb, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.70159
PMID:41386633
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研究论文 | 本研究通过分析MASH患者的肝活检样本,发现肝内CD4+ T细胞浸润增加与HCC风险相关,并结合临床参数构建了预测模型 | 首次在MASH患者中识别出肝内CD4+ T细胞密度增加作为HCC发展的预测性免疫标志,并开发了结合免疫和临床变量的高精度预测模型 | 样本量较小(仅23例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 | 识别MASH患者发展为HCC的预测性免疫特征 | MASH患者的肝活检样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA-seq | 预测模型(基于ROC-AUC评估) | 图像,转录组数据 | 23例MASH患者(10例发展为HCC,13例对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-01-15 |
Crotonylation and the Risk of Head and Neck Cancer: Insights from a Two-Sample Mendelian Randomization Study
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.109341
PMID:41447823
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研究论文 | 本研究通过双样本孟德尔随机化分析,探讨了巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险的因果关系 | 首次利用孟德尔随机化方法评估巴豆酰化相关基因对头颈癌风险的因果影响,并结合单细胞RNA测序和代谢组学进行多维度验证 | 研究结果仍需通过共定位分析和功能实验进一步验证,且样本来源主要依赖公共数据库 | 探究巴豆酰化相关基因与头颈癌风险之间的因果关系 | 头颈癌患者及正常对照组织样本 | 生物信息学 | 头颈癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、定量PCR、代谢组学分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组表达数据、单细胞转录组数据、代谢物数据 | 基于TCGA数据库的头颈癌样本及正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-01-15 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,揭示了Mustn1基因在骨骼肌肉组织中与Acta2共表达于壁细胞,并探讨了其在发育和修复中的作用 | 首次通过单细胞转录组学方法系统性地展示了Mustn1在多种骨骼肌肉组织中的壁细胞共定位,并关联到未表征的Sox9谱系细胞群 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集,可能受限于数据质量和样本来源的异质性,且未进行实验验证 | 探索Mustn1基因在骨骼肌肉组织中的表达模式和细胞定位,以理解其在发育和修复过程中的功能 | 骨骼、滑膜、肌肉和肌腱组织中的细胞,特别是壁细胞和Sox9谱系细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-15 |
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513222123
PMID:41533447
|
研究论文 | 本研究揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶KLHL3的活性,调控细胞外钾离子稳态的机制 | 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用作为红细胞与肾脏之间的关键组织间信号机制,调控钾离子稳态,并证实其在人类遗传研究中的关联 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,人类数据关联性仍需进一步验证;具体信号通路细节可能尚未完全阐明 | 探究组织间通讯在钾离子稳态中的作用,特别是Piezo1和KLHL3的调控机制 | 红细胞、肾脏收集管、人类遗传数据(UK Biobank参与者) | 分子生物学与生理学 | 电解质紊乱(如高钾血症) | CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、遗传关联分析 | NA | 遗传数据、转录组数据、生理参数数据 | 200,367名UK Biobank参与者及小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-01-15 |
A gene-expression module identifies circulating immune cells with enhanced recruitment to sites of inflammation
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114227
PMID:41531734
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组学识别了一个名为ALARM的保守基因模块,该模块在循环免疫细胞中表达,与炎症部位招募增强相关 | 首次在肾移植受者中通过纵向单细胞转录组学识别出ALARM基因模块,揭示了其协调免疫细胞招募和效应功能的核心作用,并验证了其在多种免疫介导疾病中的预测价值 | 研究主要基于肾移植受者和动物模型,在人类其他疾病中的普遍性需进一步验证,且机制研究部分依赖体外实验 | 探究循环免疫细胞基因表达程序如何影响其向炎症组织的招募过程 | 肾移植受者的外周血样本、公共数据集中的健康个体和感染患者数据、肺炎小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 肾移植排斥反应、COVID-19感染、肺炎 | 纵向单细胞转录组学、transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据、公共数据集 | 肾移植受者外周血样本(具体数量未明确)、公共数据集、肺炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-01-15 |
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15535-5
PMID:41530714
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA测序数据,开发了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因的功能作用 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并揭示了FAT4在结肠腺癌中的调控作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发预后预测模型 | 结肠腺癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR | GSVA, Cox回归, LASSO, 随机森林 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-15 |
Developmental single-cell atlas of coronary growth and cardiomyocyte interaction in zebrafish
2026-Jan-14, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205065
PMID:41531417
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研究论文 | 本研究结合高分辨率成像和单细胞RNA测序技术,首次系统描绘了斑马鱼冠状动脉发育的细胞和分子图谱,揭示了冠状动脉作为血管支架引导心肌细胞生长的机制 | 首次在斑马鱼中构建了冠状动脉发育的单细胞图谱,定义了四个不同的冠状动脉网络发育阶段,并揭示了Vegfa信号调控冠状动脉-心肌细胞相互作用的机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,哺乳动物冠状动脉发育可能存在物种特异性差异 | 解析冠状动脉发育过程中细胞类型协调和分子调控机制 | 斑马鱼心脏发育过程中的冠状动脉和心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高分辨率成像、遗传操作(功能获得和功能缺失) | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 37,554个心室细胞,覆盖7-30毫米体长范围的发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-01-15 |
Circulating CD34+ Fibroblast Progenitors Engaged in Heart Fibrosis of Allograft
2026-Jan-14, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326558
PMID:41532318
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传细胞谱系追踪技术,揭示了循环CD34+细胞作为心脏同种异体移植纤维化中成纤维细胞前体的新来源 | 首次识别循环CD34+细胞作为成纤维细胞前体参与心脏移植后纤维化,并揭示了CXCL12-ACKR3和MIF-ACKR3相互作用以及TGFβ/GFPT2/SMAD2/4轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要进一步在更大规模的人类队列中验证 | 探索心脏同种异体移植纤维化的细胞来源和机制 | 人类心脏移植样本和小鼠移植模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western印迹, 定量PCR, 免疫组织化学, 三维重建全组织染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 人类心脏移植样本和小鼠模型(包括C57BL/6J, Cd34-CreERT2; R26-tdTomato, mRFP, Rosa26-iDTR, Postn-CreERT2; R26-tdTomato, 双tdTomato和免疫缺陷小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-01-15 |
Microglial dynamics and ferroptosis induction in human iPSC-derived neuron-astrocyte-microglia tri-cultures
2026-Jan-14, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70182
PMID:41532473
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研究论文 | 本研究利用人iPSC衍生的神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞三培养系统,探究了小胶质细胞动态、铁死亡诱导及其在阿尔茨海默病中的病理作用 | 首次在人类iPSC衍生的三培养模型中系统研究小胶质细胞动态和铁死亡,揭示了神经元和星形胶质细胞对小胶质细胞基因表达和功能的深刻影响 | 研究基于体外三培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境 | 探究神经元-胶质细胞相互作用及小胶质细胞在阿尔茨海默病病理机制中的作用 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 三培养模型(神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞) | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及单培养、共培养和三培养多种设置 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-15 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-Jan-14, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检样本,并利用循环肿瘤细胞(CTCs)的DLL3表达水平预测患者对tarlatamab双特异性抗体的临床反应 | 首次将循环肿瘤细胞(CTCs)的DLL3表达作为生物标志物,用于预测小细胞肺癌患者对DLL3靶向双特异性抗体tarlatamab的治疗反应,并展示了其在监测获得性耐药机制中的应用 | 研究样本量较小(仅20名患者的前瞻性队列),且未涉及其他癌症类型或更大规模的验证 | 开发预测小细胞肺癌患者对tarlatamab治疗反应的生物标志物,并探索获得性耐药机制 | 小细胞肺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 20名患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-15 |
Machine learning and multi-omics integration identifies immunological predictors and mechanistic insights in autoimmune encephalitis
2026-Jan-14, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02180-8
PMID:41533076
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研究论文 | 本研究利用免疫指标和机器学习算法开发了自身免疫性脑炎的预后预测模型,并通过多组学方法探讨了核磷蛋白1在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次整合了临床免疫指标、多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、单细胞RNA测序、空间转录组学和表型全基因组关联研究,构建了可解释的预后预测模型并提出了新的潜在治疗靶点 | PAIA治疗的证据仅来自单个患者,NPM1作为治疗靶点的安全性仍需进一步验证,PheWAS仅为初步安全性评估 | 开发自身免疫性脑炎的预后预测模型并探索疾病发病机制 | 抗体阳性自身免疫性脑炎患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表型全基因组关联研究 | RF, XGBoost, LGBM | 临床免疫指标数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 未明确患者数量,包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-01-15 |
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04440-3
PMID:41533176
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研究论文 | 本研究开发了一个基于转移-基底膜相关基因的可解释预后模型,以增强膀胱癌的临床和个性化治疗策略 | 通过整合单细胞和免疫背景分析,识别了基底膜/转移相关基因特征,并构建了一个六基因风险模型,该模型在膀胱癌诊断和预后中表现出预测能力,并揭示了癌症相关成纤维细胞中的潜在治疗靶点 | NA | 开发一个可解释的预后模型,以改善膀胱癌的临床诊断和个性化治疗策略 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 | LASSO回归, SHAP分析 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO队列的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-01-15 |
Impaired Mitophagy-Induced Apoptosis of Gingival Fibroblasts Exacerbates Diabetic Periodontitis Via THBS-1/CD36-Dependent Macrophage Activation
2026-Jan-14, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02390-6
PMID:41533208
|
研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过诱导牙龈成纤维细胞凋亡,并经由THBS-1/CD36/NF-κB信号轴激活巨噬细胞,从而加剧糖尿病性牙周炎的机制 | 首次阐明了线粒体自噬缺陷诱导的牙龈成纤维细胞凋亡通过THBS-1/CD36依赖的巨噬细胞激活机制驱动糖尿病性牙周炎进展 | 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证及在体干预效果有待进一步研究 | 探究高血糖环境下牙龈成纤维细胞与巨噬细胞相互作用的分子机制及其在糖尿病性牙周炎发病中的作用 | 牙龈成纤维细胞、巨噬细胞、糖尿病性牙周炎组织 | 细胞生物学与免疫学 | 糖尿病性牙周炎 | 单细胞测序、分子建模、基因沉默 | NA | 单细胞测序数据、分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-01-15 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜的纳米诱饵,用于协同免疫治疗哮喘 | 利用M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵高效捕获多种2型细胞因子,并通过D-甘露糖修饰增强细胞因子清除,实现协同免疫抑制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发一种针对哮喘的纳米技术免疫疗法 | 哮喘(特别是嗜酸性粒细胞性哮喘) | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-15 |
From glycolytic signatures to patients: A translational roadmap for reproducible, equitable deployment of multi-omics and AI in colorectal cancer
2026-Jan-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03236-3
PMID:41528598
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综述 | 本文提出了一种以标准为先的路线图,旨在将结直肠癌中的糖酵解异质性发现转化为可重复且全球适用的临床生物标志物工具 | 提出了一个整合多组学与AI的标准化实施路线图,强调使用国际公认框架(TRIPOD+AI, PROBAST+AI, DECIDE-AI)确保透明度与校准,并关注全球公平性,包括纳入中低收入国家的试验设计 | 本文是一篇观点性通讯文章,未报告具体实验数据或模型性能验证结果,所提路线图的有效性有待实际应用检验 | 为将结直肠癌中的糖酵解异质性基础研究发现转化为可靠、公平的临床工具,建立一个可重复、标准化的实施框架 | 结直肠癌 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk转录组学,单细胞转录组学,代谢成像,光谱学 | AI | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |