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当前共找到 38358 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-16 |
Spatial transcriptomics analysis of uterine gene expression in enhancer of zeste homolog 2 conditional knockout mice†
2021-11-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab147
PMID:34344022
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫基因表达变化 | 首次应用空间转录组学方法探究Ezh2在子宫上皮和间质细胞中的特异性基因调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类子宫内膜疾病中直接验证 | 阐明EZH2在子宫组织中对基因表达的空间特异性调控机制 | 子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年去势野生型和Ezh2cKO小鼠子宫组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-04-16 |
TRUST4: immune repertoire reconstruction from bulk and single-cell RNA-seq data
2021-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01142-2
PMID:33986545
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研究论文 | 介绍TRUST4开源算法，用于从RNA-seq数据重建αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体库 | TRUST4支持FASTQ和BAM格式，速度更快、灵敏度更高，能组装更长甚至全长的受体库，且能从单细胞RNA-seq数据中调用库序列而无需V(D)J富集 | NA | 开发一种算法以重建免疫受体库 | αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体库 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | SMART-seq和5' 10x Genomics平台 |
| 3 | 2026-04-16 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
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研究论文 | 本研究利用诱导多能干细胞模型探索系统性淀粉样变疾病中肝细胞样细胞对淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌的贡献 | 首次结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序技术，揭示肝细胞在淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌中的蛋白稳态重塑作用 | 研究基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内肝细胞的复杂生理环境 | 探究系统性淀粉样变疾病中合成器官对疾病发病机制的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性患者的诱导多能干细胞及其衍生的肝细胞样细胞 | 单细胞组学 | 系统性淀粉样变疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-16 |
IL-2 production by self-reactive CD4 thymocytes scales regulatory T cell generation in the thymus
2019-11-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190993
PMID:31434685
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研究论文 | 本研究揭示了胸腺中调节性T细胞（T reg细胞）生成的关键调控机制，即自身反应性CD4单阳性胸腺细胞通过产生IL-2来调节胸腺T reg细胞的生成规模 | 首次发现胸腺中IL-2的主要来源是成熟的CD4单阳性胸腺细胞，并证明这些自身反应性细胞通过IL-2产生来调节胸腺T reg细胞的生成规模，建立了胸腺T reg细胞池大小与成熟胸腺前体细胞整体自身反应性之间的调控关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺中是否存在相同机制尚需验证；IL-2产生的具体调控机制和信号通路细节有待进一步阐明 | 探究胸腺中调节性T细胞（T reg细胞）生成和维持的调控机制，特别是IL-2在其中的作用 | 小鼠胸腺中的CD4 T细胞亚群，包括调节性T细胞（T reg细胞）及其前体细胞、成熟的CD4单阳性胸腺细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-04-16 |
Genetic and phenotypic difference in CD8+ T cell exhaustion between chronic hepatitis B infection and hepatocellular carcinoma
2019-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2018-105267
PMID:29666149
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎和肝细胞癌中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | 首次系统比较了慢性感染与癌症中CD8+ T细胞耗竭的差异，并利用单细胞测序数据进行再分析 | 样本来源有限，仅基于已发表数据集和部分组织样本，未涉及动态过程或治疗干预 | 探究慢性乙型肝炎与肝细胞癌中CD8+ T细胞耗竭的异同 | 从慢性乙型肝炎和肝细胞癌组织中分离的CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，但使用了已发表数据集GSE98638 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-04-16 |
Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment
2018-08-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.060
PMID:29961579
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，绘制了乳腺癌肿瘤微环境中多样免疫细胞表型的图谱 | 开发了SEQC预处理流程和Biscuit贝叶斯聚类与标准化方法，以解决单细胞数据固有的计算挑战，并揭示了肿瘤微环境中T细胞的连续激活模型 | 样本量相对较小（仅八个乳腺癌样本），可能限制了结果的普遍性 | 研究乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的表型多样性及其与癌症进展和免疫治疗响应的关系 | 乳腺癌肿瘤组织、正常乳腺组织、血液和淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 | 贝叶斯聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 45,000个免疫细胞（来自八个乳腺癌样本及匹配组织），外加27,000个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-15 |
Bisphenol analogs affected hepatic development and disrupted lipid homeostasis in zebrafish larvae
2026-May-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127929
PMID:41812818
|
研究论文 | 本研究通过暴露斑马鱼胚胎于BPA及其替代物BPAF和BPG，揭示了这些双酚类似物对肝脏发育和脂质稳态的干扰机制 | 首次系统比较了BPA、BPAF和BPG对斑马鱼幼虫肝脏发育和脂质代谢的影响，并利用10x单细胞RNA-Seq技术揭示了肝细胞中脂质积累和代谢通路的具体变化 | 研究仅基于斑马鱼模型，结果向人类外推需谨慎；暴露浓度设置可能未完全覆盖环境相关水平 | 探究双酚类似物对早期生命发育阶段肝脏发育和脂质稳态的影响机制 | 斑马鱼胚胎和幼虫 | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA-Seq, 脂质组学分析, 油红O染色 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎暴露于不同浓度双酚类似物（0.5, 50, 500 μg/L BPA/BPAF; 0.5, 50, 250 μg/L BPG） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA-Seq分析系统 |
| 8 | 2026-04-15 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
|
研究论文 | 本研究通过纵向空间转录组学分析，揭示了肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次在肺动脉高压患者中进行纵向空间转录组学分析，比较了13年间两次肺移植样本，揭示了小和大肺动脉在严重重塑病变中的转录组差异，并识别出独特的基因特征 | 研究基于单例患者样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的病理生理机制和分子动态变化 | 肺动脉高压患者的肺组织样本，特别是小和大肺动脉区域 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1例患者，在13年间两次肺移植的样本，包括严重和中等重塑两个时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-15 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-May, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
|
研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术，探讨了甲醛对肺癌的复杂影响，揭示了其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据分析，系统识别甲醛影响肺癌的关键靶点和通路，揭示了传统毒理学方法难以发现的复杂关系 | 研究主要基于数据库和计算模拟，缺乏实验验证，且样本来源和单细胞数据的具体细节未明确说明 | 探索甲醛诱导肺癌的分子机制，识别关键靶点和通路 | 甲醛与肺癌相关的靶点基因和蛋白质 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-04-15 |
Lumican-mediated fibroblast differentiation in skin fibrosis
2026-May, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2026.03.006
PMID:41912056
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，探讨了皮肤纤维化中Lumican介导的成纤维细胞分化机制 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统比较了胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩中成纤维细胞的基因表达谱和分化轨迹，并首次验证了Lumican作为成纤维细胞分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 探究从无瘢痕愈合到病理性纤维化的分子机制，并识别关键调控基因 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-15 |
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-May-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141961
PMID:41934838
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研究论文 | 本研究通过活体荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了纳米塑料在小鼠体内的生物分布及其对肺免疫动态的干扰 | 首次发现纳米塑料特异性靶向肺部的非经典单核细胞和CD206间质巨噬细胞亚群，并揭示其通过延迟单核细胞向巨噬细胞分化来重编程免疫动态 | 研究仅使用雌性小鼠模型，未探索性别差异；长期暴露后果和人类相关性需进一步验证 | 探究纳米塑料在体内的生物分布及其对免疫系统的直接细胞响应 | 雌性小鼠的肺组织和血液免疫细胞 | 单细胞组学 | 环境暴露相关免疫失调 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据, 流式数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-15 |
Amoeboid-mesenchymal transition and the proteolytic control of cancer invasion plasticity
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520717123
PMID:41961858
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研究论文 | 本研究揭示了癌细胞在侵袭过程中通过MMP14介导的蛋白水解作用调控间充质-阿米巴样表型转换的机制 | 挑战了传统观点，发现阿米巴样侵袭程序同样依赖MMP14介导的基质降解，并证明MMP14对维持核完整性至关重要 | 研究主要使用体外3D模型和人组织外植体，体内验证仍需进一步开展 | 探究癌细胞侵袭可塑性（间充质与阿米巴样表型转换）的调控机制 | 癌细胞（乳腺癌模型）、人乳腺癌组织外植体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、免疫组织化学 | 3D肿瘤球体模型、人组织外植体模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量，使用癌细胞系模型和人乳腺癌组织外植体 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-15 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了死亡相关蛋白激酶2（DAPK2）通过磷酸化丙酮酸激酶M2（PKM2）的第45位苏氨酸，调控内皮细胞炎症反应，从而促进血流扰动诱导的动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现DAPK2是KLF2下游的振荡剪切力敏感因子，并鉴定出PKM2是DAPK2的直接作用底物，阐明了DAPK2通过磷酸化PKM2第45位苏氨酸促进其二聚化和核转位，进而激活STAT1并上调VCAM-1和ICAM-1表达的完整信号轴 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的完全转化意义尚需进一步验证；DAPK2-PKM2轴在其他血管病理条件下的作用未予探索 | 阐明振荡剪切力诱导动脉粥样硬化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 内皮细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 质谱分析、免疫共沉淀、邻近连接实验、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、蛋白质组学数据、单细胞转录组数据 | 利用公共数据库资源及Apoe-/-背景的EC特异性基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-15 |
EpCAM supports exit from pluripotency of embryonic stem cells via Eomes
2026-Apr-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08734-w
PMID:41963283
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研究论文 | 本研究揭示了EpCAM通过调控Eomes表达和Wnt信号通路，在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的关键作用 | 首次发现EpCAM通过调控Eomes表达和Wnt信号通路，在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中发挥关键作用，并利用单细胞RNA测序技术验证了EpCAM与Eomes在早期胚胎发育阶段的共表达关系 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型和体外胚胎体分化系统，尚未在体内胚胎发育过程中进行验证 | 探究EpCAM在小鼠胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞、胚胎体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、生物信息学分析 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 野生型和Epcam敲除型小鼠胚胎干细胞在不同分化时间点的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-15 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
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研究论文 | 本文探讨了实验和计算方法对单细胞RNA-seq数据中等位基因特异性表达分析的影响，并开发了一套单细胞ASE计算工具 | 开发了单细胞ASE计算工具，并展示了在单核RNA-Seq中从内含子区域提取更多ASE信息，以及如何通过读长和杂交选择提高检测能力 | NA | 研究实验和计算方法如何影响基于ASE的分析能力，并开发相关计算工具 | 单核RNA-Seq数据，特别是等位基因特异性表达分析 | 自然语言处理 | 帕金森病 | 单核RNA-Seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of unattributed expression patterns in spatial transcriptomics
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71720-5
PMID:41963343
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法，用于恢复空间转录组学中现有分析方法遗漏的未归属表达模式 | RESCUE方法能系统性恢复因细胞分割或细胞类型解卷积而丢失的分子表达，包括脆弱细胞类型、亚细胞结构和细胞外表达等来源 | NA | 开发一种计算工具以改善空间转录组数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组数据，特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据和其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 18 | 2026-04-15 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small-cell lung cancer
2026-Apr-10, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102741
PMID:41966692
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了联合小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境生态位 | 首次在治疗初期的cSCLC肿瘤中整合空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序，揭示了不同组织学成分的单克隆起源及与突变模式的关联，并开发了基于突变的cSCLC检测工具 | 研究样本量有限（仅19个肿瘤），且仅针对治疗初期患者，未涉及治疗后的动态变化 | 探究联合小细胞肺癌的生物学特性、谱系可塑性及肿瘤微环境，以改善诊断和治疗策略 | 19个治疗初期的联合小细胞肺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 19个治疗初期的cSCLC肿瘤 | NA | 空间全外显子测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-Apr-08, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
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研究论文 | 提出了一种名为GatorST的新型空间转录组数据分析框架，通过结合图建模与元学习策略来生成具有空间信息的表示 | 首次将基于图的局部空间建模与全局基因表达聚类伪标签相结合，并采用元学习启发的训练策略，有效整合局部与全局空间信息 | 未明确说明框架对特定组织类型或数据质量的敏感性，也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够有效整合空间与转录组信息以提升下游分析性能的通用框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 元学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-15 |
TriPDCL: A Tri-Pathway Prototype-Driven Contrastive Learning Framework for Cross-Modality Single-Cell Integration
2026-Apr-08, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c00436
PMID:41952315
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研究论文 | 本文提出了一种基于原型对比学习的三路径框架TriPDCL，用于解决跨模态单细胞数据整合中的异质性对齐和鲁棒学习挑战 | 通过迭代原型学习更新机制实现异质性信息的有效传递，并利用可学习的原型中心精确构建可靠的正负样本对 | 未在摘要中明确说明 | 解决跨模态单细胞数据整合中的技术批次效应和生物异质性差异问题 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 对比学习框架 | 单细胞多组学数据 | 五个数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |