单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-07-19	Amorphous calcium zinc phosphate promotes macrophage-driven alveolar bone regeneration via modulation of energy metabolism and mitochondrial homeostasis 2025-Oct, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.053 PMID:40677756	研究论文	研究探讨了无定形钙锌磷酸盐（ACZP）纳米颗粒通过调节巨噬细胞的能量代谢和线粒体稳态促进肺泡骨再生的机制	首次揭示了ACZP通过抑制IP3R/MCU通路，调节巨噬细胞代谢从糖酵解转向氧化磷酸化，从而促进骨再生的新机制	研究仅在新西兰白兔模型中进行，尚未在更复杂的临床环境中验证	探索钙磷酸盐基材料促进骨形成的免疫调节机制，并开发新型骨再生材料	巨噬细胞和肺泡骨缺损	组织工程与再生医学	牙科疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	新西兰白兔的肺泡骨缺损模型
2	2025-07-19	Evaluation of PANoptosis activation in irreversible pulpitis: An in vitro study based on human tissue samples 2025-Sep, Archives of oral biology IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.archoralbio.2025.106305 PMID:40451096	研究论文	本研究通过分析RNA-seq和scRNA-seq数据，探讨了不可逆性牙髓炎中PANoptosis的激活情况	首次在人类牙髓炎组织中研究了PANoptosis的激活机制，并揭示了凋亡和焦亡途径的独立存在	未检测到caspase-8和PYCARD的相互作用，且样本来源有限	研究牙髓炎中PANoptosis的激活机制	人类健康及炎症牙髓组织	分子生物学	牙髓炎	RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, 共免疫沉淀	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但使用了GEO数据库中的数据集
3	2025-07-19	siHIF-1α-loaded micellar nanoparticles inhibit M1 macrophage activation to ameliorate chronic rhinosinusitis 2025-Sep, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.433 PMID:40456494	研究论文	研究负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒通过调控巨噬细胞极化和铁死亡来改善慢性鼻窦炎的分子机制	首次提出使用负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒靶向HIF-1α/TFRC-ROS轴，抑制M1巨噬细胞活化和铁死亡，为慢性鼻窦炎提供新型精准治疗策略	需进一步验证长期安全性和临床转化潜力	探究纳米颗粒介导的基因疗法对慢性鼻窦炎免疫调控的作用机制	慢性鼻窦炎小鼠模型和Raw264.7巨噬细胞系	纳米医学	慢性鼻窦炎	scRNA-seq, ChIP, 双荧光素酶报告实验, 流式细胞术	NA	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	小鼠模型（具体数量未明确）和Raw264.7细胞系
4	2025-07-19	Specificity protein 1 suppresses prohibitin 1 to induce macrophage M1 polarization and impair phagocytosis, exacerbating sepsis-associated acute lung injury 2025-Sep, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.434 PMID:40482976	研究论文	本研究探讨了特异性蛋白1(SP1)/抑制蛋白1(PHB1)轴在脓毒症相关急性肺损伤(ALI)中调控巨噬细胞极化和功能的作用	首次揭示了SP1通过转录抑制PHB1表达促进巨噬细胞M1极化并损害吞噬功能，从而加剧脓毒症诱导的ALI	未来研究需要探索针对调节巨噬细胞极化和改善脓毒症相关ALI免疫稳态的靶向治疗	阐明脓毒症诱导ALI的分子机制并探索潜在治疗靶点	巨噬细胞极化与功能	分子生物学与免疫学	脓毒症相关急性肺损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高通量测序(HTS)、机器学习(ML)算法、免疫荧光、ELISA、RT-qPCR、Western blot	ML算法	基因表达数据、蛋白质数据	CLP诱导的小鼠模型
5	2025-07-19	Novel NLRP3 inhibitors mitigate acute radiation-induced lung injury by suppressing pyroptosis in alveolar epithelial cells 2025-Sep, Toxicology and applied pharmacology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.taap.2025.117458 PMID:40618790	研究论文	本研究设计并合成了一系列新型NLRP3抑制剂，通过抑制肺泡上皮细胞的焦亡来减轻辐射诱导的肺损伤	开发了针对NLRP3 NACHT结构域的新型喹喔啉酮衍生物抑制剂(QK-3D和QK-3E)，并证实其通过抑制NLRP3/GSDMD通路减轻辐射诱导的肺损伤	研究主要聚焦于早期辐射诱导肺损伤，对长期效果和临床转化潜力需进一步验证	开发靶向NLRP3的新型抑制剂以减轻辐射诱导的肺损伤	肺泡上皮细胞(A549和MLE-12细胞系)和C57BL/6小鼠模型	分子药理学	肺损伤	高通量筛选、分子对接、单细胞测序分析、Western blot、免疫荧光	动物模型(C57BL/6小鼠)	分子生物学数据、组织病理学数据	细胞实验(具体数量未明确)和动物模型(具体数量未明确)
6	2025-07-19	Neoadjuvant PD-1 blockade induces the autophagy of immune cells: a new target for synergistic therapy of recurrent glioblastoma 2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102119 PMID:40678806	research paper	研究探讨了新辅助PD-1阻断如何通过调节免疫细胞自噬影响复发性胶质母细胞瘤的治疗效果	首次揭示了新辅助PD-1阻断诱导的免疫细胞自噬变化，并鉴定了关键免疫细胞亚群及潜在协同治疗药物	未明确验证所鉴定药物在临床中的实际疗效	阐明新辅助PD-1阻断对免疫细胞自噬的影响机制并寻找协同治疗靶点	复发性胶质母细胞瘤患者组织样本	肿瘤免疫治疗	胶质母细胞瘤	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量（GBM.rec和GBM.PD1组组织样本）
7	2025-07-19	RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250573 PMID:40298935	研究论文	该研究揭示了RORγt eTACs在口服耐受性和Treg诱导中的关键作用	首次证明RORγt eTACs是口服耐受性诱导的必要细胞群，并揭示了其独特的整合素β8表达特征	研究主要在动物模型中进行，人类相关机制仍需进一步验证	阐明口服耐受性的细胞机制和关键调控细胞	RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、RORγt树突状细胞和R-eTACs）	免疫学	自身免疫疾病	谱系追踪和单细胞测序	小鼠模型	基因表达数据和细胞表型数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型
8	2025-07-19	A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20241174 PMID:40392549	研究论文	本文报告了首例由ThPOK基因变异引起的人类疾病，该变异导致CD4+ T细胞缺陷和纤维化	首次发现ThPOK基因的致病变异导致人类免疫缺陷疾病，并揭示了ThPOK在T细胞受体激活和纤维化通路调控中的新作用	仅报告了一例患者，样本量较小	研究ThPOK基因变异对人类免疫系统的影响	一名携带ThPOKK360N变异的患者及其细胞模型	免疫学	免疫缺陷病	单细胞RNA测序，慢病毒转导	NA	基因序列数据，转录组数据	1名患者及其细胞模型
9	2025-07-19	Multiomic analysis uncovers a continuous spectrum of differentiation and Wnt-MDK-driven immune evasion in hepatoblastoma 2025-Aug, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2025.01.031 PMID:39900120	研究论文	通过多组学分析揭示肝母细胞瘤中连续的分化谱和Wnt-MDK驱动的免疫逃逸机制	揭示了肝母细胞瘤细胞存在连续的分化谱，并发现Wnt信号通过上调midkine表达改变巨噬细胞表型，从而驱动免疫逃逸	需要进一步的机制和实际验证以实现临床转化	全面分析肝母细胞瘤的肿瘤微环境，揭示其空间结构和关键信号机制	肝母细胞瘤样本、非肿瘤和胎儿肝脏样本、健康免疫细胞	肿瘤微环境研究	肝母细胞瘤	单细胞/核RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光染色、Western blotting	NA	RNA-seq数据、空间转录组数据、免疫荧光图像	单细胞/核RNA测序样本15例，空间转录组样本22例，免疫荧光染色样本7例，RNA-seq验证队列110例
10	2025-07-19	A review of spatial transcriptomics in psoriasis: new insights into cellular contributions 2025-Aug, Current opinion in immunology IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.coi.2025.102585 PMID:40505496	review	综述了空间转录组学在银屑病研究中的应用及其对细胞贡献的新见解	结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了银屑病中特定细胞群、失调通路及组织微环境的新见解	NA	探讨空间转录组学如何帮助更好地理解银屑病及其相关细胞类型	银屑病中的细胞群和组织微环境	digital pathology	psoriasis	spatial transcriptomics (ST), single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)	NA	gene expression data	NA
11	2025-07-19	Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury 2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025 PMID:40602784	研究论文	本文研究了甲基硫腺苷磷酸化酶（MTAP）在小鼠急性肾损伤（AKI）模型中的保护作用及其潜在治疗靶点	首次揭示了MTAP抑制在AKI中的保护作用，并通过转录组学和单细胞RNA测序数据验证了其在损伤反应中的调节作用	研究仅基于小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，尚未进行临床试验验证	探索MTAP在急性肾损伤中的潜在治疗作用	小鼠模型和人类肾脏细胞	生物医学	急性肾损伤	RNA-seq, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型和人类肾脏活检样本
12	2025-07-19	Idiopathic Subglottic Stenosis and the Epithelial Interface of Host and Environment 2025-Aug-01, Journal of the American College of Surgeons IF:3.8Q1 DOI:10.1097/XCS.0000000000001340 PMID:39902917	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，对特发性声门下狭窄(iSGS)患者的近端气道瘢痕组织进行了无偏见的细胞亚群表征和分子表型分析	首次揭示了iSGS患者气道基底祖细胞耗竭和上皮细胞间质转化的现象，并证实了细菌移位和宿主适应性免疫在疾病发生中的关键作用	研究样本来自国际队列但疾病罕见性可能导致样本量有限，动物模型结果向人类外推需谨慎	阐明特发性声门下狭窄的发病机制	iSGS患者的近端气道瘢痕组织	digital pathology	呼吸道纤维化疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	国际iSGS患者队列（具体数量未明确说明）
13	2025-07-19	Thymic Microenvironment Remodeling in Cancer Cachexia as a Determinant of Checkpoint Inhibitor Efficacy and Toxicity 2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle DOI:10.1002/jcsm.13874 PMID:40665793	研究论文	本研究探讨了癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的关联	揭示了癌症恶病质通过破坏胸腺髓质成纤维细胞成熟度，影响T细胞负选择，从而扩展针对组织限制性抗原的TCR库	研究主要基于小鼠模型，临床样本量有限	探究癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与ICI治疗效果的关系	恶病质肝癌小鼠模型和接受抗PD-1/L1抗体治疗的晚期癌症患者	肿瘤免疫学	肝癌	单细胞测序、免疫荧光、流式细胞术、单细胞TCR测序	NA	单细胞测序数据、流式细胞数据、临床随访数据	恶病质肝癌小鼠模型和接受ICI治疗的晚期癌症患者队列
14	2025-07-19	Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease 2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025 PMID:40602764	研究论文	利用人类多能干细胞衍生的肾脏类器官研究发育性多囊肾病的致病机制，并发现PTH1R作为潜在治疗靶点	首次揭示PTH1R作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的信号级联机制	研究主要基于体外类器官模型，尚未在完整生物体内验证	探索发育性多囊肾病的致病机制并寻找新的治疗靶点	人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、野生型类器官、人类ARPKD组织	干细胞与疾病建模	多囊肾病	单细胞RNA测序、靶向机制研究	肾脏类器官模型	基因表达数据、组织学数据	未明确说明具体样本数量，涉及多种样本类型（类器官、人类组织）
15	2025-07-19	Timp2-modified gelatinhydroxyphenylpropionic acid hydrogels reverse enhanced scleral recovery and suppress myopia development in mice 2025-Aug, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101942 PMID:40677403	研究论文	研究探讨了一种新型的治疗形觉剥夺性近视(FDM)的策略，即使用Timp2修饰的巩膜干细胞(SSC)嵌入明胶-羟基苯丙酸(Gtn-HPA)水凝胶中	通过转录组和单细胞RNA测序分析确定Timp2在FDM进展中的关键作用，并开发了具有优异生物相容性、快速凝胶化和降解特性的SSC-Gtn-HPA水凝胶复合材料	NA	探索一种通过增强巩膜恢复来治疗近视的新型治疗方法	形觉剥夺性近视(FDM)小鼠模型和人巩膜成纤维细胞(HSF)	生物医学工程	近视	转录组测序、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、细胞行为数据	NA
16	2025-07-19	Single-cell analysis of mature hepatocytes reveals an IRF1-driven restriction of HDV infection 2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101429 PMID:40677689	研究论文	通过单细胞RNA测序分析成熟肝细胞，揭示了IRF1驱动的HDV感染限制机制	首次在单细胞水平上揭示了IRF1作为HDV感染的限制因子，并阐明了其抗病毒机制	研究主要基于体外培养的肝细胞样细胞(HLCs)模型，可能与体内真实情况存在差异	探究成熟肝细胞中HDV感染的宿主限制因素	干细胞衍生的肝细胞样细胞(HLCs)和肝癌细胞系	病毒学	肝炎(HDV感染)	单细胞RNA测序(scRNAseq)	NA	RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，使用了对照组和HDV感染的HLCs
17	2025-07-19	cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy 2025-Jul-18, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792 PMID:40444360	研究论文	本研究揭示了传统1型树突状细胞（cDC1s）通过促进局部免疫反应在动脉粥样硬化中的作用，并探索了针对cDC1s的免疫治疗策略	首次明确了cDC1s通过STING依赖的机制促进动脉粥样硬化，并开发了靶向cDC1s的纳米颗粒免疫治疗方法	研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证	阐明cDC1s在动脉粥样硬化发展中的作用机制并开发靶向治疗策略	Ldlr-/-小鼠模型中的cDC1s和T细胞亚群	免疫学	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、纳米颗粒靶向递送技术	小鼠动脉粥样硬化模型（Ldlr-/-）	基因表达数据、流式细胞数据	多种基因修饰小鼠模型（Xcr1Cre-DTA、Irf8Δ32等）
18	2025-07-19	Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation 2025-Jul-18, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adv6642 PMID:40668916	研究论文	本研究通过异时共生和单细胞RNA测序技术，揭示了AdipoR1在视网膜年轻化中的关键作用	首次发现AdipoR1及其下游AMPK信号通路在视网膜年轻化中的核心作用，并证明AdipoR1激动剂AdipoRon可逆转视网膜衰老	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类视网膜中验证	探索视网膜衰老的分子机制并寻找抗衰老靶点	小鼠视网膜组织	分子生物学	老年性疾病	异时共生(HP)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠模型	转录组数据	年轻、年老及异时共生配对小鼠的视网膜样本
19	2025-07-19	Tryptamine Metabolism and Functionalization in Gut Commensal Bacteria Expand Human Tryptamine Signaling Responses 2025-Jul-18, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.5c00313 PMID:40577169	研究论文	研究肠道共生细菌中色胺代谢和功能化对人类色胺信号反应的影响	发现了两种以前未表征的代谢物，并揭示了它们在激活人类GPCRs和抑制炎症酶方面的功能	研究仅基于体外和小鼠模型，未涉及人体临床试验	探索肠道微生物分泌的小分子对人类生理的影响	人类粪便来源的细菌培养物和小鼠肠道组织	微生物学	NA	生物活性辅助分离、单细胞RNA测序	NA	化学分析数据、RNA测序数据	人类粪便来源的细菌培养物和小鼠肠道组织
20	2025-07-19	Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma 2025-Jul-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-10876-4 PMID:40676059	研究论文	本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据，识别了HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在药物候选物	结合101种机器学习模型的平均C指数，开发了最优模型组合，并识别了SPP1、GHR和ESR1作为有潜力的药物靶点	研究样本量有限，仅分析了53个免疫相关关键基因	探索HBV相关肝细胞癌的发病机制及其与免疫系统的相互作用	HBV相关肝细胞癌患者	数字病理学	肝细胞癌	批量测序、单细胞测序(ScRNA-seq)	逐步Cox回归(forward)、RSF	基因表达数据	53个免疫相关关键基因