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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-29 |
A common progenitor gives rise to fibroblastic reticular cells and vascular smooth muscle cells in murine lymph nodes
2026-Feb-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242300
PMID:41295950
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞来源于共同的CCL19表达祖细胞 | 首次揭示淋巴结中成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞具有共同的胚胎祖细胞起源 | 研究仅限于小鼠模型,人类淋巴结中是否存在相同机制尚不清楚 | 探究淋巴结基质细胞的发育起源和分化路径 | 小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,细胞命运图谱,共聚焦显微镜 | NA | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-11-29 |
The tumor microenvironment in lung cancer: Heterogeneity, therapeutic resistance and emerging treatment strategies (Review)
2026-Jan, International journal of oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.3892/ijo.2025.5824
PMID:41312736
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综述 | 本文全面分析肺癌肿瘤微环境的异质性及其在治疗抵抗中的作用,并探讨针对TME的新兴治疗策略 | 整合多组学数据和空间转录组学推动TME导向的个体化治疗策略发展 | NA | 探讨肺癌肿瘤微环境在治疗抵抗中的作用机制及靶向治疗策略 | 肺癌肿瘤微环境(包括免疫细胞、基质成分、细胞外基质和生物活性分子) | 肿瘤学 | 肺癌 | 多组学分析、空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱,揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络,发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限,仅比较年轻和老年组,缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-29 |
Preoperative pembrolizumab (anti-PD-1 antibody) combined with chemoradiotherapy for esophageal squamous cell carcinoma: a phase 1/2 trial (PALACE-2)
2025-Nov-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02477-4
PMID:41309527
|
研究论文 | 本研究评估了术前帕博利珠单抗联合放化疗治疗局部晚期可切除食管鳞癌的疗效和安全性 | 首次大规模多中心1/2期试验报告PPCT方案短期结果,并发现IL-6水平可作为治疗反应预测指标 | 短期疗效未优于新辅助放化疗,需更长期随访验证生存获益 | 探究帕博利珠单抗联合放化疗在食管鳞癌术前治疗中的疗效和安全性 | 局部晚期可切除食管鳞癌患者 | 临床医学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序,细胞因子分析,小鼠模型实验 | NA | 临床数据,分子数据,动物实验数据 | 143名入组患者,140名接受新辅助治疗,125名接受手术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-11-29 |
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Folia histochemica et cytobiologica
IF:1.7Q4
DOI:10.5603/fhc.108988
PMID:41311243
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了成年雄性小鼠肾上腺及其周围脂肪组织的高分辨率分子图谱 | 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱,揭示了肾上腺分区、更新和区室间相互作用的细胞和分子框架 | 研究仅使用CD1 IGS雄性小鼠,未涉及其他品系或雌性动物 | 解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及周围脂肪组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类、差异基因表达分析、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 成年CD1 IGS雄性小鼠肾上腺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist平台 |
| 6 | 2025-11-29 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2025-Nov-28, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
|
研究论文 | 开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并验证其在靶向癌症治疗中的效果 | 首次使用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原生成肿瘤靶向抗体,并将这些抗体修饰到载药T细胞囊泡上实现靶向治疗 | 研究仅使用卵巢癌细胞系OVCAR-8,尚未在其他癌症类型中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体以提高实体瘤药物递送效率 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8、小鼠模型 | 靶向治疗 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | OVCAR-8肿瘤荷瘤小鼠 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-29 |
Fibroblasts promote the progression of benign prostatic hyperplasia through colony-stimulating factor 1 receptor-mediated RTK signaling in prostatic epithelial cells
2025-Nov-28, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00360-w
PMID:41313502
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞通过CSF1R介导的RTK信号通路促进良性前列腺增生进展的机制 | 首次发现成纤维细胞通过分泌CSF1和IL34激活前列腺上皮细胞中的CSF1R/RTK信号轴驱动BPH进展 | 研究主要基于细胞系、类器官和小鼠模型,需要更多临床样本验证 | 阐明RTK信号通路在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 前列腺上皮细胞、成纤维细胞、BPH细胞系、类器官模型和雄激素诱导的BPH小鼠模型 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | BPH组织样本、细胞系、类器官和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-11-29 |
Multi-omics approaches including single-cell analysis and machine learning were used to identify the roles of telomere-related genes in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04047-0
PMID:41313509
|
研究论文 | 通过多组学方法和机器学习识别端粒相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后价值 | 首次系统分析端粒相关基因在ESCC中的表达模式,结合单细胞分析和三种机器学习算法构建预后风险模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索肿瘤免疫微环境异质性 | 食管鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,定量实时PCR | LASSO回归,支持向量机,随机森林 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-11-29 |
Decoding epithelial-T cell interactions in colorectal cancer through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04083-w
PMID:41313518
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示结直肠癌中上皮细胞与T细胞相互作用的时空特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析结直肠癌上皮-T细胞相互作用的时空架构 | 样本量相对有限(36例患者),需更大队列验证发现 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与T细胞的相互作用机制 | 36例结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Seurat, Harmony, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, CellTrek | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 36例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
|
研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合,并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合,在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合,其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 12 | 2025-11-29 |
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509340
PMID:41309490
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性,并发现视黄酸信号通过RARα-CIITA通路驱动肥大细胞向促炎状态重编程 | 首次系统鉴定促炎性肥大细胞亚群,揭示视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,功能验证需要进一步实验支持 | 探究肥大细胞在肿瘤免疫中的分子特征和功能多样性 | 人类十种癌症类型中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 十种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-29 |
Construction of a Multitissue Cell Atlas Reveals Cell-Type-Specific Regulation of Molecular and Complex Phenotypes in Pigs
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504961
PMID:41309493
|
研究论文 | 构建了猪多组织细胞图谱,揭示细胞类型特异性调控对分子和复杂表型的影响 | 首次在猪中构建大规模单细胞转录组图谱,发现细胞类型特异性eQTL与复杂性状的关联,并揭示猪人类同源基因对人类复杂表型的遗传力富集 | 仅基于19个组织的样本,可能未覆盖所有猪组织类型;样本数量相对有限 | 系统解析猪组织细胞异质性和细胞类型特异性调控机制 | 猪多组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据 | 229,268个高质量细胞核来自19个组织,3,921个批量RNA-seq样本来自17个匹配组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-11-29 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
|
研究论文 | 开发了一种名为scPER的计算方法,通过整合单细胞RNA测序数据来估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,能够从混杂因素中分离真实信号,在细胞比例估计方面优于现有多种方法 | NA | 开发一种严谨的计算方法来确定与癌症表型一致的肿瘤细胞亚型 | 肿瘤微环境中的细胞组成和表型相关细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,总RNA测序 | 对抗自编码器,极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-11-29 |
Neuroectoderm-derived iris muscle characterization at the single-cell resolution in native human iris and a pluripotent stem cell eye model
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65653-8
PMID:41309590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了天然人虹膜与多能干细胞眼模型中神经外胚层来源的虹膜肌肉特征 | 首次在单细胞分辨率下表征人虹膜肌肉的转录特征,并建立了多能干细胞来源的虹膜肌肉模型 | 研究主要基于体外模型,与体内真实发育环境存在差异 | 研究神经外胚层来源的虹膜肌肉的发育机制和转录特征 | 人天然虹膜组织和人多能干细胞分化的虹膜肌肉 | 单细胞生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-11-29 |
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66446-9
PMID:41309646
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研究论文 | 本研究揭示了调控成年上皮细胞命运可塑性的再生屏障机制 | 发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子,揭示了限制细胞身份转换的谱系转换屏障 | 食管细胞向皮肤谱系转换过程效率极低,表明存在尚未完全解析的调控机制 | 探究限制成年细胞命运可塑性的调控机制 | 成年上皮细胞,特别是食管细胞和皮肤细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪,3D再生培养系统 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-29 |
Spatial gene expression profiling reveals the distinct microenvironment of tuberous sclerosis complex-associated angiomyolipoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26541-9
PMID:41309810
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的独特微环境特征 | 首次使用空间转录组技术比较TSC-AML、散发性AML和肾细胞癌的转录景观,识别出TSC-AML特有的分子特征 | 研究设计为单病例分析,样本量有限 | 表征结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的转录特征并识别TSC特异性分子标志物 | 结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤、散发性肾血管平滑肌脂肪瘤和肾细胞癌组织样本 | 空间转录组学 | 结节性硬化症相关肾肿瘤 | 空间转录组分析 | 无监督聚类分析 | 空间基因表达数据 | 3例样本(TSC-AML、散发性AML和RCC各1例) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | CytAssist Visium,使用福尔马林固定石蜡包埋组织切片 |
| 18 | 2025-11-29 |
Cathepsin B as a potential serum biomarker for early diagnosis and progression of diabetic foot ulcer complicated with peripheral vascular disease
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26599-5
PMID:41309848
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现组织蛋白酶B(CTSB)可作为糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清诊断标志物 | 首次通过单细胞转录组分析鉴定CTSB在DFU合并PVD血管内皮细胞中的富集,并验证其血清检测价值 | 样本量有限,需要更大规模研究验证CTSB的诊断效能 | 探索糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清生物标志物 | 糖尿病足溃疡合并外周血管疾病患者 | 生物标志物研究 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞转录组分析,免疫组化,ELISA,临床相关性分析,血管生成实验,CCK8实验,划痕实验 | NA | 转录组数据,血清样本,组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-29 |
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28415-6
PMID:41309884
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研究论文 | 本研究首次利用锌指蛋白基因开发了子宫体子宫内膜癌预后预测模型,并分析了其与肿瘤微环境、免疫治疗反应的关系 | 首次系统研究锌指蛋白家族基因在子宫体子宫内膜癌中的作用,建立了基于8个预后相关ZNF基因的风险评分系统 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索锌指蛋白基因在子宫体子宫内膜癌中的预后价值及治疗指导意义 | 子宫体子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学,定量蛋白质组学 | COX回归,LASSO回归,风险评分模型 | 转录组数据,临床数据,单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-11-29 |
Dissecting neuroblastoma heterogeneity through single-cell multi-omics: insights into development, immunity, and therapeutic resistance
2025-Nov-27, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03635-2
PMID:41309932
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综述 | 通过单细胞多组学技术解析神经母细胞瘤异质性,揭示其发育起源、免疫微环境和治疗耐药机制 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间分析技术,首次系统描绘神经母细胞瘤的肾上腺素-间充质连续谱系状态和肿瘤可塑性机制 | NA | 解析神经母细胞瘤异质性并探索治疗耐药机制 | 神经母细胞瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学技术,包括单细胞转录组学、表观基因组学、空间分析 | NA | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |