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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-31
Happening in the Prostate Tumor Microenvironment: Ion Channels and Extrachromosomal DNA Driving Phenotypic Plasticity
2026-May, The Prostate
综述 本文综述了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中的关键作用,并分析了单细胞RNA测序数据以揭示其表达谱 整合了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌表型可塑性中的协同作用机制,并通过单细胞RNA测序数据提供了细胞类型特异性的表达证据 这是一篇综述性文章,主要基于现有证据进行分析,未进行新的实验验证 阐明离子通道和染色体外DNA如何驱动前列腺癌的表型可塑性、治疗抵抗和疾病进展 前列腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和基质细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个公开可用的单细胞RNA测序数据集(原发性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-31
Single-cell transcriptomic analysis reveals intra-tumoral heterogeneity and immunotherapy strategies in high-grade serous ovarian cancer
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了高级别浆液性卵巢癌的瘤内异质性,并探讨了免疫治疗策略 利用单细胞RNA测序技术系统解析HGSOC的细胞组成变化,发现MHC class Ⅰ高表达上皮细胞与患者预后改善及CD8 T细胞激活的关联 研究样本量有限,需在更大队列中验证;机制研究主要基于相关性分析,缺乏直接功能实验验证 解析高级别浆液性卵巢癌的瘤内异质性并探索免疫治疗新策略 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤组织样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,多重免疫组化 NA 单细胞转录组数据,免疫组化图像数据 未明确样本数量,包含原始队列和额外验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-03-31
Integrated multi-omics identifies macrophage ARG1-mediated deacetylation with causal and diagnostic implications in ischemic stroke
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别了缺血性卒中中与去乙酰化相关的基因特征,并验证了ARG1在免疫调节中的因果和诊断作用 首次整合患者和模型的多组学数据,识别出52个差异表达的去乙酰化相关基因,并构建了一个三基因诊断特征,同时通过孟德尔随机化验证了ARG1的因果作用 研究主要基于观察性数据和模型验证,需要进一步实验验证机制 探究缺血性卒中中表观遗传去乙酰化与免疫异质性的关联 缺血性卒中患者和MCAO小鼠模型 生物信息学 缺血性卒中 多组学整合分析、单细胞RNA测序、RT-qPCR、孟德尔随机化 NA 多组学数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 缺血性卒中患者和MCAO小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-03-31
AK5 suppresses breast cancer progression and modulates anti-PD-L1 efficacy via the miR-182-5p/PD-L1 axis
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文揭示了腺苷酸激酶5(AK5)在乳腺癌中的肿瘤抑制功能,并通过调控miR-182-5p/PD-L1轴影响抗PD-L1治疗的疗效 首次发现AK5作为新型肿瘤抑制因子,通过其激酶活性非经典地调控miR-182-5p成熟,进而影响PD-L1表达,为免疫治疗增敏提供了新靶点 NA 探究AK5在乳腺癌进展中的作用及其对抗PD-L1治疗疗效的调控机制 乳腺癌细胞及患者样本 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-03-31
SC-MO-GRN-DB: A comprehensive repository for single-cell multiomic gene regulatory networks
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 介绍了一个名为SC-MO-GRN-DB的公开数据库,该数据库整合了实验验证的基因调控网络和匹配的单细胞多组学数据集 开发了首个专注于单细胞多组学基因调控网络的综合数据库,涵盖多种分子模态和超过2200万条调控边 未明确提及数据库的更新频率、数据覆盖范围或潜在偏差 解决现有基因调控网络资源主要依赖转录组数据而忽视表观遗传机制的问题,为GRN推断方法的评估和改进提供平台 人类和小鼠组织中的基因调控网络及单细胞多组学数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序、染色质可及性测序、染色质免疫沉淀测序、DNA甲基化测序、染色质构象测序、基因扰动筛选 NA 单细胞多组学数据 超过200万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞ChIP-seq, 单细胞DNA甲基化测序, 单细胞Hi-C, 单细胞CRISPR-seq NA NA
6 2026-03-31
KRT15 identified by scRNA-Seq and machine learning as stemness regulator and prognostic biomarker in ESCC
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和机器学习识别KRT15作为食管鳞状细胞癌中的干细胞样亚群标志物,并验证其促进肿瘤进展和预后不良的作用 首次结合单细胞测序与机器学习算法筛选ESCC干细胞样亚群特异性标志物KRT15,并系统验证其功能调控作用及临床预后价值 研究未深入探讨KRT15调控干细胞特性的具体分子机制,且临床样本量有限 探究食管鳞状细胞癌中癌症干细胞异质性及关键分子机制,寻找预后生物标志物和治疗靶点 食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞及患者临床样本 机器学习 食管癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 机器学习算法 单细胞测序数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-03-31
Single-cell transcriptomic analyses reveal angiogenic vascular responses to chronic cerebral hypoperfusion
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠慢性脑低灌注模型中血管细胞(特别是尖端细胞)的转录组变化,并探讨了Apln/Aplnr信号通路在血管修复中的作用 识别出一种独特的血管内皮尖端细胞类型,并验证了Apln/Aplnr信号在促进血管生成和改善认知功能中的关键作用 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;且仅关注了42天后的时间点,缺乏更长期的动态观察 阐明慢性脑低灌注下血管损伤与修复的机制,为血管性认知障碍和痴呆(VD)的治疗提供新靶点 小鼠大脑组织(在不对称颈总动脉狭窄诱导的慢性脑低灌注42天后采集) 数字病理学 血管性认知障碍和痴呆 单细胞RNA测序,免疫染色,免疫印迹,细胞培养实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据,蛋白质数据 小鼠大脑组织(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-31
Valvular Leaflets Are Not Innocent Bystanders: Divergent Fibrotic Remodeling Accompanies Functional Mitral and Tricuspid Regurgitation
2026-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的机制,揭示了二尖瓣和三尖瓣反流的不同病理过程 首次系统比较功能性二尖瓣和三尖瓣反流中瓣叶特异性纤维化重塑机制,并识别出PDK4和IFN信号作为潜在治疗靶点 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅基于19个瓣叶样本,且动物模型可能无法完全模拟人类疾病 阐明功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的细胞机制和潜在治疗策略 心脏移植患者的功能性二尖瓣和三尖瓣反流瓣叶组织,以及原发性瓣膜内皮细胞和间质细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,组织病理学分析 NA RNA测序数据,组织图像数据 单细胞RNA测序:19个FVR瓣叶样本(FMR:8个,FTR:11个);bulk RNA测序:82个样本(FMR/FTR各41个) NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
9 2026-03-31
Glial Plasticity and Dysfunction: Mechanistic Insights and Therapeutic Opportunities in Neurodegeneration
2026-Apr, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
综述 本文综述了神经胶质细胞在神经退行性疾病中的多样生理病理作用及新兴治疗策略 整合单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像等先进技术,系统揭示胶质细胞的异质性、可塑性及其在神经退行性疾病中的双重角色,并评估基于胶质细胞可塑性的新兴治疗策略 面临细胞异质性、递送障碍和缺乏特异性生物标志物等临床转化挑战 探讨胶质细胞在神经退行性疾病中的作用机制及治疗潜力 星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和施万细胞等神经胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、多发性硬化症等神经退行性疾病 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-03-31
ZFP36L1 promotes non-small cell lung cancer progression under hypoxia by modulating CXCL9:SPP1 polarity: A single-cell transcriptomic study
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了ZFP36L1在缺氧条件下通过调节巨噬细胞CXCL9:SPP1极化促进非小细胞肺癌进展的机制 首次在单细胞水平上阐明ZFP36L1通过调控巨噬细胞极化影响NSCLC进展,并建立了从体外实验到患者来源类器官和体内小鼠模型的完整验证体系 研究主要聚焦于巨噬细胞极化机制,其他免疫细胞类型在缺氧微环境中的作用未充分探讨,且临床样本量有限 探究ZFP36L1在非小细胞肺癌进展中的分子机制及其与肿瘤微环境缺氧状态的关联 非小细胞肺癌细胞、巨噬细胞、患者来源类器官、ZFP36L1基因敲除小鼠模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光、流式细胞术、ELISA、双荧光素酶报告基因、ChIP、CCK-8、Transwell、克隆形成、划痕实验、H&E染色、EdU检测、CellTiter-Glo检测 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 未明确说明具体样本数量,但包含患者来源类器官和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-03-31
Identification of biomarkers associated with endoplasmic reticulum stress-related cell death in osteoporosis based on bulk and single-cell transcriptomic analyses and experimental validation
2026-Mar-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过批量与单细胞转录组分析结合实验验证,识别了与骨质疏松症中内质网应激相关细胞死亡相关的诊断生物标志物 结合批量转录组、单细胞RNA测序和实验验证,首次鉴定CAMKK2和DAPK3作为骨质疏松症的诊断生物标志物,并揭示了它们在骨髓间充质干细胞分化中的动态表达模式 研究依赖于公共数据集,样本量可能有限,且实验验证仅通过RT-qPCR进行,需要进一步的功能性实验确认生物标志物的机制 识别与骨质疏松症中内质网应激相关细胞死亡相关的诊断生物标志物,并探索其潜在机制 骨质疏松症患者和对照的基因表达数据,以及骨髓间充质干细胞 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序,批量转录组分析,RT-qPCR,机器学习 机器学习 转录组数据 多个公共数据集(GSE56815、GSE56814、GSE147287),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
12 2026-03-31
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用高分辨率空间转录组技术,解析了猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞分化及进入减数分裂的空间动态 首次应用空间转录组技术于猪早期性腺研究,揭示了细胞间空间定位与通讯机制,特别是BMP信号通路在生殖细胞发育中的关键作用 研究仅聚焦于猪模型,结果可能不完全适用于其他哺乳动物;空间转录组技术分辨率虽高,但可能无法捕获所有细胞亚型的细微差异 探究哺乳动物早期性腺发育中生殖细胞与体细胞间的空间通讯机制 猪雌性早期性腺组织,包括原始生殖细胞、性腺体细胞(如颗粒细胞、间质细胞、内皮细胞) 空间转录组学 NA 空间转录组测序 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但基于猪早期性腺组织 NA 空间转录组学 NA NA
13 2026-03-31
Defocus Coding and Transcriptomic Remodeling in the Mouse Myopic Retina
2026-Mar-30, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序技术,探索了小鼠近视视网膜中离焦编码和转录组重塑的机制 揭示了视网膜侧向抑制网络(特别是水平细胞而非AII无长突细胞)对光学离焦的响应,以及多巴胺能无长突细胞在聚焦图像中的最大兴奋作用,并首次在单细胞水平上展示了近视视网膜中GABA能突触和间隙连接通路的协调重塑 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类近视机制,且未涉及长期治疗干预效果 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号,并将其转化为调控眼轴生长的遗传信号 小鼠视网膜细胞,特别是水平细胞、AII无长突细胞和多巴胺能无长突细胞 数字病理学 近视 全细胞记录,单细胞RNA测序 NA 电生理记录数据,单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠视网膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-31
Non-neuronal sites of latency for alphaherpesviruses
2026-Mar-30, Journal of virology IF:4.0Q2
综述 本文综述了α疱疹病毒在神经元外细胞(如免疫细胞)中建立潜伏感染的新证据,并探讨了其在病毒发病机制中的潜在作用 提出了α疱疹病毒(如BoHV-1和HSV-1)的基因组可在扁桃体和淋巴组织等部位的免疫细胞亚群中持续存在并支持应激诱导的病毒再激活,挑战了传统认为潜伏感染仅限于感觉神经元的观点 在人类α疱疹病毒中,区分真正的‘潜伏感染’与流产性或持续性感染仍然具有挑战性 探讨α疱疹病毒在神经元外细胞中建立潜伏感染的证据及其在病毒潜伏、再激活和传播中的作用 α疱疹病毒亚科成员(如HSV-1、BoHV-1)及其在神经元和非神经元细胞(特别是免疫细胞)中的感染状态 NA 疱疹病毒感染 单细胞转录组学、空间分析 NA NA NA NA NA NA NA
15 2026-03-31
Astrocytes in neuroinflammation and brain cancer
2026-Mar-30, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文综述了星形胶质细胞在神经炎症和脑癌(特别是胶质瘤)进展中的主动调控作用,并提出了一个整合时空映射和液体活检的转化研究框架 提出了一个4D时空映射框架来重建星形胶质细胞轨迹,并引入了基于胶质液体活检的概念来分离肿瘤与星形胶质细胞来源的分析物 作为一篇综述,主要基于现有证据进行综合,未报告新的原始实验数据或临床验证结果 阐明星形胶质细胞在胶质瘤进展和神经炎症中的动态作用,并推动相关治疗策略的临床转化 星形胶质细胞及其在胶质瘤微环境中的状态转变 数字病理学 脑癌(胶质瘤) 单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 转录组数据、蛋白质数据、空间成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
16 2026-03-31
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组分析,识别了IGSF9作为早期肺腺癌的潜在诊断生物标志物和治疗靶点,并揭示了其在恶性转化中的多面性作用 首次将IGSF9识别为早期肺腺癌的诊断生物标志物,并利用单细胞RNA测序和多种分析技术(如细胞间通讯推断、拷贝数变异分析和伪时间轨迹重建)系统阐明了其在肿瘤微环境中的表达定位和功能机制 研究主要基于转录组数据,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来确认IGSF9的致癌机制 阐明早期肺腺癌的分子机制,并识别有效的早期检测生物标志物和治疗干预靶点 肺腺癌(LUAD),特别是早期阶段的肿瘤样本 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,随机森林,LASSO,拷贝数变异分析,伪时间轨迹重建 随机森林(RF),最小绝对收缩和选择算子(LASSO) 转录组数据,单细胞RNA测序数据 未在摘要中明确指定样本数量,但提及使用了独立外部数据集进行验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-31
SAA/FPR2 Signaling Between Pericentral Hepatocytes and Macrophages Exacerbates Zonated Liver Transplant Injury
2026-Mar-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学等技术,揭示了肝移植中FOXO1/SAA/FPR2信号轴在中央区肝细胞损伤中的关键作用 首次系统性地整合单细胞、空间转录组学、染色质可及性分析、蛋白质组学和bulk RNA-seq数据,揭示了肝移植损伤中中央区肝细胞与巨噬细胞间SAA/FPR2信号通路的区域特异性机制 研究主要基于小鼠模型和临床样本验证,人类样本的深入机制和长期疗效仍需进一步探索 阐明肝移植中中央区肝细胞选择性缺血再灌注损伤的分子机制 肝移植移植物、小鼠HIRI模型、临床LT样本、体外实验 数字病理学 肝移植损伤 单细胞转录组学, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 蛋白质组学, bulk RNA-seq NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 临床LT标本、小鼠HIRI模型和体外实验样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
18 2026-03-31
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化相互作用中的关键角色 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因,特别是AEBP1,并验证其在两种疾病中的上调表达 研究主要基于小鼠模型和人类样本的体外分析,临床转化和机制深入探讨仍需进一步研究 识别骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因和细胞机制 人类骨髓和颈动脉样本、自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导的小鼠模型 生物信息学 骨质疏松与动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描、免疫组化、免疫荧光、Von Kossa染色、RT-qPCR NA RNA测序数据、图像数据 人类骨髓和颈动脉样本(具体数量未明确)、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
19 2026-03-31
ACOT8-mediated palmitate accumulation promotes M1 macrophage polarization in renal ischemia-reperfusion injury via activation of the cGAS-STING pathway
2026-Mar-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了ACOT8通过调控棕榈酸积累,激活cGAS-STING通路,从而促进巨噬细胞M1极化,加剧肾缺血再灌注损伤的分子机制 整合多组学数据与多层次实验验证,首次阐明ACOT8通过调控脂质代谢(特别是棕榈酸)影响巨噬细胞极化的新机制,并利用肾脏特异性AAV9载体敲低ACOT8进行功能验证 研究主要在动物模型和体外细胞实验中进行,其临床转化潜力及在人类患者中的确切作用尚需进一步验证 探究ACOT8在肾缺血再灌注损伤中的作用及分子机制,寻找潜在治疗靶点 肾缺血再灌注损伤模型小鼠、肾小管上皮细胞、巨噬细胞 生物信息学与多组学整合分析 急性肾损伤 单细胞RNA测序、脂质组学、pQTL孟德尔随机化分析、机器学习算法(LASSO, SVM-RFE)、体内外实验验证 LASSO, SVM-RFE 转录组数据、单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 未明确说明具体样本数量,涉及多个转录组数据集、动物模型及体外细胞实验 NA 单细胞RNA-seq, 脂质组学 NA NA
20 2026-03-31
Liver Sinusoidal Endothelial Cells and Laminin dictate cholangiocytes' fate in chronic liver disease
2026-Mar-27, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究揭示了在慢性肝病中,毛细血管化的CD34+肝窦内皮细胞通过维持层粘连蛋白沉积来限制胆管反应细胞向肝细胞分化的机制 首次识别出层粘连蛋白包围的胆管反应细胞亚群,并阐明CD34+肝窦内皮细胞通过调控层粘连蛋白影响胆管反应细胞命运的微环境机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;DR来源的肝细胞对整体肝再生的贡献程度仍需进一步量化 探究慢性肝病中胆管反应细胞向肝细胞分化的微环境调控机制 小鼠慢性肝损伤模型、人类肝病组织样本、胆管反应细胞、肝窦内皮细胞 数字病理学 慢性肝病 免疫组织化学、流式细胞术、RT-qPCR、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 组织图像、基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型及人类肝病组织样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA RESOLVE分子图谱技术用于空间转录组分析
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