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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Integrated multi-omics analysis identifies prognostic risk genes and constructs a predictive signature in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2026.2700818
PMID:42420780
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后风险基因并构建预测模型 | 首次结合eQTL-MR分析、单细胞RNA测序和免疫浸润分析,系统鉴定出15个与DLBCL发病和预后相关的风险基因并构建预测模型 | 未说明具体局限性 | 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤的潜在致病基因并构建预后预测模型 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 | 计算机视觉 | 淋巴瘤 | eQTL-MR分析, 单细胞RNA测序, GO/KEGG富集分析, 免疫浸润分析, 药物敏感性分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-07-10 |
POU2F2 as a dual oncogenic and immunomodulatory driver in kidney renal clear cell carcinoma
2026-Dec, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2026.2700062
PMID:42421306
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研究论文 | 探讨POU2F2在肾透明细胞癌中的致癌和免疫调节作用 | 首次揭示POU2F2在肾透明细胞癌中兼具致癌和免疫调节双重功能,特别是通过影响巨噬细胞极化来调控肿瘤微环境 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本量未提及 | 研究转录因子POU2F2在肾透明细胞癌发生发展及肿瘤微环境免疫调节中的作用 | 肾透明细胞癌细胞系及肿瘤样本 | 自然语言处理 | 肾透明细胞癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、共培养实验 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-10 |
Mitochondria-related pathogenic genes in acute and chronic kidney disease: a Mendelian randomization study
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2698274
PMID:42421394
|
研究论文 | 利用基于汇总数据的孟德尔随机化方法探究线粒体相关基因与急性肾损伤和慢性肾病的潜在关联 | 首次通过SMR方法结合多组学数据(DNA甲基化、基因表达、蛋白表达)系统评估线粒体相关基因与AKI和CKD的因果关系 | 未明确说明,可能包括样本来源局限(主要为美国退伍军人)和效应量较小(如CKD保护基因OR 0.95) | 利用SMR方法识别与急性肾损伤(AKI)和慢性肾病(CKD)相关的线粒体致病基因 | 线粒体相关基因(来自MitoCarta3.0数据库)及其多组学定量性状位点(mQTL、eQTL、pQTL) | 机器学习 | 肾脏疾病(急性肾损伤、慢性肾病) | NA | NA | 基因表达、甲基化、蛋白表达数据 | 美国百万退伍军人项目(发现数据集)和英国生物样本库(验证数据集)的汇总统计数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-07-10 |
Immune regulatory mechanisms and potential microbiota-associated targets in Kawasaki disease: an integrative multi-omics and network pharmacology study
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2700919
PMID:42422999
|
研究论文 | 该研究采用整合多组学策略,系统调查川崎病中肠道微生物群-代谢物相互作用,并识别关键分子靶点 | 首次整合多组学分析、网络药理学和孟德尔随机化,揭示肠道微生物群-代谢物-SELP轴作为川崎病潜在治疗靶点 | 研究仍处于初步阶段,未明确提及具体限制信息 | 探索川崎病中肠道微生物群在免疫调节和炎症反应中的作用机制,并确定潜在干预靶点 | 川崎病患者的肠道微生物群、代谢物及免疫细胞相互作用 | 机器学习 | 川崎病 | 多组学分析、网络药理学、孟德尔随机化、单细胞转录组学、分子对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据、微生物组数据、代谢组数据 | 未在标题和摘要中说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-07-10 |
Integrative genomic characterization of the FADS1-2-3 mood disorder risk locus: implications for the role of polyunsaturated fatty acids
2026-Nov-01, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.122140
PMID:42309192
|
研究论文 | 对FADS1-2-3情绪障碍风险位点进行整合基因组特征分析,探讨多不饱和脂肪酸在其中的作用 | 通过整合遗传共定位分析、跨群体变异注释及单细胞RNA-seq数据,优先将FADS1而非FADS2或FADS3确定为最可能的效应基因,并发现TMEM258和MYRF作为替代效应基因涉及N-糖基化和轴突髓鞘化等新型机制 | 未来需要采用正交方法进一步验证该位点中潜在的水平多效性来源 | 解析FADS1-2-3基因簇与情绪障碍(双相情感障碍和重度抑郁症)之间的遗传风险关联及潜在效应基因 | FADS1-2-3情绪障碍风险位点及相关遗传变异 | 自然语言处理 | 情绪障碍(双相情感障碍、重度抑郁症) | 全基因组关联研究、cis-eQTL分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因型数据、表达数量性状位点数据 | 最大样本量达400万人的GWAS摘要统计数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-07-10 |
Vesicular QSOX1-MMP2 from inflammatory cancer-associated fibroblasts degrades the extracellular matrix to drive colorectal cancer pulmonary dissemination
2026-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218645
PMID:42217558
|
研究论文 | 本研究揭示炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡携带QSOX1-MMP2复合物降解细胞外基质,驱动结直肠癌肺转移 | 首次发现炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡中QSOX1选择性富集,并能与MMP2结合促进其分泌和活性,从而重塑转移微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限,且QSOX1抑制剂Ebselen的安全性需进一步评估 | 阐明结直肠癌肺转移中基质细胞介导的转移定植机制,并探索靶向QSOX1的治疗策略 | 结直肠癌肺转移小鼠模型中的炎性癌相关成纤维细胞及其分泌的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 结直肠癌肺转移小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 7 | 2026-07-10 |
A multiperspective evaluation framework of spatial transcriptomics clustering methods
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag075
PMID:42421749
|
研究论文 | 提出一个多视角评估框架,用于系统评价空间转录组聚类方法 | 整合了前沿和传统的标签依赖与标签无关指标,提供统一灵活的评价策略,能够同时评估转录组和空间信息的整合效果 | 依赖合成数据集和现有数据集,可能无法涵盖所有实际应用场景,标签无关指标仍难以完全反映空间聚类方法的全部特征 | 开发统一框架以克服现有评估方法的局限性,实现空间转录组聚类方法的全方位、可重复评估 | 十一种深度学习空间域识别方法,在合成数据集和七种空间转录组技术所生成的十三个数据集上的表现 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 两个合成数据集和十三个来自七种空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-10 |
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-Aug, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.104089
PMID:42162633
|
research paper | 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境,解释利妥昔单抗临床悖论 | 提出类风湿关节炎治疗无需完全系统性B细胞清除,通过单细胞转录组学与纵向数据整合揭示“不完全耗竭”在维持组织免疫安全边际中的作用 | NA | 解释利妥昔单抗在类风湿关节炎中临床疗效与B细胞耗竭深度不一致的悖论,并提出未来治疗范式 | 类风湿关节炎患者及滑膜组织中的致病性B细胞-成纤维细胞相互作用 | machine learning, digital pathology | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、纵向临床数据 | 来自REDO试验的纵向数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-07-10 |
In vivo engineering tumor cells to a universal "all-in-one" cancer vaccine with full antigen spectrum
2026-Jul-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee5201
PMID:42418568
|
研究论文 | 开发了一种通用型“一体化”癌细胞衍生疫苗UniCVac,通过体内编程肿瘤细胞为抗原呈递细胞,实现全面抗原谱覆盖和T细胞直接激活 | 首次通过共递送CIITA、NLRC5、CD80和IL-2将肿瘤细胞编程为专业抗原呈递细胞,实现同时提供HLA-I和HLA-II抗原呈递、共刺激和T细胞增殖信号,并且不依赖传统抗原呈递细胞直接激活CD4和CD8 T细胞 | 研究中仅使用了小鼠模型,尚需在人类临床样本和临床试验中验证其有效性和安全性 | 开发一种通用型癌症疫苗,克服现有疫苗抗原覆盖有限、抗原呈递不足和免疫抑制微环境等挑战 | 肿瘤细胞、T细胞、小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 癌症(肿瘤) | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的预防性和治疗性肿瘤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 通过单细胞转录组分析验证免疫细胞亚型相似性 |
| 10 | 2026-07-10 |
VCAM-1-targeting peptide assemblies protect vascular endothelium and prolong cardiac xenograft survival
2026-Jul-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec5707
PMID:42418593
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序,识别出VCAM-1内皮细胞亚群是心脏异种移植急性排斥的主要靶点,并开发了靶向VCAM-1的纳米颗粒,显著延长了异种移植物的存活时间 | 首次在猪到灵长类异种移植模型中通过单细胞RNA测序鉴定VCAM-1内皮细胞亚群为急性排斥关键亚型,并开发了整合VCAM-1靶向肽、自组装纳米纤维涂层和免疫抑制药物递送的多功能纳米颗粒 | 未在文中明确指出局限性,但可能包括研究仅基于猪到灵长类模型、样本量有限、长期效果和安全性需进一步验证 | 保护血管内皮细胞并延长心脏异种移植物的存活时间 | 猪到灵长类异种移植模型中的心脏内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量,但涉及猪到灵长类异种移植模型 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 11 | 2026-07-10 |
FLT3-ITD scaffolds PKCι-STAT1 to drive noncanonical S727 phosphorylation and CD276-driven CD8+ T-cell exhaustion in AML
2026-Jul-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032254
PMID:41878790
|
研究论文 | 本研究揭示FLT3-ITD通过支架PKCι-STAT1复合物驱动非经典S727磷酸化,上调CD276表达,导致AML中CD8+ T细胞耗竭 | 首次发现FLT3-ITD作为一种突变特异性支架蛋白,组装PKCι-STAT1三元复合物,介导STAT1 S727磷酸化而非经典Y701位点,驱动CD276转录,阐明其激酶非依赖性免疫抑制机制 | 研究主要基于体外和异种移植模型,临床样本验证规模有限(104例),且未深入探索其他可能的免疫调节机制 | 阐明FLT3-ITD在急性髓系白血病中激酶非依赖性免疫抑制机制 | FLT3-ITD突变的急性髓系白血病患者样本、CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、免疫共沉淀、染色质免疫沉淀、电泳迁移率变动分析、报告基因实验、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据 | 104例原发性患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-07-10 |
T cell transfer into immunodeficient mice uncovers a paralytic phenotype beyond colitis
2026-Jul-09, Experimental animals
IF:2.2Q1
DOI:10.1538/expanim.26-0035
PMID:42419956
|
研究论文 | 将CD45RB T细胞过继转移至免疫缺陷小鼠后,意外发现部分小鼠出现类似实验性自身免疫性脑脊髓炎的麻痹表型,而非仅结肠炎 | 首次报道T细胞过继转移模型中出现麻痹表型,揭示ex-Th17细胞在结肠炎和中枢神经系统自身免疫中的共同作用,并建立此模型为研究组织特异性自身免疫病理的平台 | 未明确列出,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、机制研究的深度有限 | 探究T细胞过继转移诱导的结肠炎模型中意外出现的麻痹表型及其与中枢神经系统自身免疫的关联 | 免疫缺陷小鼠(如Rag-/-小鼠)以及克罗恩病和多发性硬化症患者的结肠和脑脊液样本 | 免疫学 | 炎症性肠病、多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞RNA-seq) | 涉及小鼠实验及克罗恩病患者结肠样本、多发性硬化症患者脑脊液样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-07-10 |
Integrative bulk and single-cell analyses implicate ASL in MIF-associated myeloid programs in glioblastoma
2026-Jul-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01973-2
PMID:42420626
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研究论文 | 通过整合性批量与单细胞分析,揭示ASL在胶质母细胞瘤中与MIF相关髓系免疫程序的关系 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,系统鉴定ASL作为精氨酸代谢相关预后基因,并明确其在胶质母细胞瘤高危分子亚型(如IDH野生型和1p/19q非共缺失)中的作用,特别关联肿瘤微环境中的髓系免疫程序 | 研究主要基于公共数据库(TCGA、CGGA、GEO)和少量单细胞样本(5个),可能限制结果的普适性;ASL的具体功能机制和因果关系需进一步实验验证 | 阐明胶质母细胞瘤中精氨酸代谢相关基因的预后价值及其细胞特异性作用,尤其关注髓系细胞的免疫调节功能 | 胶质母细胞瘤患者的批量转录组数据(TCGA、CGGA、GEO)和单细胞RNA测序数据(5个样本) | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA胶质母细胞瘤批量数据(样本数未明确);5个胶质母细胞瘤样本用于单细胞RNA测序,获得38,263个高质量细胞 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-07-10 |
PAPSS2-mediated BMPR1A sulfation in stromal cells regulating endometrial decidualization via autophagy
2026-Jul-09, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag103
PMID:42421304
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研究论文 | 该论文研究了PAPSS2介导的BMPR1A硫酸化通过自噬调控子宫内膜间质细胞蜕膜化的机制 | 首次揭示了PAPSS2-BMPR1A硫酸化轴通过调控BMP2/SMAD信号和自噬稳态来微调蜕膜化这一先前未被识别的机制 | 需要更大样本量的进一步研究以确认体内相关性 | 阐明PAPSS2介导的硫酸化在复发性植入失败患者蜕膜化缺陷中的作用及机制 | 复发性植入失败患者和生育能力正常对照者的分泌中期子宫内膜组织,以及永生化人子宫内膜间质细胞和原代人子宫内膜间质细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 复发性植入失败患者和生育能力正常对照者的子宫内膜组织样本(具体数量未详述) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-07-10 |
Neutrophils Orchestrate Osteoclastogenesis in Orthodontic Tooth Movement
2026-Jul-09, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345261459909
PMID:42421520
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞在正畸牙移动中通过TNF-TNFR2轴调控巨噬细胞招募和破骨细胞生成的关键作用 | 首次在无菌性炎症环境中系统阐明中性粒细胞通过TNF-TNFR2信号轴调控巨噬细胞进而驱动破骨细胞生成的新机制,发现特定中性粒细胞亚群“Inflammatory-Neu”的扩增及功能 | 研究基于小鼠模型,结果向临床转化需进一步验证;未深入探讨中性粒细胞与其他免疫细胞类型的交互作用 | 阐明中性粒细胞在正畸牙移动中促进骨吸收的分子机制 | 正畸牙移动小鼠模型中的牙周膜组织、中性粒细胞、巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析, 伪时间分析, 细胞互作分析, 中性粒细胞体内耗竭 | 伪时间分析, CellChat互作分析 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 小鼠模型(未提供具体样本数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 16 | 2026-07-10 |
Structural-information Guided Fusion for spatial domain identification from Spatial Transcriptomics
2026-Jul-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag508
PMID:42423290
|
研究论文 | 提出了一种名为SGFST的框架,通过整合空间图和信号图,并利用双分支图卷积网络与注意力融合,从空间转录组数据中识别空间域 | 首次将空间图与信号图融合,并通过双分支图卷积网络和注意力机制捕捉互补的空间和功能信息,同时联合优化贝叶斯个性化排序损失、零膨胀负二项损失和距离结构信息约束,以保留局部邻域连续性和全局拓扑一致性 | 未明确提及,但可能依赖于高质量的空间转录组数据,且对大规模数据集的扩展性有待验证 | 从空间转录组数据中准确识别空间域,以理解组织结构和病理机制 | 空间转录组数据集中的空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 (GCN) | 空间转录组数据 | 多个数据集(未具体说明数量) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-07-10 |
Identification of ZNF469 as a potential biomarker and therapeutic target for gastric cancer through integrated multi dataset analysis
2026-Jul-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05297-2
PMID:42423853
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-07-10 |
LY6D identifies persistent stem-like cells driving pancreatic tumourigenesis
2026-Jul-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336460
PMID:41545197
|
研究论文 | 本研究鉴定LY6D为胰腺导管腺癌中一种持久存在的干细胞样细胞状态标志物,并揭示其驱动肿瘤发生的机制 | 首次发现LY6D作为胰腺癌早期异质性中胃样细胞状态的标志物,并证明其通过GPI锚定蛋白支架脂筏相关激酶网络驱动FOSL1依赖性表观遗传转录重编程 | 未明确说明研究限制,但可能包括动物模型与人类疾病的差异以及样本量限制 | 鉴定并功能表征胰腺癌早期细胞异质性中的关键癌前细胞状态,为早期干预提供新生物标志物和靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的癌前细胞状态 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, TurboID邻近蛋白质组学, 表观遗传分析, 代谢分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共和内部单细胞RNA测序数据,以及人类PDAC队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-07-10 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals hepatocyte reprogramming in Fontan-associated liver disease
2026-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198823
PMID:41734025
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学揭示Fontan相关性肝病中肝细胞重编程机制 | 首次利用CosMx空间分子成像技术对6000个基因进行原位杂交,在单细胞水平解析FALD肝组织空间转录组,发现晚期纤维化中肝细胞中带扩张及应激诱导的区带模糊表型,并揭示异位WNT2信号驱动肝细胞区带紊乱 | 早期和晚期纤维化样本各仅1例用于空间转录组检测,样本量极小可能限制结果普适性;验证实验基于18例额外组织但仅通过免疫荧光确认蛋白表达,缺乏功能性实验验证 | 阐明Fontan相关性肝病进展的病理生理机制,特别是肝细胞区带重编程与疾病严重程度的关系 | Fontan术后的单心室患者肝组织标本 | 数字病理学 | Fontan相关性肝病 | 空间转录组学,原位杂交,免疫荧光 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 2例肝组织用于空间转录组(早期纤维化1例、晚期纤维化1例),18例额外组织用于免疫荧光验证 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx空间分子成像系统 | CosMx空间分子成像结合6000基因原位杂交 |
| 20 | 2026-07-10 |
Macrophage signaling associates with fibrogenic program activation in periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2026-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199226
PMID:42024458
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、RNA测序和蛋白质组学,研究小儿原发性硬化性胆管炎中巨噬细胞信号与导管周成纤维细胞纤维化程序激活的关联 | 首次采用多组学方法(空间转录组学、RNA-Seq和蛋白质组学)揭示小儿PSC纤维化导管周区域的巨噬细胞-肝星状细胞互作及17个巨噬细胞纤维化驱动基因 | 基于小儿样本,结果可能无法直接推广至成人PSC;未进行功能性验证实验 | 阐明小儿PSC中导管周纤维化的细胞间通信机制 | 小儿原发性硬化性胆管炎患者的肝脏组织及血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学, RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, RNA测序数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 包含PSC患者(早期和纤维化期)及健康对照的肝脏活检和血浆样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |