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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-04-08
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构,特别是免疫浸润特征和T/B细胞聚集体的细胞构成 首次在儿童AML中发现约三分之一病例存在免疫浸润的骨髓微环境,并识别出大型T细胞网络及富含T/B细胞的免疫聚集热点 研究样本量有限,且主要基于观察性分析,未深入验证免疫聚集体的功能机制 解析儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成与空间结构,为免疫治疗提供新见解 儿童急性髓系白血病患者及非白血病对照的骨髓样本 数字病理学 急性髓系白血病 空间转录组学 NA 空间转录组数据、免疫表型数据 儿童AML病例及非白血病对照(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
2 2026-04-08
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前列腺癌进展中肿瘤微环境内间充质细胞的分子变化及其关键作用 首次通过跨物种(小鼠模型与人类肿瘤)单细胞分析,系统鉴定了八个保守的间充质细胞亚群,并发现骨转移相关基质特征,提出了超越Gleason评分的新型预后基因标志物 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨间充质细胞与其他肿瘤微环境成分的动态互作机制 解析前列腺癌进展过程中肿瘤基质细胞的分子特征与功能作用 前列腺癌肿瘤微环境中的间充质细胞 单细胞组学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 四种基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-04-08
An Integrated Map of Cell Type-Specific Gene Expression in Pancreatic Islets
2023-11-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序构建了一个胰腺胰岛细胞类型特异性基因表达的综合图谱,涵盖多种疾病状态 首次整合了来自65名供体的192,203个细胞的单细胞RNA测序数据,创建了一个易于查询和用于生物信息学流程的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖其他组学层面(如蛋白质组学或表观遗传学)的信息,且样本来源和数量可能限制某些罕见细胞类型的全面表征 构建一个全面的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱,以促进胰岛生物学研究和糖尿病相关疾病的理解 来自无糖尿病、1型糖尿病自身抗体阳性、1型糖尿病和2型糖尿病供体的胰腺胰岛细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 192,203个细胞,来自65名供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-04-08
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
研究论文 本研究通过多组学方法探讨肥胖如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的细胞功能和化疗耐药性 首次结合单细胞和批量转录组学、代谢组学及蛋白质组学分析,揭示脂肪细胞分泌组对B-ALL细胞的代谢、氧化应激保护、生存和化疗耐药性的调控作用,并发现肥胖相关的B细胞特异性转录特征与患者生存结局相关 研究主要基于体外和动物模型,人类样本分析可能受限于样本数量和异质性,且未详细探讨肥胖与B-ALL之间的因果关系机制 探究肥胖如何通过脂肪细胞影响B-ALL细胞的生物学功能及化疗耐药性,以识别潜在的治疗靶点 正常和恶性B细胞、小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的血清和血浆样本 数字病理学 B细胞急性淋巴细胞白血病 RNA测序(单细胞和批量转录组学)、质谱分析(代谢组学和蛋白质组学) NA 转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 涉及小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 NA NA
5 2026-04-08
Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2023-01-16, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与多组学数据,揭示了SERPINE2作为晚期肾细胞癌转移的潜在治疗靶点 首次在晚期肾细胞癌中整合单细胞转录组、Hi-C、ATAC-seq和RNA-seq多组学数据,系统解析了恶性细胞与肿瘤微环境的相互作用,并鉴定出SERPINE2作为关键转移驱动因子 样本量相对有限(8例患者组织样本),主要基于细胞系验证,需要在更大规模临床队列中进一步验证 揭示晚期肾细胞癌进展中基因组、转录组和表观遗传改变的机制,并寻找转移治疗靶点 肾细胞癌患者组织样本、Caki-1肾癌细胞系、HK-2人肾小管上皮细胞系 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, Hi-C, ATAC-seq, RNA测序, 微阵列, 组织芯片 非负矩阵分解 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 三维基因组数据, 批量转录组数据 8例RCC患者组织样本(含2对原发-转移匹配样本), 407例RCC患者微阵列数据, 两个组织芯片队列(TMA-30和TMA-2020) NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq NA NA
6 2026-04-08
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过多模态方法研究了非洲爪蟾附肢再生过程中的代谢重编程,发现再生组织通过增强戊糖磷酸途径(PPP)通量来支持细胞增殖和再生 揭示了再生过程中葡萄糖代谢从糖酵解转向戊糖磷酸途径(PPP)的关键代谢重编程机制,并利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)证实了高增殖细胞中PPP酶转录上调 研究主要基于非洲爪蟾模型,结果在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证,且未深入探讨PPP调控的具体分子机制 探究再生过程中支持快速组织生长的代谢途径 非洲爪蟾(Xenopus tropicalis)的附肢再生组织 代谢组学与再生生物学 NA 液相色谱-质谱联用(LC-MS)代谢物分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 代谢物数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-04-08
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文介绍了Uphyloplot2,一个用于从单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息生成系统发育图的Python脚本工具 开发了一个自动化工具,直接从RNA-seq推断数据或Newick格式的树文件生成系统发育图,简化了肿瘤克隆性可视化的流程 工具依赖于外部CNV推断工具(如inferCNV、CaSpER、HoneyBADGER)的准确性,且未在多种肿瘤类型或大规模数据集上进行广泛验证 开发一个可视化工具,用于从单细胞RNA-seq数据中推断的染色体拷贝数变异(CNV)信息生成系统发育图,以展示肿瘤克隆性 单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息或Newick格式的树文件 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA-seq(scRNA-seq)、染色体拷贝数变异(CNV)推断 NA 基因表达数据、CNV推断数据、树文件 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-04-08
Genetic pathways regulating hematopoietic lineage speciation: Factorial latent variable model analysis of single cell transcriptome
2021-Jun, Data in brief IF:1.0Q3
研究论文 本研究应用因子单细胞潜变量模型分析小鼠造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组数据,以解析造血谱系分化的遗传调控通路 首次采用因子单细胞潜变量模型分解单细胞转录组异质性为可解释的生物学因子,动态揭示细胞命运调控机制 研究仅基于12周龄雌性小鼠的造血干细胞和祖细胞数据,样本来源和年龄性别范围有限 解析稳态造血过程中调控细胞谱系分化的遗传通路 小鼠造血干细胞和祖细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 因子单细胞潜变量模型 单细胞转录组测序数据 1,920个造血干细胞和祖细胞,来自12周龄雌性小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-04-08
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle IF:5.3Q2
研究论文 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法,以分析小鼠快肌纤维的基因表达模式 首次应用全细胞流式分选方法对单一肌肉类型(小鼠快肌屈趾短肌)进行单细胞RNA测序,而非基于单核RNA,扩展了纤维类型特异性基因的已知库 在763个肌纤维中,仅有171个细胞达到质量控制最优标准,样本利用率较低,可能影响统计效力 探索全细胞流式分选方法在单一肌肉类型单细胞RNA测序中的应用,以生成深度表达谱并识别纤维类型特异性基因 小鼠快肌屈趾短肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式分选 NA RNA测序数据 763个完整和碎片化肌纤维,其中171个通过质量控制 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-04-08
Ribonucleotide reductase small subunit M2 is a master driver of aggressive prostate cancer
2020-08, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本文探讨了核糖核苷酸还原酶小亚基M2(RRM2)在驱动侵袭性前列腺癌亚型中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 首次将RRM2特征与PCS和PAM50分子分类系统整合,识别出侵袭性前列腺癌亚型,并揭示了RRM2在免疫逃逸和恩杂鲁胺耐药中的新作用 研究主要基于已发表的队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且单细胞RNA-seq数据集样本来源有限 确定RRM2特征是否能用于识别侵袭性前列腺癌亚型,并评估其临床意义 前列腺癌细胞及来自六个已发表队列的4000例前列腺癌病例 生物信息学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体和通路分析, CIBERSORT分析 NA RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 六个已发表队列共4000例前列腺癌病例 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-04-08
Selective LXR agonist DMHCA corrects retinal and bone marrow dysfunction in type 2 diabetes
2020-07-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了选择性LXR激动剂DMHCA在2型糖尿病小鼠模型和人类循环血管生成细胞中纠正视网膜和骨髓功能障碍的作用及分子机制 首次采用单细胞RNA测序技术分析糖尿病小鼠造血干细胞,揭示了DMHCA通过减少髓系分化、增加循环血管生成细胞和红细胞祖细胞来纠正糖尿病造血干细胞功能障碍的新机制 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在人体临床试验中验证DMHCA的疗效和安全性 探究DMHCA对2型糖尿病引起的视网膜和骨髓病理改变的改善作用及其分子机制 2型糖尿病(db/db)小鼠、人类循环血管生成细胞(CACs)、小鼠造血干细胞(HSCs) 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用糖尿病小鼠和人类CACs NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-04-07
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在胰腺导管腺癌(PDAC)中用于解析肿瘤内异质性、微环境成分及动态细胞相互作用的应用 系统总结了scRNA-seq在PDAC研究中的工作流程、数据分析方法及其在识别细胞亚群转化、生物标志物和治疗靶点方面的创新应用 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要依赖现有文献总结,可能未涵盖所有最新技术进展 探讨scRNA-seq技术如何帮助理解PDAC的肿瘤内异质性、微环境动态及潜在治疗策略 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤细胞、微环境成分(如免疫细胞、癌症相关成纤维细胞)及相关生物标志物 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-04-07
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 首次应用空间转录组学技术分析腺样基底癌、过渡巢、鳞状细胞癌和高级别鳞状上皮内病变之间的分子差异,并识别出区分过渡巢的关键基因CK13和SCCA2 样本量有限(仅4例用于空间转录组分析),未来需要更大规模的研究来指导临床决策 阐明腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系,为治疗策略提供指导 子宫颈腺样基底癌及其伴随的鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 数字病理学 子宫颈癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织图像 20例腺样基底癌病例,其中4例用于空间转录组分析 NA 空间转录组学 NA NA
14 2026-04-07
The immune-metabolism interactome in efferocytosis: a new paradigm for the central nervous system diseases revealed by single-cell sequencing analysis
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
综述 本文综述了胞葬作用在维持中枢神经系统稳态中的基本过程、免疫-代谢交互作用及其调控,并基于单细胞测序分析探讨了其在多种中枢神经系统疾病中的关键作用 提出了免疫-代谢相互作用组在胞葬作用中的新范式,并利用单细胞测序分析揭示了小胶质细胞在胞葬过程中的异质性 NA 总结胞葬作用在中枢神经系统发育、衰老及疾病中的作用,并探讨其潜在治疗策略 小胶质细胞、中枢神经系统疾病(如脑缺血、脑出血、创伤性脑损伤、重度抑郁症、多形性胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、帕金森病等) 数字病理学 老年性疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-04-07
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用Xenium空间转录组学技术,比较了难治/复发性和治疗敏感的血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤样本,揭示了肿瘤微环境的异质性并鉴定出与预后相关的新型Tfh细胞亚群 首次在AITL中鉴定出具有干细胞样特征的NEIL3+ Tfh细胞亚群,并系统描绘了难治/复发与治疗敏感病例间肿瘤微环境免疫细胞组成的空间分布差异 样本量较小(10例临床样本),且为观察性研究,需要更大规模队列和功能实验验证 解析血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质性及其与治疗抵抗的关联 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤患者的临床组织样本 空间转录组学 淋巴瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 10例临床样本(包括难治/复发和治疗敏感病例) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组分析平台
16 2026-04-07
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2026-Apr, Global spine journal IF:2.6Q1
研究论文 本研究探讨了芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中通过调节小胶质细胞和PI3K/AKT及NF-κB信号通路减轻神经炎症和神经元凋亡的神经保护机制 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法,揭示了芦丁和欧查黄酮协同抑制小胶质细胞激活及下游信号通路的分子机制,为脊髓损伤提供了一种新的联合治疗策略 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床中进行验证,且具体剂量和长期安全性需进一步评估 阐明芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中的神经保护作用机制,特别是对次级损伤过程的调控 脊髓损伤小鼠模型、LPS刺激的BV2小胶质细胞、小胶质细胞-神经元共培养系统 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序、网络药理学、Western blotting、免疫荧光、ELISA NA 基因表达数据、蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-04-07
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2026-Apr, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本文提出了一种基于重组HUH-核酸内切酶-凝集素标记(HEATag)的通用且成本效益高的样本标记方法,用于多重单细胞RNA测序 结合鸭圆环病毒HUH核酸内切酶(DCV)和小麦胚芽凝集素(WGA),开发了一种新型通用细胞膜标记方法,实现了快速、序列特异性的索引单链DNA标记,且适用于新鲜或固定细胞及多种物种 NA 解决单细胞转录组学中多重样本标记方法成本高或操作复杂的问题,以降低单细胞测序的每样本成本 细胞膜(适用于新鲜或固定细胞及多种物种) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 兼容商业平台和定制系统,可适配多种单细胞组学工作流程
18 2026-04-07
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-Apr, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学数据、临床验证和空间分析,揭示了NNT作为肥胖相关结直肠癌预后生物标志物的潜力 结合多模态分子和空间分析,首次将NNT鉴定为肥胖相关结直肠癌的预后生物标志物,并揭示了其与肿瘤微环境的关联 研究依赖于现有数据集和独立队列验证,可能存在样本选择偏差,且空间分析仅限于GeoMx DSP平台 识别反映肥胖相关肿瘤特征的分子生物标志物并分层患者预后 结直肠癌患者样本,包括正常、健康体重和肥胖个体 数字病理学 结直肠癌 转录组学分析、免疫组织化学、空间转录组学 NA 转录组数据、临床数据、空间转录组数据 TCGA-COADREAD数据集和独立验证队列 NanoString 空间转录组学 GeoMx DSP GeoMx数字空间分析仪
19 2026-04-07
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究全面表征了慢性鼻窦炎(CRS)中胞葬作用的缺陷,并探讨了其与炎症内型及临床结局的关联 首次在单细胞分辨率下系统揭示了CRS中胞葬作用的广泛缺陷,并识别出与疾病复发相关的5分子特征预测面板 研究主要基于组织样本分析,缺乏体内功能验证实验 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎(特别是伴鼻息肉型)中的作用机制及其临床意义 慢性鼻窦炎(CRS)患者,特别是伴鼻息肉型(CRSwNP)的鼻息肉组织与健康鼻黏膜 数字病理学 慢性鼻窦炎 定量实时PCR、免疫组织化学、单细胞RNA测序 回归模型、受试者工作特征分析 基因表达数据、组织图像数据 未明确样本数量,涉及CRS患者与健康对照的鼻组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-04-07
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析和小鼠视网膜外植体实验,探讨了内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性表达 首次在单细胞水平上系统描绘了人视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达图谱,并利用芳香化酶抑制剂验证了局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的功能相关性 研究主要基于小鼠视网膜外植体模型,可能无法完全模拟人视网膜的生理环境;且实验仅使用单一浓度(20 μM)的来曲唑进行抑制,缺乏剂量依赖性验证 探究内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性功能 人视网膜单细胞RNA测序数据和小鼠视网膜外植体 数字病理学 视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 基于公开数据集E-MTAB-7316,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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