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当前共找到 43363 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-18 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过对正常和cSCC人类皮肤组织的单细胞测序数据进行假体分析，并结合体外和体内CRISPR干扰筛选，鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的关键长链非编码RNA | 首次通过体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序假体分析，系统性揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用，并验证了LINC00704和LINC01116作为cSCC生长调控因子和潜在生物标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用和机制 | 正常和cSCC人类皮肤组织中的角质形成细胞亚群及cSCC细胞系 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, CRISPR干扰筛选 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-18 |
Unraveling the Role of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from the Crosstalk between Immunometabolism and Ferroptosis
2026, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析，揭示了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞在免疫代谢与铁死亡交叉对话中的作用 | 首次从免疫代谢与铁死亡交叉对话的角度，结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，系统揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的保护性机制，并鉴定出八个关键因果基因 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量有限；未进行体内外功能实验证实关键基因的具体机制 | 探究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，特别是免疫代谢与铁死亡交叉对话相关的分子通路 | 阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 文本, 基因表达数据 | 来自GEO数据库的阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-18 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学表征低危骨髓增生异常综合征（LR-MDS）中造血干祖细胞至髓系分化谱系的细胞状态，并开发了一个30基因评分来区分LR-MDS HSPC与健康HSPC。 | 开发了一个30基因评分来分类LR-MDS HSPC，并识别了LR-MDS的新分子特征，提示囊泡运输功能障碍。 | 摘要中未提及 | 表征LR-MDS中HSPC-髓系分化景观的细胞状态，并发现LR-MDS病理生理学的转化靶点。 | 低危骨髓增生异常综合征（LR-MDS）患者的造血干祖细胞（HSPC）和髓系分化细胞。 | 单细胞转录组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-18 |
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Nov-18, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖途径促进成纤维细胞向脂肪细胞转化，导致梗死心脏脂肪浸润的分子机制 | 首次揭示成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖级联介导成纤维细胞向脂肪细胞的转化，阐明了梗死后脂肪性化生的细胞机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅限于单细胞RNA测序分析，缺乏直接的功能性验证实验 | 探究心肌梗死后脂肪性化生的细胞机制，特别是成纤维细胞向脂肪细胞转化的分子通路 | 小鼠心脏成纤维细胞、心肌梗死小鼠模型、人类心肌梗死患者单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 超声心动图, 组织学研究, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 图像, 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-18 |
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析APS患者皮肤微血管内皮细胞，揭示YAP1和CCN2介导的信号通路在APS血管病变中的作用 | 首次揭示APS微血管内皮细胞中YAP1介导的信号激活，并证明YAP1靶点CCN2在促进微血管内皮细胞与血管平滑肌细胞之间的促增殖通讯中发挥关键作用 | 样本量有限，且主要基于皮肤活检，对其他受累器官（如肾脏、心脏）的机制验证不够充分 | 阐明APS血管病变的细胞和分子机制，寻找潜在治疗靶点 | APS合并网状青斑患者的皮肤活检样本、APS肾病活检样本、健康皮肤微血管内皮细胞、APS患者来源血清或IgG、小鼠模型 | 单细胞组学 | 抗磷脂综合征血管病变 | 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据、图像、蛋白质定量数据 | APS合并网状青斑患者的皮肤活检样本（具体数量未在摘要中说明）、APS肾病活检样本、健康皮肤微血管内皮细胞培养样本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-18 |
BDNF as a Key Mediator in Eosinophilic Inflammation in CRSwNP: Insights From Transcriptomic and Functional Analysis
2025-11, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23628
PMID:40600933
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研究论文 | 该研究通过转录组学和功能分析揭示了BDNF在嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉中作为上皮-嗜酸性粒细胞交互关键介导因子的作用 | 首次系统性地将BDNF定位为CRSwNP中上皮-嗜酸性粒细胞交互的关键调控因子，揭示了Th2细胞因子通过JAK/STAT信号通路上调HNECs中BDNF表达，以及外源性BDNF通过TrkB受体增强嗜酸性粒细胞存活和迁移的机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究BDNF在CRSwNP嗜酸性炎症中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 23例鼻黏膜样本和95例鼻分泌物样本，以及原代人鼻上皮细胞（HNECs）和嗜酸性粒细胞 | digital pathology | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA-seq, single-cell RNA sequencing, ELISA, immunofluorescence staining, flow cytometry, transwell assay | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | 23例鼻黏膜样本（bulk RNA-seq），95例鼻分泌物样本（ELISA），单细胞RNA测序样本，原代HNECs及嗜酸性粒细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-09-18 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 本文介绍了REMODEL试验的研究背景、设计方法和基线特征，该试验旨在探索司美格鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾脏病患者中的肾脏保护作用机制 | 采用多管齐下的方法，包括基于MRI的肾脏氧合、灌注和炎症评估，以及肾脏活检组织的单细胞核和空间转录组学分析，以全面揭示司美格鲁肽的肾脏特异性作用机制 | 样本量相对较小（106例），肾活检亚组仅33例，可能影响统计效能和结果的普遍性 | 研究司美格鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾脏病患者中的肾脏保护作用及其潜在机制 | 2型糖尿病合并慢性肾脏病的成年患者 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | MRI、单细胞核转录组学、空间转录组学、病理学检查、组织学评估 | NA | 图像、文本 | 106例参与者（其中33例为肾活检亚组） | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞核RNA测序用于单细胞核转录组学分析，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 8 | 2026-09-18 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
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研究论文 | 该研究利用MetTag单细胞条形码与转录组分析技术结合CRISPR筛选，揭示了肿瘤细胞内在IFNγ信号在转移生态位适应和早期转移定植中的时空调控作用 | 开发了MetTag方法，结合时间戳批次标识条形码（BC.IDs）和功能性CRISPR筛选，首次在单细胞水平实现时间分辨的克隆追踪，揭示了早期播散克隆在转移生态位中的优先富集现象以及肿瘤内在IFNγ信号驱动转移生态位适应和转移共进化的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析播散肿瘤细胞（DTCs）在转移生态位中存活和定植的克隆性、时间动态及分子决定因素，阐明肿瘤内在机制与生态位驱动机制之间的相互作用 | 播散肿瘤细胞（DTCs）、转移生态位、腹膜转移模型、腹水来源的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR/Cas9筛选、RNA速率分析、单细胞条形码追踪、深度测序 | CRISPR/Cas9敲除模型 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 9 | 2026-09-18 |
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669006
PMID:40832362
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液，发现促纤维化单核细胞来源肺泡巨噬细胞（MoAM）和间质巨噬细胞增多与肺纤维化严重程度相关，并可作为SSc-ILD的生物标志物及治疗靶点 | 首次提出支气管肺泡灌洗液中促纤维化MoAM和间质巨噬细胞的比例可作为SSc-ILD的生物标志物，并揭示了霉酚酸酯治疗对MoAM转录组的影响，同时利用空间转录组学发现SSc-ILD肺外植体中间质巨噬细胞向肺泡腔扩展 | 样本量较小，仅纳入9例SSc-ILD患者和13例健康对照，需要更大规模的队列研究验证MoAM作为生物标志物的临床实用性 | 验证SSc-ILD患者支气管肺泡灌洗液中MoAM的存在及比例是否可作为间质性肺病严重程度的生物标志物，并探索其作为治疗靶点的可能性 | 9例前瞻性入组的SSc-ILD患者和13例健康对照者的支气管肺泡灌洗液样本，以及SSc-ILD肺外植体 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，图像 | 9例SSc-ILD患者的支气管肺泡灌洗液样本，13例健康对照的支气管肺泡灌洗液样本，以及SSc-ILD肺外植体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台，10x Visium空间转录组学平台 |
| 10 | 2026-09-18 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，分析了疟原虫和按蚊细胞在不同发育阶段和代谢条件下的转录组，揭示了按蚊中肠内疟原虫的发育转变及蚊虫-寄生虫相互作用 | 首次对疟原虫和按蚊细胞进行单细胞RNA测序，结合共享条形码分析和共聚焦显微镜，揭示了寄生虫与中肠祖细胞的优先相互作用及晚期卵囊与肌肉细胞的紧密连接，并发现转录因子SIP2对子孢子感染人类肝细胞至关重要 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育转变和蚊虫-寄生虫相互作用，寻找传播阻断策略的候选靶点 | 疟原虫（Plasmodium）和按蚊（Anopheles）雌蚊的中肠细胞 | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、显微图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-18 |
Conformal inference for reliable single cell RNA-seq annotation
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf521
PMID:40973204
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研究论文 | 提出基于保形预测框架的单细胞RNA测序注释方法，用于检测分布外细胞类型并提供可靠的统计不确定性量化 | 首次将保形预测框架应用于单细胞RNA测序注释，无需对数据底层分布做任何假设即可提供统计保证；同时处理两个关键挑战：检测查询数据中的分布外细胞类型，以及通过良好校准的预测集进行可靠的不确定性量化 | 摘要中未明确提及局限性；可能的研究限制包括仅在有限数量的批量实验中验证（10个实验），未在大规模或更多样化的数据集上评估 | 为单细胞RNA测序的自动细胞类型注释提供可靠的统计不确定性量化方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 保形预测 | 文本 | 10个批量实验，来自多种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-09-18 |
DiSTect: a Bayesian model for disease-associated gene discovery and prediction in spatial transcriptomics
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf530
PMID:40981505
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研究论文 | 本文提出了一种名为DiSTect的贝叶斯收缩模型，通过自回归项纳入组织斑点间的空间相关性，用于空间转录组学中疾病相关基因的发现与预测 | 提出DiSTect贝叶斯收缩模型，通过自回归项刻画疾病状态在组织斑点间的空间相关性，采用层次结构支持多相关样本分析，并扩展以适应组织内缺失数据；针对不同样本量设计了两套贝叶斯参数估计计算框架 | 需要针对小样本和大样本分别采用不同的计算框架，可能在实际应用中增加使用复杂度；仅应用于HER2+乳腺癌和阿尔茨海默病两个数据集，泛化能力有待进一步验证 | 开发一种能够纳入空间相关性、适用于多相关样本及含缺失数据的贝叶斯模型，用于空间转录组学中疾病相关基因的发现与预测 | 空间转录组学数据中的组织斑点和基因表达，具体应用于HER2+乳腺癌和阿尔茨海默病研究数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 贝叶斯收缩模型, 自回归模型, 层次模型 | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-18 |
CLUEY enables knowledge-guided clustering and cell type detection from single-cell omics data
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf528
PMID:40981522
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研究论文 | 提出知识引导的框架CLUEY，用于单细胞组学数据的细胞类型检测和聚类 | 将先验生物学知识整合到聚类过程中，提供最佳聚类数目的指导，增强结果的可解释性 | 未明确提及 | 解决单细胞组学数据聚类中由于降维方法和参数选择导致细胞类型数目差异大，以及手动注释主观性的问题 | 单细胞组学数据，包括单模态（scRNA-seq、scATAC-seq）和多模态（CITE-seq、SHARE-seq）数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，CITE-seq，SHARE-seq | NA | 基因表达谱，表观遗传谱，多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-18 |
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-10, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-025-02040-1
PMID:40779286
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序，揭示了CREBBP突变与神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET阴性结果及SSTR2表达降低之间的关联 | 首次发现CREBBP突变在SSTR2阴性/低表达神经内分泌肿瘤中高频出现，频率接近MEN1、PTEN、RB1等已知NET驱动突变，并首次提出CREBBP突变可能改变SSTR2表达从而导致68Ga-DOTATATE PET假阴性 | 样本量较小（仅18例患者），为回顾性研究，CREBBP突变调控SSTR2表达的具体分子机制尚未通过功能实验验证 | 阐明神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET显像阴性的分子和遗传因素，探索PET阴性结果与基因突变之间的相互作用 | 18例肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者，这些患者在初始诊断检查中接受了68Ga-DOTATATE和18F-FDG PET/CT扫描 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 18例神经内分泌肿瘤患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-18 |
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-10-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf159
PMID:40876844
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研究论文 | 该研究报告了一例由RELA单倍剂量不足导致的非典型克罗恩病样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 | 首次将RELA单倍剂量不足与非典型克罗恩病样表型联系起来，揭示了Th1/Th17极化和干扰素驱动的炎症机制 | 仅基于单个病例的研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 描述由RELA单倍剂量不足驱动的非典型克罗恩病样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者，诊断为全肠型克罗恩病、肛周瘘、慢性黏膜皮肤念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序，Sanger测序，蛋白质建模，Western blotting，免疫荧光，基于核提取物的NF-κB激活测定，质谱流式细胞术（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，蛋白质数据，图像，文本 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 16 | 2026-09-18 |
Spatial transcriptomics elucidates localized immune responses in atherosclerotic coronary artery
2025-10, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00280-w
PMID:40847214
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研究论文 | 本研究利用GeoMx和CosMx空间转录组技术分析不同动脉粥样硬化病变严重程度的人冠状动脉连续切片，揭示局部免疫反应的空间组织特征 | 结合GeoMx和CosMx两种空间转录组平台，在单细胞水平上无偏倚地解析人冠状动脉粥样硬化病变中免疫细胞的空间组织和分子通路 | 摘要中未明确说明样本量大小及具体的技术局限性 | 阐明免疫细胞在动脉粥样硬化进展过程中的空间组织特征和作用，以发现新的治疗靶点，减少心血管事件负担 | 不同动脉粥样硬化病变严重程度患者的人冠状动脉组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx, CosMx | GeoMx数字空间分析平台和CosMx空间分子成像仪 |
| 17 | 2026-09-18 |
GNAS/PKA signaling promotes aberrant osteochondral differentiation of Gli1+ tendon sheath progenitors
2025-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00553-7
PMID:40890486
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研究论文 | 该研究发现小鼠跟腱切断后Gli1+腱鞘细胞扩增并分化为腱性和骨软骨细胞，通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示其起源于Scx+肌腱干/祖细胞，并证明GNAS/PKA信号通路激活促进异位骨化 | 首次鉴定Gli1+腱鞘祖细胞具有骨软骨分化能力，并揭示GNAS/PKA信号通路在该过程中的关键作用，提出PKA作为治疗肌腱骨化的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类肌腱干细胞实验有限，GNAS/PKA信号通路的具体下游机制尚未完全阐明 | 探究肌腱损伤后异位骨化过程中腱鞘祖细胞的骨软骨分化机制 | 小鼠跟腱切断模型中的Gli1+腱鞘细胞、Scx+肌腱干/祖细胞及人类肌腱干细胞 | 单细胞转录组学, 干细胞生物学, 骨生物学 | 肌腱骨化, 异位骨化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 遗传抑制 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-18 |
Spatial isoform sequencing at sub-micrometer single-cell resolution reveals novel patterns of spatial isoform variability in brain cell types
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661563
PMID:40667010
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研究论文 | 该研究开发了Spl-ISO-Seq2空间长读长测序技术，在220纳米点尺寸和500纳米分辨率下实现亚微米单细胞分辨率，并配套开发Spl-IsoQuant-2和Spl-IsoFind软件包，应用于成体小鼠大脑，揭示了脑细胞类型中空间异构体变异的新模式 | 开发了Spl-ISO-Seq2技术，将空间长读长测序分辨率提升至220纳米点尺寸和500纳米分辨率，实现亚微米单细胞分辨率；使用1.4亿个条形码（此前仅8万个）；开发了配套软件Spl-IsoQuant-2和Spl-IsoFind；首次证明空间异构体变异发生在兴奋性神经元中而非仅由细胞类型组成驱动 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发高分辨率空间长读长测序技术，解决空间可变异构体是否代表同一细胞类型内的空间变异还是不同区域间细胞类型组成差异的问题 | 成体小鼠大脑（包括少突胶质细胞和兴奋性神经元等脑细胞类型） | 空间转录组学 | NA | 空间长读长测序 | NA | 图像、文本 | 成体小鼠大脑样本，以及公开的Visium HD 3'长读长数据 | 10x Genomics | 空间转录组学, 长读长测序 | 10x Visium HD | Spl-ISO-Seq2（220nm点尺寸，500nm分辨率，1.4亿条形码）；10x Visium HD 3'长读长数据 |
| 19 | 2026-09-18 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
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研究论文 | 利用单细胞转录组学研究促增殖信号对果蝇卵泡细胞谱系上皮稳态的影响，揭示Hh与EGFR-Ras信号通路通过独立机制共同防止肿瘤发生的失败安全机制 | 首次揭示Hh和EGFR-Ras两条非交互信号通路在转录水平上汇聚，通过独立激活不同转录因子形成转录杂合状态，从而防止恶性细胞行为 | 研究基于果蝇卵泡细胞谱系，结论在哺乳动物系统中的普适性有待验证；未涉及具体的人类肿瘤样本 | 探究促增殖信号通路对上皮组织稳态的影响及其防止肿瘤发生的机制 | 果蝇卵泡细胞谱系 | 单细胞转录组学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-09-18 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
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研究论文 | 通过条件性敲除视网膜祖细胞中的Ptbp1，结合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq，发现Ptbp1对 retinal 神经发生和细胞命运决定并非必需 | 首次通过在体遗传学方法在视网膜发育中条件性敲除Ptbp1，结合bulk和单细胞转录组证明Ptbp1对 retinal 细胞命运决定非必需，挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育过程，未评估Ptbp1在其他神经系统区域或成年期神经发生中的作用；单细胞转录组变化较轻微，功能验证有限 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用 | 小鼠视网膜祖细胞及成熟视网膜 | 机器学习 | NA | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |