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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-11 |
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/20008066.2026.2619389
PMID:41665627
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学与机器学习方法,识别出与免疫相关的重度抑郁症生物标志物 | 首次结合LASSO和SVM-RFE两种机器学习算法筛选生物标志物,并通过单细胞RNA测序数据验证其在免疫细胞亚群中的表达 | 研究主要基于公共基因表达数据集,实验验证仅在CUMS大鼠模型中进行,未涉及人类临床样本 | 开发重度抑郁症的早期客观诊断生物标志物 | 重度抑郁症相关基因表达数据及CUMS大鼠模型 | 机器学习 | 重度抑郁症 | 高通量转录组学、单细胞RNA测序 | LASSO、SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,包含GEO数据库多个数据集及CUMS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-11 |
Inflammation-induced Neuronal Damage in CNS Tuberculosis: Molecular Mechanism and Therapeutic Targets
2026-Mar-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150169
PMID:41558621
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综述 | 本文综述了中枢神经系统结核病中神经炎症诱导神经元损伤的分子机制及潜在治疗靶点 | 提出了以胶质细胞驱动的炎症和线粒体功能障碍为核心的统一框架,为疾病发病机制提供了关键见解 | NA | 探讨中枢神经系统结核病中神经免疫机制及宿主导向治疗策略 | 中枢神经系统结核病(CNS-TB)相关的神经炎症和神经元损伤 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学、免疫代谢分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-02-11 |
Olfactomedin-4+ neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage in Clostridioides difficile infection
2026-Feb-10, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00229-25
PMID:41498562
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研究论文 | 本研究探讨了表达Olfactomedin-4的中性粒细胞(OLFM4中性粒细胞)在艰难梭菌感染(CDI)中加剧肠道上皮细胞损伤的作用机制 | 首次揭示了OLFM4中性粒细胞通过高表达脱颗粒基因并聚集于肠道上皮损伤区域,直接加剧CDI诱导的肠道上皮损伤 | 机制研究主要基于小鼠模型,人类患者数据有限,且OLFM4的具体作用通路尚未完全阐明 | 探究中性粒细胞在艰难梭菌感染中加剧组织损伤的机制 | 小鼠和人类患者中的中性粒细胞,特别是OLFM4+中性粒细胞亚群 | NA | 艰难梭菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染小鼠和患者样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-11 |
T cell receptors for antigen on intraepithelial cytolytic T lymphocytes in celiac disease engage enterocyte HLA-E and HLA-B
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525433123
PMID:41642982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,比较了活动性乳糜泻与正常对照的十二指肠活检样本,揭示了上皮内细胞毒性T淋巴细胞通过T细胞受体与肠上皮细胞HLA-E和HLA-B的相互作用机制 | 首次发现乳糜泻中αβ和γδ T细胞受体均能与肠上皮细胞的HLA-E和HLA-B结合,而非传统认为的NKG2C,这为理解疾病中CTL激活和抗原依赖性杀伤提供了新视角 | 研究主要基于十二指肠活检样本,可能未涵盖疾病所有阶段或其他组织类型,且样本量未明确说明,可能限制结果的普遍性 | 探究乳糜泻中上皮内细胞毒性T淋巴细胞的激活机制及其与肠上皮细胞的相互作用 | 活动性乳糜泻患者和正常对照的十二指肠活检样本 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序, 循环免疫荧光, RNAScope, 邻近连接分析 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-11 |
Bioinformatics approach to identifying molecular targets of Danlou tablet against atherosclerosis: a machine learning pharmacology study
2026-Feb-10, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04972-5
PMID:41663811
|
研究论文 | 本研究采用整合计算框架,结合网络药理学、生物信息学、单细胞RNA测序和机器学习等方法,旨在识别丹蒌片治疗动脉粥样硬化的新型分子靶点并阐明其作用机制 | 首次将网络药理学、单细胞RNA测序、机器学习、分子对接和分子动力学模拟等多种计算与实验方法整合,系统性地识别丹蒌片抗动脉粥样硬化的新型分子靶点,并提出了HAS2作为β-谷甾醇作用的新候选靶点 | 研究主要基于计算预测和初步的体外细胞验证,缺乏深入的体内实验和临床验证,所提出的分子假说需要进一步的实验证实 | 识别丹蒌片治疗动脉粥样硬化的新型分子靶点并生成机制假说 | 丹蒌片的生物活性成分及其与动脉粥样硬化相关的分子靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 分子对接, 分子动力学模拟, 细胞热位移分析 (CETSA), 酶联免疫吸附测定 (ELISA) | 机器学习算法 | 转录组数据 (单细胞和批量), 化合物-靶点相互作用数据 | 涉及人类脐静脉内皮细胞 (HUVECs) 的初步验证实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-02-11 |
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15648-5
PMID:41663976
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-02-11 |
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03726-1
PMID:41664072
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研究论文 | 本研究揭示了GPR35通过结合Raf1的CR2结构域,在缺血性中风再灌注损伤中发挥保护作用 | 首次发现GPR35与Raf1的CR2结构域直接相互作用,并阐明了其通过Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路抑制神经炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探究GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的作用机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞 | 神经科学 | 缺血性中风 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-02-11 |
Mapping Whole-Organism Genetic Comorbidities Across Model Species Using Unified Ontologies
2026-Feb-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 本文提出了一种计算方法来分析与非梗阻性无精子症(NOA)相关基因的全生物体共病性,利用统一的本体结构跨物种比较表型 | 开发了一个整合新生殖表型本体与标准化全身表型类别的框架,实现直接跨物种比较,并创建了CoMorbidity DataBase Mapper(CoMo DBM)资源 | 方法依赖于模型生物数据库中的基因型-表型关联数据,可能受数据完整性和准确性限制 | 识别遗传变异如何贡献于全生物体表型,以揭示疾病机制 | 与非梗阻性无精子症(NOA)相关的基因及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和线虫中的直系同源物 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA-seq,全生物体基因表达分析,基因本体注释 | NA | 基因型-表型关联数据,RNA-seq数据,基因表达数据 | 204个经实验验证的小鼠基因及其跨物种直系同源物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-11 |
Cardiac Macrophages and Fibroblasts Modulate Atrial Fibrillation Maintenance
2026-Feb-10, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326291
PMID:41664919
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研究论文 | 本研究探讨了心脏巨噬细胞和成纤维细胞在持续性心房颤动维持中的作用,通过猪模型和人类样本验证了驱动区域的细胞组成变化 | 首次结合高密度瞬时频率调制图谱、单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,识别了心房颤动驱动区域中成纤维细胞和巨噬细胞的表型变化及其功能相关性 | 样本量相对较小,猪模型与人类疾病可能存在差异,且驱动区域的识别依赖于特定技术,可能无法完全反映所有心房颤动病例 | 研究持续性心房颤动维持过程中非心肌细胞(特别是成纤维细胞和巨噬细胞)的区域性适应性变化及其机制 | 猪模型(包括有和无梗死相关基质的PsAF模型)和人类PsAF患者,以及对照组的猪和人类样本 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质组学分析、高密度瞬时频率调制图谱 | 动物模型(猪)和人类临床研究 | 细胞组成数据、转录组数据、蛋白质组数据、电生理图谱 | 猪模型:PsAF组54只(27只有梗死基质,27只无),对照组13只(9只假手术,4只健康);人类:PsAF患者20人,窦性心律对照7人,补充队列PsAF患者进行单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-11 |
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01419-8
PMID:41665703
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、机器学习和实验验证,识别了TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 | 首次探索了血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序数据与人类批量RNA测序及微阵列数据集整合,结合机器学习方法识别了关键的衰老相关基因 | TGFB1和SERPINE1的具体作用机制需要进一步研究和验证 | 研究颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的病理机制,并识别相关的生物标志物 | 小鼠弹性蛋白酶诱导的颅内动脉瘤模型和人类颅内动脉瘤组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学分析 | 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 机器学习 | RNA测序数据, 微阵列数据, 图像数据 | 小鼠模型数据集(GSE193533)及人类数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-11 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破(PPROM)中人类胎膜及邻近胎盘细胞的多样性 | 识别了先前未知的滋养层细胞亚型FABP7+Tb,并发现MMP11在EVT-1中的上调表达可能作为PPROM诊断的生物标志物 | 样本来源仅限于脐带周围约两厘米的组织,可能无法完全代表整个胎膜及胎盘区域的细胞多样性 | 探究PPROM的细胞组成和遗传变化,以揭示其分子机制和早期预测靶点 | 来自足月分娩、早产无胎膜早破及PPROM女性的胎膜及邻近胎盘组织 | 数字病理学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 来自三组女性(FTIL、PPWROM、PPROM)的胎膜及邻近胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-02-10 |
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39168-1
PMID:41656346
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-02-11 |
Single-cell RNA sequencing unveils CCDC86-driven immune modulation and antigen-presenting cell dynamics in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04134-2
PMID:41661401
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了CCDC86基因在头颈部鳞状细胞癌中驱动免疫调节和抗原呈递细胞动态的关键作用 | 首次在头颈部鳞状细胞癌中表征了免疫相关基因CCDC86的表达模式及其免疫学功能,揭示了其在抗原呈递细胞中的特异性表达和双重免疫调节潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于FaDu细胞系的qPCR,缺乏体内功能验证 | 阐明CCDC86基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式及其免疫学功能 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本和FaDu细胞系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,qPCR | NA | RNA测序数据,单细胞转录组数据 | TCGA数据库和GEO数据库(GSE139324)中的头颈部鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-02-10 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04595-z
PMID:41661456
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-02-11 |
A Multi-Step Immune-Competent Genetically Engineered Mouse Model Reveals Phenotypic Plasticity in Uveal Melanoma
2026-Feb-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2684
PMID:41661679
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研究论文 | 本文开发了一种多步骤的免疫健全基因工程小鼠模型,用于研究葡萄膜黑色素瘤的生物学特性和表型可塑性 | 首次构建了能够模拟人类葡萄膜黑色素瘤进展多步骤遗传改变的免疫健全小鼠模型,并揭示了肿瘤细胞从黑色素细胞状态向神经嵴样状态去分化的轨迹 | 模型构建过程复杂,可能需要进一步验证在人类患者中的直接临床相关性 | 开发更准确模拟人类葡萄膜黑色素瘤的动物模型,以研究肿瘤生物学和免疫微环境 | 葡萄膜黑色素瘤 | 肿瘤生物学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-02-11 |
AKT3-Driven Epithelial-Mesenchymal Plasticity Governs Ovarian Metastasis in Colorectal Cancer via Tumor Microenvironment Remodeling
2026-Feb-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1718
PMID:41662163
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析,揭示了AKT3驱动的上皮-间质可塑性在结直肠癌卵巢转移中的作用,并提出了针对该亚型的精准治疗平台 | 首次在结直肠癌卵巢转移中识别AKT3⁺ EMT样细胞作为转移起始细胞,并阐明其通过肿瘤微环境重塑促进转移的机制 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据和模型验证,需进一步临床验证 | 阐明结直肠癌卵巢转移的生物学机制并探索潜在治疗靶点 | 结直肠癌卵巢转移患者样本、异种移植模型和患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据、免疫荧光图像 | 35名患者的155,163个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-02-11 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb-09, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
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研究论文 | 本研究探讨了Regnase-1如何通过调节中性粒细胞功能影响SARS-CoV-2 MA10株诱导的肺炎 | 揭示了Regnase-1通过抑制Tsc22d3基因表达来促进中性粒细胞过度干扰素反应,从而削弱对SARS-CoV-2感染的抵抗力 | 研究基于小鼠模型和鼠适应病毒株,可能不完全反映人类COVID-19的免疫反应 | 探究Regnase-1在调节中性粒细胞功能和对SARS-CoV-2感染抵抗力中的作用 | Regnase-1+/-小鼠、SARS-CoV-2 MA10病毒株、肺组织中性粒细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-02-11 |
Single-cell pseudotime and cell communication analysis of pancreatic cancer
2026-Feb-09, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/203156
PMID:41662508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建胰腺癌细胞的伪时间轨迹,分析细胞间通讯,揭示了肿瘤进展中的关键转录因子、信号通路及细胞间相互作用 | 整合单细胞伪时间轨迹与细胞间通讯分析,系统解析胰腺癌肿瘤微环境中的细胞状态转变和细胞间相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全覆盖蛋白质水平或空间维度的相互作用 | 阐明胰腺癌进展的细胞和分子机制,为治疗干预和早期诊断提供新靶点 | 胰腺癌组织中的癌细胞、基质成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电子显微镜 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-02-11 |
MTFP1 drives pancreatic cancer liver metastatic colonisation by regulating mitochondrial metabolism reprogramming
2026-Feb-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336323
PMID:41663153
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研究论文 | 本研究揭示了MTFP1通过调控线粒体代谢重编程驱动胰腺癌肝转移定植的机制 | 首次将MTFP1鉴定为胰腺癌肝转移定植的关键驱动因子,并发现其作为新型ATP合酶调节剂,通过ROS/PI3K/AKT/c-MYC/SLC1A5通路增强氧化磷酸化和谷氨酰胺摄取,重塑免疫抑制肿瘤微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化潜力需进一步验证;虚拟筛选发现的抑制剂KPT 9274的疗效和安全性有待临床评估 | 识别胰腺导管腺癌肝转移定植过程中调控线粒体功能的关键驱动因子及其在免疫抑制肿瘤微环境重塑中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、小鼠肝转移模型、PDAC类器官、CD8+ T细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | CRISPR功能缺失筛选、单细胞RNA测序、空间代谢组学、代谢通量分析、GST pull-down实验 | 小鼠体内模型、PDAC类器官模型 | 基因表达数据、代谢数据、空间分布数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型、PDAC类器官和多种体外实验体系 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-11 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度域对抗神经网络的细胞类型反卷积框架DANST,用于空间转录组学数据中恢复细胞类型比例 | 通过整合单细胞RNA测序与推断的空间坐标构建伪空间数据,并利用变分自编码器学习精细特征表示,引入域对抗架构对齐伪数据与真实数据的特征分布 | NA | 开发一种高精度的细胞类型反卷积方法,以分析空间转录组学数据中的细胞组成 | 人类和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | 深度域对抗神经网络,变分自编码器(VAE) | 基因表达数据,空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |