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当前共找到 35413 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-01-21
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2026-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用和治疗潜力 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统表征,结合单细胞和空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的富集模式,并通过分子对接和动力学模拟筛选出潜在抑制剂 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HNSCC细胞系,缺乏体内模型验证和更广泛的癌症类型实验数据 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断和预后价值,探索其与肿瘤免疫微环境的关联及治疗潜力 多种癌症类型(包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等)的肿瘤样本和HNSCC细胞系 生物信息学 泛癌研究 多组学分析、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 涉及多种癌症类型的公共数据集和HNSCC细胞系 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
2 2026-01-21
Cellular and molecular determinants of lymph node metastasis in papillary thyroid carcinoma: Integrated multi-omics profiling and machine learning models
2026-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大块转录组数据,系统解析了甲状腺乳头状癌淋巴结转移的细胞和分子决定因素,并构建了基于随机森林的预测模型 首次整合多组学数据揭示PTC淋巴结转移的免疫微环境变化、恶性细胞异质性及FN1-SDC4轴的关键调控作用,并开发了17个关键基因的预测签名 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证;样本量可能有限,需进一步临床队列验证 阐明甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制并开发预测工具 甲状腺乳头状癌的原发灶和转移灶组织 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 大块转录组测序 随机森林 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 大块转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
3 2026-01-21
scGImpute: A hybrid BiLayer multi-head graph attention-based imputation framework for zero dropout in single-cell sequencing datasets
2026-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文提出了一种名为scGImpute的混合双层多头图注意力神经网络框架,用于在单细胞测序数据中恢复技术性零值同时保留生物性零值 提出了一种新颖的混合双层多头图注意力神经网络框架,专门针对单细胞测序数据中的零值丢失问题,并适用于多种组学数据类型 NA 解决单细胞测序数据中高频零读计数或丢失事件的技术挑战,以降低技术噪声并改善下游分析 单细胞测序数据集,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq数据 机器学习 NA 单细胞测序 混合双层多头图注意力神经网络 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, CITE-seq NA NA
4 2026-01-21
Pulmonary macrophage-targeted RNAi and mRNA co-delivery via SORT lipid nanoparticles enhances immunotherapy in lung cancer
2026-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本文开发了一种靶向肺巨噬细胞的RNAi和mRNA共递送系统,通过SORT脂质纳米颗粒增强肺癌免疫治疗效果 创新点在于设计了甘露糖修饰的SORT脂质纳米颗粒,能够共递送SPP1-siRNA和IFN-γ mRNA,实现肺限制性、甘露糖受体引导的精准靶向SPP1巨噬细胞,并展示出协同效应 NA 研究目的是开发一种精准细胞类型靶向策略,以增强非小细胞肺癌的免疫治疗效果,特别是针对免疫检查点抑制剂无应答患者 研究对象为SPP1巨噬细胞,这是一种在非小细胞肺癌免疫治疗中被识别为重要障碍的巨噬细胞亚群 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-01-21
Unraveling the Transcription Factor Code of Odontoblast Differentiation
2026-Feb, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq分析揭示转录因子在成牙本质细胞分化中的作用,并证明在小鼠诱导多能干细胞中过表达特定转录因子可引导其分化为成牙本质细胞样细胞 首次基于单细胞RNA-seq数据筛选并验证了四种转录因子在成牙本质细胞分化中的关键作用,为利用大组学数据指导细胞分化提供了新策略 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证;体内外实验的长期效果和安全性需进一步评估 探究成牙本质细胞分化的分子机制,并开发基于转录因子调控的细胞分化方法 小鼠牙齿干细胞、小鼠诱导多能干细胞及成牙本质细胞 发育生物学与再生医学 NA 单细胞RNA-seq、多组学分析 NA 单细胞RNA-seq数据 基于持续生长的小鼠牙齿样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-01-21
Meeting report for the 2025 UC Irvine Center for Neural Circuit Mapping conference: The Changing Brain
2026-Feb, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
会议报告 本文报告了2025年加州大学欧文分校神经环路图谱中心(CNCM)第五届年度会议“变化中的大脑”的概况,包括会议内容、参与情况及对神经环路研究领域的推动作用 NA NA 报告神经环路图谱领域的最新进展,并促进该领域在进化、发育、功能和疾病方面的研究交流 神经环路 神经科学 精神疾病和神经系统疾病 空间转录组学、病毒遗传学工具 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
7 2026-01-21
Inhibition of FOS-Like Antigen 1 Reduces Chemoresistance to Temozolomide Through Stemness Reprogramming via IL-6/STAT3Tyr705 Pathway
2026-Feb, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了FOSL1通过调控IL-6/STAT3信号通路促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺的化疗耐药性,并提出了靶向FOSL1作为克服耐药性的新策略 首次将FOSL1鉴定为胶质母细胞瘤化疗耐药的关键调控因子,并阐明其通过IL-6/STAT3信号轴调控肿瘤干细胞特性的新机制 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在临床患者中进行验证 探索胶质母细胞瘤化疗耐药的新机制并寻找潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤细胞系、小鼠模型 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、转录组分析 NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
8 2026-01-21
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序,揭示了VCAN在胃癌相关成纤维细胞中的高表达及其通过特定信号通路促进高干性胃腺癌细胞进展的机制 首次结合bulk测序与单细胞测序技术,系统性地鉴定出VCAN主要由癌症相关成纤维细胞(特别是pan-pCAF亚型)分泌,并阐明其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路驱动高干性胃腺癌细胞恶性表型的新机制 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证;信号通路机制尚未完全阐明,且未涉及VCAN靶向治疗的临床前评估 探究versican(VCAN)在胃腺癌(STAD)中的作用机制,寻找新的治疗靶点 胃腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 肿瘤生物学 胃癌 bulk测序、单细胞测序 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-01-21
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为scSemiPLC的单细胞半监督注释训练框架,通过聚类和一致性正则化生成伪标签,以提高单细胞RNA测序数据的注释效率和准确性 scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类,在模型训练中为未标记样本分配伪标签,并通过约束扰动数据的预测与伪标签相似,解决了固定高阈值伪标签范式导致的未标记数据利用率低的问题,为半监督学习领域的细胞注释提供了新方法 NA 开发一种高效且便捷的自动化细胞注释方法,以应对传统手动标记基因匹配方法的繁琐和耗时问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 半监督学习框架 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-01-21
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了PFKFB3在巨噬细胞中对溃疡性结肠炎的影响,发现抑制PFKFB3可通过调节肠道菌群缓解炎症 首次证明PFKFB3缺陷巨噬细胞通过改变肠道菌群微环境,可作为一种新的溃疡性结肠炎治疗策略 研究主要基于小鼠模型,人类数据相关性分析有限,抗生素处理可能影响菌群结果的解释 探究PFKFB3在溃疡性结肠炎中的功能作用和机制基础 人类UC患者、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、巨噬细胞 生物医学研究 溃疡性结肠炎 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 人类UC队列和健康对照、DSS诱导的结肠炎小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-01-21
Glycolytic heterogeneity drives metabolic-targeted therapy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jan-20, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学、单细胞及bulk RNA测序技术,揭示了胰腺导管腺癌中显著的糖酵解异质性,并探讨了其与临床预后和治疗反应的关系 首次系统性地描绘了胰腺导管腺癌的糖酵解异质性空间图谱,并建立了基于糖酵解表型的患者分层框架,为个性化代谢治疗提供了新策略 研究主要基于体外模型和测序数据,需要进一步的体内实验和临床试验验证其临床转化价值 探究胰腺导管腺癌的代谢异质性及其对靶向治疗反应的影响 胰腺导管腺癌患者样本、患者来源的细胞模型和类器官 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 代谢组学, 蛋白质组学, 脂质组学 NA 转录组数据, 代谢组数据, 蛋白质组数据, 脂质组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
12 2026-01-21
RUNX1 N6-methyladenosine methylation enhances cytoskeleton remodeling and boosts cardiac fibrosis
2026-Jan-20, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了YTHDF1通过识别m6A修饰的Runx1 mRNA增强其翻译,进而驱动RUNX1介导的Ctgf转录,从而促进心脏成纤维细胞增殖和纤维化的新表观转录组学通路 首次阐明了m6A介导的YTHDF1-RUNX1轴在心脏纤维化中的调控机制,特别是发现了peak_21317位点特异性m6A修饰对于YTHDF1结合和促进Runx1翻译的关键作用 当前转录因子结合模型很少整合RNA修饰,且包含这些修饰的最新方法仍然有限,这阻碍了转录因子亲和力的准确分析 探究m6A介导的机制在心脏纤维化过程中调控RUNX转录因子的作用 人心房颤动组织、心脏成纤维细胞特异性Ythdf1条件性敲除小鼠、ISO/TAC诱导的心脏纤维化模型、TGF-β1刺激的心脏成纤维细胞 表观转录组学 心血管疾病 MeRIP-seq, 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, RNA测序, 组织学和生化分析 条件性敲除小鼠模型, AAV9介导的基因敲低模型 RNA测序数据, 单细胞RNA-seq数据, ChIP-seq数据, 组织学图像, 生化数据 人心房颤动组织样本、多组小鼠模型(包括Ythdf1条件性敲除鼠、Cre对照、野生型对照) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
13 2026-01-21
Integrated multi-omics identifies MCRS1 as a causal hub linking aging, metabolic syndrome, and breast cancer progression
2026-Jan-20, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别出MCRS1是连接衰老、代谢综合征和乳腺癌进展的核心因果枢纽 首次通过整合乳腺癌、代谢综合征和衰老队列的转录组数据集,结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别并验证了MCRS1作为连接这些状态的核心因果驱动因子 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要在人类患者中进行进一步验证 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14 2026-01-21
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Jan-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架,用于增强空间单细胞转录组数据的保真度,以解码复杂的组织微环境 S3RL通过有效去噪稀疏测量和放大生物学相关信号,能够恢复原本会丢失的细粒度空间表达模式和调控关系,在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的调整兰德指数改进 未在摘要中明确说明 增强空间转录组数据的保真度,以更好地解码复杂的组织微环境 人类、小鼠和植物等多种组织的空间转录组数据 空间转录组学 肿瘤免疫交互 空间转录组学 可分离表示学习框架 空间转录组数据 多种人类、小鼠和植物组织 NA 空间转录组学 NA NA
15 2026-01-21
Thrombospondin 1 and 2 regulate mesenchymal progenitor cell fate and matrix organization
2026-Jan-19, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究揭示了血小板反应蛋白1和2在调控间充质祖细胞命运和细胞外基质组织中的关键作用,特别是在创伤诱导的异位骨化形成和进展中 首次阐明了TSP1和TSP2作为基质细胞因子在间充质祖细胞与细胞外基质相互作用中的调控作用,并发现其在异位骨化形成中的特异性表达模式 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 探究TSP1和TSP2在间充质祖细胞命运决定和细胞外基质组织调控中的作用机制 间充质祖细胞、细胞外基质、创伤诱导的异位骨化模型 数字病理学 骨骼肌肉疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 使用TSP1/2双敲除小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
16 2026-01-21
Single-cell characterization of the adult male hippocampus suggests a prominent, and cell-type specific, role for Nrgn and Sgk1 in response to a social stressor
2026-Jan-19, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,对成年雄性小鼠海马体在基础状态和急性应激条件下的分子特征进行了全面表征,并利用基因敲除模型探索了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体在应激反应中的作用 首次在单细胞水平上揭示了成年雄性小鼠海马体对单一延长社交挫败应激的细胞类型特异性分子特征,并鉴定出Nrgn和Sgk1作为应激反应性神经元的关键调控因子 研究仅针对成年雄性小鼠,未涵盖雌性或不同年龄阶段的动物,且仅关注了海马体这一特定脑区 探究应激相关精神障碍的分子机制,特别是海马体在应激反应中的细胞类型特异性调控网络 成年雄性小鼠海马体细胞,包括谷氨酸能神经元、GABA能神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞 单细胞组学 应激相关精神障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-01-21
Deciphering CD4+ Naive T cell-mediated divergent pathogenic links between type 2 diabetes and pathologic scarring via an integrated multi-omics approach
2026-Jan-19, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了2型糖尿病通过CD4+初始T细胞介导的免疫微环境调控,对增生性瘢痕和瘢痕疙瘩产生相反因果效应的潜在机制 首次采用表型范围孟德尔随机化结合单细胞RNA测序等多组学技术,系统阐明了2型糖尿病与不同病理性瘢痕之间的因果关联及CD4+初始T细胞的介导作用 研究主要基于遗传学和转录组学数据,缺乏直接的体内功能验证实验 探究糖尿病与病理性瘢痕(增生性瘢痕和瘢痕疙瘩)之间的因果关系及免疫细胞机制 糖尿病(1型和2型)与病理性瘢痕(增生性瘢痕和瘢痕疙瘩) 多组学整合分析 糖尿病与皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、细胞间通讯推断、代谢通路分析、转录组差异表达分析 孟德尔随机化模型、伪时间轨迹分析 遗传数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-01-21
A single-nucleus RNA sequencing reveals the differential fate mechanism underlying flavonoid biosynthesis of middle and inner tepals in Chimonanthus praecox
2026-Jan-17, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序揭示了蜡梅中、内被片花青素生物合成的差异命运机制 首次构建了蜡梅被片的单细胞转录组图谱,揭示了细胞发育调控与花青素合成途径基因表达的时间动态关联 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢物水平的验证,且样本量相对有限 探究蜡梅被片花色形成的分子机制,特别是花青素生物合成的细胞特异性积累 蜡梅(Chimonanthus praecox)的中被片和内被片细胞 植物生物学 NA 单核RNA测序(snRNA-seq)、伪时间分析、WGCNA分析 NA 单细胞转录组数据 13,073个内被片单细胞核和12,625个中被片单细胞核 NA 单核RNA测序 NA NA
19 2026-01-21
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Jan-17, Theoretical population biology IF:1.2Q4
研究论文 本文通过建模和理论分析,探讨了在顺序编辑的分子记录系统中,如何利用基于距离的方法高概率地准确重建细胞谱系树 首次对顺序编辑的分子记录系统进行建模,并明确了在何种实验条件下,简单高效的基于距离的重建方法能够准确解析细胞谱系树 研究主要基于模拟和理论分析,尚未通过大规模实际实验数据进行全面验证 探究顺序编辑的分子记录系统(如基于CRISPR的系统)在细胞谱系追踪中的信息内容和重建条件 细胞谱系树 机器学习 NA 单细胞RNA测序 基于距离的重建方法 序列数据 数千个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-01-21
IL-6 drives chemoimmunotherapy resistance in NSCLC by reprogramming myeloid cells and impairing cytotoxic lymphocyte function
2026-Jan-17, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了基线血浆IL-6水平在预测晚期非小细胞肺癌患者对一线化疗免疫疗法原发性耐药及生存预后中的价值,并通过小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了IL-6通过重塑肿瘤免疫微环境驱动耐药的机制 首次将基线血浆IL-6水平确立为晚期NSCLC患者一线化疗免疫疗法原发性耐药和不良生存的独立预测因子,并利用单细胞RNA测序在小鼠模型中阐明了IL-6通过促进巨噬细胞向免疫抑制表型极化、抑制CD8 T细胞浸润、增加调节性T细胞比例以及损害NK细胞功能来驱动耐药的详细机制 研究为回顾性分析,样本量相对有限(123例患者),且小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤的复杂性,需要前瞻性研究和更大规模队列验证 探究IL-6在晚期非小细胞肺癌患者对化疗免疫疗法产生原发性耐药中的作用及其机制 晚期非小细胞肺癌患者(123例)以及小鼠肺腺癌(LLC)和鳞状细胞癌(KLN205)模型 肿瘤免疫学 肺癌 ELISA, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 血浆样本(ELISA测量)、单细胞RNA测序数据 123例晚期NSCLC患者,以及小鼠肺腺癌(LLC)和鳞状细胞癌(KLN205)模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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